source/wham/src-M/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for WHAM multichain version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_WHAM_M_SRC0
  11         wham_multparm.F
  12         bxread.F
  13         xread.F
  14         cxread.F
  15         enecalc1.F
  16         energy_p_new.F
  17         initialize_p.F
  18         molread_zs.F
  19         openunits.F
  20         readrtns.F
  21         arcos.f
  22         cartder.f
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.F
  25         geomout.F
  26         gnmr1.f
  27         icant.f
  28         intcor.f
  29         int_from_cart.f
  30         make_ensemble1.F
  31         matmult.f
  32         misc.f
  33         mygetenv.F
  34         parmread.F
  35         permut.F
  36         pinorm.f
  37         printmat.f
  38         rescode.f
  39         setup_var.f
  40         slices.F
  41         store_parm.F
  42         timing.F
  43         wham_calc1.F
  44         readrtns_compar.F
  45         read_dist_constr.F
  46         readpdb.f
  47         fitsq.f
  48         contact.f
  49         elecont.f
  50         contfunc.f
  51         cont_frag.f
  52         conf_compar.F
  53         match_contact.f
  54         angnorm.f
  55         odlodc.f
  56         promienie.f
  57         qwolynes.f
  58         read_ref_str.F
  59         rmscalc.f
  60         secondary.f
  61         proc_cont.f
  62         define_pairs.f
  63         mysort.f
  64 )
  65
  66 set(UNRES_WHAM_M_PP_SRC
  67         bxread.F
  68         chainbuild.F
  69         conf_compar.F
  70         cxread.F
  71         enecalc1.F
  72         energy_p_new.F
  73         geomout.F
  74         initialize_p.F
  75         make_ensemble1.F
  76         molread_zs.F
  77         mygetenv.F
  78         openunits.F
  79         parmread.F
  80         permut.F
  81         read_ref_str.F
  82         read_dist_constr.F
  83         readrtns_compar.F
  84         readrtns.F
  85         slices.F
  86         store_parm.F
  87         timing.F
  88         wham_calc1.F
  89         wham_multparm.F
  90         xread.F
  91         proc_proc.c
  92 )
  93
  94
  95 #================================================
  96 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  97 #================================================
  98 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  99   set(FFLAGS0 "-g -CB -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}" )
 100 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 101   set(FFLAGS0 "-g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}" )
 102 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 103
 104
 105 #=========================================
 106 # Add MPI compiler flags
 107 #=========================================
 108 if(UNRES_WITH_MPI)
 109   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 110 endif(UNRES_WITH_MPI)
 111
 112 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_M_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 113
 114 #=========================================
 115 # WHAM preprocesor flags
 116 #=========================================
 117
 118 set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 119
 120 #=========================================
 121 # System specific flags
 122 #=========================================
 123 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 124   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 125 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 126
 127 #=========================================
 128 # Compiler specific flags
 129 #=========================================
 130
 131 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 132   # Add ifort preprocessor flags
 133   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 134 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 135   # Add new gfortran flags
 136   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 137 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 138   # Add old gfortran flags
 139   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 140 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 141
 142 #=========================================
 143 # Add MPI preprocessor flags
 144 #=========================================
 145 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI")
 146
 147 #=========================================
 148 # Add 64-bit specific preprocessor flags
 149 #=========================================
 150 if (architektura STREQUAL "64")
 151   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 152 endif (architektura STREQUAL "64")
 153
 154 #=========================================
 155 # Apply preprocesor flags to *.F files
 156 #=========================================
 157 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_M_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 158
 159
 160 #========================================
 161 #  Setting binary name
 162 #========================================
 163 set(UNRES_WHAM_M_BIN "wham_${Fortran_COMPILER_NAME}.exe")
 164
 165 #=========================================
 166 # cinfo.f workaround for CMake
 167 #=========================================
 168 # get date
 169 TODAY(DATE)
 170 # getenerate cinfo.f
 171 FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 172 "C CMake generated file
 173        subroutine cinfo
 174        include 'COMMON.IOUNITS'
 175        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 176        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 177        write(iout,*)'Compiled ${DATE}'
 178        write(iout,*)'Compiled by $ENV{USER}@$ENV{HOST}'
 179        write(iout,*)'OS name: ${CMAKE_SYSTEM_NAME}'
 180        write(iout,*)'OS release: ${CMAKE_SYSTEM}'
 181        write(iout,*)'FC: ${CMAKE_Fortran_COMPILER}'
 182        write(iout,*)'Force field: ${UNRES_MD_FF}'
 183        write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 184        return
 185        end
 186 ")
 187 # set include paths
 188 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}"  )
 189
 190 #=========================================
 191 # Set full unres CSA sources
 192 #=========================================
 193 set(UNRES_WHAM_M_SRCS ${UNRES_WHAM_M_SRC0} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
 194
 195 #=========================================
 196 # Build the binary
 197 #=========================================
 198 add_executable(UNRES_WHAM_M_BIN ${UNRES_WHAM_M_SRCS} )
 199 set_target_properties(UNRES_WHAM_M_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_M_BIN})
 200
 201 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 202 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 203
 204 #=========================================
 205 # Link libraries
 206 #=========================================
 207 # link MPI library (libmpich.a)
 208 target_link_libraries( UNRES_WHAM_M_BIN ${MPIF_LIBRARIES} )
 209 # link libxdrf.a
 210 target_link_libraries( UNRES_WHAM_M_BIN xdrf )
 211
 212 #=========================================
 213 # TESTS
 214 #=========================================
 215
 216 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 217 #SET(UNRES_TEST_FILES
 218 #       ala10.inp
 219 #    )
 220
 221 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 222 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 223 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 224 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 225 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 226 #          POST_BUILD
 227 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 228 #      )
 229 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 230
 231 #=========================================
 232 # Generate data test files
 233 #=========================================
 234 #  test_single_ala.sh
 235 #=========================================
 236
 237 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 238 #"#!/bin/sh
 239 #export POT=GB
 240 #export PREFIX=ala10
 241 #-----------------------------------------------------------------------------
 242 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 243 #-----------------------------------------------------------------------------
 244 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 245 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 246 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 247 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 248 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 249 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 250 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 251 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 252 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 253 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 254 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 255 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 256 #-----------------------------------------------------------------------------
 257 #$UNRES_BIN
 258 #")
 259
 260 #=========================================
 261 #  ala10.inp
 262 #=========================================
 263
 264 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 265 #"ala10 unblocked
 266 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 267 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 268 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 269 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 270 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 271 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 272 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 273 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 274 #12
 275 #XAAAAAAAAAAX
 276 # 0
 277 # 0
 278 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 279 #   90.0000   90.0000
 280 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 281 #  180.0000
 282 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 283 #  110.0000  110.0000
 284 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 285 # -120.0000 -120.0000
 286 #")
 287
 288
 289 # Add tests
 290
 291 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 292
 293 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 294
 295 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)