examples/unres/new/REMD/Nose-Hoover/ff_gab/1L2Y_REMD.out_GB000

   1 --------------------------------------------------------------------------------
   2                               FILE ASSIGNMENT
   3 --------------------------------------------------------------------------------
   4  Input file                      : 1L2Y_REMD.inp
   5  Output file                     : 1L2Y_REMD.out_GB000
   6
   7  Sidechain potential file        :
   8  /users/pk376/unres-git/unres/PARAM/sc_GB_opt.1e0g-52-17k-2k-newclass-shan1e9_ga
   9  p8g-sc
  10  SCp potential file              : /users/pk376/unres-git/unres/PARAM/scp.parm
  11  Electrostatic potential file    :
  12  /users/pk376/unres-git/unres/PARAM/electr_631Gdp.parm
  13  Cumulant coefficient file       :
  14  /users/pk376/unres-git/unres/PARAM/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
  15  Torsional parameter file        :
  16  /users/pk376/unres-git/unres/PARAM/torsion_631Gdp.parm
  17  Double torsional parameter file :
  18  /users/pk376/unres-git/unres/PARAM/torsion_double_631Gdp.parm
  19  SCCOR parameter file : /users/pk376/unres-git/unres/PARAM/sccor_pdb_shelly.dat
  20  Bond & inertia constant file    : /users/pk376/unres-git/unres/PARAM/bond.parm
  21  Bending parameter file          :
  22  /users/pk376/unres-git/unres/PARAM/thetaml.5parm
  23  Rotamer parameter file          :
  24  /users/pk376/unres-git/unres/PARAM/scgauss.parm
  25  Threading database              :
  26  /users/pk376/unres-git/unres/PARAM/patterns.cart
  27 --------------------------------------------------------------------------------
  28 ********************************************************************************
  29 United-residue force field calculation - parallel job.
  30 ********************************************************************************
  31  ### LAST MODIFIED  03/28/12 23:29 by czarek
  32  ++++ Compile info ++++
  33  Version 2.5 build 302
  34  compiled Mon Jul 23 17:42:12 2012
  35  compiled by jal47@matrix.chem.cornell.edu
  36  OS name:    Linux
  37  OS release: 2.6.34.9-69.fc13.x86_64
  38  OS version: #1 SMP Tue May 3 09:23:03 UTC 2011
  39  flags:
  40  INSTALL_DIR = /users/software/mpich-1.2.7p1_int...
  41  FC= ifort
  42  OPT =  -g -ip -w -CB
  43  FFLAGS = -c ${OPT} -I$(INSTALL_DIR)/include
  44  FFLAGS1 = -c -w -g -d2 -CA -CB -I$(INSTALL_DIR)...
  45  FFLAGS2 = -c -w -g -O0 -I$(INSTALL_DIR)/include
  46  FFLAGSE = -c -w -O3 -ipo -ipo_obj  -opt_report ...
  47  LIBS = -L$(INSTALL_DIR)/lib -lmpich xdrf/libxdr...
  48  ARCH = LINUX
  49  PP = /lib/cpp -P
  50  object = unres.o arcos.o cartprint.o chainbuild...
  51  GAB: CPPFLAGS = -DPROCOR -DLINUX -DPGI -DUNRES ...
  52  GAB: BIN = ../../../bin/unres/MD/unres_ifort_MP...
  53  E0LL2Y: CPPFLAGS = -DPROCOR -DLINUX -DPGI -DUNR...
  54  E0LL2Y: BIN = ../../../bin/unres/MD/unres_ifort...
  55  ++++ End of compile info ++++
  56
  57 Potential is GB , exponents are   6 12
  58
  59 Disulfide bridge parameters:
  60 S-S bridge energy:      -5.50
  61 d0cm:      3.78 akcm:     15.10
  62 akth:     11.00 akct:     12.00
  63 v1ss:     -1.08 v2ss:      7.61 v3ss:     13.70
  64  MPI: node=            0  iseed(4)=            0           0         -46
  65       -45086
  66  ran_num  6.422640197456531E-013
  67 RMSDBC =        3.0
  68 RMSDBC1 =        0.5
  69 RMSDBC1MAX =        1.5
  70 DRMS    =        0.1
  71 RMSDBCM =        3.0
  72 Time limit (min):     960.0
  73  RESCALE_MODE           2
  74 Library  routine used to diagonalize matrices.
  75
  76 =========================== Parameters of the MD run ===========================
