source/unres/src_MD-M/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for UNRES with MD for single chains
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # build the xdrf library
   9 #================================
  10 #add_subdirectory(xdrf)
  11
  12 #================================
  13 # Set source file lists
  14 #================================
  15 set(UNRES_MDM_SRC0
  16         add.f
  17         arcos.f
  18         banach.f
  19         bank.F
  20         blas.f
  21         bond_move.f
  22         cartder.F
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.F
  25         check_bond.f
  26         checkder_p.F
  27         check_sc_distr.f
  28         compare_s1.F
  29         contact.f
  30         convert.f
  31         cored.f
  32         csa.f
  33         dihed_cons.F
  34         diff12.f
  35         distfit.f
  36         djacob.f
  37         econstr_local.F
  38         eigen.f
  39         elecont.f
  40         energy_split-sep.F
  41         entmcm.F
  42         fitsq.f
  43         gauss.f
  44         gen_rand_conf.F
  45         geomout.F
  46         gnmr1.f
  47         indexx.f
  48         initialize_p.F
  49         intcartderiv.F
  50         intcor.f
  51         intlocal.f
  52         int_to_cart.f
  53         kinetic_lesyng.f
  54         lagrangian_lesyng.F
  55         local_move.f
  56         map.f
  57         matmult.f
  58         mc.F
  59         mcm.F
  60         MD_A-MTS.F
  61         minimize_p.F
  62         minim_jlee.F
  63         minim_mcmf.F
  64         misc.f
  65         moments.f
  66         MP.F
  67         MREMD.F
  68         muca_md.f
  69         newconf.f
  70         parmread.F
  71         permut.F
  72         pinorm.f
  73         printmat.f
  74         q_measure.F
  75         ran.f
  76         randgens.f
  77         rattle.F
  78         readpdb.F
  79         readrtns_CSA.F
  80         refsys.f
  81         regularize.F
  82         rescode.f
  83         rmdd.f
  84         rmsd.F
  85         sc_move.F
  86         shift.F
  87         sort.f
  88         stochfric.F
  89         sumsld.f
  90         surfatom.f
  91         test.F
  92         thread.F
  93         timing.F
  94         together.F
  95         unres.F
  96 )
  97
  98 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  99   set(UNRES_MDM_SRC0 ${UNRES_MDM_SRC0} prng.f )
 100 elseif(Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "mpif90")
 101   set(UNRES_MDM_SRC0 ${UNRES_MDM_SRC0} prng.f )
 102 else()
 103   set(UNRES_MDM_SRC0 ${UNRES_MDM_SRC0} prng_32.F )
 104 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 105
 106
 107 set(UNRES_MDM_SRC3 energy_p_new_barrier.F energy_p_new-sep_barrier.F gradient_p.F )
 108
 109 set(UNRES_MDM_PP_SRC
 110         bank.F
 111         cartder.F
 112         chainbuild.F
 113         checkder_p.F
 114         compare_s1.F
 115         cored.f
 116         csa.f
 117         dihed_cons.F
 118         diff12.f
 119         econstr_local.F
 120         energy_p_new.F
 121         energy_p_new_barrier.F
 122         energy_p_new-sep_barrier.F
 123         energy_split-sep.F
 124         entmcm.F
 125         gen_rand_conf.F
 126         geomout.F
 127         gradient_p.F
 128         intcor.f
 129         initialize_p.F
 130         intcartderiv.F
 131         lagrangian_lesyng.F
 132         matmult.f
 133         mc.F
 134         mcm.F
 135         MD_A-MTS.F
 136         minimize_p.F
 137         minim_jlee.F
 138         minim_mcmf.F
 139         MP.F
 140         MREMD.F
 141         newconf.f
 142         parmread.F
 143         permut.F
 144         q_measure1.F
 145         q_measure3.F
 146         q_measure.F
 147         ran.f
 148         rattle.F
 149         readpdb.F
 150         readrtns_CSA.F
 151         regularize.F
 152         rmdd.f
 153         rmsd.F
 154         sc_move.F
 155         shift.F
 156         stochfric.F
 157         sumsld.f
 158         test.F
 159         thread.F
 160         timing.F
 161         together.F
 162         unres.F
 163         proc_proc.c
 164 )
 165
 166
 167 if(NOT Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 168   set(UNRES_MDM_PP_SRC "${UNRES_MDM_PP_SRC} prng_32.F")
 169 endif(NOT Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 170
 171
 172 #================================================
 173 # Set comipiler flags for different sourcefiles
 174 #================================================
 175 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 176   set(FFLAGS0 "-ip -w" )
 177   set(FFLAGS1 "-w -g -d2 -CA -CB" )
 178   set(FFLAGS2 "-w -g -00 ")
 179   set(FFLAGS3 "-w -ipo " )
 180 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 181   set(FFLAGS0 "-std=legacy -I. " )
 182   set(FFLAGS1 "-std=legacy -g -I. " )
 183   set(FFLAGS2 "-std=legacy -I. ")
 184   set(FFLAGS3 "-std=legacy -I. " )
 185 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 186
 187
 188 # Add MPI compiler flags
 189 if(UNRES_WITH_MPI)
 190   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 191   set(FFLAGS1 "${FFLAGS1} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 192   set(FFLAGS2 "${FFLAGS2} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 193   set(FFLAGS3 "${FFLAGS3} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 194 endif(UNRES_WITH_MPI)
 195
 196 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_SRC0} APPEND PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 197 #set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC1} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS1} )
 198 #set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC2} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS2} )
 199 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_SRC3} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS3} )
 200
 201 #=========================================
