source/unres/src_CSA/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for UNRES with MD for single chains
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_CSA_SRC0 unres_csa.F arcos.f cartprint.f chainbuild.F convert.f
  11         initialize_p.F matmult.f parmread.F gen_rand_conf.F
  12         printmat.f pinorm.f randgens.f rescode.f intcor.f timing.F
  13         misc.f intlocal.f cartder.F checkder_p.F econstr_local.F
  14         minimize_p.F sumsld.f cored.f rmdd.f readpdb.F
  15         fitsq.f
  16         contact.f djacob.f
  17         MP.F prng_32.F banach.f rmsd.F elecont.f sc_move.F
  18         local_move.f intcartderiv.F
  19         int_to_cart.f test.F )
  20
  21 set(UNRES_CSA_SRC3 energy_p_new_barrier.F gradient_p.F )
  22
  23 set(UNRES_CSA_PP_SRC cartder.F chainbuild.F checkder_p.F econstr_local.F
  24         energy_p_new_barrier.F gen_rand_conf.F
  25         gradient_p.F initialize_p.F intcartderiv.F
  26         minimize_p.F MP.F parmread.F prng_32.F q_measure1.F q_measure3.F
  27         readpdb.F rmsd.F sc_move.F test.F timing.F
  28         unresi_csa.F )
  29
  30
  31 #================================================
  32 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  33 #================================================
  34 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  35   set(FFLAGS0 "-c -ip -w" )
  36   set(FFLAGS1 "-c -w -g -d2 -CA -CB" )
  37   set(FFLAGS2 "-c -w -g -00 ")
  38   #set(FFLAGS3 "-c -w -O3 -ipo -ipo_obj -opt_report" )
  39   set(FFLAGS3 "-c -w -ipo " )
  40 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
  41   set(FFLAGS0 "-c -I. " )
  42   set(FFLAGS1 "-c -g -I. " )
  43   set(FFLAGS2 "-c -I. ")
  44   #set(FFLAGS3 "-c -w -O3 -ipo -ipo_obj -opt_report" )
  45   set(FFLAGS3 "-c -I. " )
  46 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  47
  48
  49 # Add MPI compiler flags
  50 if(UNRES_WITH_MPI)
  51   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
  52   set(FFLAGS1 "${FFLAGS1} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
  53   set(FFLAGS2 "${FFLAGS2} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
  54   set(FFLAGS3 "${FFLAGS3} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
  55 endif(UNRES_WITH_MPI)
  56
  57 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC0} APPEND PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
  58 #set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC1} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS1} )
  59 #set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC2} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS2} )
  60 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC3} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS3} )
  61
  62 #=========================================
  63 # Settings for GAB force field
  64 #=========================================
  65 if(UNRES_FF STREQUAL "GAB" )
  66   # set preprocesor flags
  67   set(CPPFLAGS "PROCOR -DLINUX -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANGO -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
  68
  69   if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  70     # Add ifort preprocessor flags
  71     set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
  72   elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
  73     # Add gfortran flags
  74     set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
  75   elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
  76     # Add gfortran flags
  77     set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
  78   endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  79
  80 #=========================================
  81 #  Settings for E0LL2Y force field
  82 #=========================================
  83 elseif(UNRES_FF STREQUAL "E0LL2Y")
  84   # set preprocesor flags
  85   set(CPPFLAGS "PROCOR -DLINUX -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0" )
  86
  87   if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  88     # Add ifort preprocessor flags
  89     set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
  90   endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  91
  92 endif(UNRES_FF STREQUAL "GAB")
  93
  94 # Add MPI preprocessor flags
  95 if (UNRES_WITH_MPI)
  96   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMP -DMPI")
  97 endif(UNRES_WITH_MPI)
  98
  99 # Apply preprocesor flags to *.F files
 100 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 101
 102
 103 #========================================
 104 #  Setting binary name
 105 #========================================
 106 if(UNRES_WITH_MPI)
 107   # binary with mpi
 108   set(UNRES_BIN "unres_${Fortran_COMPILER_NAME}_MPICH_${UNRES_FF}.exe")
 109 else(UNRES_WITH_MPI)
 110   # binary without mpi
 111   set(UNRES_BIN "unres_${Fortran_COMPILER_NAME}_single_${UNRES_FF}.exe")
 112 endif(UNRES_WITH_MPI)
 113
 114 #=========================================
 115 # cinfo.f stupid workaround for cmake
 116 #  - shame on me ]:)
 117 #=========================================
 118 set_property(SOURCE compinfo.c PROPERTY CMAKE_C_FLAGS "-c" )
 119 add_executable(compinfo-csa compinfo.c)
 120 set_target_properties(compinfo-csa PROPERTIES OUTPUT_NAME compinfo)
 121
 122 set(UNRES_CINFO_DIR "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}" )
 123 add_custom_command(OUTPUT ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 124         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/cinfo.f ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 125         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/COMMON.IOUNITS ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/COMMON.IOUNITS
 126         COMMAND ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/compinfo | true
 127         DEPENDS ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/cinfo.f )
 128 set_property(SOURCE ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 129
 130 #=========================================
 131 # Set full unres MD sources
 132 #=========================================
 133 set(UNRES_CSA_SRCS ${UNRES_CSA_SRC0} ${UNRES_CSA_SRC3} ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f )
 134
 135
 136
 137 #=========================================
 138 # Build the binary
 139 #=========================================
 140 add_executable(UNRES_BIN-CSA ${UNRES_CSA_SRCS} )
 141 set_target_properties(UNRES_BIN-CSA PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_BIN})
 142
 143 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 144 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 145
 146 #=========================================
 147 # Link libraries
 148 #=========================================
 149 # link MPI library (libmpich.a)
 150 if(UNRES_WITH_MPI)
 151   target_link_libraries( UNRES_BIN-CSA ${MPIF_LIBRARIES} )
 152 endif(UNRES_WITH_MPI)
 153 # link libxdrf.a
 154 #target_link_libraries( ${UNRES_BIN} xdrf )
 155
 156 #=========================================
 157 # TESTS
 158 #=========================================
 159
 160 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 161 #SET(UNRES_TEST_FILES
 162 #       ala10.inp
 163 #    )
 164
 165 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 166 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 167 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 168 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 169 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 170 #          POST_BUILD
 171 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 172 #      )
 173 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 174
 175 #=========================================
 176 # Generate data test files
 177 #=========================================
 178 #  test_single_ala.sh
 179 #=========================================
 180
 181 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 182 #"#!/bin/sh
 183 #export POT=GB
 184 #export PREFIX=ala10
 185 #-----------------------------------------------------------------------------
 186 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 187 #-----------------------------------------------------------------------------
 188 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 189 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 190 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 191 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 192 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 193 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 194 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 195 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 196 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 197 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 198 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 199 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 200 #-----------------------------------------------------------------------------
 201 #$UNRES_BIN
 202 #")
 203
 204 #=========================================
 205 #  ala10.inp
 206 #=========================================
 207
 208 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 209 #"ala10 unblocked
 210 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 211 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 212 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 213 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 214 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 215 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 216 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 217 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 218 #12
 219 #XAAAAAAAAAAX
 220 # 0
 221 # 0
 222 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 223 #   90.0000   90.0000
 224 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 225 #  180.0000
 226 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 227 #  110.0000  110.0000
 228 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 229 # -120.0000 -120.0000
 230 #")
 231
 232
 233 # Add tests
 234
 235 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 236
 237 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 238
 239 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)
 240