  77
  78 The units are:
  79 positions: angstrom, time: 48.9 fs
  80 velocity: angstrom/(48.9 fs), acceleration: angstrom/(48.9 fs)**2
  81 energy: kcal/mol, temperature: K
  82
  83                                        Number of time steps:   1000000
  84                  Initial time step of numerical integration:   0.10000 natural units
  85                                                                4.89000 fs
  86 A-MTS algorithm used; initial time step for fast-varying short-range forces split into   1 steps.
  87 Short-range force cutoff 2.00 lambda 0.30
  88 Maximum acceleration threshold to reduce the time step/increase split number:  10.00000
  89 Maximum predicted energy drift to reduce the timestep/increase split number:  10.00000
  90             Maximum velocity threshold to reduce velocities:  20.00000
  91                                Frequency of property output:     10000
  92                              Frequency of coordinate output:     10000
  93 Nose-Hoover bath calculation
  94 Mol.Phys. 87 1117 (1996) Martyna et al.
  95 NVT-XI-RESPA algorithm
  96                                                 Temperature: 300.00000
  97                                                          Q =   1.00000
  98
  99 ============================== End of MD run setup =============================
 100
 101  REMD setup
 102  NREP=           16
 103  NSTEX=       100000
 104  SYNC=  T
 105  NSYN=       100000
 106  TRAJCACHE=            1
 107  tlist   250.000000000000        260.000000000000        270.000000000000
 108    280.000000000000        290.000000000000        300.000000000000
 109    310.000000000000        320.000000000000        330.000000000000
 110    340.000000000000        350.000000000000        360.000000000000
 111    370.000000000000        380.000000000000        390.000000000000
 112    400.000000000000
 113  mlist           1           1           1           1           1           1
 114            1           1           1           1           1           1
 115            1           1           1           1
 116  Total number of replicas           16
 117
 118 ============================== End of REMD run setup =============================
 119
 120
 121 Energy-term weights (unscaled):
 122
 123 WSCC=     1.352790 (SC-SC)
 124 WSCP=     1.593040 (SC-p)
 125 WELEC=    0.715340 (p-p electr)
 126 WVDWPP=   0.113710 (p-p VDW)
 127 WBOND=    1.000000 (stretching)
 128 WANG=     1.138730 (bending)
 129 WSCLOC=   0.162580 (SC local)
 130 WTOR=     1.985990 (torsional)
 131 WTORD=    1.570690 (double torsional)
 132 WSTRAIN=  1.000000 (SS bridges & dist. cnstr.)
 133 WEL_LOC=  0.160360 (multi-body 3-rd order)
 134 WCORR4=   0.428870 (multi-body 4th order)
 135 WCORR5=   0.000000 (multi-body 5th order)
 136 WCORR6=   0.000000 (multi-body 6th order)
 137 WSCCOR=   0.000000 (back-scloc correlation)
 138 WTURN3=   1.687220 (turns, 3rd order)
 139 WTURN4=   0.662300 (turns, 4th order)
 140 WTURN6=   0.000000 (turns, 6th order)
 141
 142 Hydrogen-bonding correlation between contact pairs of peptide groups
 143
 144 Scaling factor of 1,4 SC-p interactions:   0.400
 145 General scaling factor of SC-p interactions:   1.000
 146
 147 Energy-term weights (scaled):
 148
 149 WSCC=     1.352790 (SC-SC)
 150 WSCP=     1.593040 (SC-p)
 151 WELEC=    0.715340 (p-p electr)
 152 WVDWPP=   0.113710 (p-p VDW)
 153 WBOND=    1.000000 (stretching)
 154 WANG=     1.138730 (bending)
 155 WSCLOC=   0.162580 (SC local)
 156 WTOR=     1.985990 (torsional)
 157 WTORD=    1.570690 (double torsional)
 158 WSTRAIN=  1.000000 (SS bridges & dist. cnstr.)
 159 WEL_LOC=  0.160360 (multi-body 3-rd order)
 160 WCORR4=   0.428870 (multi-body 4th order)
 161 WCORR5=   0.000000 (multi-body 5th order)
 162 WCORR6=   0.000000 (multi-body 6th order)
 163 WSCCOR=   0.000000 (back-scloc correlatkion)
 164 WTURN3=   1.687220 (turns, 3rd order)
 165 WTURN4=   0.662300 (turns, 4th order)
 166 WTURN6=   0.000000 (turns, 6th order)
 167  Reference temperature for weights calculation:   300.000000000000
 168  Parameters of the SS-bond potential:
 169  D0CM   3.78000000000000       AKCM   15.1000000000000       AKTH
 170    11.0000000000000       AKCT   12.0000000000000
 171  V1SS  -1.08000000000000       V2SS   7.61000000000000       V3SS
 172    13.7000000000000
 173  EBR  -5.50000000000000
 174 PDB data will be read from file ../../../1L2Y.pdb
 175  Nres:    21
 176 Backbone and SC coordinates as read from the PDB
 177   1 21  D    -9.841   4.399  -5.051       -9.841   4.399  -5.051
 178   2 14  ASN  -8.608   3.135  -1.618      -10.407   3.153  -2.437
 179   3  5  LEU  -4.923   4.002  -2.452       -4.618   6.091  -1.850
 180   4  8  TYR  -3.690   2.738   0.981       -1.959   3.143   3.797
 181   5  4  ILE  -5.857  -0.449   0.613       -7.484  -0.369   1.074
 182   6 13  GLN  -4.122  -1.167  -2.743       -5.089  -1.450  -4.853
 183   7  7  TRP  -0.716  -0.631  -0.993        1.727   0.440   1.450
 184   8  5  LEU  -1.641  -2.932   1.963       -2.244  -2.097   3.799
 185   9 19  LYS  -3.024  -5.791  -0.269       -3.820  -5.527  -3.146
 186  10 16  ASP   0.466  -6.016  -1.905        0.653  -5.125  -3.676
 187  11 10  GLY   2.060  -6.618   1.593        2.060  -6.618   1.593
 188  12 10  GLY   2.626  -2.967   2.723        2.626  -2.967   2.723
