source/unres/src_MD-M/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for UNRES with MD for single chains
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_MDM_SRC0
  11         add.f
  12         arcos.f
  13         banach.f
  14         bank.F
  15         blas.f
  16         bond_move.f
  17         cartder.F
  18         cartprint.f
  19         chainbuild.F
  20         check_bond.f
  21         checkder_p.F
  22         check_sc_distr.f
  23         compare_s1.F
  24         contact.f
  25         convert.f
  26         cored.f
  27         csa.f
  28         dihed_cons.F
  29         diff12.f
  30         distfit.f
  31         djacob.f
  32         econstr_local.F
  33         eigen.f
  34         elecont.f
  35         energy_split-sep.F
  36         entmcm.F
  37         fitsq.f
  38         gauss.f
  39         gen_rand_conf.F
  40         geomout.F
  41         gnmr1.f
  42         indexx.f
  43         initialize_p.F
  44         intcartderiv.F
  45         intcor.f
  46         intlocal.f
  47         int_to_cart.f
  48         kinetic_lesyng.f
  49         lagrangian_lesyng.F
  50         local_move.f
  51         map.f
  52         matmult.f
  53         mc.F
  54         mcm.F
  55         MD_A-MTS.F
  56         minimize_p.F
  57         minim_jlee.F
  58         minim_mcmf.F
  59         misc.f
  60         moments.f
  61         MP.F
  62         MREMD.F
  63         muca_md.f
  64         newconf.f
  65         parmread.F
  66         permut.F
  67         pinorm.f
  68         printmat.f
  69         prng_32.F
  70         q_measure.F
  71         ran.f
  72         randgens.f
  73         rattle.F
  74         readpdb.F
  75         readrtns_CSA.F
  76         refsys.f
  77         regularize.F
  78         rescode.f
  79         rmdd.f
  80         rmsd.F
  81         sc_move.F
  82         shift.F
  83         sort.f
  84         stochfric.F
  85         sumsld.f
  86         surfatom.f
  87         test.F
  88         thread.F
  89         timing.F
  90         together.F
  91         unres.F
  92         ssMD.F
  93 )
  94
  95 set(UNRES_MDM_SRC3 energy_p_new_barrier.F energy_p_new-sep_barrier.F gradient_p.F )
  96
  97 set(UNRES_MDM_PP_SRC
  98         bank.F
  99         cartder.F
 100         chainbuild.F
 101         checkder_p.F
 102         compare_s1.F
 103         cored.f
 104         csa.f
 105         dihed_cons.F
 106         diff12.f
 107         econstr_local.F
 108         energy_p_new.F
 109         energy_p_new_barrier.F
 110         energy_p_new-sep_barrier.F
 111         energy_split-sep.F
 112         entmcm.F
 113         gen_rand_conf.F
 114         geomout.F
 115         gradient_p.F
 116         intcor.f
 117         initialize_p.F
 118         intcartderiv.F
 119         lagrangian_lesyng.F
 120         matmult.f
 121         mc.F
 122         mcm.F
 123         MD_A-MTS.F
 124         minimize_p.F
 125         minim_jlee.F
 126         minim_mcmf.F
 127         MP.F
 128         MREMD.F
 129         newconf.f
 130         parmread.F
 131         permut.F
 132         prng_32.F
 133         q_measure1.F
 134         q_measure3.F
 135         q_measure.F
 136         ran.f
 137         rattle.F
 138         readpdb.F
 139         readrtns_CSA.F
 140         regularize.F
 141         rmdd.f
 142         rmsd.F
 143         sc_move.F
 144         shift.F
 145         stochfric.F
 146         sumsld.f
 147         test.F
 148         thread.F
 149         timing.F
 150         together.F
 151         unres.F
 152         proc_proc.c
 153 )
 154
 155
 156 if(NOT Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 157   set(UNRES_MDM_PP_SRC "${UNRES_MDM_PP_SRC} prng_32.F")
 158 endif(NOT Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 159
 160
 161 #================================================
 162 # Set comipiler flags for different sourcefiles
 163 #================================================
 164 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 165   set(FFLAGS0 "-ip -w" )
 166   set(FFLAGS1 "-w -g -d2 -CA -CB" )
 167   set(FFLAGS2 "-w -g -00 ")
 168   set(FFLAGS3 "-w -ipo " )
 169 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 170   set(FFLAGS0 "-std=legacy -I. " )
 171   set(FFLAGS1 "-std=legacy -g -I. " )
 172   set(FFLAGS2 "-std=legacy -I. ")
 173   set(FFLAGS3 "-std=legacy -I. " )
 174 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 175
 176
 177 # Add MPI compiler flags
 178 if(UNRES_WITH_MPI)
 179   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 180   set(FFLAGS1 "${FFLAGS1} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 181   set(FFLAGS2 "${FFLAGS2} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 182   set(FFLAGS3 "${FFLAGS3} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 183 endif(UNRES_WITH_MPI)
 184
 185 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_SRC0} APPEND PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 186 #set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC1} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS1} )
 187 #set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC2} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS2} )
 188 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_SRC3} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS3} )
 189
 190 #=========================================
 191 # Settings for GAB force field
 192 #=========================================
 193 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 194   # set preprocesor flags
 195   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC  -DSCCORPDB -DTIMING -DTIMING_ENE" )
 196
 197 #=========================================
 198 #  Settings for E0LL2Y force field
 199 #=========================================
 200 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 201   # set preprocesor flags
 202   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DSCCORPDB" )
