source/unres/src-HCD-5D/DIMENSIONS

   1 ********************************************************************************
   2 * Settings for the program of united-residue peptide simulation in real space  *
   3 *                                                                              *
   4 *                -------  As of 6/23/01 -----------                            *
   5 *                                                                              *
   6 ********************************************************************************
   7 C Max. number of processors.
   8       integer maxprocs
   9       parameter (maxprocs=2048)
  10 C Max. number of fine-grain processors
  11       integer max_fg_procs
  12 c      parameter (max_fg_procs=16)
  13       parameter (max_fg_procs=256)
  14 C Max. number of coarse-grain processors
  15       integer max_cg_procs
  16       parameter (max_cg_procs=maxprocs)
  17 C Max. number of AA residues
  18       integer maxres
  19 c      parameter (maxres=70000)
  20       parameter (maxres=1000)
  21 C Max. number of AA residues per chain
  22       integer maxres_chain
  23       parameter (maxres_chain=1200)
  24 C Max. number of cysteines and other bridging residues
  25       integer max_cyst
  26       parameter (max_cyst=100)
  27 C Appr. max. number of interaction sites
  28       integer maxres2,maxres6,maxres2_chain,mmaxres2_chain
  29       parameter (maxres2=2*maxres,maxres6=6*maxres)
  30       parameter (maxres2_chain=2*maxres_chain,
  31      &           mmaxres2_chain=maxres2_chain*(maxres2_chain+1)/2)
  32 C Max number of symetric chains
  33       integer maxchain
  34       parameter (maxchain=250)
  35       integer maxperm
  36 c      parameter (maxperm=5040)
  37       parameter (maxperm=3628800)
  38 C Max. number of variables
  39       integer maxvar
  40       parameter (maxvar=6*maxres)
  41 C Max. number of groups of interactions that a given SC is involved in
  42       integer maxint_gr
  43       parameter (maxint_gr=2)
  44 C Max. number of derivatives of virtual-bond and side-chain vectors in theta
  45 C or phi.
  46       integer maxdim
  47       parameter (maxdim=(maxres_chain-1)*(maxres_chain-2)/2)
  48 c      parameter (maxdim=(maxres-1)*(maxres-2)/2)
  49 C Max. number of SC contacts
  50       integer maxcont
  51       parameter (maxcont=12*maxres)
  52 C Max. number of contacts per residue
  53       integer maxconts
  54       parameter (maxconts=maxres)
  55 c      parameter (maxconts=50)
  56 C Max. number of interactions within cutoff per residue
  57       integer maxint_res
  58       parameter (maxint_res=250)
  59 C Max. number od residues within distance cufoff from a given residue to
  60 C     include in template-based/contact distance restraints.
  61       integer maxcont_res
  62       parameter (maxcont_res=200)
  63 C Max. number of distance/contact-distance restraints
  64       integer maxdim_cont
  65       parameter (maxdim_cont=maxres*maxcont_res)
  66 C Number of AA types (at present only natural AA's will be handled
  67       integer ntyp,ntyp1
  68       parameter (ntyp=24,ntyp1=ntyp+1)
  69 C Max. number of types of dihedral angles & multiplicity of torsional barriers
  70 C and the number of terms in double torsionals
  71       integer maxtor,maxterm,maxlor,maxtermd_1,maxtermd_2,maxtor_kcc,
  72      & maxval_kcc
  73       parameter (maxtor=4,maxterm=10,maxlor=3,maxtermd_1=8,maxtermd_2=8)
  74       parameter (maxtor_kcc=6,maxval_kcc=6)
  75 c Max number of new valence-angle (only) terms
  76       integer maxang_kcc
  77       parameter (maxang_kcc=36)
  78 C Max. number of residue types and parameters in expressions for
  79 C virtual-bond angle bending potentials
  80       integer maxthetyp,maxthetyp1,maxtheterm,maxtheterm2,maxtheterm3,
  81      &  maxsingle,maxdouble,mmaxtheterm