 189  13 20  PRO   6.333  -2.533   3.806        5.724  -2.372   5.058
 190  14 12  SER   7.049  -6.179   2.704        6.757  -6.938   3.675
 191  15 12  SER   6.389  -5.315  -1.015        5.245  -5.350  -1.546
 192  16 10  GLY   9.451  -3.116  -1.870        9.451  -3.116  -1.870
 193  17 18  ARG   7.289   0.084  -2.054        5.225  -1.826  -3.986
 194  18 20  PRO   6.782   3.088   0.345        7.458   3.741  -0.688
 195  19 20  PRO   3.287   4.031   1.686        4.025   4.206   2.856
 196  20 20  PRO   1.185   6.543  -0.353        0.358   5.421  -0.430
 197  21 12  SER   0.852  10.027   1.285        1.151  10.636   1.488
 198  22 21  D    -1.250  12.539  -0.754       -1.250  12.539  -0.754
 199 nsup= 20 nstart_sup=  2
 200  ITEL
 201            1          21           0
 202            2          14           1
 203            3           5           1
 204            4           8           1
 205            5           4           1
 206            6          13           1
 207            7           7           1
 208            8           5           1
 209            9          19           1
 210           10          16           1
 211           11          10           1
 212           12          10           2
 213           13          20           1
 214           14          12           1
 215           15          12           1
 216           16          10           1
 217           17          18           2
 218           18          20           2
 219           19          20           2
 220           20          20           1
 221           21          12           0
 222  ns=           0  iss:
 223 Boundaries in phi angle sampling:
 224 D      1    -180.0     180.0
 225 ASN    2    -180.0     180.0
 226 LEU    3    -180.0     180.0
 227 TYR    4    -180.0     180.0
 228 ILE    5    -180.0     180.0
 229 GLN    6    -180.0     180.0
 230 TRP    7    -180.0     180.0
 231 LEU    8    -180.0     180.0
 232 LYS    9    -180.0     180.0
 233 ASP   10    -180.0     180.0
 234 GLY   11    -180.0     180.0
 235 GLY   12    -180.0     180.0
 236 PRO   13    -180.0     180.0
 237 SER   14    -180.0     180.0
 238 SER   15    -180.0     180.0
 239 GLY   16    -180.0     180.0
 240 ARG   17    -180.0     180.0
 241 PRO   18    -180.0     180.0
 242 PRO   19    -180.0     180.0
 243 PRO   20    -180.0     180.0
 244 SER   21    -180.0     180.0
 245 D     22    -180.0     180.0
 246 nsup= 20
 247  nsup=          20  nstart_sup=           2  nstart_seq=           2
 248  NZ_START=           2  NZ_END=          21
 249  IZ_SC=           0
 250  Contact order:  0.308441558441558
 251  Shifting contacts:           2           2
 252            1  ILE            5  ASN            2
 253            2  TRP            7  TYR            4
 254            3  LEU            8  TYR            4
 255            4  LEU            8  ILE            5
 256            5  LYS            9  GLN            6
 257            6  GLY           12  TRP            7
 258            7  GLY           12  LEU            8
 259            8  SER           14  GLY           11
 260            9  SER           15  ASP           10
 261           10  SER           15  GLY           11
 262           11  PRO           19  TRP            7
 263           12  PRO           20  LEU            3
 264           13  PRO           20  TYR            4
 265           14  PRO           20  TRP            7
 266 Extended chain initial geometry.
 267
 268 Geometry of the virtual chain.
 269   Res           d     Theta     Gamma       Dsc     Alpha      Beta
 270 D     1     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
 271 ASN   2     3.800     0.000     0.000     1.684   110.000  -120.000
 272 LEU   3     3.800    90.000     0.000     1.939   110.000  -120.000
 273 TYR   4     3.800    90.000   180.000     2.484   110.000  -120.000
 274 ILE   5     3.800    90.000   180.000     1.776   110.000  -120.000
 275 GLN   6     3.800    90.000   180.000     2.240   110.000  -120.000
 276 TRP   7     3.800    90.000   180.000     2.605   110.000  -120.000
 277 LEU   8     3.800    90.000   180.000     1.939   110.000  -120.000
 278 LYS   9     3.800    90.000   180.000     2.541   110.000  -120.000
 279 ASP  10     3.800    90.000   180.000     1.709   110.000  -120.000
 280 GLY  11     3.800    90.000   180.000     0.000   110.000  -120.000
 281 GLY  12     3.800    90.000   180.000     0.000   110.000  -120.000
 282 PRO  13     3.800    90.000   180.000     1.345   110.000  -120.000
 283 SER  14     3.800    90.000   180.000     1.150   110.000  -120.000
 284 SER  15     3.800    90.000   180.000     1.150   110.000  -120.000
 285 GLY  16     3.800    90.000   180.000     0.000   110.000  -120.000
 286 ARG  17     3.800    90.000   180.000     3.020   110.000  -120.000
 287 PRO  18     3.800    90.000   180.000     1.345   110.000  -120.000
 288 PRO  19     3.800    90.000   180.000     1.345   110.000  -120.000
 289 PRO  20     3.800    90.000   180.000     1.345   110.000  -120.000
 290 SER  21     3.800    90.000   180.000     1.150   110.000  -120.000
 291 D    22     3.800    90.000   180.000     0.000     0.000     0.000
 292
 293
 294 ********************************************************************************
