source/wham/src/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for WHAM single chain version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_WHAM_SRC0
  11         wham_multparm.F
  12         bxread.F
  13         xread.F
  14         cxread.F
  15         enecalc1.F
  16         energy_p_new.F
  17         initialize_p.F
  18         molread_zs.F
  19         openunits.F
  20         readrtns.F
  21         arcos.f
  22         cartder.f
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.f
  25         geomout.F
  26         gnmr1.f
  27         icant.f
  28         intcor.f
  29         int_from_cart.f
  30         make_ensemble1.F
  31         matmult.f
  32         misc.f
  33         mygetenv.F
  34         parmread.F
  35         pinorm.f
  36         printmat.f
  37         rescode.f
  38         setup_var.f
  39         slices.F
  40         store_parm.F
  41         timing.F
  42         wham_calc1.F
  43         readrtns_compar.F
  44         readpdb.f
  45         fitsq.f
  46         contact.f
  47         elecont.f
  48         contfunc.f
  49         cont_frag.f
  50         conf_compar.F
  51         match_contact.f
  52         angnorm.f
  53         odlodc.f
  54         promienie.f
  55         qwolynes.f
  56         read_ref_str.F
  57         rmscalc.f
  58         secondary.f
  59         proc_cont.f
  60         define_pairs.f
  61         mysort.f
  62 )
  63
  64 set(UNRES_WHAM_PP_SRC
  65         bxread.F
  66         chainbuild.F
  67         conf_compar.F
  68         cxread.F
  69         enecalc1.F
  70         energy_p_new.F
  71         geomout.F
  72         initialize_p.F
  73         make_ensemble1.F
  74         molread_zs.F
  75         mygetenv.F
  76         openunits.F
  77         parmread.F
  78         read_ref_str.F
  79         readrtns_compar.F
  80         readrtns.F
  81         slices.F
  82         store_parm.F
  83         timing.F
  84         wham_calc1.F
  85         wham_multparm.F
  86         xread.F
  87         proc_proc.c
  88 )
  89
  90
  91 #================================================
  92 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  93 #================================================
  94 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  95   set(FFLAGS0 "-mcmodel=medium -g -CB -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
  96 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
  97   set(FFLAGS0 "-std=legacy -g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
  98 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  99
 100
 101 #=========================================
 102 # Add MPI compiler flags
 103 #=========================================
 104 if(UNRES_WITH_MPI)
 105   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 106 endif(UNRES_WITH_MPI)
 107
 108 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 109
 110 #=========================================
 111 #  Settings for GAB force field
 112 #=========================================
 113
 114 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 115   # set preprocesor flags
 116   set(CPPFLAGS "PROCOR  -DSPLITELE -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC  -DSCCORPDB" )
 117
 118 #=========================================
 119 #  Settings for E0LL2Y force field
 120 #=========================================
 121 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 122   # set preprocesor flags
 123   set(CPPFLAGS "PROCOR  -DSPLITELE -DSCCORPDB" )
 124 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 125
 126
 127 #=========================================
 128 # System specific flags
 129 #=========================================
 130 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 131   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 132 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 133
 134 #=========================================
 135 # Compiler specific flags
 136 #=========================================
 137
 138 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 139   # Add ifort preprocessor flags
 140   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 141 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 142   # Add new gfortran flags
 143   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 144 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 145   # Add old gfortran flags
 146   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 147 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 148
 149 #=========================================
 150 # Add MPI preprocessor flags
 151 #=========================================
 152 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI")
 153
 154 #=========================================
 155 # Add 64-bit specific preprocessor flags
 156 #=========================================
 157 if (architektura STREQUAL "64")
 158   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 159 endif (architektura STREQUAL "64")
 160
 161 #=========================================
 162 # Apply preprocesor flags to *.F files
 163 #=========================================
 164 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 165
 166
 167 #========================================
 168 #  Setting binary name
 169 #========================================
 170 set(UNRES_WHAM_BIN "wham_${Fortran_COMPILER_NAME}.exe")
 171
 172 #=========================================
 173 # cinfo.f workaround for CMake
 174 #=========================================
 175 # get the current date
 176 TODAY(DATE)
 177 # generate cinfo.f
 178
 179 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
 180 FILE(WRITE ${CINFO}
 181 "C CMake generated file
 182        subroutine cinfo
 183        include 'COMMON.IOUNITS'
 184        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 185        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 186 ")
 187
 188 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
 189 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
 190 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
 191 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
 192 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
 193 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
 194 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
 195
 196 FILE(APPEND ${CINFO}
 197 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 198        return
 199        end ")
 200
 201 # set include path
 202 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}" )
 203
 204 #=========================================
 205 # Set full unres CSA sources
 206 #=========================================
 207 set(UNRES_WHAM_SRCS ${UNRES_WHAM_SRC0} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
 208
 209 #=========================================
 210 # Build the binary
 211 #=========================================
 212 add_executable(UNRES_WHAM_BIN ${UNRES_WHAM_SRCS} )
 213 set_target_properties(UNRES_WHAM_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_BIN})
 214
 215 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 216 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 217
 218 #=========================================
 219 # Link libraries
 220 #=========================================
 221 # link MPI library (libmpich.a)
 222 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN ${MPIF_LIBRARIES} )
 223 # link libxdrf.a
 224 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN xdrf )
 225
 226 #=========================================
 227 # TESTS
 228 #=========================================
 229
 230 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 231 #SET(UNRES_TEST_FILES
 232 #       ala10.inp
 233 #    )
 234
 235 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 236 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 237 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 238 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 239 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 240 #          POST_BUILD
 241 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 242 #      )
 243 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 244
 245 #=========================================
 246 # Generate data test files
 247 #=========================================
 248 #  test_single_ala.sh
 249 #=========================================
 250
 251 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 252 #"#!/bin/sh
 253 #export POT=GB
 254 #export PREFIX=ala10
 255 #-----------------------------------------------------------------------------
 256 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 257 #-----------------------------------------------------------------------------
 258 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 259 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 260 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 261 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 262 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 263 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 264 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 265 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 266 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 267 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 268 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 269 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 270 #-----------------------------------------------------------------------------
 271 #$UNRES_BIN
 272 #")
 273
 274 #=========================================
 275 #  ala10.inp
 276 #=========================================
 277
 278 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 279 #"ala10 unblocked
 280 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 281 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 282 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 283 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 284 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 285 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 286 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 287 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 288 #12
 289 #XAAAAAAAAAAX
 290 # 0
 291 # 0
 292 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 293 #   90.0000   90.0000
 294 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 295 #  180.0000
 296 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 297 #  110.0000  110.0000
 298 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 299 # -120.0000 -120.0000
 300 #")
 301
 302
 303 # Add tests
 304
 305 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 306
 307 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 308
 309 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)