source/unres/src_MD-M/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for UNRES with MD for single chains
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # build the xdrf library
   9 #================================
  10 #add_subdirectory(xdrf)
  11
  12 #================================
  13 # Set source file lists
  14 #================================
  15 set(UNRES_MDM_SRC0
  16         add.f
  17         arcos.f
  18         banach.f
  19         bank.F
  20         blas.f
  21         bond_move.f
  22         cartder.F
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.F
  25         check_bond.f
  26         checkder_p.F
  27         check_sc_distr.f
  28         compare_s1.F
  29         contact.f
  30         convert.f
  31         cored.f
  32         csa.f
  33         dihed_cons.F
  34         diff12.f
  35         distfit.f
  36         djacob.f
  37         econstr_local.F
  38         eigen.f
  39         elecont.f
  40         energy_split-sep.F
  41         entmcm.F
  42         fitsq.f
  43         gauss.f
  44         gen_rand_conf.F
  45         geomout.F
  46         gnmr1.f
  47         indexx.f
  48         initialize_p.F
  49         intcartderiv.F
  50         intcor.f
  51         intlocal.f
  52         int_to_cart.f
  53         kinetic_lesyng.f
  54         lagrangian_lesyng.F
  55         local_move.f
  56         map.f
  57         matmult.f
  58         mc.F
  59         mcm.F
  60         MD_A-MTS.F
  61         minimize_p.F
  62         minim_jlee.F
  63         minim_mcmf.F
  64         misc.f
  65         moments.f
  66         MP.F
  67         MREMD.F
  68         muca_md.f
  69         newconf.f
  70         parmread.F
  71         permut.F
  72         pinorm.f
  73         printmat.f
  74         q_measure.F
  75         ran.f
  76         randgens.f
  77         rattle.F
  78         readpdb.F
  79         readrtns_CSA.F
  80         refsys.f
  81         regularize.F
  82         rescode.f
  83         rmdd.f
  84         rmsd.F
  85         sc_move.F
  86         shift.F
  87         sort.f
  88         stochfric.F
  89         sumsld.f
  90         surfatom.f
  91         test.F
  92         thread.F
  93         timing.F
  94         together.F
  95         unres.F
  96 )
  97
  98 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  99   set(UNRES_MDM_SRC0 ${UNRES_MDM_SRC0} prng.f )
 100 else()
 101   set(UNRES_MDM_SRC0 ${UNRES_MDM_SRC0} prng_32.F )
 102 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 103
 104
 105 set(UNRES_MDM_SRC3 energy_p_new_barrier.F energy_p_new-sep_barrier.F gradient_p.F )
 106
 107 set(UNRES_MDM_PP_SRC
 108         bank.F
 109         cartder.F
 110         chainbuild.F
 111         checkder_p.F
 112         compare_s1.F
 113         cored.f
 114         csa.f
 115         dihed_cons.F
 116         diff12.f
 117         econstr_local.F
 118         energy_p_new.F
 119         energy_p_new_barrier.F
 120         energy_p_new-sep_barrier.F
 121         energy_split-sep.F
 122         entmcm.F
 123         gen_rand_conf.F
 124         geomout.F
 125         gradient_p.F
 126         intcor.f
 127         initialize_p.F
 128         intcartderiv.F
 129         lagrangian_lesyng.F
 130         matmult.f
 131         mc.F
 132         mcm.F
 133         MD_A-MTS.F
 134         minimize_p.F
 135         minim_jlee.F
 136         minim_mcmf.F
 137         MP.F
 138         MREMD.F
 139         newconf.f
 140         parmread.F
 141         permut.F
 142         q_measure1.F
 143         q_measure3.F
 144         q_measure.F
 145         ran.f
 146         rattle.F
 147         readpdb.F
 148         readrtns_CSA.F
 149         regularize.F
 150         rmdd.f
 151         rmsd.F
 152         sc_move.F
 153         shift.F
 154         stochfric.F
 155         sumsld.f
 156         test.F
 157         thread.F
 158         timing.F
 159         together.F
 160         unres.F
 161         proc_proc.c
 162 )
 163
 164
 165 if(NOT Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 166   set(UNRES_MDM_PP_SRC "${UNRES_MDM_PP_SRC} prng_32.F")
 167 endif(NOT Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 168
 169
 170 #================================================
 171 # Set comipiler flags for different sourcefiles
 172 #================================================
 173 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 174   set(FFLAGS0 "-ip -w" )
 175   set(FFLAGS1 "-w -g -d2 -CA -CB" )
 176   set(FFLAGS2 "-w -g -00 ")
 177   #set(FFLAGS3 "-c -w -O3 -ipo -ipo_obj -opt_report" )
 178   set(FFLAGS3 "-w -ipo " )
 179 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 180   set(FFLAGS0 "-I. " )
 181   set(FFLAGS1 "-g -I. " )
 182   set(FFLAGS2 "-I. ")
 183   #set(FFLAGS3 "-c -w -O3 -ipo -ipo_obj -opt_report" )
 184   set(FFLAGS3 "-I. " )
 185 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 186
 187
 188 # Add MPI compiler flags
 189 if(UNRES_WITH_MPI)
 190   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 191   set(FFLAGS1 "${FFLAGS1} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 192   set(FFLAGS2 "${FFLAGS2} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 193   set(FFLAGS3 "${FFLAGS3} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 194 endif(UNRES_WITH_MPI)
 195
 196 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_SRC0} APPEND PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 197 #set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC1} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS1} )
 198 #set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC2} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS2} )
 199 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_SRC3} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS3} )
 200
