source/unres/src_MD-M/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for UNRES with MD for single chains
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # build the xdrf library
   9 #================================
  10 add_subdirectory(xdrf)
  11
  12 #================================
  13 # Set source file lists
  14 #================================
  15 set(UNRES_MDM_SRC0
  16         add.f
  17         arcos.f
  18         banach.f
  19         bank.F
  20         blas.f
  21         bond_move.f
  22         cartder.F
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.F
  25         check_bond.f
  26         checkder_p.F
  27         check_sc_distr.f
  28         compare_s1.F
  29         contact.f
  30         convert.f
  31         cored.f
  32         csa.f
  33         dihed_cons.F
  34         diff12.f
  35         distfit.f
  36         djacob.f
  37         econstr_local.F
  38         eigen.f
  39         elecont.f
  40         energy_split-sep.F
  41         entmcm.F
  42         fitsq.f
  43         gauss.f
  44         gen_rand_conf.F
  45         geomout.F
  46         gnmr1.f
  47         indexx.f
  48         initialize_p.F
  49         intcartderiv.F
  50         intcor.f
  51         intlocal.f
  52         int_to_cart.f
  53         kinetic_lesyng.f
  54         lagrangian_lesyng.F
  55         local_move.f
  56         map.f
  57         matmult.f
  58         mc.F
  59         mcm.F
  60         MD_A-MTS.F
  61         minimize_p.F
  62         minim_jlee.F
  63         minim_mcmf.F
  64         misc.f
  65         moments.f
  66         MP.F
  67         MREMD.F
  68         muca_md.f
  69         newconf.f
  70         parmread.F
  71         permut.F
  72         pinorm.f
  73         printmat.f
  74         prng_32.F
  75         q_measure.F
  76         ran.f
  77         randgens.f
  78         rattle.F
  79         readpdb.F
  80         readrtns_CSA.F
  81         refsys.f
  82         regularize.F
  83         rescode.f
  84         rmdd.f
  85         rmsd.F
  86         sc_move.F
  87         shift.F
  88         sort.f
  89         stochfric.F
  90         sumsld.f
  91         surfatom.f
  92         test.F
  93         thread.F
  94         timing.F
  95         together.F
  96         unres.F
  97 )
  98
  99 set(UNRES_MDM_SRC3 energy_p_new_barrier.F energy_p_new-sep_barrier.F gradient_p.F )
 100
 101 set(UNRES_MDM_PP_SRC
 102         bank.F
 103         cartder.F
 104         chainbuild.F
 105         checkder_p.F
 106         compare_s1.F
 107         cored.f
 108         csa.f
 109         dihed_cons.F
 110         diff12.f
 111         econstr_local.F
 112         energy_p_new.F
 113         energy_p_new_barrier.F
 114         energy_p_new-sep_barrier.F
 115         energy_split-sep.F
 116         entmcm.F
 117         gen_rand_conf.F
 118         geomout.F
 119         gradient_p.F
 120         intcor.f
 121         initialize_p.F
 122         intcartderiv.F
 123         lagrangian_lesyng.F
 124         matmult.f
 125         mc.F
 126         mcm.F
 127         MD_A-MTS.F
 128         minimize_p.F
 129         minim_jlee.F
 130         minim_mcmf.F
 131         MP.F
 132         MREMD.F
 133         newconf.f
 134         parmread.F
 135         permut.F
 136         prng_32.F
 137         q_measure1.F
 138         q_measure3.F
 139         q_measure.F
 140         ran.f
 141         rattle.F
 142         readpdb.F
 143         readrtns_CSA.F
 144         regularize.F
 145         rmdd.f
 146         rmsd.F
 147         sc_move.F
 148         shift.F
 149         stochfric.F
 150         sumsld.f
 151         test.F
 152         thread.F
 153         timing.F
 154         together.F
 155         unres.F
 156 )
 157
 158
 159 #================================================
 160 # Set comipiler flags for different sourcefiles
 161 #================================================
 162 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 163   set(FFLAGS0 "-ip -w" )
 164   set(FFLAGS1 "-w -g -d2 -CA -CB" )
 165   set(FFLAGS2 "-w -g -00 ")
 166   #set(FFLAGS3 "-c -w -O3 -ipo -ipo_obj -opt_report" )
 167   set(FFLAGS3 "-w -ipo " )
 168 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 169   set(FFLAGS0 "-I. " )
 170   set(FFLAGS1 "-g -I. " )
 171   set(FFLAGS2 "-I. ")
 172   #set(FFLAGS3 "-c -w -O3 -ipo -ipo_obj -opt_report" )
 173   set(FFLAGS3 "-I. " )
 174 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 175
 176
 177 # Add MPI compiler flags
 178 if(UNRES_WITH_MPI)
 179   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 180   set(FFLAGS1 "${FFLAGS1} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 181   set(FFLAGS2 "${FFLAGS2} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 182   set(FFLAGS3 "${FFLAGS3} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 183 endif(UNRES_WITH_MPI)
 184
 185 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_SRC0} APPEND PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 186 #set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC1} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS1} )
 187 #set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC2} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS2} )
 188 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_SRC3} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS3} )
 189
 190 #=========================================
 191 # Settings for GAB force field
 192 #=========================================
