source/unres/src_CSA/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for UNRES CSA version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_CSA_SRC0
  11         arcos.f
  12         banach.f
  13         bank.F
  14         cartder.F
  15         cartprint.f
  16         chainbuild.F
  17         checkder_p.F
  18         cinfo.f
  19         contact.f
  20         convert.f
  21         cored.f
  22         csa.f
  23         dfa.F
  24         diff12.f
  25         distfit.f
  26         djacob.f
  27         econstr_local.F
  28         elecont.f
  29         energy_p_new_barrier.F
  30         fitsq.f
  31         gen_rand_conf.F
  32         geomout_min.F
  33         gradient_p.F
  34         indexx.f
  35         initialize_p.F
  36         intcartderiv.F
  37         intcor.f
  38         intlocal.f
  39         int_to_cart.f
  40         local_move.f
  41         matmult.f
  42         minimize_p.F
  43         minim_jlee.F
  44         minim_mult.F
  45         misc.f
  46         MP.F
  47         newconf.f
  48         parmread.F
  49         pinorm.f
  50         printmat.f
  51         prng_32.F
  52         randgens.f
  53         ran.f
  54         readpdb.F
  55         readrtns_csa.F
  56         rescode.f
  57         rmdd.f
  58         rmsd.F
  59         sc_move.F
  60         shift.F
  61         sumsld.f
  62         test.F
  63         timing.F
  64         TMscore_subroutine.f
  65         together.F
  66         unres_csa.F
  67 )
  68
  69 set(UNRES_CSA_SRC3 energy_p_new_barrier.F gradient_p.F )
  70
  71 set(UNRES_CSA_PP_SRC
  72         bank.F
  73         cartder.F
  74         chainbuild.F
  75         checkder_p.F
  76         dfa.F
  77         econstr_local.F
  78         energy_p_new_barrier.F
  79         gen_rand_conf.F
  80         geomout_min.F
  81         gradient_p.F
  82         initialize_p.F
  83         intcartderiv.F
  84         minimize_p.F
  85         minim_jlee.F
  86         minim_mult.F
  87         MP.F
  88         parmread.F
  89         prng_32.F
  90         readpdb.F
  91         readrtns_csa.F
  92         rmsd.F
  93         sc_move.F
  94         shift.F
  95         test.F
  96         timing.F
  97         together.F
  98         unres_csa.F
  99 )
 100
 101
 102 #================================================
 103 # Set comipiler flags for different sourcefiles
 104 #================================================
 105 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 106   set(FFLAGS0 "-c -ip -w" )
 107   set(FFLAGS1 "-c -w -g -d2 -CA -CB" )
 108   set(FFLAGS2 "-c -w -g -00 ")
 109   #set(FFLAGS3 "-c -w -O3 -ipo -ipo_obj -opt_report" )
 110   set(FFLAGS3 "-c -w -ipo " )
 111 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 112   set(FFLAGS0 "-c -I. " )
 113   set(FFLAGS1 "-c -g -I. " )
 114   set(FFLAGS2 "-c -I. ")
 115   #set(FFLAGS3 "-c -w -O3 -ipo -ipo_obj -opt_report" )
 116   set(FFLAGS3 "-c -I. " )
 117 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 118
 119
 120 # Add MPI compiler flags
 121 if(UNRES_WITH_MPI)
 122   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 123   set(FFLAGS1 "${FFLAGS1} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 124   set(FFLAGS2 "${FFLAGS2} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 125   set(FFLAGS3 "${FFLAGS3} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 126 endif(UNRES_WITH_MPI)
 127
 128 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 129 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC1} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS1} )
 130 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC2} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS2} )
 131 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC3} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS3} )
 132
 133 #=========================================
 134 # Settings for CSA force fields
 135 #=========================================
 136
 137 if(UNRES_CSA_FF STREQUAL "CASP3" )
 138   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_TOR -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC -DMOMENT" )
 139 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "ALPHA")
 140   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 141 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "BETA")
 142   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 143 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "ALPHABETA")
 144   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 145 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "CASP5")
 146   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 147 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "3P")
 148   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 149 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "4P")
 150   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 151 endif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "CASP3")
 152
 153 #=========================================
 154 # System specific flags
 155 #=========================================
 156 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 157   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 158 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 159
 160 #=========================================
 161 # Compiler specific flags
 162 #=========================================
 163
 164 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 165   # Add ifort preprocessor flags
 166   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 167 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 168   # Add new gfortran flags
 169   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 170 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 171   # Add old gfortran flags
