source/unres/src_MD-M/refsys.f

   1       subroutine refsys(i2,i3,i4,e1,e2,e3,fail)
   2 c This subroutine calculates unit vectors of a local reference system
   3 c defined by atoms (i2), (i3), and (i4). The x axis is the axis from
   4       implicit real*8 (a-h,o-z)
   5       include 'DIMENSIONS'
   6       include 'COMMON.IOUNITS'
   7       include "COMMON.CHAIN"
   8 c this subroutine calculates unity vectors of a local reference system
   9 c defined by atoms (i2), (i3), and (i4). the x axis is the axis from
  10 c atom (i3) to atom (i2), and the xy plane is the plane defined by atoms
  11 c (i2), (i3), and (i4). z axis is directed according to the sign of the
  12 c vector product (i3)-(i2) and (i3)-(i4). sets fail to .true. if atoms
  13 c (i2) and (i3) or (i3) and (i4) coincide or atoms (i2), (i3), and (i4)
  14 c form a linear fragment. returns vectors e1, e2, and e3.
  15       logical fail
  16       double precision e1(3),e2(3),e3(3)
  17       double precision u(3),z(3)
  18       double precision coinc/1.0D-13/,align /1.0D-13/
  19 c      print *,'just initialize'
  20       fail=.false.
  21 c      print *,fail
  22       s1=0.0
  23       s2=0.0
  24       print *,s1,s2
  25       do 1 i=1,3
  26       print *, i2,i3,i4
  27       zi=c(i,i2)-c(i,i3)
  28       ui=c(i,i4)-c(i,i3)
  29       print *,zi,ui
  30       s1=s1+zi*zi
  31       s2=s2+ui*ui
  32       z(i)=zi
  33     1 u(i)=ui
  34       s1=sqrt(s1)
  35       s2=sqrt(s2)
  36       if (s1.gt.coinc) goto 2
  37       write (iout,1000) i2,i3,i1
  38       fail=.true.
  39       return
  40     2 if (s2.gt.coinc) goto 4
  41       write(iout,1000) i3,i4,i1
  42       fail=.true.
  43       return
  44       print *,'two if pass'
  45     4 s1=1.0/s1
  46       s2=1.0/s2
  47       v1=z(2)*u(3)-z(3)*u(2)
  48       v2=z(3)*u(1)-z(1)*u(3)
  49       v3=z(1)*u(2)-z(2)*u(1)
  50       anorm=sqrt(v1*v1+v2*v2+v3*v3)
  51       if (anorm.gt.align) goto 6
  52       write (iout,1010) i2,i3,i4,i1
  53       fail=.true.
  54       return
  55     6 anorm=1.0/anorm
  56       e3(1)=v1*anorm
  57       e3(2)=v2*anorm
  58       e3(3)=v3*anorm
  59       e1(1)=z(1)*s1
  60       e1(2)=z(2)*s1
  61       e1(3)=z(3)*s1
  62       e2(1)=e1(3)*e3(2)-e1(2)*e3(3)
  63       e2(2)=e1(1)*e3(3)-e1(3)*e3(1)
  64       e2(3)=e1(2)*e3(1)-e1(1)*e3(2)
  65  1000 format (/1x,' * * * Error - atoms',i4,' and',i4,' coincide.',
  66      1 'coordinates of atom',i4,' are set to zero.')
  67  1010 format (/1x,' * * * Error - atoms',2(i4,2h, ),i4,' form a linear',
  68      1 ' fragment. coordinates of atom',i4,' are set to zero.')
  69       return
  70       end