 193 if(UNRES_FF STREQUAL "GAB" )
 194   # set preprocesor flags
 195   set(CPPFLAGS "PROCOR -DLINUX -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 196
 197   if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 198     # Add ifort preprocessor flags
 199     set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 200   elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 201     # Add gfortran flags
 202     set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 203   elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 204     # Add gfortran flags
 205     set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 206   endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 207
 208 #=========================================
 209 #  Settings for E0LL2Y force field
 210 #=========================================
 211 elseif(UNRES_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 212   # set preprocesor flags
 213   set(CPPFLAGS "PROCOR -DLINUX -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0" )
 214
 215   if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 216     # Add ifort preprocessor flags
 217     set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 218   endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 219
 220 endif(UNRES_FF STREQUAL "GAB")
 221
 222 # Add MPI preprocessor flags
 223 if (UNRES_WITH_MPI)
 224   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMP -DMPI")
 225 endif(UNRES_WITH_MPI)
 226
 227
 228 # add 64-bit specific preprocessor flags
 229 if (architektura STREQUAL "64")
 230   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 231 endif (architektura STREQUAL "64")
 232
 233
 234
 235 # Apply preprocesor flags to *.F files
 236 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 237
 238 # Apply preprocesor flags to proc_proc.c
 239 set_property(SOURCE proc_proc.c APPEND PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS "SGI" )
 240
 241
 242 #========================================
 243 #  Setting binary name
 244 #========================================
 245 if(UNRES_WITH_MPI)
 246   # binary with mpi
 247   set(UNRES_BIN "unres_${Fortran_COMPILER_NAME}_MPICH_${UNRES_FF}.exe")
 248 else(UNRES_WITH_MPI)
 249   # binary without mpi
 250   set(UNRES_BIN "unres_${Fortran_COMPILER_NAME}_single_${UNRES_FF}.exe")
 251 endif(UNRES_WITH_MPI)
 252
 253 #=========================================
 254 # cinfo.f stupid workaround for cmake
 255 #  - shame on me ]:)
 256 #=========================================
 257 set_property(SOURCE compinfo.c PROPERTY CMAKE_C_FLAGS "-c" )
 258 add_executable(compinfo-mdm compinfo.c)
 259 set_target_properties(compinfo-mdm PROPERTIES OUTPUT_NAME compinfo)
 260
 261 set(UNRES_CINFO_DIR "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}" )
 262 add_custom_command(OUTPUT ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 263         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/cinfo.f ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 264         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/COMMON.IOUNITS ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/COMMON.IOUNITS
 265         COMMAND ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/compinfo | true
 266         DEPENDS compinfo-mdm )
 267 set_property(SOURCE ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 268
 269 #=========================================
 270 # Set full unres MD-M sources
 271 #=========================================
 272 set(UNRES_MDM_SRCS ${UNRES_MDM_SRC0} ${UNRES_MDM_SRC3} ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f proc_proc.c )
 273
 274 #=========================================
 275 # Build the binary
 276 #=========================================
 277 add_executable(UNRES_BIN-MD-M ${UNRES_MDM_SRCS} )
 278 set_target_properties(UNRES_BIN-MD-M PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_BIN})
 279
 280 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 281 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 282
 283 #=========================================
 284 # Link libraries
 285 #=========================================
 286 # link MPI library (libmpich.a)
 287 if(UNRES_WITH_MPI)
 288   target_link_libraries( UNRES_BIN-MD-M ${MPIF_LIBRARIES} )
 289 endif(UNRES_WITH_MPI)
 290 # link libxdrf.a
 291 #message("UNRES_XDRFLIB=${UNRES_XDRFLIB}")
 292 target_link_libraries( UNRES_BIN-MD-M xdrf-MD-M )
 293
 294 #=========================================
 295 # TESTS
 296 #=========================================
 297
 298 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 299 #SET(UNRES_TEST_FILES
 300 #       ala10.inp
 301 #    )
 302
 303 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 304 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 305 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 306 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 307 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 308 #          POST_BUILD
 309 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 310 #      )
 311 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 312
 313 #=========================================
 314 # Generate data test files
 315 #=========================================
 316
 317 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 318
 319 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 320
 321 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)
 322