 295                     Processor   0: end reading molecular data.
 296 ********************************************************************************
 297
 298
 299 Replica exchange molecular dynamics (REMD) calculation.
 300
 301 ********************************************************************************
 302
 303  Calling chainbuild
 304  Calling REMD
 305  MREMD          16 time before  1.171875000000000E-002
 306  NREP=          16
 307  i2rep      1      2      3      4      5      6      7      8      9     10
 308      11     12     13     14     15     16
 309  i2set      1      1      1      1      1      1      1      1      1      1
 310       1      1      1      1      1      1
 311  i,j,il,il1,i_index(i,j,il,il1)
 312 ifirst   1
 313   nupa   1:   2
 314 ndowna   1:
 315   nupa   2:   3
 316 ndowna   2:   1
 317   nupa   3:   4
 318 ndowna   3:   2
 319   nupa   4:   5
 320 ndowna   4:   3
 321   nupa   5:   6
 322 ndowna   5:   4
 323   nupa   6:   7
 324 ndowna   6:   5
 325   nupa   7:   8
 326 ndowna   7:   6
 327   nupa   8:   9
 328 ndowna   8:   7
 329   nupa   9:  10
 330 ndowna   9:   8
 331   nupa  10:  11
 332 ndowna  10:   9
 333   nupa  11:  12
 334 ndowna  11:  10
 335   nupa  12:  13
 336 ndowna  12:  11
 337   nupa  13:  14
 338 ndowna  13:  12
 339   nupa  14:  15
 340 ndowna  14:  13
 341   nupa  15:  16
 342 ndowna  15:  14
 343   nupa  16:
 344 ndowna  16:  15
 345                                            REMD Temperature: 250.00000
 346 ====================MD calculation start====================
 347  Initial velocities randomly generated
 348  Initial velocities
 349   0   0.02069   0.05735  -0.16550      0.00000   0.00000   0.00000
 350   1   0.00000   0.00000   0.00000      0.00000   0.00000   0.00000
 351   2  -0.32876  -0.20726  -0.00156     -0.06303  -0.02233   0.22619
 352   3   0.25246   0.18847   0.12917      0.23917   0.13789   0.08528
 353   4   0.09890  -0.10900   0.13430      0.09430  -0.08759   0.02991
 354   5   0.05293  -0.08192   0.07599      0.03541   0.02418  -0.13426
 355   6   0.01106   0.15012  -0.13429     -0.01486   0.10588  -0.15072
 356   7  -0.00922  -0.05032   0.03343     -0.17306   0.05869   0.04136
 357   8  -0.01642   0.12268  -0.04117      0.02116   0.09728   0.03398
 358   9  -0.24153  -0.01761   0.08700     -0.20570  -0.15587  -0.04194
 359  10   0.12837  -0.05524  -0.16763      0.18636  -0.14195  -0.15819
 360  11  -0.12912   0.12012  -0.00669      0.00000   0.00000   0.00000
 361  12   0.18024  -0.22147   0.01606      0.00000   0.00000   0.00000
 362  13  -0.13972   0.25567   0.06619      0.05987   0.13532   0.09181
 363  14   0.10136  -0.29158   0.14318     -0.02692  -0.08844   0.04927
 364  15   0.13268   0.09441  -0.21684     -0.12710   0.07259   0.06988
 365  16  -0.10926   0.13472   0.13695      0.00000   0.00000   0.00000
 366  17  -0.08222  -0.14474  -0.18471     -0.07262  -0.07774  -0.09353
 367  18   0.22036   0.08274   0.12819     -0.01893   0.09330   0.04480
 368  19  -0.13103  -0.06596  -0.26603     -0.11327  -0.06258  -0.02718
 369  20   0.26050   0.08237   0.51647      0.02143   0.14877   0.17591
 370  21   0.00000   0.00000   0.00000     -0.12529  -0.05874  -0.20044
 371  22   0.00000   0.00000   0.00000      0.00000   0.00000   0.00000
 372  Calling the zero-angular  momentum subroutine
 373  vcm right after adjustment:
