Dodanie przykladow do MD, REMD, MREMD i mikrokanonicznego
[unres.git] / examples / unres / new / REMD / with_constrains / Berendsen / ff_1l2y / 1L2Y_REMD.inp
1 1L2Y simulation with constrains in ff_1l2y Replica Exchange MD simulation
2 SEED=-3059743 PDBREF RE PDBSTART RESCALE_MODE=2 CONSTR_DIST=3
3 nstep=1000000 ntwe=10000 ntwx=10000 dt=0.20 damax=10.0 lang=0 tbf              &
4 tau_bath=1.0 t_bath=300 reset_vel=10000 respa ntime_split=1 maxtime_split=64
5 nrep=16 nstex=100000 tlist mlist traj1file rest1file sync nsyn=100000
6   250  260  270  280  290  300  310  320  330  340  350  360  370  380  390  400
7     1    1    1    1    1    1    1    1    1    1    1    1    1    1    1    1  
8 WLONG=1.00000 WSCP=1.23315 WELEC=0.84476 WBOND=1.00000 WANG=0.62954            &
9 WSCLOC=0.10554 WTOR=1.84316 WTORD=1.26571 WCORRH=0.19212 WCORR5=0.00000        &
10 WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.37357 WTURN3=1.40323 WTURN4=0.64673 WTURN6=0.00000    &
11 WVDWPP=0.23173 WHPB=1.00000 WSCCOR=0.0                                         &
12 CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
13 ../../../../1L2Y.pdb
14  0
15  0
16 NFRAG=1 IFRAG=2 10 WFRAG=0.05