source/unres/src_MD-M/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for UNRES with MD for single chains
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # build the xdrf library
   9 #================================
  10 #add_subdirectory(xdrf)
  11
  12 #================================
  13 # Set source file lists
  14 #================================
  15 set(UNRES_MDM_SRC0
  16         add.f
  17         arcos.f
  18         banach.f
  19         bank.F
  20         blas.f
  21         bond_move.f
  22         cartder.F
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.F
  25         check_bond.f
  26         checkder_p.F
  27         check_sc_distr.f
  28         compare_s1.F
  29         contact.f
  30         convert.f
  31         cored.f
  32         csa.f
  33         dihed_cons.F
  34         diff12.f
  35         distfit.f
  36         djacob.f
  37         econstr_local.F
  38         eigen.f
  39         elecont.f
  40         energy_split-sep.F
  41         entmcm.F
  42         fitsq.f
  43         gauss.f
  44         gen_rand_conf.F
  45         geomout.F
  46         gnmr1.f
  47         indexx.f
  48         initialize_p.F
  49         intcartderiv.F
  50         intcor.f
  51         intlocal.f
  52         int_to_cart.f
  53         kinetic_lesyng.f
  54         lagrangian_lesyng.F
  55         local_move.f
  56         map.f
  57         matmult.f
  58         mc.F
  59         mcm.F
  60         MD_A-MTS.F
  61         minimize_p.F
  62         minim_jlee.F
  63         minim_mcmf.F
  64         misc.f
  65         moments.f
  66         MP.F
  67         MREMD.F
  68         muca_md.f
  69         newconf.f
  70         parmread.F
  71         permut.F
  72         pinorm.f
  73         printmat.f
  74         q_measure.F
  75         ran.f
  76         randgens.f
  77         rattle.F
  78         readpdb.F
  79         readrtns_CSA.F
  80         refsys.f
  81         regularize.F
  82         rescode.f
  83         rmdd.f
  84         rmsd.F
  85         sc_move.F
  86         shift.F
  87         sort.f
  88         stochfric.F
  89         sumsld.f
  90         surfatom.f
  91         test.F
  92         thread.F
  93         timing.F
  94         together.F
  95         unres.F
  96 )
  97
  98 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  99   set(UNRES_MDM_SRC0 "${UNRES_MDM_SRC0} prng.f")
 100 else
 101   set(UNRES_MDM_SRC0 "${UNRES_MDM_SRC0} prng_32.F")
 102 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 103
 104
 105 set(UNRES_MDM_SRC3 energy_p_new_barrier.F energy_p_new-sep_barrier.F gradient_p.F )
 106
 107 set(UNRES_MDM_PP_SRC
 108         bank.F
 109         cartder.F
 110         chainbuild.F
 111         checkder_p.F
 112         compare_s1.F
 113         cored.f
 114         csa.f
 115         dihed_cons.F
 116         diff12.f
 117         econstr_local.F
 118         energy_p_new.F
 119         energy_p_new_barrier.F
 120         energy_p_new-sep_barrier.F
 121         energy_split-sep.F
 122         entmcm.F
 123         gen_rand_conf.F
 124         geomout.F
 125         gradient_p.F
 126         intcor.f
 127         initialize_p.F
 128         intcartderiv.F
 129         lagrangian_lesyng.F
 130         matmult.f
 131         mc.F
 132         mcm.F
 133         MD_A-MTS.F
 134         minimize_p.F
 135         minim_jlee.F
 136         minim_mcmf.F
 137         MP.F
 138         MREMD.F
 139         newconf.f
 140         parmread.F
 141         permut.F
 142         q_measure1.F
 143         q_measure3.F
 144         q_measure.F
 145         ran.f
 146         rattle.F
 147         readpdb.F
 148         readrtns_CSA.F
 149         regularize.F
 150         rmdd.f
 151         rmsd.F
 152         sc_move.F
 153         shift.F
 154         stochfric.F
 155         sumsld.f
 156         test.F
 157         thread.F
 158         timing.F
 159         together.F
 160         unres.F
 161 )
 162
 163
 164 if(NOT Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 165   set(UNRES_MDM_PP_SRC "${UNRES_MDM_PP_SRC} prng_32.F")
 166 endif(NOT Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 167
 168
 169 #================================================
 170 # Set comipiler flags for different sourcefiles
 171 #================================================
 172 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 173   set(FFLAGS0 "-ip -w" )
 174   set(FFLAGS1 "-w -g -d2 -CA -CB" )
 175   set(FFLAGS2 "-w -g -00 ")
 176   #set(FFLAGS3 "-c -w -O3 -ipo -ipo_obj -opt_report" )
 177   set(FFLAGS3 "-w -ipo " )
 178 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 179   set(FFLAGS0 "-I. " )
 180   set(FFLAGS1 "-g -I. " )
 181   set(FFLAGS2 "-I. ")
 182   #set(FFLAGS3 "-c -w -O3 -ipo -ipo_obj -opt_report" )
 183   set(FFLAGS3 "-I. " )
 184 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 185
 186
 187 # Add MPI compiler flags
 188 if(UNRES_WITH_MPI)
 189   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 190   set(FFLAGS1 "${FFLAGS1} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 191   set(FFLAGS2 "${FFLAGS2} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 192   set(FFLAGS3 "${FFLAGS3} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 193 endif(UNRES_WITH_MPI)
 194
 195 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_SRC0} APPEND PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 196 #set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC1} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS1} )
 197 #set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC2} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS2} )
 198 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_SRC3} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS3} )
 199
 200 #=========================================
