source/wham/src/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for WHAM single chain version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_WHAM_SRC0
  11         wham_multparm.F
  12         bxread.F
  13         xread.F
  14         cxread.F
  15         enecalc1.F
  16         energy_p_new.F
  17         initialize_p.F
  18         molread_zs.F
  19         openunits.F
  20         readrtns.F
  21         arcos.f
  22         cartder.f
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.f
  25         geomout.F
  26         icant.f
  27         intcor.f
  28         int_from_cart.f
  29         make_ensemble1.F
  30         matmult.f
  31         misc.f
  32         mygetenv.F
  33         parmread.F
  34         pinorm.f
  35         printmat.f
  36         rescode.f
  37         setup_var.f
  38         slices.F
  39         store_parm.F
  40         timing.F
  41         wham_calc1.F
  42         readrtns_compar.F
  43         readpdb.f
  44         fitsq.f
  45         contact.f
  46         elecont.f
  47         contfunc.f
  48         cont_frag.f
  49         conf_compar.F
  50         match_contact.f
  51         angnorm.f
  52         odlodc.f
  53         promienie.f
  54         qwolynes.f
  55         read_ref_str.F
  56         rmscalc.f
  57         secondary.f
  58         proc_cont.f
  59         define_pairs.f
  60         mysort.f
  61 )
  62
  63 set(UNRES_WHAM_PP_SRC
  64         bxread.F
  65         chainbuild.F
  66         conf_compar.F
  67         cxread.F
  68         enecalc1.F
  69         energy_p_new.F
  70         geomout.F
  71         initialize_p.F
  72         make_ensemble1.F
  73         molread_zs.F
  74         mygetenv.F
  75         openunits.F
  76         parmread.F
  77         read_ref_str.F
  78         readrtns_compar.F
  79         readrtns.F
  80         slices.F
  81         store_parm.F
  82         timing.F
  83         wham_calc1.F
  84         wham_multparm.F
  85         xread.F
  86         proc_proc.c
  87 )
  88
  89
  90 #================================================
  91 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  92 #================================================
  93 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  94   set(FFLAGS0 "-mcmodel=medium -g -CB -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
  95 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
  96   set(FFLAGS0 "-g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
  97 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  98
  99
 100 #=========================================
 101 # Add MPI compiler flags
 102 #=========================================
 103 if(UNRES_WITH_MPI)
 104   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 105 endif(UNRES_WITH_MPI)
 106
 107 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 108
 109 #=========================================
 110 # WHAM preprocesor flags
 111 #=========================================
 112
 113 set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 114
 115 #=========================================
 116 # System specific flags
 117 #=========================================
 118 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 119   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 120 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 121
 122 #=========================================
 123 # Compiler specific flags
 124 #=========================================
 125
 126 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 127   # Add ifort preprocessor flags
 128   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 129 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 130   # Add new gfortran flags
 131   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 132 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 133   # Add old gfortran flags
 134   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 135 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 136
 137 #=========================================
 138 # Add MPI preprocessor flags
 139 #=========================================
 140 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI")
 141
 142 #=========================================
 143 # Add 64-bit specific preprocessor flags
 144 #=========================================
 145 if (architektura STREQUAL "64")
 146   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 147 endif (architektura STREQUAL "64")
 148
 149 #=========================================
 150 # Apply preprocesor flags to *.F files
 151 #=========================================
 152 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 153
 154
 155 #========================================
 156 #  Setting binary name
 157 #========================================
 158 set(UNRES_WHAM_BIN "wham_${Fortran_COMPILER_NAME}.exe")
 159
 160 #=========================================
 161 # cinfo.f stupid workaround for cmake
 162 #  - shame on me ]:)
 163 #=========================================
 164 set_property(SOURCE compinfo.c PROPERTY CMAKE_C_FLAGS "-c" )
 165 add_executable(compinfo-wham compinfo.c)
 166 set_target_properties(compinfo-wham PROPERTIES OUTPUT_NAME compinfo)
 167
 168 set(UNRES_CINFO_DIR "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}" )
 169 add_custom_command(OUTPUT ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 170         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/cinfo.f ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 171         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/COMMON.IOUNITS ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/COMMON.IOUNITS
 172         COMMAND ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/compinfo | true
 173         DEPENDS compinfo-wham )
 174 set_property(SOURCE ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 175
 176 #=========================================
 177 # Set full unres CSA sources
 178 #=========================================
 179 set(UNRES_WHAM_SRCS ${UNRES_WHAM_SRC0} ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
 180
 181 #=========================================
 182 # Build the binary
 183 #=========================================
 184 add_executable(UNRES_WHAM_BIN ${UNRES_WHAM_SRCS} )
 185 set_target_properties(UNRES_WHAM_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_BIN})
 186
 187 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 188 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 189
 190 #=========================================
 191 # Link libraries
 192 #=========================================
 193 # link MPI library (libmpich.a)
 194 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN ${MPIF_LIBRARIES} )
 195 # link libxdrf.a
 196 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN xdrf )
 197
 198 #=========================================
 199 # TESTS
 200 #=========================================
 201
 202 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 203 #SET(UNRES_TEST_FILES
 204 #       ala10.inp
 205 #    )
 206
 207 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 208 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 209 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 210 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 211 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 212 #          POST_BUILD
 213 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 214 #      )
 215 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 216
 217 #=========================================
 218 # Generate data test files
 219 #=========================================
 220 #  test_single_ala.sh
 221 #=========================================
 222
 223 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 224 #"#!/bin/sh
 225 #export POT=GB
 226 #export PREFIX=ala10
 227 #-----------------------------------------------------------------------------
 228 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 229 #-----------------------------------------------------------------------------
 230 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 231 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 232 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 233 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 234 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 235 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 236 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 237 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 238 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 239 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 240 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 241 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 242 #-----------------------------------------------------------------------------
 243 #$UNRES_BIN
 244 #")
 245
 246 #=========================================
 247 #  ala10.inp
 248 #=========================================
 249
 250 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 251 #"ala10 unblocked
 252 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 253 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 254 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 255 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 256 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 257 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 258 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 259 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 260 #12
 261 #XAAAAAAAAAAX
 262 # 0
 263 # 0
 264 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 265 #   90.0000   90.0000
 266 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 267 #  180.0000
 268 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 269 #  110.0000  110.0000
 270 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 271 # -120.0000 -120.0000
 272 #")
 273
 274
 275 # Add tests
 276
 277 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 278
 279 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 280
 281 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)