 374   2.286804207044001E-017  1.061730524699000E-017 -3.266863152920001E-018
 375
 376
 377               alpha-carbon coordinates            centroid coordinates
 378              X           Y           Z          X           Y           Z
 379 D  (  1)     0.00000     0.00000     0.00000     0.00000     0.00000     0.00000
 380 ASN(  2)     3.80000     0.00000     0.00000     3.64779     0.96674     1.37044
 381 LEU(  3)     3.80000    -3.80000     0.00000     2.68687    -3.62474    -1.57795
 382 TYR(  4)     7.60000    -3.80000     0.00000     7.37548    -2.37399     2.02147
 383 ILE(  5)     7.60000    -7.60000     0.00000     6.58044    -7.43947    -1.44530
 384 GLN(  6)    11.40000    -7.60000     0.00000    11.19753    -6.31407     1.82291
 385 TRP(  7)    11.40000   -11.40000     0.00000     9.90453   -11.16454    -2.11994
 386 LEU(  8)    15.20000   -11.40000     0.00000    15.02474   -10.28687     1.57795
 387 LYS(  9)    15.20000   -15.20000     0.00000    13.74127   -14.97033    -2.06786
 388 ASP( 10)    19.00000   -15.20000     0.00000    18.84553   -14.21890     1.39078
 389 GLY( 11)    19.00000   -19.00000     0.00000    19.00000   -19.00000     0.00000
 390 GLY( 12)    22.80000   -19.00000     0.00000    22.80000   -19.00000     0.00000
 391 PRO( 13)    22.80000   -22.80000     0.00000    22.02787   -22.67843    -1.09456
 392 SER( 14)    26.60000   -22.80000     0.00000    26.49606   -22.13981     0.93587
 393 SER( 15)    26.60000   -26.60000     0.00000    25.93981   -26.49606    -0.93587
 394 GLY( 16)    30.40000   -26.60000     0.00000    30.40000   -26.60000     0.00000
 395 ARG( 17)    30.40000   -30.40000     0.00000    28.66629   -30.12703    -2.45767
 396 PRO( 18)    34.20000   -30.40000     0.00000    34.07843   -29.62787     1.09456
 397 PRO( 19)    34.20000   -34.20000     0.00000    33.42787   -34.07843    -1.09456
 398 PRO( 20)    38.00000   -34.20000     0.00000    37.87843   -33.42787     1.09456
 399 SER( 21)    38.00000   -38.00000     0.00000    37.33981   -37.89606    -0.93587
 400 D  ( 22)    41.80000   -38.00000     0.00000    41.80000   -38.00000     0.00000
 401
 402 Geometry of the virtual chain.
 403   Res           d     Theta     Gamma       Dsc     Alpha      Beta
 404 D     1     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
 405 ASN   2     3.800     0.000     0.000     1.684   110.000  -120.000
 406 LEU   3     3.800    90.000     0.000     1.939   110.000  -120.000
 407 TYR   4     3.800    90.000   180.000     2.484   110.000  -120.000
 408 ILE   5     3.800    90.000   180.000     1.776   110.000  -120.000
 409 GLN   6     3.800    90.000   180.000     2.240   110.000  -120.000
 410 TRP   7     3.800    90.000   180.000     2.605   110.000  -120.000
 411 LEU   8     3.800    90.000   180.000     1.939   110.000  -120.000
 412 LYS   9     3.800    90.000   180.000     2.541   110.000  -120.000
 413 ASP  10     3.800    90.000   180.000     1.709   110.000  -120.000
 414 GLY  11     3.800    90.000   180.000     0.000   180.000   180.000
 415 GLY  12     3.800    90.000   180.000     0.000   180.000   180.000
 416 PRO  13     3.800    90.000   180.000     1.345   110.000  -120.000
 417 SER  14     3.800    90.000   180.000     1.150   110.000  -120.000
 418 SER  15     3.800    90.000   180.000     1.150   110.000  -120.000
 419 GLY  16     3.800    90.000   180.000     0.000   180.000   180.000
 420 ARG  17     3.800    90.000   180.000     3.020   110.000  -120.000
 421 PRO  18     3.800    90.000   180.000     1.345   110.000  -120.000
 422 PRO  19     3.800    90.000   180.000     1.345   110.000  -120.000
 423 PRO  20     3.800    90.000   180.000     1.345   110.000  -120.000
 424 SER  21     3.800    90.000   180.000     1.150   110.000  -120.000
 425 D    22     3.800    90.000   180.000     0.000   180.000   180.000
 426  H0=    106.458545596980
 427  Potential energy and its components
 428
 429 Virtual-chain energies:
 430
 431 EVDW=     -1.680592E+01 WEIGHT=    1.352790D+00 (SC-SC)
 432 EVDW2=     2.387106E+01 WEIGHT=    1.593040D+00 (SC-p)
 433 EES=      -7.520330E+00 WEIGHT=    8.010569D-01 (p-p)
 434 EVDWPP=   -2.624923E+01 WEIGHT=    1.137100D-01 (p-p VDW)
 435 ESTR=      8.665144E-27 WEIGHT=    1.000000D+00 (stretching)
 436 EBE=       1.082023E+00 WEIGHT=    1.138730D+00 (bending)
 437 ESC=       9.168846E+01 WEIGHT=    1.625800D-01 (SC local)
 438 ETORS=     2.664535E-15 WEIGHT=    2.223965D+00 (torsional)
 439 ETORSD=   -2.547586E+00 WEIGHT=    1.930120D+00 (double torsional)