 202 # Settings for GAB force field
 203 #=========================================
 204 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 205   # set preprocesor flags
 206   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 207
 208 #=========================================
 209 #  Settings for E0LL2Y force field
 210 #=========================================
 211 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 212   # set preprocesor flags
 213   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0" )
 214 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 215
 216
 217 #=========================================
 218 # System specific flags
 219 #=========================================
 220 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 221   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 222 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 223
 224
 225 #=========================================
 226 # Compiler specific flags
 227 #=========================================
 228
 229 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 230   # Add ifort preprocessor flags
 231   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 232 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 233   # Add new gfortran flags
 234   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 235 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 236   # Add old gfortran flags
 237   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 238 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 239
 240
 241 #=========================================
 242 # Add MPI preprocessor flags
 243 #=========================================
 244 if (UNRES_WITH_MPI)
 245   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMP -DMPI")
 246 endif(UNRES_WITH_MPI)
 247
 248
 249 # add 64-bit specific preprocessor flags
 250 if (architektura STREQUAL "64")
 251   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 252 endif (architektura STREQUAL "64")
 253
 254
 255
 256 # Apply preprocesor flags to *.F files
 257 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 258
 259 # Apply preprocesor flags to proc_proc.c
 260 set_property(SOURCE proc_proc.c PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS "SGI" )
 261
 262
 263 #========================================
 264 #  Setting binary name
 265 #========================================
 266 if(UNRES_WITH_MPI)
 267   # binary with mpi
 268   set(UNRES_BIN "unres_${Fortran_COMPILER_NAME}_MPICH_${UNRES_FF}.exe")
 269 else(UNRES_WITH_MPI)
 270   # binary without mpi
 271   set(UNRES_BIN "unres_${Fortran_COMPILER_NAME}_single_${UNRES_FF}.exe")
 272 endif(UNRES_WITH_MPI)
 273
 274 #=========================================
 275 # cinfo.f workaround for cmake
 276 #=========================================
 277 # get the current date
 278 TODAY(DATE)
 279 # generate cinfo.f
 280 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
 281 FILE(WRITE ${CINFO}
 282 "C CMake generated file
 283        subroutine cinfo
 284        include 'COMMON.IOUNITS'
 285        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 286        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 287 ")
 288
 289 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
 290 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
 291 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
 292 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
 293 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
 294 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
 295 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
 296
 297 FILE(APPEND ${CINFO}
 298 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 299        return
 300        end ")
 301
 302
 303 # add include path
 304 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}")
 305
 306 #=========================================
 307 # Set full unres MD-M sources
 308 #=========================================
 309 set(UNRES_MDM_SRCS ${UNRES_MDM_SRC0} ${UNRES_MDM_SRC3} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c )
 310
 311 #=========================================
 312 # Build the binary
 313 #=========================================
 314 add_executable(UNRES_BIN-MD-M ${UNRES_MDM_SRCS} )
 315 set_target_properties(UNRES_BIN-MD-M PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_BIN})
 316
 317 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 318 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 319
 320 #=========================================
 321 # Link libraries
 322 #=========================================
 323 # link MPI library (libmpich.a)
 324 if(UNRES_WITH_MPI)
 325   target_link_libraries( UNRES_BIN-MD-M ${MPIF_LIBRARIES} )
 326 endif(UNRES_WITH_MPI)
 327 # link libxdrf.a
 328 #message("UNRES_XDRFLIB=${UNRES_XDRFLIB}")
 329 target_link_libraries( UNRES_BIN-MD-M xdrf )
 330
 331 #=========================================
 332 # TESTS
 333 #=========================================
 334
 335 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 336 #SET(UNRES_TEST_FILES
 337 #       ala10.inp
 338 #    )
 339
 340 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 341 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 342 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 343 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 344 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 345 #          POST_BUILD
 346 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 347 #      )
 348 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 349
 350 #=========================================
 351 # Generate data test files
 352 #=========================================
 353
 354 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 355
 356 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 357
 358 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)
 359