source/unres/src_MD-M/refsys.f

   1       subroutine refsys(i2,i3,i4,e1,e2,e3,fail)
   2 c This subroutine calculates unit vectors of a local reference system
   3 c defined by atoms (i2), (i3), and (i4). The x axis is the axis from
   4       implicit real*8 (a-h,o-z)
   5       include 'DIMENSIONS'
   6 c this subroutine calculates unity vectors of a local reference system
   7 c defined by atoms (i2), (i3), and (i4). the x axis is the axis from
   8 c atom (i3) to atom (i2), and the xy plane is the plane defined by atoms
   9 c (i2), (i3), and (i4). z axis is directed according to the sign of the
  10 c vector product (i3)-(i2) and (i3)-(i4). sets fail to .true. if atoms
  11 c (i2) and (i3) or (i3) and (i4) coincide or atoms (i2), (i3), and (i4)
  12 c form a linear fragment. returns vectors e1, e2, and e3.
  13       logical fail
  14       double precision e1(3),e2(3),e3(3)
  15       double precision u(3),z(3)
  16       include 'COMMON.IOUNITS'
  17       double precision coinc/1.0D-13/,align /1.0D-13/
  18 c      print *,'just initialize'
  19       fail=.false.
  20 c      print *,fail
  21       s1=0.0
  22       s2=0.0
  23       print *,s1,s2
  24       do 1 i=1,3
  25       print *, i2,i3,i4
  26       zi=c(i,i2)-c(i,i3)
  27       ui=c(i,i4)-c(i,i3)
  28       print *,zi,ui
  29       s1=s1+zi*zi
  30       s2=s2+ui*ui
  31       z(i)=zi
  32     1 u(i)=ui
  33       s1=sqrt(s1)
  34       s2=sqrt(s2)
  35       if (s1.gt.coinc) goto 2
  36       write (iout,1000) i2,i3,i1
  37       fail=.true.
  38       return
  39     2 if (s2.gt.coinc) goto 4
  40       write(iout,1000) i3,i4,i1
  41       fail=.true.
  42       return
  43       print *,'two if pass'
  44     4 s1=1.0/s1
  45       s2=1.0/s2
  46       v1=z(2)*u(3)-z(3)*u(2)
  47       v2=z(3)*u(1)-z(1)*u(3)
  48       v3=z(1)*u(2)-z(2)*u(1)
  49       anorm=sqrt(v1*v1+v2*v2+v3*v3)
  50       if (anorm.gt.align) goto 6
  51       write (iout,1010) i2,i3,i4,i1
  52       fail=.true.
  53       return
  54     6 anorm=1.0/anorm
  55       e3(1)=v1*anorm
  56       e3(2)=v2*anorm
  57       e3(3)=v3*anorm
  58       e1(1)=z(1)*s1
  59       e1(2)=z(2)*s1
  60       e1(3)=z(3)*s1
  61       e2(1)=e1(3)*e3(2)-e1(2)*e3(3)
  62       e2(2)=e1(1)*e3(3)-e1(3)*e3(1)
  63       e2(3)=e1(2)*e3(1)-e1(1)*e3(2)
  64  1000 format (/1x,' * * * Error - atoms',i4,' and',i4,' coincide.',
  65      1 'coordinates of atom',i4,' are set to zero.')
  66  1010 format (/1x,' * * * Error - atoms',2(i4,2h, ),i4,' form a linear',
  67      1 ' fragment. coordinates of atom',i4,' are set to zero.')
  68       return
  69       end