source/unres/src_MD-M/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for UNRES with MD for single chains
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_MDM_SRC0
  11         add.f
  12         arcos.f
  13         banach.f
  14         bank.F
  15         blas.f
  16         bond_move.f
  17         cartder.F
  18         cartprint.f
  19         chainbuild.F
  20         check_bond.f
  21         checkder_p.F
  22         check_sc_distr.f
  23         compare_s1.F
  24         contact.f
  25         convert.f
  26         cored.f
  27         csa.f
  28         dihed_cons.F
  29         diff12.f
  30         distfit.f
  31         djacob.f
  32         econstr_local.F
  33         eigen.f
  34         elecont.f
  35         energy_split-sep.F
  36         entmcm.F
  37         fitsq.f
  38         gauss.f
  39         gen_rand_conf.F
  40         geomout.F
  41         gnmr1.f
  42         indexx.f
  43         initialize_p.F
  44         intcartderiv.F
  45         intcor.f
  46         intlocal.f
  47         int_to_cart.f
  48         kinetic_lesyng.f
  49         lagrangian_lesyng.F
  50         local_move.f
  51         map.f
  52         matmult.f
  53         mc.F
  54         mcm.F
  55         MD_A-MTS.F
  56         minimize_p.F
  57         minim_jlee.F
  58         minim_mcmf.F
  59         misc.f
  60         moments.f
  61         MP.F
  62         MREMD.F
  63         muca_md.f
  64         newconf.f
  65         parmread.F
  66         permut.F
  67         pinorm.f
  68         printmat.f
  69         prng_32.F
  70         q_measure.F
  71         ran.f
  72         randgens.f
  73         rattle.F
  74         readpdb.F
  75         readrtns_CSA.F
  76         refsys.f
  77         regularize.F
  78         rescode.f
  79         rmdd.f
  80         rmsd.F
  81         sc_move.F
  82         shift.F
  83         sort.f
  84         ssMD.F
  85         stochfric.F
  86         sumsld.f
  87         surfatom.f
  88         test.F
  89         thread.F
  90         timing.F
  91         together.F
  92         unres.F
  93 )
  94
  95 set(UNRES_MDM_SRC3 energy_p_new_barrier.F energy_p_new-sep_barrier.F gradient_p.F )
  96
  97 set(UNRES_MDM_PP_SRC
  98         bank.F
  99         cartder.F
 100         chainbuild.F
 101         checkder_p.F
 102         compare_s1.F
 103         cored.f
 104         csa.f
 105         dihed_cons.F
 106         diff12.f
 107         econstr_local.F
 108         energy_p_new.F
 109         energy_p_new_barrier.F
 110         energy_p_new-sep_barrier.F
 111         energy_split-sep.F
 112         entmcm.F
 113         gen_rand_conf.F
 114         geomout.F
 115         gradient_p.F
 116         intcor.f
 117         initialize_p.F
 118         intcartderiv.F
 119         lagrangian_lesyng.F
 120         matmult.f
 121         mc.F
 122         mcm.F
 123         MD_A-MTS.F
 124         minimize_p.F
 125         minim_jlee.F
 126         minim_mcmf.F
 127         MP.F
 128         MREMD.F
 129         newconf.f
 130         parmread.F
 131         permut.F
 132         prng_32.F
 133         q_measure1.F
 134         q_measure3.F
 135         q_measure.F
 136         ran.f
 137         rattle.F
 138         readpdb.F
 139         readrtns_CSA.F
 140         regularize.F
 141         rmdd.f
 142         rmsd.F
 143         sc_move.F
 144         shift.F
 145         ssMD.F
 146         stochfric.F
 147         sumsld.f
 148         test.F
 149         thread.F
 150         timing.F
 151         together.F
 152         unres.F
 153         proc_proc.c
 154 )
 155
 156
 157 if(NOT Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 158   set(UNRES_MDM_PP_SRC "${UNRES_MDM_PP_SRC} prng_32.F")
 159 endif(NOT Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 160
 161
 162 #================================================
 163 # Set comipiler flags for different sourcefiles
 164 #================================================
 165 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 166   set(FFLAGS0 "-ip -w" )
 167   set(FFLAGS1 "-w -g -d2 -CA -CB" )
 168   set(FFLAGS2 "-w -g -00 ")
 169   set(FFLAGS3 "-w -ipo " )
 170 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 171   set(FFLAGS0 "-std=legacy -I. " )
 172   set(FFLAGS1 "-std=legacy -g -I. " )
 173   set(FFLAGS2 "-std=legacy -I. ")
 174   set(FFLAGS3 "-std=legacy -I. " )
 175 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 176
 177
 178 # Add MPI compiler flags
 179 if(UNRES_WITH_MPI)
 180   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 181   set(FFLAGS1 "${FFLAGS1} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 182   set(FFLAGS2 "${FFLAGS2} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 183   set(FFLAGS3 "${FFLAGS3} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 184 endif(UNRES_WITH_MPI)
 185
 186 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_SRC0} APPEND PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 187 #set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC1} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS1} )
 188 #set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC2} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS2} )
 189 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_SRC3} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS3} )
 190
 191 #=========================================
 192 # Settings for GAB force field
 193 #=========================================
 194 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 195   # set preprocesor flags
 196   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC  -DSCCORPDB -DTIMING -DTIMING_ENE" )
 197
 198 #=========================================
 199 #  Settings for E0LL2Y force field
 200 #=========================================
 201 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 202   # set preprocesor flags
 203   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 " )
