source/wham/src/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for WHAM single chain version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_WHAM_SRC0
  11         wham_multparm.F
  12         bxread.F
  13         xread.F
  14         cxread.F
  15         enecalc1.F
  16         energy_p_new.F
  17         initialize_p.F
  18         molread_zs.F
  19         openunits.F
  20         readrtns.F
  21         arcos.f
  22         cartder.f
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.f
  25         geomout.F
  26         gnmr1.f
  27         icant.f
  28         intcor.f
  29         int_from_cart.f
  30         make_ensemble1.F
  31         matmult.f
  32         misc.f
  33         mygetenv.F
  34         parmread.F
  35         pinorm.f
  36         printmat.f
  37         rescode.f
  38         setup_var.f
  39         slices.F
  40         store_parm.F
  41         timing.F
  42         wham_calc1.F
  43         readrtns_compar.F
  44         readpdb.f
  45         fitsq.f
  46         contact.f
  47         elecont.f
  48         contfunc.f
  49         cont_frag.f
  50         conf_compar.F
  51         match_contact.f
  52         angnorm.f
  53         odlodc.f
  54         promienie.f
  55         qwolynes.f
  56         read_ref_str.F
  57         rmscalc.f
  58         secondary.f
  59         proc_cont.f
  60         define_pairs.f
  61         mysort.f
  62 )
  63
  64 set(UNRES_WHAM_PP_SRC
  65         bxread.F
  66         chainbuild.F
  67         conf_compar.F
  68         cxread.F
  69         enecalc1.F
  70         energy_p_new.F
  71         geomout.F
  72         initialize_p.F
  73         make_ensemble1.F
  74         molread_zs.F
  75         mygetenv.F
  76         openunits.F
  77         parmread.F
  78         read_ref_str.F
  79         readrtns_compar.F
  80         readrtns.F
  81         slices.F
  82         store_parm.F
  83         timing.F
  84         wham_calc1.F
  85         wham_multparm.F
  86         xread.F
  87         proc_proc.c
  88 )
  89
  90
  91 #================================================
  92 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  93 #================================================
  94 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  95   set(FFLAGS0 "-mcmodel=medium -g -CB -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
  96 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
  97   set(FFLAGS0 "-g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
  98 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  99
 100
 101 #=========================================
 102 # Add MPI compiler flags
 103 #=========================================
 104 if(UNRES_WITH_MPI)
 105   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 106 endif(UNRES_WITH_MPI)
 107
 108 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 109
 110 #=========================================
 111 # WHAM preprocesor flags
 112 #=========================================
 113
 114 set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 115
 116 #=========================================
 117 # System specific flags
 118 #=========================================
 119 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 120   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 121 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 122
 123 #=========================================
 124 # Compiler specific flags
 125 #=========================================
 126
 127 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 128   # Add ifort preprocessor flags
 129   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 130 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 131   # Add new gfortran flags
 132   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 133 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 134   # Add old gfortran flags
 135   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 136 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 137
 138 #=========================================
 139 # Add MPI preprocessor flags
 140 #=========================================
 141 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI")
 142
 143 #=========================================
 144 # Add 64-bit specific preprocessor flags
 145 #=========================================
 146 if (architektura STREQUAL "64")
 147   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 148 endif (architektura STREQUAL "64")
 149
 150 #=========================================
 151 # Apply preprocesor flags to *.F files
 152 #=========================================
 153 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 154
 155
 156 #========================================
 157 #  Setting binary name
 158 #========================================
 159 set(UNRES_WHAM_BIN "wham_${Fortran_COMPILER_NAME}.exe")
 160
 161 #=========================================
 162 # cinfo.f workaround for CMake
 163 #=========================================
 164 # get current date
 165 TODAY(DATE)
 166 # generate cinfo.f
 167 FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 168 "C CMake generated file
 169        subroutine cinfo
 170        include 'COMMON.IOUNITS'
 171        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 172        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 173        write(iout,*)'Compiled ${DATE}'
 174        write(iout,*)'Compiled by $ENV{USER}@$ENV{HOST}'
 175        write(iout,*)'OS name: ${CMAKE_SYSTEM_NAME}'
 176        write(iout,*)'OS release: ${CMAKE_SYSTEM}'
 177        write(iout,*)'FC: ${CMAKE_Fortran_COMPILER}'
 178        write(iout,*)'MD Force field: ${UNRES_MD_FF}'
 179        write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 180        return
 181        end
 182 ")
 183 # set include path
 184 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}" )
 185
 186 #=========================================
 187 # Set full unres CSA sources
 188 #=========================================
 189 set(UNRES_WHAM_SRCS ${UNRES_WHAM_SRC0} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
 190
 191 #=========================================
 192 # Build the binary
 193 #=========================================
 194 add_executable(UNRES_WHAM_BIN ${UNRES_WHAM_SRCS} )
 195 set_target_properties(UNRES_WHAM_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_BIN})
 196
 197 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 198 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 199
 200 #=========================================
 201 # Link libraries
 202 #=========================================
 203 # link MPI library (libmpich.a)
 204 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN ${MPIF_LIBRARIES} )
 205 # link libxdrf.a
 206 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN xdrf )
 207
 208 #=========================================
 209 # TESTS
 210 #=========================================
 211
 212 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 213 #SET(UNRES_TEST_FILES
 214 #       ala10.inp
 215 #    )
 216
 217 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 218 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 219 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 220 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 221 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 222 #          POST_BUILD
 223 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 224 #      )
 225 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 226
 227 #=========================================
 228 # Generate data test files
 229 #=========================================
 230 #  test_single_ala.sh
 231 #=========================================
 232
 233 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 234 #"#!/bin/sh
 235 #export POT=GB
 236 #export PREFIX=ala10
 237 #-----------------------------------------------------------------------------
 238 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 239 #-----------------------------------------------------------------------------
 240 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 241 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 242 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 243 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 244 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 245 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 246 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 247 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 248 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 249 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 250 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 251 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 252 #-----------------------------------------------------------------------------
 253 #$UNRES_BIN
 254 #")
 255
 256 #=========================================
 257 #  ala10.inp
 258 #=========================================
 259
 260 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 261 #"ala10 unblocked
 262 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 263 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 264 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 265 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 266 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 267 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 268 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 269 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 270 #12
 271 #XAAAAAAAAAAX
 272 # 0
 273 # 0
 274 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 275 #   90.0000   90.0000
 276 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 277 #  180.0000
 278 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 279 #  110.0000  110.0000
 280 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 281 # -120.0000 -120.0000
 282 #")
 283
 284
 285 # Add tests
 286
 287 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 288
 289 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 290
 291 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)