 203 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 204
 205
 206 #=========================================
 207 # System specific flags
 208 #=========================================
 209 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 210   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 211 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 212
 213
 214 #=========================================
 215 # Compiler specific flags
 216 #=========================================
 217
 218 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 219   # Add ifort preprocessor flags
 220   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 221 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 222   # Add new gfortran flags
 223   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 224 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 225   # Add old gfortran flags
 226   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 227 else (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 228   # Default preprocessor flags
 229   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 230 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 231
 232
 233 #=========================================
 234 # Add MPI preprocessor flags
 235 #=========================================
 236 if (UNRES_WITH_MPI)
 237   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMP -DMPI")
 238 endif(UNRES_WITH_MPI)
 239
 240
 241 #=========================================
 242 # add 64-bit specific preprocessor flags
 243 #=========================================
 244 if (architektura STREQUAL "64")
 245   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 246 endif (architektura STREQUAL "64")
 247
 248
 249
 250 # Apply preprocesor flags to *.F files
 251 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 252
 253 # Apply preprocesor flags to proc_proc.c
 254 set_property(SOURCE proc_proc.c PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS "SGI" )
 255
 256
 257 #========================================
 258 #  Setting binary name
 259 #========================================
 260 if(UNRES_WITH_MPI)
 261   # binary with mpi
 262   set(UNRES_BIN "unresMD-M_${Fortran_COMPILER_NAME}_MPICH_${UNRES_MD_FF}.exe")
 263 else(UNRES_WITH_MPI)
 264   # binary without mpi
 265   set(UNRES_BIN "unresMD-M_${Fortran_COMPILER_NAME}_single_${UNRES_MD_FF}.exe")
 266 endif(UNRES_WITH_MPI)
 267
 268 #=========================================
 269 # cinfo.f workaround for cmake
 270 #=========================================
 271 # get the current date
 272 TODAY(DATE)
 273 # generate cinfo.f
 274 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
 275 FILE(WRITE ${CINFO}
 276 "C CMake generated file
 277        subroutine cinfo
 278        include 'COMMON.IOUNITS'
 279        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 280        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 281 ")
 282
 283 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
 284 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
 285 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
 286 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
 287 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
 288 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
 289 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
 290
 291 FILE(APPEND ${CINFO}
 292 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 293        return
 294        end ")
 295
 296
 297 # add include path
 298 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}")
 299
 300 #=========================================
 301 # Set full unres MD-M sources
 302 #=========================================
 303 set(UNRES_MDM_SRCS ${UNRES_MDM_SRC0} ${UNRES_MDM_SRC3} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c )
 304
 305 #=========================================
 306 # Build the binary
 307 #=========================================
 308 add_executable(UNRES_BIN-MD-M ${UNRES_MDM_SRCS} )
 309 set_target_properties(UNRES_BIN-MD-M PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_BIN})
 310 set_property(TARGET UNRES_BIN-MD-M PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin )
 311 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 312
 313 #=========================================
 314 # Link libraries
 315 #=========================================
 316 # link MPI library (libmpich.a)
 317 if(UNRES_WITH_MPI)
 318   target_link_libraries( UNRES_BIN-MD-M ${MPI_Fortran_LIBRARIES} )
 319 endif(UNRES_WITH_MPI)
 320 # link libxdrf.a
 321 #message("UNRES_XDRFLIB=${UNRES_XDRFLIB}")
 322 target_link_libraries( UNRES_BIN-MD-M xdrf )
 323
 324 #=========================================
 325 # Install Path
 326 #=========================================
 327 install(TARGETS UNRES_BIN-MD-M DESTINATION ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/unres/MD)
 328
 329 #=========================================
 330 # TESTS
 331 #=========================================
 332
 333 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 334 #SET(UNRES_TEST_FILES
 335 #       ala10.inp
 336 #    )
 337
 338 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 339 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 340 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 341 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 342 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 343 #          POST_BUILD
 344 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 345 #      )
 346 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 347
 348 #=========================================
 349 # Generate data test files
 350 #=========================================
 351
 352 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 353
 354 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 355
 356 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)
 357