source/wham/src-M/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for WHAM multichain version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_WHAM_M_SRC0
  11         wham_multparm.F
  12         bxread.F
  13         xread.F
  14         cxread.F
  15         enecalc1.F
  16         energy_p_new.F
  17         initialize_p.F
  18         molread_zs.F
  19         openunits.F
  20         readrtns.F
  21         arcos.f
  22         cartder.f
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.F
  25         geomout.F
  26         gnmr1.f
  27         icant.f
  28         intcor.f
  29         int_from_cart.f
  30         make_ensemble1.F
  31         matmult.f
  32         misc.f
  33         mygetenv.F
  34         parmread.F
  35         permut.F
  36         pinorm.f
  37         printmat.f
  38         rescode.f
  39         setup_var.f
  40         slices.F
  41         store_parm.F
  42         timing.F
  43         wham_calc1.F
  44         readrtns_compar.F
  45         read_dist_constr.F
  46         readpdb.f
  47         fitsq.f
  48         contact.f
  49         elecont.f
  50         contfunc.f
  51         cont_frag.f
  52         conf_compar.F
  53         match_contact.f
  54         angnorm.f
  55         odlodc.f
  56         promienie.f
  57         qwolynes.f
  58         read_ref_str.F
  59         rmscalc.f
  60         secondary.f
  61         proc_cont.f
  62         define_pairs.f
  63         mysort.f
  64 )
  65
  66 set(UNRES_WHAM_M_PP_SRC
  67         bxread.F
  68         chainbuild.F
  69         conf_compar.F
  70         cxread.F
  71         enecalc1.F
  72         energy_p_new.F
  73         geomout.F
  74         initialize_p.F
  75         make_ensemble1.F
  76         molread_zs.F
  77         mygetenv.F
  78         openunits.F
  79         parmread.F
  80         permut.F
  81         read_ref_str.F
  82         read_dist_constr.F
  83         readrtns_compar.F
  84         readrtns.F
  85         slices.F
  86         store_parm.F
  87         timing.F
  88         wham_calc1.F
  89         wham_multparm.F
  90         xread.F
  91         proc_proc.c
  92 )
  93
  94
  95 #================================================
  96 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  97 #================================================
  98 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  99   set(FFLAGS0 "-g -CB -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}" )
 100 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 101   set(FFLAGS0 "-std=legacy -g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}" )
 102 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 103
 104
 105 #=========================================
 106 # Add MPI compiler flags
 107 #=========================================
 108 if(UNRES_WITH_MPI)
 109   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 110 endif(UNRES_WITH_MPI)
 111
 112 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_M_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 113
 114 #=========================================
 115 #  Settings for GAB force field
 116 #=========================================
 117 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 118   # set preprocesor flags
 119   set(CPPFLAGS "PROCOR  -DSPLITELE -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC  -DSCCORPDB" )
 120
 121 <<<<<<< HEAD
 122 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 123   # set preprocesor flags
 124   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC  -DSCCORPDB" )
 125
 126 =======
 127 >>>>>>> devel
 128 #=========================================
 129 #  Settings for E0LL2Y force field
 130 #=========================================
 131 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 132   # set preprocesor flags
 133 <<<<<<< HEAD
 134   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DSCCORPDB" )
 135 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 136 =======
 137   set(CPPFLAGS "PROCOR  -DSPLITELE -DSCCORPDB" )
 138 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 139
 140 #=========================================
 141 # Additional flags
 142 #=========================================
 143 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DUNRES -DISNAN")
 144 >>>>>>> devel
 145
 146 #=========================================
 147 # System specific flags
 148 #=========================================
 149 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 150   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 151 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 152
 153 #=========================================
 154 # Compiler specific flags
 155 #=========================================
 156
 157 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 158   # Add ifort preprocessor flags
 159   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 160 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 161   # Add new gfortran flags
 162   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 163 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 164   # Add old gfortran flags
 165   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 166 else (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 167   # Default preprocessor flags
 168   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 169 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 170
 171 #=========================================
 172 # Add MPI preprocessor flags
 173 #=========================================
 174 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI")
 175
 176 #=========================================
 177 # Add 64-bit specific preprocessor flags
 178 #=========================================
 179 if (architektura STREQUAL "64")
 180   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 181 endif (architektura STREQUAL "64")
 182
 183 #=========================================
 184 # Apply preprocesor flags to *.F files
 185 #=========================================
 186 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_M_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 187
 188
 189 #========================================
 190 #  Setting binary name
 191 #========================================
 192 set(UNRES_WHAM_M_BIN "wham_${Fortran_COMPILER_NAME}.exe")
 193
 194 #=========================================
 195 # cinfo.f workaround for CMake
 196 #=========================================
 197 # get the current date
 198 TODAY(DATE)
 199 # generate cinfo.f
 200
 201 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
 202 FILE(WRITE ${CINFO}
 203 "C CMake generated file
 204        subroutine cinfo
 205        include 'COMMON.IOUNITS'
 206        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 207        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 208 ")
 209
 210 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
 211 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
 212 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
 213 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
 214 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
 215 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
 216 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
 217
 218 FILE(APPEND ${CINFO}
 219 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 220        return
 221        end ")
 222
 223 # set include paths
 224 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}"  )
 225
 226 #=========================================
 227 # Set full unres CSA sources
 228 #=========================================
 229 set(UNRES_WHAM_M_SRCS ${UNRES_WHAM_M_SRC0} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
 230
 231 #=========================================
 232 # Build the binary
 233 #=========================================
 234 add_executable(UNRES_WHAM_M_BIN ${UNRES_WHAM_M_SRCS} )
 235 set_target_properties(UNRES_WHAM_M_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_M_BIN})
 236
 237 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 238 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 239
 240 #=========================================
 241 # Link libraries
 242 #=========================================
 243 # link MPI library (libmpich.a)
 244 target_link_libraries( UNRES_WHAM_M_BIN ${MPIF_LIBRARIES} )
 245 # link libxdrf.a
 246 target_link_libraries( UNRES_WHAM_M_BIN xdrf )
 247
 248 #=========================================
 249 # TESTS
 250 #=========================================
 251
 252 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 253 #SET(UNRES_TEST_FILES
 254 #       ala10.inp
 255 #    )
 256
 257 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 258 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 259 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 260 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 261 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 262 #          POST_BUILD
 263 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 264 #      )
 265 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 266
 267 #=========================================
 268 # Generate data test files
 269 #=========================================
 270 #  test_single_ala.sh
 271 #=========================================
 272
 273 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 274 #"#!/bin/sh
 275 #export POT=GB
 276 #export PREFIX=ala10
 277 #-----------------------------------------------------------------------------
 278 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 279 #-----------------------------------------------------------------------------
 280 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 281 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 282 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 283 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 284 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 285 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 286 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 287 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 288 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 289 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 290 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 291 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 292 #-----------------------------------------------------------------------------
 293 #$UNRES_BIN
 294 #")
 295
 296 #=========================================
 297 #  ala10.inp
 298 #=========================================
 299
 300 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 301 #"ala10 unblocked
 302 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 303 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 304 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 305 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 306 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 307 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 308 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 309 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 310 #12
 311 #XAAAAAAAAAAX
 312 # 0
 313 # 0
 314 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 315 #   90.0000   90.0000
 316 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 317 #  180.0000
 318 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 319 #  110.0000  110.0000
 320 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 321 # -120.0000 -120.0000
 322 #")
 323
 324
 325 # Add tests
 326
 327 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 328
 329 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 330
 331 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)