  82       parameter (maxthetyp=3,maxthetyp1=maxthetyp+1,maxtheterm=20,
  83      & maxtheterm2=6,maxtheterm3=4,maxsingle=6,maxdouble=4,
  84      & mmaxtheterm=maxtheterm)
  85 c Max number of torsional terms in SCCOR
  86       integer maxterm_sccor
  87       parameter (maxterm_sccor=6)
  88 C Max. number of lobes in SC distribution
  89       integer maxlob
  90       parameter (maxlob=4)
  91 C Max. number of S-S bridges and other links
  92       integer maxss
  93 c      parameter (maxss=20)
  94       parameter (maxss=max_cyst*(max_cyst-1)/2)
  95 C Max. number of dihedral angle constraints
  96       integer maxdih_constr
  97       parameter (maxdih_constr=maxres)
  98 C Max. number of patterns in the pattern database
  99       integer maxseq
 100       parameter (maxseq=10)
 101 C Max. number of residues in a peptide in the database
 102       integer maxres_base
 103       parameter (maxres_base=10)
 104 C Max. number of threading attempts
 105       integer maxthread
 106       parameter (maxthread=20)
 107 C Max. number of move types in MCM
 108       integer maxmovetype
 109       parameter (maxmovetype=4)
 110 C Max. number of stored confs. in MC/MCM simulation
 111       integer maxsave
 112       parameter (maxsave=20)
 113 C Max. number of energy intervals
 114       integer max_ene
 115       parameter (max_ene=10)
 116 C Max. number of conformations in Master's cache array
 117       integer max_cache
 118       parameter (max_cache=10)
 119 C Max. number of conformations in the pool
 120       integer max_pool
 121       parameter (max_pool=10)
 122 C Number of energy components
 123       integer n_ene,n_ene2
 124       parameter (n_ene=31,n_ene2=2*n_ene)
 125 C Number of threads in deformation
 126       integer max_thread,max_thread2
 127       parameter (max_thread=4,max_thread2=2*max_thread)
 128 C Number of structures to compare at t=0
 129       integer max_threadss,max_threadss2
 130       parameter (max_threadss=8,max_threadss2=2*max_threadss)
 131 C Maxmimum number of angles per residue
 132       integer mxang
 133       parameter (mxang=4)
 134 C Maximum number of groups of angles
 135       integer mxgr
 136       parameter (mxgr=2*maxres)
 137 C Maximum number of chains
 138       integer mxch
 139       parameter (mxch=1)
 140 C Maximum number of generated conformations
 141       integer mxio
 142       parameter (mxio=2)
 143 C Maximum number of n7 generated conformations
 144       integer mxio2
 145       parameter (mxio2=2)
 146 C Maximum number of moves (n1-n8)
 147       integer mxmv
 148       parameter (mxmv=18)
 149 C Maximum number of seed
 150       integer max_seed
 151       parameter (max_seed=1)
 152 C Maximum number of timesteps for which stochastic MD matrices can be stored
 153       integer maxflag_stoch
 154       parameter (maxflag_stoch=0)
 155 C Maximum number of backbone fragments in restraining
 156       integer maxfrag_back
 157       parameter (maxfrag_back=4)
 158 C Maximum number of SC local term fitting function coefficiants
 159       integer maxsccoef
 160       parameter (maxsccoef=65)
 161 C Maximum number of terms in SC bond-stretching potential
 162       integer maxbondterm
 163       parameter (maxbondterm=3)
 164 C Maximum number of conformation stored in cache on each CPU before sending
 165 C to master; depends on nstex / ntwx ratio
 166       integer max_cache_traj
 167       parameter (max_cache_traj=10)
 168 C Maximum number of bins in SAXS restraints
 169       integer MaxSAXS
 170       parameter (MaxSAXS=1000)
 171 C Maximum number of templates in homology-modeling restraints
 172       integer max_template
 173       parameter(max_template=50)
 174 c Maximum number of clusters of templates containing same fragments
 175       integer maxclust
 176       parameter(maxclust=1000)