source/wham/src-M/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for WHAM multichain version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_WHAM_M_SRC0
  11         wham_multparm.F
  12         bxread.F
  13         xread.F
  14         cxread.F
  15         enecalc1.F
  16         energy_p_new.F
  17         initialize_p.F
  18         molread_zs.F
  19         openunits.F
  20         readrtns.F
  21         arcos.f
  22         cartder.f
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.F
  25         geomout.F
  26         gnmr1.f
  27         icant.f
  28         intcor.f
  29         int_from_cart.f
  30         make_ensemble1.F
  31         matmult.f
  32         misc.f
  33         mygetenv.F
  34         parmread.F
  35         permut.F
  36         pinorm.f
  37         printmat.f
  38         rescode.f
  39         setup_var.f
  40         slices.F
  41         store_parm.F
  42         timing.F
  43         wham_calc1.F
  44         readrtns_compar.F
  45         read_dist_constr.F
  46         readpdb.f
  47         fitsq.f
  48         contact.f
  49         elecont.f
  50         contfunc.f
  51         cont_frag.f
  52         conf_compar.F
  53         match_contact.f
  54         angnorm.f
  55         odlodc.f
  56         promienie.f
  57         qwolynes.f
  58         read_ref_str.F
  59         rmscalc.f
  60         secondary.f
  61         proc_cont.f
  62         define_pairs.f
  63         mysort.f
  64 )
  65
  66 set(UNRES_WHAM_M_PP_SRC
  67         bxread.F
  68         chainbuild.F
  69         conf_compar.F
  70         cxread.F
  71         enecalc1.F
  72         energy_p_new.F
  73         geomout.F
  74         initialize_p.F
  75         make_ensemble1.F
  76         molread_zs.F
  77         mygetenv.F
  78         openunits.F
  79         parmread.F
  80         permut.F
  81         read_ref_str.F
  82         read_dist_constr.F
  83         readrtns_compar.F
  84         readrtns.F
  85         slices.F
  86         store_parm.F
  87         timing.F
  88         wham_calc1.F
  89         wham_multparm.F
  90         xread.F
  91         proc_proc.c
  92 )
  93
  94
  95 #================================================
  96 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  97 #================================================
  98 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  99   set(FFLAGS0 "-g -CB -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}" )
 100 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 101   set(FFLAGS0 "-g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}" )
 102 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 103
 104
 105 #=========================================
 106 # Add MPI compiler flags
 107 #=========================================
 108 if(UNRES_WITH_MPI)
 109   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 110 endif(UNRES_WITH_MPI)
 111
 112 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_M_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 113
 114 #=========================================
 115 # WHAM preprocesor flags
 116 #=========================================
 117
 118 set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 119
 120 #=========================================
 121 # System specific flags
 122 #=========================================
 123 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 124   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 125 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 126
 127 #=========================================
 128 # Compiler specific flags
 129 #=========================================
 130
 131 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 132   # Add ifort preprocessor flags
 133   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 134 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 135   # Add new gfortran flags
 136   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 137 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 138   # Add old gfortran flags
 139   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 140 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 141
 142 #=========================================
 143 # Add MPI preprocessor flags
 144 #=========================================
 145 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI")
 146
 147 #=========================================
 148 # Add 64-bit specific preprocessor flags
 149 #=========================================
 150 if (architektura STREQUAL "64")
 151   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 152 endif (architektura STREQUAL "64")
 153
 154 #=========================================
 155 # Apply preprocesor flags to *.F files
 156 #=========================================
 157 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_M_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 158
 159
 160 #========================================
 161 #  Setting binary name
 162 #========================================
 163 set(UNRES_WHAM_M_BIN "wham_${Fortran_COMPILER_NAME}.exe")
 164
 165 #=========================================
 166 # cinfo.f stupid workaround for cmake
 167 #  - shame on me ]:)
 168 #=========================================
 169 set_property(SOURCE compinfo.c PROPERTY CMAKE_C_FLAGS "-c" )
 170 add_executable(compinfo-wham-m compinfo.c)
 171 set_target_properties(compinfo-wham-m PROPERTIES OUTPUT_NAME compinfo)
 172
 173 set(UNRES_CINFO_DIR "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}" )
 174 add_custom_command(OUTPUT ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 175         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/cinfo.f ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 176         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/COMMON.IOUNITS ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/COMMON.IOUNITS
 177         COMMAND ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/compinfo | true
 178         DEPENDS compinfo-wham-m )
 179 set_property(SOURCE ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 180
 181 #=========================================
 182 # Set full unres CSA sources
 183 #=========================================
 184 set(UNRES_WHAM_M_SRCS ${UNRES_WHAM_M_SRC0} ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
 185
 186 #=========================================
 187 # Build the binary
 188 #=========================================
 189 add_executable(UNRES_WHAM_M_BIN ${UNRES_WHAM_M_SRCS} )
 190 set_target_properties(UNRES_WHAM_M_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_M_BIN})
 191
 192 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 193 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 194
 195 #=========================================
 196 # Link libraries
 197 #=========================================
 198 # link MPI library (libmpich.a)
 199 target_link_libraries( UNRES_WHAM_M_BIN ${MPIF_LIBRARIES} )
 200 # link libxdrf.a
 201 target_link_libraries( UNRES_WHAM_M_BIN xdrf )
 202
 203 #=========================================
 204 # TESTS
 205 #=========================================
 206
 207 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 208 #SET(UNRES_TEST_FILES
 209 #       ala10.inp
 210 #    )
 211
 212 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 213 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 214 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 215 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 216 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 217 #          POST_BUILD
 218 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 219 #      )
 220 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 221
 222 #=========================================
 223 # Generate data test files
 224 #=========================================
 225 #  test_single_ala.sh
 226 #=========================================
 227
 228 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 229 #"#!/bin/sh
 230 #export POT=GB
 231 #export PREFIX=ala10
 232 #-----------------------------------------------------------------------------
 233 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 234 #-----------------------------------------------------------------------------
 235 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 236 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 237 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 238 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 239 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 240 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 241 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 242 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 243 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 244 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 245 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 246 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 247 #-----------------------------------------------------------------------------
 248 #$UNRES_BIN
 249 #")
 250
 251 #=========================================
 252 #  ala10.inp
 253 #=========================================
 254
 255 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 256 #"ala10 unblocked
 257 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 258 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 259 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 260 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 261 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 262 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 263 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 264 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 265 #12
 266 #XAAAAAAAAAAX
 267 # 0
 268 # 0
 269 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 270 #   90.0000   90.0000
 271 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 272 #  180.0000
 273 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 274 #  110.0000  110.0000
 275 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 276 # -120.0000 -120.0000
 277 #")
 278
 279
 280 # Add tests
 281
 282 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 283
 284 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 285
 286 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)