 201 #=========================================
 202 # Settings for GAB force field
 203 #=========================================
 204 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 205   # set preprocesor flags
 206   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 207
 208 #=========================================
 209 #  Settings for E0LL2Y force field
 210 #=========================================
 211 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 212   # set preprocesor flags
 213   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0" )
 214 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 215
 216
 217 #=========================================
 218 # System specific flags
 219 #=========================================
 220 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 221   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 222 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 223
 224
 225 #=========================================
 226 # Compiler specific flags
 227 #=========================================
 228
 229 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 230   # Add ifort preprocessor flags
 231   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 232 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 233   # Add new gfortran flags
 234   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 235 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 236   # Add old gfortran flags
 237   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 238 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 239
 240
 241 #=========================================
 242 # Add MPI preprocessor flags
 243 #=========================================
 244 if (UNRES_WITH_MPI)
 245   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMP -DMPI")
 246 endif(UNRES_WITH_MPI)
 247
 248
 249 # add 64-bit specific preprocessor flags
 250 if (architektura STREQUAL "64")
 251   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 252 endif (architektura STREQUAL "64")
 253
 254
 255
 256 # Apply preprocesor flags to *.F files
 257 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 258
 259 # Apply preprocesor flags to proc_proc.c
 260 set_property(SOURCE proc_proc.c PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS "SGI" )
 261
 262
 263 #========================================
 264 #  Setting binary name
 265 #========================================
 266 if(UNRES_WITH_MPI)
 267   # binary with mpi
 268   set(UNRES_BIN "unres_${Fortran_COMPILER_NAME}_MPICH_${UNRES_FF}.exe")
 269 else(UNRES_WITH_MPI)
 270   # binary without mpi
 271   set(UNRES_BIN "unres_${Fortran_COMPILER_NAME}_single_${UNRES_FF}.exe")
 272 endif(UNRES_WITH_MPI)
 273
 274 #=========================================
 275 # cinfo.f stupid workaround for cmake
 276 #  - shame on me ]:)
 277 #=========================================
 278 set_property(SOURCE compinfo.c PROPERTY CMAKE_C_FLAGS "-c" )
 279 add_executable(compinfo-mdm compinfo.c)
 280 set_target_properties(compinfo-mdm PROPERTIES OUTPUT_NAME compinfo)
 281
 282 set(UNRES_CINFO_DIR "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}" )
 283 add_custom_command(OUTPUT ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 284         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/cinfo.f ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 285         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/COMMON.IOUNITS ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/COMMON.IOUNITS
 286         COMMAND ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/compinfo | true
 287         DEPENDS compinfo-mdm )
 288 set_property(SOURCE ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 289
 290 #=========================================
 291 # Set full unres MD-M sources
 292 #=========================================
 293 set(UNRES_MDM_SRCS ${UNRES_MDM_SRC0} ${UNRES_MDM_SRC3} ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f proc_proc.c )
 294
 295 #=========================================
 296 # Build the binary
 297 #=========================================
 298 add_executable(UNRES_BIN-MD-M ${UNRES_MDM_SRCS} )
 299 set_target_properties(UNRES_BIN-MD-M PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_BIN})
 300
 301 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 302 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 303
 304 #=========================================
 305 # Link libraries
 306 #=========================================
 307 # link MPI library (libmpich.a)
 308 if(UNRES_WITH_MPI)
 309   target_link_libraries( UNRES_BIN-MD-M ${MPIF_LIBRARIES} )
 310 endif(UNRES_WITH_MPI)
 311 # link libxdrf.a
 312 #message("UNRES_XDRFLIB=${UNRES_XDRFLIB}")
 313 target_link_libraries( UNRES_BIN-MD-M xdrf )
 314
 315 #=========================================
 316 # TESTS
 317 #=========================================
 318
 319 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 320 #SET(UNRES_TEST_FILES
 321 #       ala10.inp
 322 #    )
 323
 324 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 325 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 326 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 327 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 328 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 329 #          POST_BUILD
 330 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 331 #      )
 332 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 333
 334 #=========================================
 335 # Generate data test files
 336 #=========================================
 337
 338 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 339
 340 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 341
 342 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)
 343