 172   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 173 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 174
 175 #=========================================
 176 # Add MPI preprocessor flags
 177 #=========================================
 178 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMP -DMPI")
 179
 180 # Apply preprocesor flags to *.F files
 181 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 182
 183
 184 #========================================
 185 #  Setting binary name
 186 #========================================
 187 set(UNRES_BIN "unresCSA_${Fortran_COMPILER_NAME}_${UNRES_CSA_FF}.exe")
 188
 189 #=========================================
 190 # cinfo.f stupid workaround for cmake
 191 #  - shame on me ]:)
 192 #=========================================
 193 set_property(SOURCE compinfo.c PROPERTY CMAKE_C_FLAGS "-c" )
 194 add_executable(compinfo-csa compinfo.c)
 195 set_target_properties(compinfo-csa PROPERTIES OUTPUT_NAME compinfo)
 196
 197 set(UNRES_CINFO_DIR "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}" )
 198 add_custom_command(OUTPUT ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 199         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/cinfo.f ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 200         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/COMMON.IOUNITS ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/COMMON.IOUNITS
 201         COMMAND ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/compinfo | true
 202         DEPENDS compinfo-csa )
 203 set_property(SOURCE ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 204
 205 #=========================================
 206 # Set full unres CSA sources
 207 #=========================================
 208 set(UNRES_CSA_SRCS ${UNRES_CSA_SRC0} ${UNRES_CSA_SRC3} ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f )
 209
 210 #=========================================
 211 # Build the binary
 212 #=========================================
 213 add_executable(UNRES_BIN-CSA ${UNRES_CSA_SRCS} )
 214 set_target_properties(UNRES_BIN-CSA PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_BIN})
 215
 216 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 217 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 218
 219 #=========================================
 220 # Link libraries
 221 #=========================================
 222 # link MPI library (libmpich.a)
 223 target_link_libraries( UNRES_BIN-CSA ${MPIF_LIBRARIES} )
 224 # link libxdrf.a
 225 #target_link_libraries( ${UNRES_BIN} xdrf )
 226
 227 #=========================================
 228 # TESTS
 229 #=========================================
 230
 231 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 232 #SET(UNRES_TEST_FILES
 233 #       ala10.inp
 234 #    )
 235
 236 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 237 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 238 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 239 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 240 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 241 #          POST_BUILD
 242 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 243 #      )
 244 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 245
 246 #=========================================
 247 # Generate data test files
 248 #=========================================
 249 #  test_single_ala.sh
 250 #=========================================
 251
 252 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 253 #"#!/bin/sh
 254 #export POT=GB
 255 #export PREFIX=ala10
 256 #-----------------------------------------------------------------------------
 257 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 258 #-----------------------------------------------------------------------------
 259 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 260 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 261 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 262 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 263 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 264 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 265 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 266 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 267 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 268 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 269 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 270 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 271 #-----------------------------------------------------------------------------
 272 #$UNRES_BIN
 273 #")
 274
 275 #=========================================
 276 #  ala10.inp
 277 #=========================================
 278
 279 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 280 #"ala10 unblocked
 281 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 282 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 283 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 284 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 285 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 286 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 287 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 288 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 289 #12
 290 #XAAAAAAAAAAX
 291 # 0
 292 # 0
 293 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 294 #   90.0000   90.0000
 295 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 296 #  180.0000
 297 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 298 #  110.0000  110.0000
 299 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 300 # -120.0000 -120.0000
 301 #")
 302
 303
 304 # Add tests
 305
 306 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 307
 308 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 309
 310 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)
 311