added CMake files to build cluster/wham/src-M
[unres.git] / source / cluster / wham / src / CMakeLists.txt
1 #
2 # CMake project file for cluster analysis from WHAM for single-chain proteins  
3
4
5 enable_language (Fortran)
6
7 #================================
8 # Set source file lists
9 #================================
10 set(UNRES_CLUSTER_WHAM_SRC0 
11         arcos.f
12         cartprint.f
13         chainbuild.f
14         contact.f
15         convert.f
16         energy_p_new.F
17         fitsq.f
18         geomout.F
19         hc.f
20         icant.f
21         initialize_p.F
22         intcor.f
23         int_from_cart1.f
24         main_clust.F
25         matmult.f
26         misc.f
27         noyes.f
28         parmread.F
29         pinorm.f
30         probabl.F
31         read_coords.F
32         readpdb.f
33         readrtns.F
34         rescode.f
35         setup_var.f
36         srtclust.f
37         timing.F
38         track.F
39         wrtclust.f
40         work_partition.F
41 )
42
43 set(UNRES_CLUSTER_WHAM_PP_SRC
44         energy_p_new.F
45         initialize_p.F
46         geomout.F
47         main_clust.F
48         parmread.F
49         probabl.F
50         read_coords.F
51         readrtns.F
52         timing.F
53         track.F
54         work_partition.F
55         proc_proc.c
56
57
58
59 #================================================
60 # Set comipiler flags for different sourcefiles  
61 #================================================
62 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
63   set(FFLAGS0 "-ip -w -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres " ) 
64 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
65   set(FFLAGS0 "-I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/inlude_unres " ) 
66 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
67
68 # Add MPI compiler flags
69 if(UNRES_WITH_MPI)
70   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
71 endif(UNRES_WITH_MPI)
72
73 set_property(SOURCE ${UNRES_CLUSTER_WHAM_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
74
75 set(CPPFLAGS "PROCOR -DSPLITELE -DPROCOR -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
76
77 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
78   # Add ifort preprocessor flags
79   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI") 
80 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
81   # Add new gfortran flags
82   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77") 
83 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
84   # Add old gfortran flags
85   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77") 
86 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
87
88
89 #=========================================
90 # System specific flags
91 #=========================================
92 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
93   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX") 
94 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
95
96 #=========================================
97 # Add MPI preprocessor flags
98 #=========================================
99 if (UNRES_WITH_MPI)
100   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMP -DMPI") 
101 endif(UNRES_WITH_MPI)
102
103
104 #=========================================
105 # Apply preprocesor flags to *.F files
106 #=========================================
107 set_property(SOURCE ${UNRES_CLUSTER_WHAM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )  
108
109
110 #========================================
111 #  Setting binary name
112 #========================================
113 set(UNRES_CLUSTER_WHAM_BIN "unres_clustMD.exe")
114
115 #=========================================
116 # cinfo.f stupid workaround for cmake
117 #  - shame on me ]:)
118 #=========================================
119 #set_property(SOURCE compinfo.c PROPERTY CMAKE_C_FLAGS "-c" )
120 #add_executable(compinfo-wham-m compinfo.c)
121 #set_target_properties(compinfo-wham-m PROPERTIES OUTPUT_NAME compinfo)
122
123 #set(UNRES_CINFO_DIR "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}" )
124 #add_custom_command(OUTPUT ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f 
125 #       COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/cinfo.f ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
126 #       COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/COMMON.IOUNITS ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/COMMON.IOUNITS 
127 #       COMMAND ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/compinfo | true     
128 #       DEPENDS compinfo-wham-m )
129 #set_property(SOURCE ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
130
131 #=========================================
132 # Set full unres CLUSTER sources
133 #=========================================
134 set(UNRES_CLUSTER_WHAM_SRCS ${UNRES_CLUSTER_WHAM_SRC0} ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/proc_proc.c)
135
136 #=========================================
137 # Build the binary
138 #=========================================
139 add_executable(UNRES_CLUSTER_WHAM_BIN ${UNRES_CLUSTER_WHAM_SRCS} )
140 set_target_properties(UNRES_CLUSTER_WHAM_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_CLUSTER_WHAM_BIN})
141
142 #=========================================
143 # Link libraries
144 #=========================================
145 # link MPI library (libmpich.a)  
146 if(UNRES_WITH_MPI)
147   target_link_libraries( UNRES_CLUSTER_WHAM_BIN ${MPIF_LIBRARIES} )
148 endif(UNRES_WITH_MPI)
149 # link libxdrf.a 
150 target_link_libraries( UNRES_CLUSTER_WHAM_BIN xdrf )
151
152 #=========================================
153 # TESTS 
154 #=========================================
155
156 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
157 #SET(UNRES_TEST_FILES
158 #       ala10.inp
159 #    )
160
161 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
162 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
163 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
164 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
165 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
166 #          POST_BUILD
167 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
168 #      )
169 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
170
171 #=========================================
172 # Generate data test files
173 #=========================================
174 #  test_single_ala.sh
175 #=========================================
176
177 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
178 #"#!/bin/sh
179 #export POT=GB
180 #export PREFIX=ala10
181 #-----------------------------------------------------------------------------
182 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
183 #-----------------------------------------------------------------------------
184 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
185 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
186 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
187 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
188 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
189 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
190 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
191 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
192 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
193 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
194 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
195 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
196 #-----------------------------------------------------------------------------
197 #$UNRES_BIN
198 #")
199
200 #=========================================
201 #  ala10.inp
202 #=========================================
203
204 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
205 #"ala10 unblocked
206 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
207 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
208 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
209 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
210 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
211 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
212 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
213 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
214 #12
215 #XAAAAAAAAAAX 
216 # 0
217 # 0
218 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000 
219 #   90.0000   90.0000
220 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
221 #  180.0000
222 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000 
223 #  110.0000  110.0000
224 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
225 # -120.0000 -120.0000
226 #")
227
228
229 # Add tests
230
231 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
232
233 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
234
235 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)