source/wham/src-M/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for WHAM multichain version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_WHAM_M_SRC0
  11         wham_multparm.F
  12         bxread.F
  13         xread.F
  14         cxread.F
  15         enecalc1.F
  16         energy_p_new.F
  17         initialize_p.F
  18         molread_zs.F
  19         openunits.F
  20         readrtns.F
  21         arcos.f
  22         cartder.f
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.F
  25         geomout.F
  26         gnmr1.f
  27         icant.f
  28         intcor.f
  29         int_from_cart.f
  30         make_ensemble1.F
  31         matmult.f
  32         misc.f
  33         mygetenv.F
  34         parmread.F
  35         permut.F
  36         pinorm.f
  37         printmat.f
  38         rescode.f
  39         setup_var.f
  40         slices.F
  41         store_parm.F
  42         timing.F
  43         wham_calc1.F
  44         readrtns_compar.F
  45         read_dist_constr.F
  46         readpdb.f
  47         fitsq.f
  48         contact.f
  49         elecont.f
  50         contfunc.f
  51         cont_frag.f
  52         conf_compar.F
  53         match_contact.f
  54         angnorm.f
  55         odlodc.f
  56         promienie.f
  57         qwolynes.f
  58         read_ref_str.F
  59         rmscalc.f
  60         secondary.f
  61         proc_cont.f
  62         define_pairs.f
  63         mysort.f
  64 )
  65
  66 set(UNRES_WHAM_M_PP_SRC
  67         bxread.F
  68         chainbuild.F
  69         conf_compar.F
  70         cxread.F
  71         enecalc1.F
  72         energy_p_new.F
  73         geomout.F
  74         initialize_p.F
  75         make_ensemble1.F
  76         molread_zs.F
  77         mygetenv.F
  78         openunits.F
  79         parmread.F
  80         permut.F
  81         read_ref_str.F
  82         read_dist_constr.F
  83         readrtns_compar.F
  84         readrtns.F
  85         slices.F
  86         store_parm.F
  87         timing.F
  88         wham_calc1.F
  89         wham_multparm.F
  90         xread.F
  91         proc_proc.c
  92 )
  93
  94
  95 #================================================
  96 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  97 #================================================
  98 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  99   set(FFLAGS0 "-g -CB -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}" )
 100 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 101   set(FFLAGS0 "-g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}" )
 102 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 103
 104
 105 #=========================================
 106 # Add MPI compiler flags
 107 #=========================================
 108 if(UNRES_WITH_MPI)
 109   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 110 endif(UNRES_WITH_MPI)
 111
 112 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_M_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 113
 114 #=========================================
 115 # WHAM preprocesor flags
 116 #=========================================
 117
 118 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 119   # set preprocesor flags
 120   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC  -DSCCORPDB" )
 121
 122 #=========================================
 123 #  Settings for E0LL2Y force field
 124 #=========================================
 125 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 126   # set preprocesor flags
 127   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DSCCORPDB" )
 128 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 129
 130 #=========================================
 131 # System specific flags
 132 #=========================================
 133 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 134   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 135 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 136
 137 #=========================================
 138 # Compiler specific flags
 139 #=========================================
 140
 141 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 142   # Add ifort preprocessor flags
 143   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 144 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 145   # Add new gfortran flags
 146   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 147 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 148   # Add old gfortran flags
 149   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 150 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 151
 152 #=========================================
 153 # Add MPI preprocessor flags
 154 #=========================================
 155 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI")
 156
 157 #=========================================
 158 # Add 64-bit specific preprocessor flags
 159 #=========================================
 160 if (architektura STREQUAL "64")
 161   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 162 endif (architektura STREQUAL "64")
 163
 164 #=========================================
 165 # Apply preprocesor flags to *.F files
 166 #=========================================
 167 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_M_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 168
 169
 170 #========================================
 171 #  Setting binary name
 172 #========================================
 173 set(UNRES_WHAM_M_BIN "wham_${Fortran_COMPILER_NAME}.exe")
 174
 175 #=========================================
 176 # cinfo.f stupid workaround for cmake
 177 #  - shame on me ]:)
 178 #=========================================
 179 set_property(SOURCE compinfo.c PROPERTY CMAKE_C_FLAGS "-c" )
 180 add_executable(compinfo-wham-m compinfo.c)
 181 set_target_properties(compinfo-wham-m PROPERTIES OUTPUT_NAME compinfo)
 182
 183 set(UNRES_CINFO_DIR "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}" )
 184 add_custom_command(OUTPUT ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 185         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/cinfo.f ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 186         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/COMMON.IOUNITS ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/COMMON.IOUNITS
 187         COMMAND ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/compinfo | true
 188         DEPENDS compinfo-wham-m )
 189 set_property(SOURCE ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 190
 191 #=========================================
 192 # Set full unres CSA sources
 193 #=========================================
 194 set(UNRES_WHAM_M_SRCS ${UNRES_WHAM_M_SRC0} ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
 195
 196 #=========================================
 197 # Build the binary
 198 #=========================================
 199 add_executable(UNRES_WHAM_M_BIN ${UNRES_WHAM_M_SRCS} )
 200 set_target_properties(UNRES_WHAM_M_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_M_BIN})
 201
 202 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 203 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 204
 205 #=========================================
 206 # Link libraries
 207 #=========================================
 208 # link MPI library (libmpich.a)
 209 target_link_libraries( UNRES_WHAM_M_BIN ${MPIF_LIBRARIES} )
 210 # link libxdrf.a
 211 target_link_libraries( UNRES_WHAM_M_BIN xdrf )
 212
 213 #=========================================
 214 # TESTS
 215 #=========================================
 216
 217 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 218 #SET(UNRES_TEST_FILES
 219 #       ala10.inp
 220 #    )
 221
 222 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 223 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 224 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 225 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 226 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 227 #          POST_BUILD
 228 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 229 #      )
 230 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 231
 232 #=========================================
 233 # Generate data test files
 234 #=========================================
 235 #  test_single_ala.sh
 236 #=========================================
 237
 238 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 239 #"#!/bin/sh
 240 #export POT=GB
 241 #export PREFIX=ala10
 242 #-----------------------------------------------------------------------------
 243 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 244 #-----------------------------------------------------------------------------
 245 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 246 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 247 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 248 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 249 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 250 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 251 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 252 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 253 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 254 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 255 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 256 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 257 #-----------------------------------------------------------------------------
 258 #$UNRES_BIN
 259 #")
 260
 261 #=========================================
 262 #  ala10.inp
 263 #=========================================
 264
 265 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 266 #"ala10 unblocked
 267 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 268 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 269 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 270 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 271 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 272 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 273 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 274 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 275 #12
 276 #XAAAAAAAAAAX
 277 # 0
 278 # 0
 279 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 280 #   90.0000   90.0000
 281 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 282 #  180.0000
 283 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 284 #  110.0000  110.0000
 285 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 286 # -120.0000 -120.0000
 287 #")
 288
 289
 290 # Add tests
 291
 292 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 293
 294 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 295
 296 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)