 201 # Settings for GAB force field
 202 #=========================================
 203 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 204   # set preprocesor flags
 205   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 206
 207 #=========================================
 208 #  Settings for E0LL2Y force field
 209 #=========================================
 210 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 211   # set preprocesor flags
 212   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0" )
 213 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 214
 215
 216 #=========================================
 217 # System specific flags
 218 #=========================================
 219 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 220   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 221 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 222
 223
 224 #=========================================
 225 # Compiler specific flags
 226 #=========================================
 227
 228 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 229   # Add ifort preprocessor flags
 230   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 231 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 232   # Add new gfortran flags
 233   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 234 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 235   # Add old gfortran flags
 236   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 237 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 238
 239
 240 #=========================================
 241 # Add MPI preprocessor flags
 242 #=========================================
 243 if (UNRES_WITH_MPI)
 244   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMP -DMPI")
 245 endif(UNRES_WITH_MPI)
 246
 247
 248 # add 64-bit specific preprocessor flags
 249 if (architektura STREQUAL "64")
 250   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 251 endif (architektura STREQUAL "64")
 252
 253
 254
 255 # Apply preprocesor flags to *.F files
 256 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 257
 258 # Apply preprocesor flags to proc_proc.c
 259 set_property(SOURCE proc_proc.c APPEND PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS "SGI" )
 260
 261
 262 #========================================
 263 #  Setting binary name
 264 #========================================
 265 if(UNRES_WITH_MPI)
 266   # binary with mpi
 267   set(UNRES_BIN "unres_${Fortran_COMPILER_NAME}_MPICH_${UNRES_FF}.exe")
 268 else(UNRES_WITH_MPI)
 269   # binary without mpi
 270   set(UNRES_BIN "unres_${Fortran_COMPILER_NAME}_single_${UNRES_FF}.exe")
 271 endif(UNRES_WITH_MPI)
 272
 273 #=========================================
 274 # cinfo.f stupid workaround for cmake
 275 #  - shame on me ]:)
 276 #=========================================
 277 set_property(SOURCE compinfo.c PROPERTY CMAKE_C_FLAGS "-c" )
 278 add_executable(compinfo-mdm compinfo.c)
 279 set_target_properties(compinfo-mdm PROPERTIES OUTPUT_NAME compinfo)
 280
 281 set(UNRES_CINFO_DIR "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}" )
 282 add_custom_command(OUTPUT ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 283         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/cinfo.f ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 284         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/COMMON.IOUNITS ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/COMMON.IOUNITS
 285         COMMAND ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/compinfo | true
 286         DEPENDS compinfo-mdm )
 287 set_property(SOURCE ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 288
 289 #=========================================
 290 # Set full unres MD-M sources
 291 #=========================================
 292 set(UNRES_MDM_SRCS ${UNRES_MDM_SRC0} ${UNRES_MDM_SRC3} ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f proc_proc.c )
 293
 294 #=========================================
 295 # Build the binary
 296 #=========================================
 297 add_executable(UNRES_BIN-MD-M ${UNRES_MDM_SRCS} )
 298 set_target_properties(UNRES_BIN-MD-M PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_BIN})
 299
 300 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 301 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 302
 303 #=========================================
 304 # Link libraries
 305 #=========================================
 306 # link MPI library (libmpich.a)
 307 if(UNRES_WITH_MPI)
 308   target_link_libraries( UNRES_BIN-MD-M ${MPIF_LIBRARIES} )
 309 endif(UNRES_WITH_MPI)
 310 # link libxdrf.a
 311 #message("UNRES_XDRFLIB=${UNRES_XDRFLIB}")
 312 target_link_libraries( UNRES_BIN-MD-M xdrf )
 313
 314 #=========================================
 315 # TESTS
 316 #=========================================
 317
 318 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 319 #SET(UNRES_TEST_FILES
 320 #       ala10.inp
 321 #    )
 322
 323 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 324 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 325 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 326 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 327 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 328 #          POST_BUILD
 329 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 330 #      )
 331 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 332
 333 #=========================================
 334 # Generate data test files
 335 #=========================================
 336
 337 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 338
 339 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 340
 341 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)
 342