 204 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 205
 206
 207 #=========================================
 208 # System specific flags
 209 #=========================================
 210 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 211   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 212 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 213
 214
 215 #=========================================
 216 # Compiler specific flags
 217 #=========================================
 218
 219 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 220   # Add ifort preprocessor flags
 221   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 222 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 223   # Add new gfortran flags
 224   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 225 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 226   # Add old gfortran flags
 227   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 228 else (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 229   # Default preprocessor flags
 230   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 231 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 232
 233
 234 #=========================================
 235 # Add MPI preprocessor flags
 236 #=========================================
 237 if (UNRES_WITH_MPI)
 238   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMP -DMPI")
 239 endif(UNRES_WITH_MPI)
 240
 241
 242 #=========================================
 243 # add 64-bit specific preprocessor flags
 244 #=========================================
 245 if (architektura STREQUAL "64")
 246   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 247 endif (architektura STREQUAL "64")
 248
 249
 250
 251 # Apply preprocesor flags to *.F files
 252 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 253
 254 # Apply preprocesor flags to proc_proc.c
 255 set_property(SOURCE proc_proc.c PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS "SGI" )
 256
 257
 258 #========================================
 259 #  Setting binary name
 260 #========================================
 261 if(UNRES_WITH_MPI)
 262   # binary with mpi
 263   set(UNRES_BIN "unresMD-M_${Fortran_COMPILER_NAME}_MPICH_${UNRES_MD_FF}.exe")
 264 else(UNRES_WITH_MPI)
 265   # binary without mpi
 266   set(UNRES_BIN "unresMD-M_${Fortran_COMPILER_NAME}_single_${UNRES_MD_FF}.exe")
 267 endif(UNRES_WITH_MPI)
 268
 269 #=========================================
 270 # cinfo.f workaround for cmake
 271 #=========================================
 272 # get the current date
 273 TODAY(DATE)
 274 # generate cinfo.f
 275 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
 276 FILE(WRITE ${CINFO}
 277 "C CMake generated file
 278        subroutine cinfo
 279        include 'COMMON.IOUNITS'
 280        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 281        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 282 ")
 283
 284 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
 285 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
 286 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
 287 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
 288 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
 289 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
 290 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
 291
 292 FILE(APPEND ${CINFO}
 293 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 294        return
 295        end ")
 296
 297
 298 # add include path
 299 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}")
 300
 301 #=========================================
 302 # Set full unres MD-M sources
 303 #=========================================
 304 set(UNRES_MDM_SRCS ${UNRES_MDM_SRC0} ${UNRES_MDM_SRC3} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c )
 305
 306 #=========================================
 307 # Build the binary
 308 #=========================================
 309 add_executable(UNRES_BIN-MD-M ${UNRES_MDM_SRCS} )
 310 set_target_properties(UNRES_BIN-MD-M PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_BIN})
 311 set_property(TARGET UNRES_BIN-MD-M PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin )
 312 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 313
 314 #=========================================
 315 # Link libraries
 316 #=========================================
 317 # link MPI library (libmpich.a)
 318 if(UNRES_WITH_MPI)
 319   target_link_libraries( UNRES_BIN-MD-M ${MPI_Fortran_LIBRARIES} )
 320 endif(UNRES_WITH_MPI)
 321 # link libxdrf.a
 322 #message("UNRES_XDRFLIB=${UNRES_XDRFLIB}")
 323 target_link_libraries( UNRES_BIN-MD-M xdrf )
 324
 325 #=========================================
 326 # Install Path
 327 #=========================================
 328 install(TARGETS UNRES_BIN-MD-M DESTINATION ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/unres/MD)
 329
 330 #=========================================
 331 # TESTS
 332 #=========================================
 333
 334 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 335 #SET(UNRES_TEST_FILES
 336 #       ala10.inp
 337 #    )
 338
 339 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 340 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 341 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 342 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 343 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 344 #          POST_BUILD
 345 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 346 #      )
 347 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 348
 349 #=========================================
 350 # Generate data test files
 351 #=========================================
 352
 353 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 354
 355 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 356
 357 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)
 358