 440 EHPB=      0.000000E+00 WEIGHT=    1.000000D+00 (SS bridges & dist. cnstr.)
 441 ECORR4=   -4.501075E+00 WEIGHT=    5.672548D-01 (multi-body)
 442 ECORR5=    0.000000E+00 WEIGHT=    0.000000D+00 (multi-body)
 443 ECORR6=    0.000000E+00 WEIGHT=    0.000000D+00 (multi-body)
 444 EELLO=     2.197932E+01 WEIGHT=    1.970561D-01 (electrostatic-local)
 445 ETURN3=   -1.258124E+00 WEIGHT=    2.073316D+00 (turns, 3rd order)
 446 ETURN4=    9.498513E+00 WEIGHT=    8.760064D-01 (turns, 4th order)
 447 ETURN6=    0.000000E+00 WEIGHT=    0.000000D+00 (turns, 6th order)
 448 ESCCOR=    0.000000E+00 WEIGHT=    0.000000D+00 (backbone-rotamer corr)
 449 EDIHC=     0.000000E+00 (dihedral angle constraints)
 450 ESS=       0.000000E+00 (disulfide-bridge intrinsic energy)
 451 UCONST=     0.000000E+00 (Constraint energy)
 452 ETOT=      2.499553E+01 (total)
 453
 454 Initial:
 455            Kinetic energy   2.63515E+01
 456          potential energy   2.49955E+01
 457              total energy   5.13470E+01
 458
 459     maximum acceleration    7.10627E-01
 460
 461  Setup time  1.953125000000000E-002
 462  REMD synchro at      100000
 463          ntwx_cache       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1
 464  MIN ii_write=           1
 465  REMD gather times=   41.2968750000000       0.000000000000000E+000
 466  REMD writing rst time=  3.906250000000000E-003
 467  REMD writing traj time=  0.000000000000000E+000
 468  NREP          16
 469 ACC   1   250.00000     1.00000    1
 470 ACC   2   260.00000     1.00000    1
 471 ACC   3   270.00000     0.00000    1
 472 ACC   4   280.00000     1.00000    1
 473 ACC   5   290.00000     1.00000    1
 474 ACC   6   300.00000     0.00000    1
 475 ACC   7   310.00000     1.00000    1
 476 ACC   8   320.00000     1.00000    1
 477 ACC   9   330.00000     0.00000    1
 478 ACC  10   340.00000     0.00000    1
 479 ACC  11   350.00000     0.00000    1
 480 ACC  12   360.00000     1.00000    1
 481 ACC  13   370.00000     1.00000    1
 482 ACC  14   380.00000     1.00000    1
 483 ACC  15   390.00000     1.00000    1
 484  REMD scatter time=  0.000000000000000E+000
 485  REMD exchange time=  3.906250000000000E-003
 486  REMD synchro at      200000
 487          ntwx_cache       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1
 488  MIN ii_write=           1
 489  REMD gather times=   82.8515625000000       0.000000000000000E+000
 490  REMD writing rst time=  3.906250000000000E-003
 491  REMD writing traj time=  3.906250000000000E-003
 492  NREP          16
 493 ACC   1   250.00000     0.50000    2
 494 ACC   2   260.00000     0.50000    2
 495 ACC   3   270.00000     0.00000    2
 496 ACC   4   280.00000     1.00000    2
 497 ACC   5   290.00000     1.00000    2
 498 ACC   6   300.00000     0.50000    2
 499 ACC   7   310.00000     0.50000    2
 500 ACC   8   320.00000     1.00000    2
 501 ACC   9   330.00000     0.00000    2
 502 ACC  10   340.00000     0.50000    2
 503 ACC  11   350.00000     0.50000    2
 504 ACC  12   360.00000     1.00000    2
 505 ACC  13   370.00000     1.00000    2
 506 ACC  14   380.00000     1.00000    2
 507 ACC  15   390.00000     1.00000    2
 508  REMD scatter time=  0.000000000000000E+000
 509  REMD exchange time=  7.812500000000000E-003
 510  acceleration/energy drift too large   11.7947192637743
 511    12.6185934898872       split increased to            2  itime      205273
 512   itsplit           1
 513  REMD synchro at      300000
 514          ntwx_cache       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1
 515  MIN ii_write=           1
 516  REMD gather times=   125.027343750000       0.000000000000000E+000
 517  REMD writing rst time=  3.906250000000000E-003
 518  REMD writing traj time=  0.000000000000000E+000
 519  NREP          16
 520 ACC   1   250.00000     0.33333    3
 521 ACC   2   260.00000     0.33333    3
 522 ACC   3   270.00000     0.33333    3
 523 ACC   4   280.00000     1.00000    3
 524 ACC   5   290.00000     0.66667    3
 525 ACC   6   300.00000     0.33333    3
 526 ACC   7   310.00000     0.66667    3
 527 ACC   8   320.00000     0.66667    3
 528 ACC   9   330.00000     0.33333    3
 529 ACC  10   340.00000     0.66667    3
 530 ACC  11   350.00000     0.66667    3
 531 ACC  12   360.00000     1.00000    3
 532 ACC  13   370.00000     0.66667    3
 533 ACC  14   380.00000     0.66667    3
 534 ACC  15   390.00000     1.00000    3
 535  REMD scatter time=  0.000000000000000E+000
 536  REMD exchange time=  3.906250000000000E-003
 537  acceleration/energy drift too large   11.2341422335143
