source/wham/src/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for WHAM single chain version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_WHAM_SRC0
  11         wham_multparm.F
  12         bxread.F
  13         xread.F
  14         cxread.F
  15         enecalc1.F
  16         energy_p_new.F
  17         initialize_p.F
  18         molread_zs.F
  19         openunits.F
  20         readrtns.F
  21         arcos.f
  22         cartder.f
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.f
  25         geomout.F
  26         gnmr1.f
  27         icant.f
  28         intcor.f
  29         int_from_cart.f
  30         make_ensemble1.F
  31         matmult.f
  32         misc.f
  33         mygetenv.F
  34         parmread.F
  35         pinorm.f
  36         printmat.f
  37         rescode.f
  38         setup_var.f
  39         slices.F
  40         ssMD.F
  41         store_parm.F
  42         timing.F
  43         wham_calc1.F
  44         readrtns_compar.F
  45         readpdb.f
  46         fitsq.f
  47         contact.f
  48         elecont.f
  49         contfunc.f
  50         cont_frag.f
  51         conf_compar.F
  52         match_contact.f
  53         angnorm.f
  54         odlodc.f
  55         promienie.f
  56         qwolynes.f
  57         read_ref_str.F
  58         rmscalc.f
  59         secondary.f
  60         proc_cont.f
  61         define_pairs.f
  62         mysort.f
  63 )
  64
  65 set(UNRES_WHAM_PP_SRC
  66         bxread.F
  67         chainbuild.F
  68         conf_compar.F
  69         cxread.F
  70         enecalc1.F
  71         energy_p_new.F
  72         geomout.F
  73         initialize_p.F
  74         make_ensemble1.F
  75         molread_zs.F
  76         mygetenv.F
  77         openunits.F
  78         parmread.F
  79         read_ref_str.F
  80         readrtns_compar.F
  81         readrtns.F
  82         slices.F
  83         ssMD.F
  84         store_parm.F
  85         timing.F
  86         wham_calc1.F
  87         wham_multparm.F
  88         xread.F
  89         proc_proc.c
  90 )
  91
  92
  93 #================================================
  94 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  95 #================================================
  96 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  97   set(FFLAGS0 "-mcmodel=large -g -CB -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
  98 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
  99   set(FFLAGS0 "-std=legacy -g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
 100 else ()
 101   set(FFLAGS0 "-g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
 102 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 103
 104
 105 #=========================================
 106 # Add MPI compiler flags
 107 #=========================================
 108 if(UNRES_WITH_MPI)
 109   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 110 endif(UNRES_WITH_MPI)
 111
 112 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 113
 114 #=========================================
 115 #  Settings for GAB force field
 116 #=========================================
 117
 118 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 119   # set preprocesor flags
 120   set(CPPFLAGS "PROCOR -DSPLITELE -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC  -DSCCORPDB" )
 121
 122 #=========================================
 123 #  Settings for E0LL2Y force field
 124 #=========================================
 125 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 126   # set preprocesor flags
 127   set(CPPFLAGS "PROCOR  -DSPLITELE -DSCCORPDB" )
 128 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 129
 130
 131 #=========================================
 132 # Additional flags
 133 #=========================================
 134 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DUNRES -DISNAN -DWHAM ")
 135
 136
 137 #=========================================
 138 # System specific flags
 139 #=========================================
 140 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 141   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 142 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 143
 144 #=========================================
 145 # Compiler specific flags
 146 #=========================================
 147
 148 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 149   # Add ifort preprocessor flags
 150   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 151 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 152   # Add new gfortran flags
 153   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 154 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 155   # Add old gfortran flags
 156   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 157 else (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 158   # Default preprocessor flags
 159   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 160 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 161
 162 #=========================================
 163 # Add MPI preprocessor flags
 164 #=========================================
 165 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI")
 166
 167 #=========================================
 168 # Add 64-bit specific preprocessor flags
 169 #=========================================
 170 if (architektura STREQUAL "64")
 171   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 172 endif (architektura STREQUAL "64")
 173
 174 #=========================================
 175 # Apply preprocesor flags to *.F files
 176 #=========================================
 177 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 178
 179
 180 #========================================
 181 #  Setting binary name
 182 #========================================
 183 set(UNRES_WHAM_BIN "wham_${Fortran_COMPILER_NAME}_${UNRES_MD_FF}.exe")
 184
 185 #=========================================
 186 # cinfo.f workaround for CMake
 187 #=========================================
 188 # get the current date
 189 TODAY(DATE)
 190 # generate cinfo.f
 191
 192 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
 193 FILE(WRITE ${CINFO}
 194 "C CMake generated file
 195        subroutine cinfo
 196        include 'COMMON.IOUNITS'
 197        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 198        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 199 ")
 200
 201 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
 202 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
 203 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
 204 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
 205 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
 206 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
 207 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
 208
 209 FILE(APPEND ${CINFO}
 210 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 211        return
 212        end ")
 213
 214 # set include path
 215 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}" )
 216
 217 #=========================================
 218 # Set full unres CSA sources
 219 #=========================================
 220 set(UNRES_WHAM_SRCS ${UNRES_WHAM_SRC0} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
 221
 222 #=========================================
 223 # Build the binary
 224 #=========================================
 225 add_executable(UNRES_WHAM_BIN ${UNRES_WHAM_SRCS} )
 226 set_target_properties(UNRES_WHAM_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_BIN})
 227 set_property(TARGET UNRES_WHAM_BIN PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin )
 228 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 229
 230 #=========================================
 231 # Link libraries
 232 #=========================================
 233 # link MPI libraries
 234 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN ${MPI_Fortran_LIBRARIES} )
 235 # link libxdrf.a
 236 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN xdrf )
 237
 238 #=========================================
 239 # Install Path
 240 #=========================================
 241 install(TARGETS UNRES_WHAM_BIN DESTINATION ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/wham)
 242
 243
 244 #=========================================
 245 # TESTS
 246 #=========================================
 247
 248 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 249 #SET(UNRES_TEST_FILES
 250 #       ala10.inp
 251 #    )
 252
 253 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 254 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 255 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 256 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 257 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 258 #          POST_BUILD
 259 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 260 #      )
 261 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 262
 263 #=========================================
 264 # Generate data test files
 265 #=========================================
 266 #  test_single_ala.sh
 267 #=========================================
 268
 269 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 270 #"#!/bin/sh
 271 #export POT=GB
 272 #export PREFIX=ala10
 273 #-----------------------------------------------------------------------------
 274 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 275 #-----------------------------------------------------------------------------
 276 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 277 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 278 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 279 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 280 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 281 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 282 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 283 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 284 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 285 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 286 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 287 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 288 #-----------------------------------------------------------------------------
 289 #$UNRES_BIN
 290 #")
 291
 292 #=========================================
 293 #  ala10.inp
 294 #=========================================
 295
 296 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 297 #"ala10 unblocked
 298 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 299 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 300 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 301 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 302 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 303 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 304 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 305 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 306 #12
 307 #XAAAAAAAAAAX
 308 # 0
 309 # 0
 310 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 311 #   90.0000   90.0000
 312 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 313 #  180.0000
 314 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 315 #  110.0000  110.0000
 316 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 317 # -120.0000 -120.0000
 318 #")
 319
 320
 321 # Add tests
 322
 323 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 324
 325 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 326
 327 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)