source/unres/src_MD-M/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for UNRES with MD for single chains
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # build the xdrf library
   9 #================================
  10 #add_subdirectory(xdrf)
  11
  12 #================================
  13 # Set source file lists
  14 #================================
  15 set(UNRES_MDM_SRC0
  16         add.f
  17         arcos.f
  18         banach.f
  19         bank.F
  20         blas.f
  21         bond_move.f
  22         cartder.F
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.F
  25         check_bond.f
  26         checkder_p.F
  27         check_sc_distr.f
  28         compare_s1.F
  29         contact.f
  30         convert.f
  31         cored.f
  32         csa.f
  33         dihed_cons.F
  34         diff12.f
  35         distfit.f
  36         djacob.f
  37         econstr_local.F
  38         eigen.f
  39         elecont.f
  40         energy_split-sep.F
  41         entmcm.F
  42         fitsq.f
  43         gauss.f
  44         gen_rand_conf.F
  45         geomout.F
  46         gnmr1.f
  47         indexx.f
  48         initialize_p.F
  49         intcartderiv.F
  50         intcor.f
  51         intlocal.f
  52         int_to_cart.f
  53         kinetic_lesyng.f
  54         lagrangian_lesyng.F
  55         local_move.f
  56         map.f
  57         matmult.f
  58         mc.F
  59         mcm.F
  60         MD_A-MTS.F
  61         minimize_p.F
  62         minim_jlee.F
  63         minim_mcmf.F
  64         misc.f
  65         moments.f
  66         MP.F
  67         MREMD.F
  68         muca_md.f
  69         newconf.f
  70         parmread.F
  71         permut.F
  72         pinorm.f
  73         printmat.f
  74         q_measure.F
  75         ran.f
  76         randgens.f
  77         rattle.F
  78         readpdb.F
  79         readrtns_CSA.F
  80         refsys.f
  81         regularize.F
  82         rescode.f
  83         rmdd.f
  84         rmsd.F
  85         sc_move.F
  86         shift.F
  87         sort.f
  88         stochfric.F
  89         sumsld.f
  90         surfatom.f
  91         test.F
  92         thread.F
  93         timing.F
  94         together.F
  95         unres.F
  96         ssMD.F
  97 )
  98
  99 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 100   set(UNRES_MDM_SRC0 ${UNRES_MDM_SRC0} prng.f )
 101 elseif(Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "mpif90")
 102   set(UNRES_MDM_SRC0 ${UNRES_MDM_SRC0} prng.f )
 103 else()
 104   set(UNRES_MDM_SRC0 ${UNRES_MDM_SRC0} prng_32.F )
 105 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 106
 107
 108 set(UNRES_MDM_SRC3 energy_p_new_barrier.F energy_p_new-sep_barrier.F gradient_p.F )
 109
 110 set(UNRES_MDM_PP_SRC
 111         bank.F
 112         cartder.F
 113         chainbuild.F
 114         checkder_p.F
 115         compare_s1.F
 116         cored.f
 117         csa.f
 118         dihed_cons.F
 119         diff12.f
 120         econstr_local.F
 121         energy_p_new.F
 122         energy_p_new_barrier.F
 123         energy_p_new-sep_barrier.F
 124         energy_split-sep.F
 125         entmcm.F
 126         gen_rand_conf.F
 127         geomout.F
 128         gradient_p.F
 129         intcor.f
 130         initialize_p.F
 131         intcartderiv.F
 132         lagrangian_lesyng.F
 133         matmult.f
 134         mc.F
 135         mcm.F
 136         MD_A-MTS.F
 137         minimize_p.F
 138         minim_jlee.F
 139         minim_mcmf.F
 140         MP.F
 141         MREMD.F
 142         newconf.f
 143         parmread.F
 144         permut.F
 145         q_measure1.F
 146         q_measure3.F
 147         q_measure.F
 148         ran.f
 149         rattle.F
 150         readpdb.F
 151         readrtns_CSA.F
 152         regularize.F
 153         rmdd.f
 154         rmsd.F
 155         sc_move.F
 156         shift.F
 157         stochfric.F
 158         sumsld.f
 159         test.F
 160         thread.F
 161         timing.F
 162         together.F
 163         unres.F
 164         proc_proc.c
 165 )
 166
 167
 168 if(NOT Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 169   set(UNRES_MDM_PP_SRC "${UNRES_MDM_PP_SRC} prng_32.F")
 170 endif(NOT Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 171
 172
 173 #================================================
 174 # Set comipiler flags for different sourcefiles
 175 #================================================
 176 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 177   set(FFLAGS0 "-ip -w" )
 178   set(FFLAGS1 "-w -g -d2 -CA -CB" )
 179   set(FFLAGS2 "-w -g -00 ")
 180   set(FFLAGS3 "-w -ipo " )
 181 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 182   set(FFLAGS0 "-std=legacy -I. " )
 183   set(FFLAGS1 "-std=legacy -g -I. " )
 184   set(FFLAGS2 "-std=legacy -I. ")
 185   set(FFLAGS3 "-std=legacy -I. " )
 186 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 187
 188
 189 # Add MPI compiler flags
 190 if(UNRES_WITH_MPI)
 191   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 192   set(FFLAGS1 "${FFLAGS1} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 193   set(FFLAGS2 "${FFLAGS2} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 194   set(FFLAGS3 "${FFLAGS3} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 195 endif(UNRES_WITH_MPI)
 196
 197 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_SRC0} APPEND PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 198 #set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC1} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS1} )
 199 #set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC2} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS2} )
 200 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_SRC3} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS3} )
 201
 202 #=========================================
