source/wham/src/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for WHAM single chain version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_WHAM_SRC0
  11         wham_multparm.F
  12         bxread.F
  13         xread.F
  14         cxread.F
  15         enecalc1.F
  16         energy_p_new.F
  17         initialize_p.F
  18         molread_zs.F
  19         openunits.F
  20         readrtns.F
  21         arcos.f
  22         cartder.f
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.f
  25         geomout.F
  26         icant.f
  27         intcor.f
  28         int_from_cart.f
  29         make_ensemble1.F
  30         matmult.f
  31         misc.f
  32         mygetenv.F
  33         parmread.F
  34         pinorm.f
  35         printmat.f
  36         rescode.f
  37         setup_var.f
  38         slices.F
  39         store_parm.F
  40         timing.F
  41         wham_calc1.F
  42         readrtns_compar.F
  43         readpdb.f
  44         fitsq.f
  45         contact.f
  46         elecont.f
  47         contfunc.f
  48         cont_frag.f
  49         conf_compar.F
  50         match_contact.f
  51         angnorm.f
  52         odlodc.f
  53         promienie.f
  54         qwolynes.f
  55         read_ref_str.F
  56         rmscalc.f
  57         secondary.f
  58         proc_cont.f
  59         define_pairs.f
  60         mysort.f
  61 )
  62
  63 set(UNRES_WHAM_PP_SRC
  64         bxread.F
  65         chainbuild.F
  66         conf_compar.F
  67         cxread.F
  68         enecalc1.F
  69         energy_p_new.F
  70         geomout.F
  71         initialize_p.F
  72         make_ensemble1.F
  73         molread_zs.F
  74         mygetenv.F
  75         openunits.F
  76         parmread.F
  77         read_ref_str.F
  78         readrtns_compar.F
  79         readrtns.F
  80         slices.F
  81         store_parm.F
  82         timing.F
  83         wham_calc1.F
  84         wham_multparm.F
  85         xread.F
  86         proc_proc.c
  87 )
  88
  89
  90 #================================================
  91 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  92 #================================================
  93 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  94   set(FFLAGS0 "-mcmodel=medium -g -CB -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
  95 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
  96   set(FFLAGS0 "-c -I. " )
  97   set(FFLAGS1 "-c -g -I. " )
  98   set(FFLAGS2 "-c -I. ")
  99   #set(FFLAGS3 "-c -w -O3 -ipo -ipo_obj -opt_report" )
 100   set(FFLAGS3 "-c -I. " )
 101 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 102
 103
 104 #=========================================
 105 # Add MPI compiler flags
 106 #=========================================
 107 if(UNRES_WITH_MPI)
 108   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 109 endif(UNRES_WITH_MPI)
 110
 111 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 112
 113 #=========================================
 114 # WHAM preprocesor flags
 115 #=========================================
 116
 117 set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 118
 119 #=========================================
 120 # System specific flags
 121 #=========================================
 122 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 123   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 124 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 125
 126 #=========================================
 127 # Compiler specific flags
 128 #=========================================
 129
 130 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 131   # Add ifort preprocessor flags
 132   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 133 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 134   # Add new gfortran flags
 135   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 136 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 137   # Add old gfortran flags
 138   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 139 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 140
 141 #=========================================
 142 # Add MPI preprocessor flags
 143 #=========================================
 144 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI")
 145
 146 #=========================================
 147 # Add 64-bit specific preprocessor flags
 148 #=========================================
 149 if (architektura STREQUAL "64")
 150   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 151 endif (architektura STREQUAL "64")
 152
 153 #=========================================
 154 # Apply preprocesor flags to *.F files
 155 #=========================================
 156 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 157
 158
 159 #========================================
 160 #  Setting binary name
 161 #========================================
 162 set(UNRES_WHAM_BIN "wham_${Fortran_COMPILER_NAME}.exe")
 163
 164 #=========================================
 165 # cinfo.f stupid workaround for cmake
 166 #  - shame on me ]:)
 167 #=========================================
 168 set_property(SOURCE compinfo.c PROPERTY CMAKE_C_FLAGS "-c" )
 169 add_executable(compinfo-wham compinfo.c)
 170 set_target_properties(compinfo-wham PROPERTIES OUTPUT_NAME compinfo)
 171
 172 set(UNRES_CINFO_DIR "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}" )
 173 add_custom_command(OUTPUT ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 174         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/cinfo.f ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 175         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/COMMON.IOUNITS ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/COMMON.IOUNITS
 176         COMMAND ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/compinfo | true
 177         DEPENDS compinfo-wham )
 178 set_property(SOURCE ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 179
 180 #=========================================
 181 # Set full unres CSA sources
 182 #=========================================
 183 set(UNRES_WHAM_SRCS ${UNRES_WHAM_SRC0} ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
 184
 185 #=========================================
 186 # Build the binary
 187 #=========================================
 188 add_executable(UNRES_WHAM_BIN ${UNRES_WHAM_SRCS} )
 189 set_target_properties(UNRES_WHAM_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_BIN})
 190
 191 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 192 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 193
 194 #=========================================
 195 # Link libraries
 196 #=========================================
 197 # link MPI library (libmpich.a)
 198 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN ${MPIF_LIBRARIES} )
 199 # link libxdrf.a
 200 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN xdrf )
 201
 202 #=========================================
 203 # TESTS
 204 #=========================================
 205
 206 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 207 #SET(UNRES_TEST_FILES
 208 #       ala10.inp
 209 #    )
 210
 211 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 212 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 213 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 214 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 215 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 216 #          POST_BUILD
 217 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 218 #      )
 219 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 220
 221 #=========================================
 222 # Generate data test files
 223 #=========================================
 224 #  test_single_ala.sh
 225 #=========================================
 226
 227 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 228 #"#!/bin/sh
 229 #export POT=GB
 230 #export PREFIX=ala10
 231 #-----------------------------------------------------------------------------
 232 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 233 #-----------------------------------------------------------------------------
 234 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 235 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 236 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 237 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 238 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 239 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 240 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 241 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 242 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 243 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 244 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 245 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 246 #-----------------------------------------------------------------------------
 247 #$UNRES_BIN
 248 #")
 249
 250 #=========================================
 251 #  ala10.inp
 252 #=========================================
 253
 254 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 255 #"ala10 unblocked
 256 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 257 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 258 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 259 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 260 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 261 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 262 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 263 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 264 #12
 265 #XAAAAAAAAAAX
 266 # 0
 267 # 0
 268 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 269 #   90.0000   90.0000
 270 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 271 #  180.0000
 272 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 273 #  110.0000  110.0000
 274 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 275 # -120.0000 -120.0000
 276 #")
 277
 278
 279 # Add tests
 280
 281 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 282
 283 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 284
 285 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)