 538    16.0955510188413       split increased to            2  itime      348226
 539   itsplit           1
 540  REMD synchro at      400000
 541          ntwx_cache       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1
 542  MIN ii_write=           1
 543  REMD gather times=   166.632812500000       0.000000000000000E+000
 544  REMD writing rst time=  3.906250000000000E-003
 545  REMD writing traj time=  0.000000000000000E+000
 546  NREP          16
 547 ACC   1   250.00000     0.25000    4
 548 ACC   2   260.00000     0.25000    4
 549 ACC   3   270.00000     0.25000    4
 550 ACC   4   280.00000     1.00000    4
 551 ACC   5   290.00000     0.75000    4
 552 ACC   6   300.00000     0.50000    4
 553 ACC   7   310.00000     0.50000    4
 554 ACC   8   320.00000     0.50000    4
 555 ACC   9   330.00000     0.50000    4
 556 ACC  10   340.00000     0.75000    4
 557 ACC  11   350.00000     0.75000    4
 558 ACC  12   360.00000     1.00000    4
 559 ACC  13   370.00000     0.75000    4
 560 ACC  14   380.00000     0.75000    4
 561 ACC  15   390.00000     1.00000    4
 562  REMD scatter time=  0.000000000000000E+000
 563  REMD exchange time=  3.906250000000000E-003
 564  acceleration/energy drift too large   11.1581687600111
 565    11.8937809741821       split increased to            2  itime      450747
 566   itsplit           1
 567  REMD synchro at      500000
 568          ntwx_cache       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1
 569  MIN ii_write=           1
 570  REMD gather times=   208.304687500000       0.000000000000000E+000
 571  REMD writing rst time=  0.000000000000000E+000
 572  REMD writing traj time=  3.906250000000000E-003
 573  NREP          16
 574 ACC   1   250.00000     0.40000    5
 575 ACC   2   260.00000     0.20000    5
 576 ACC   3   270.00000     0.20000    5
 577 ACC   4   280.00000     0.80000    5
 578 ACC   5   290.00000     0.80000    5
 579 ACC   6   300.00000     0.60000    5
 580 ACC   7   310.00000     0.40000    5
 581 ACC   8   320.00000     0.60000    5
 582 ACC   9   330.00000     0.40000    5
 583 ACC  10   340.00000     0.80000    5
 584 ACC  11   350.00000     0.80000    5
 585 ACC  12   360.00000     1.00000    5
 586 ACC  13   370.00000     0.80000    5
 587 ACC  14   380.00000     0.80000    5
 588 ACC  15   390.00000     0.80000    5
 589  REMD scatter time=  0.000000000000000E+000
 590  REMD exchange time=  3.906250000000000E-003
 591  acceleration/energy drift too large   11.9473386275269
 592    16.6003287460296       split increased to            2  itime      529448
 593   itsplit           1
 594  acceleration/energy drift too large   10.7642600253068
 595    13.4561498306359       split increased to            2  itime      578217
 596   itsplit           1
 597  REMD synchro at      600000
 598          ntwx_cache       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1
 599  MIN ii_write=           1
 600  REMD gather times=   250.296875000000       0.000000000000000E+000
 601  REMD writing rst time=  3.906250000000000E-003
 602  REMD writing traj time=  0.000000000000000E+000
 603  NREP          16
 604 ACC   1   250.00000     0.50000    6
 605 ACC   2   260.00000     0.33333    6
 606 ACC   3   270.00000     0.16667    6
 607 ACC   4   280.00000     0.83333    6
 608 ACC   5   290.00000     0.66667    6
 609 ACC   6   300.00000     0.50000    6
 610 ACC   7   310.00000     0.50000    6
 611 ACC   8   320.00000     0.66667    6
 612 ACC   9   330.00000     0.33333    6
 613 ACC  10   340.00000     0.66667    6
 614 ACC  11   350.00000     0.83333    6
 615 ACC  12   360.00000     1.00000    6
 616 ACC  13   370.00000     0.83333    6
 617 ACC  14   380.00000     0.83333    6
 618 ACC  15   390.00000     0.83333    6
 619  REMD scatter time=  0.000000000000000E+000
 620  REMD exchange time=  3.906250000000000E-003
 621  REMD synchro at      700000
 622          ntwx_cache       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1
 623  MIN ii_write=           1
 624  REMD gather times=   291.777343750000       0.000000000000000E+000
 625  REMD writing rst time=  3.906250000000000E-003
 626  REMD writing traj time=  0.000000000000000E+000
 627  NREP          16
 628 ACC   1   250.00000     0.57143    7
 629 ACC   2   260.00000     0.42857    7
 630 ACC   3   270.00000     0.14286    7
 631 ACC   4   280.00000     0.71429    7
 632 ACC   5   290.00000     0.57143    7
 633 ACC   6   300.00000     0.57143    7
 634 ACC   7   310.00000     0.42857    7
 635 ACC   8   320.00000     0.71429    7