 203 # Settings for GAB force field
 204 #=========================================
 205 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 206   # set preprocesor flags
 207   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 208
 209 #=========================================
 210 #  Settings for E0LL2Y force field
 211 #=========================================
 212 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 213   # set preprocesor flags
 214   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0" )
 215 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 216
 217
 218 #=========================================
 219 # System specific flags
 220 #=========================================
 221 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 222   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 223 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 224
 225
 226 #=========================================
 227 # Compiler specific flags
 228 #=========================================
 229
 230 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 231   # Add ifort preprocessor flags
 232   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 233 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 234   # Add new gfortran flags
 235   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 236 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 237   # Add old gfortran flags
 238   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 239 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 240
 241
 242 #=========================================
 243 # Add MPI preprocessor flags
 244 #=========================================
 245 if (UNRES_WITH_MPI)
 246   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMP -DMPI")
 247 endif(UNRES_WITH_MPI)
 248
 249
 250 # add 64-bit specific preprocessor flags
 251 if (architektura STREQUAL "64")
 252   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 253 endif (architektura STREQUAL "64")
 254
 255
 256
 257 # Apply preprocesor flags to *.F files
 258 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 259
 260 # Apply preprocesor flags to proc_proc.c
 261 set_property(SOURCE proc_proc.c PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS "SGI" )
 262
 263
 264 #========================================
 265 #  Setting binary name
 266 #========================================
 267 if(UNRES_WITH_MPI)
 268   # binary with mpi
 269   set(UNRES_BIN "unres_${Fortran_COMPILER_NAME}_MPICH_${UNRES_FF}.exe")
 270 else(UNRES_WITH_MPI)
 271   # binary without mpi
 272   set(UNRES_BIN "unres_${Fortran_COMPILER_NAME}_single_${UNRES_FF}.exe")
 273 endif(UNRES_WITH_MPI)
 274
 275 #=========================================
 276 # cinfo.f workaround for cmake
 277 #=========================================
 278 # get the current date
 279 TODAY(DATE)
 280 # generate cinfo.f
 281 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
 282 FILE(WRITE ${CINFO}
 283 "C CMake generated file
 284        subroutine cinfo
 285        include 'COMMON.IOUNITS'
 286        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 287        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 288 ")
 289
 290 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
 291 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
 292 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
 293 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
 294 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
 295 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
 296 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
 297
 298 FILE(APPEND ${CINFO}
 299 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 300        return
 301        end ")
 302
 303
 304 # add include path
 305 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}")
 306
 307 #=========================================
 308 # Set full unres MD-M sources
 309 #=========================================
 310 set(UNRES_MDM_SRCS ${UNRES_MDM_SRC0} ${UNRES_MDM_SRC3} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c )
 311
 312 #=========================================
 313 # Build the binary
 314 #=========================================
 315 add_executable(UNRES_BIN-MD-M ${UNRES_MDM_SRCS} )
 316 set_target_properties(UNRES_BIN-MD-M PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_BIN})
 317
 318 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 319 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 320
 321 #=========================================
 322 # Link libraries
 323 #=========================================
 324 # link MPI library (libmpich.a)
 325 if(UNRES_WITH_MPI)
 326   target_link_libraries( UNRES_BIN-MD-M ${MPIF_LIBRARIES} )
 327 endif(UNRES_WITH_MPI)
 328 # link libxdrf.a
 329 #message("UNRES_XDRFLIB=${UNRES_XDRFLIB}")
 330 target_link_libraries( UNRES_BIN-MD-M xdrf )
 331
 332 #=========================================
 333 # TESTS
 334 #=========================================
 335
 336 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 337 #SET(UNRES_TEST_FILES
 338 #       ala10.inp
 339 #    )
 340
 341 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 342 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 343 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 344 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 345 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 346 #          POST_BUILD
 347 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 348 #      )
 349 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 350
 351 #=========================================
 352 # Generate data test files
 353 #=========================================
 354
 355 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 356
 357 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 358
 359 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)
 360