added source code
[unres.git] / source / unres / src_MD-M / Makefile-biosim
1 #CPPFLAGS =  -WF,-DOLD_GINV \
2             -WF,-DUNRES -WF,-DMP -WF,-DMPI \
3             -WF,-DSPLITELE -WF,-DISNAN \
4             -WF,-DAIX -WF,-DLANG0 -WF,-DPROCOR
5 #
6 INSTALL_DIR = /opt/mpich-pgi
7 CC = cc
8 FC=mpif90
9 PGI=/opt/pgi
10 #OPT =  -fast -pc 64 -tp p6  \
11 #-Minline=name:scalar2,scalar,transpose2,matvec2,prodmat3
12 OPT =  -fast 
13
14 OPT1 = -fast
15 #OPT = -C -g
16 #OPT1 = -C -g
17
18 # -Mvect <---slows down
19 #        -Minline=name:matmat2 <---false convergence
20
21 FFLAGS = -c ${OPT} -I$(INSTALL_DIR)/include 
22 FFLAGS1 = -c ${OPT1} -I$(INSTALL_DIR)/include
23 FFLAGSE = ${FFLAGS}
24 FFLAGS2 = ${FFLAGS}
25
26 BIN = /home/aliwo/UNRES/MD/bin/unres_MD_Tc-new-fg.exe
27 LIBS = ../src_Tc_cache/xdrf_new/libxdrf.a
28 #LIBS=-lmpichfsup
29 CPPFLAGS = -DLINUX -DUNRES -DMP -DMPI -DPGI -DSPLITELE -DPROCOR -DOLD_GINV -DLANG0
30 CFLAGS = -DLINUX -DPGI -c
31
32 ARCH = LINUX
33 PP = /lib/cpp -P
34
35
36 all: unres
37
38 .SUFFIXES: .F
39 .F.o:
40         ${FC} ${FFLAGS}  ${CPPFLAGS} $*.F
41
42
43 object = unres.o arcos.o cartprint.o chainbuild.o convert.o initialize_p.o \
44         matmult.o readrtns_CSA.o parmread.o gen_rand_conf.o printmat.o map.o \
45         pinorm.o randgens.o rescode.o intcor.o timing.o misc.o intlocal.o \
46         cartder.o checkder_p.o econstr_local.o energy_p_new.o gradient_p.o minimize_p.o sumsld.o \
47         cored.o rmdd.o geomout.o readpdb.o regularize.o thread.o fitsq.o mcm.o \
48         mc.o bond_move.o refsys.o check_sc_distr.o check_bond.o contact.o djacob.o \
49         eigen.o blas.o add.o entmcm.o minim_mcmf.o \
50         together.o csa.o minim_jlee.o shift.o diff12.o bank.o newconf.o ran.o \
51         indexx.o MP.o compare_s1.o prng.o \
52         test.o banach.o distfit.o rmsd.o elecont.o dihed_cons.o \
53         sc_move.o local_move.o \
54         intcartderiv.o lagrangian_lesyng.o\
55         stochfric.o kinetic_lesyng.o MD.o moments.o int_to_cart.o \
56         surfatom.o sort.o muca_md.o MREMD.o rattle.o gauss.o energy_split.o \
57         q_measure.o gnmr1.o
58
59 unres: ${object} proc_proc.o
60         cc -o compinfo compinfo.c 
61         ./compinfo | true
62         ${FC} ${FFLAGS} cinfo.f
63         ${FC} ${OPT} ${object} proc_proc.o cinfo.o ${LIBS}  -o ${BIN}
64
65
66 clean:
67         /bin/rm *.o
68
69 newconf.o: newconf.f
70         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} newconf.f
71
72 bank.o: bank.F
73         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} bank.F
74
75 diff12.o: diff12.f
76         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} diff12.f
77
78 csa.o: csa.f
79         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} csa.f
80
81 shift.o: shift.F
82         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} shift.F
83
84 ran.o: ran.f
85         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ran.f
86
87 together.o: together.F
88         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} together.F
89
90 test.o: test.F
91         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} test.F
92
93 chainbuild.o: chainbuild.F
94         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} chainbuild.F
95
96 matmult.o: matmult.f
97         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} matmult.f
98
99 parmread.o : parmread.F
100         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} parmread.F
101
102 intcor.o : intcor.f
103         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} intcor.f
104
105 cartder.o : cartder.F
106         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} cartder.F
107
108 readpdb.o : readpdb.f
109         ${FC} ${FFLAGS2} ${CPPFLAGS} readpdb.f
110
111 sumsld.o : sumsld.f
112         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} sumsld.f
113         
114 cored.o : cored.f
115         ${FC} ${FFLAGS1} ${CPPFLAGS} cored.f
116  
117 rmdd.o : rmdd.f
118         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} rmdd.f
119
120 energy_p_new.o : energy_p_new.F
121         ${FC} ${FFLAGSE} ${CPPFLAGS} energy_p_new.F
122
123 lagrangian_lesyng.o : lagrangian_lesyng.F
124         ${FC} ${FFLAGSE} ${CPPFLAGS} lagrangian_lesyng.F
125
126 proc_proc.o: proc_proc.c
127         ${CC} ${CFLAGS} proc_proc.c