 636 ACC   9   330.00000     0.42857    7
 637 ACC  10   340.00000     0.71429    7
 638 ACC  11   350.00000     0.71429    7
 639 ACC  12   360.00000     1.00000    7
 640 ACC  13   370.00000     0.85714    7
 641 ACC  14   380.00000     0.85714    7
 642 ACC  15   390.00000     0.71429    7
 643  REMD scatter time=  0.000000000000000E+000
 644  REMD exchange time=  7.812500000000000E-003
 645  acceleration/energy drift too large   10.7793195017638
 646    13.5481889000988       split increased to            2  itime      789154
 647   itsplit           1
 648  REMD synchro at      800000
 649          ntwx_cache       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1
 650  MIN ii_write=           1
 651  REMD gather times=   333.242187500000       0.000000000000000E+000
 652  REMD writing rst time=  3.906250000000000E-003
 653  REMD writing traj time=  0.000000000000000E+000
 654  NREP          16
 655 ACC   1   250.00000     0.62500    8
 656 ACC   2   260.00000     0.50000    8
 657 ACC   3   270.00000     0.25000    8
 658 ACC   4   280.00000     0.62500    8
 659 ACC   5   290.00000     0.62500    8
 660 ACC   6   300.00000     0.62500    8
 661 ACC   7   310.00000     0.50000    8
 662 ACC   8   320.00000     0.62500    8
 663 ACC   9   330.00000     0.37500    8
 664 ACC  10   340.00000     0.75000    8
 665 ACC  11   350.00000     0.75000    8
 666 ACC  12   360.00000     1.00000    8
 667 ACC  13   370.00000     0.75000    8
 668 ACC  14   380.00000     0.87500    8
 669 ACC  15   390.00000     0.75000    8
 670  REMD scatter time=  0.000000000000000E+000
 671  REMD exchange time=  3.906250000000000E-003
 672  acceleration/energy drift too large   9.66071688513195
 673    12.0796171071504       split increased to            2  itime      833577
 674   itsplit           1
 675  REMD synchro at      900000
 676          ntwx_cache       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1
 677  MIN ii_write=           1
 678  REMD gather times=   375.066406250000       0.000000000000000E+000
 679  REMD writing rst time=  3.906250000000000E-003
 680  REMD writing traj time=  3.906250000000000E-003
 681  NREP          16
 682 ACC   1   250.00000     0.66667    9
 683 ACC   2   260.00000     0.44444    9
 684 ACC   3   270.00000     0.33333    9
 685 ACC   4   280.00000     0.66667    9
 686 ACC   5   290.00000     0.55556    9
 687 ACC   6   300.00000     0.66667    9
 688 ACC   7   310.00000     0.44444    9
 689 ACC   8   320.00000     0.66667    9
 690 ACC   9   330.00000     0.44444    9
 691 ACC  10   340.00000     0.66667    9
 692 ACC  11   350.00000     0.77778    9
 693 ACC  12   360.00000     0.88889    9
 694 ACC  13   370.00000     0.77778    9
 695 ACC  14   380.00000     0.88889    9
 696 ACC  15   390.00000     0.77778    9
 697  REMD scatter time=  0.000000000000000E+000
 698  REMD exchange time=  7.812500000000000E-003
 699  acceleration/energy drift too large   12.3943859835290
 700    15.4572766810046       split increased to            2  itime      946232
 701   itsplit           1
 702  acceleration/energy drift too large   10.5294013063566
 703    33.6470754235687       split increased to            2  itime      960546
 704   itsplit           1
 705  acceleration/energy drift too large   9.09627417363667
 706    10.9619024170769       split increased to            2  itime      972893
 707   itsplit           1
 708  acceleration/energy drift too large   10.8429639456552
 709    15.8998725659601       split increased to            2  itime      985022
 710   itsplit           1
 711  acceleration/energy drift too large   9.22390726200052
 712    25.4291482188530       split increased to            2  itime      993966
 713   itsplit           1
 714  REMD synchro at     1000000
 715          ntwx_cache       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1       1
 716  MIN ii_write=           1
 717  writing restart at the end of run
 718
 719
 720 ===================================  Timing  ===================================
 721
 722                   MD calculations setup:    7.81250E-03
 723            Energy & gradient evaluation:    3.81410E+02
 724                     Stochastic MD setup:    0.00000E+00
 725                Stochastic MD step setup:    0.00000E+00
 726                                MD steps:    4.19094E+02
 727
 728
 729 ============================  End of MD calculation  ===========================
 730 CG processor   0 is finishing work.
 731  Total wall clock time   419.113281250000       sec