examples/unres/new/MULTCONF/int/1aoy_min.out_GB002

   1 ********************************************************************************
   2 United-residue force field calculation - parallel job.
   3 ********************************************************************************
   4  MPI: node=            2  iseed(4)=            0           0        -140
   5        -4188
   6  ran_num  6.422640197456531E-013
   7 RMSDBC =        3.0
   8 RMSDBC1 =        0.5
   9 RMSDBC1MAX =        1.5
  10 DRMS    =        0.1
  11 RMSDBCM =        3.0
  12 Time limit (min):     960.0
  13  RESCALE_MODE           0
  14 Library  routine used to diagonalize matrices.
  15
  16 ********************************************************************************
  17                     Options in energy minimization:
  18 ********************************************************************************
  19 MaxMin: 2000 MaxFun: 3000MinMin: 2000 MinFun: 2000 TolF:   1.00000E-02 RTolF:   1.00000E-04
  20
  21 Energy-term weights (unscaled):
  22
  23 WSCC=     1.352790 (SC-SC)
  24 WSCP=     1.593040 (SC-p)
  25 WELEC=    0.715340 (p-p electr)
  26 WVDWPP=   0.113710 (p-p VDW)
  27 WBOND=    1.000000 (stretching)
  28 WANG=     1.138730 (bending)
  29 WSCLOC=   0.162580 (SC local)
  30 WTOR=     1.985990 (torsional)
  31 WTORD=    1.570690 (double torsional)
  32 WSTRAIN=  1.000000 (SS bridges & dist. cnstr.)
  33 WEL_LOC=  0.160360 (multi-body 3-rd order)
  34 WCORR4=   0.428870 (multi-body 4th order)
  35 WCORR5=   0.000000 (multi-body 5th order)
  36 WCORR6=   0.000000 (multi-body 6th order)
  37 WSCCOR=   0.000000 (back-scloc correlation)
  38 WTURN3=   1.687220 (turns, 3rd order)
  39 WTURN4=   0.662300 (turns, 4th order)
  40 WTURN6=   0.000000 (turns, 6th order)
  41
  42 Hydrogen-bonding correlation between contact pairs of peptide groups
  43
  44 Scaling factor of 1,4 SC-p interactions:   0.400
  45 General scaling factor of SC-p interactions:   1.000
  46
  47 Energy-term weights (scaled):
  48
  49 WSCC=     1.352790 (SC-SC)
  50 WSCP=     1.593040 (SC-p)
  51 WELEC=    0.715340 (p-p electr)
  52 WVDWPP=   0.113710 (p-p VDW)
  53 WBOND=    1.000000 (stretching)
  54 WANG=     1.138730 (bending)
  55 WSCLOC=   0.162580 (SC local)
  56 WTOR=     1.985990 (torsional)
  57 WTORD=    1.570690 (double torsional)
  58 WSTRAIN=  1.000000 (SS bridges & dist. cnstr.)
  59 WEL_LOC=  0.160360 (multi-body 3-rd order)
  60 WCORR4=   0.428870 (multi-body 4th order)
  61 WCORR5=   0.000000 (multi-body 5th order)
  62 WCORR6=   0.000000 (multi-body 6th order)
  63 WSCCOR=   0.000000 (back-scloc correlatkion)
  64 WTURN3=   1.687220 (turns, 3rd order)
  65 WTURN4=   0.662300 (turns, 4th order)
  66 WTURN6=   0.000000 (turns, 6th order)
  67  Reference temperature for weights calculation:   300.000000000000
  68  Parameters of the SS-bond potential:
  69  D0CM   3.78000000000000       AKCM   15.1000000000000       AKTH
  70    11.0000000000000       AKCT   12.0000000000000
  71  V1SS  -1.08000000000000       V2SS   7.61000000000000       V3SS
  72    13.7000000000000
  73  EBR  -5.50000000000000       SS_DEPTH  -7.39571661678271
  74   HT  0.000000000000000E+000
  75 PDB data will be read from file native.pdb
  76  Nres:    66
  77 Backbone and SC coordinates as read from the PDB
  78   1 21  D   -16.309   1.688  -2.582      -16.309   1.688  -2.582
  79   2 13  GLN -14.237  -0.233   0.024      -13.329  -2.478  -1.370
  80   3 15  GLU -13.142   3.240   1.229      -15.062   5.248   0.948
  81   4 15  GLU -11.070   1.319   3.835      -11.736   1.182   6.069
  82   5  5  LEU  -8.746  -0.695   1.565       -8.382  -2.246   0.216
  83   6  6  VAL  -7.565   2.726   0.297       -8.204   3.623  -0.690
  84   7 19  LYS  -6.781   4.350   3.703       -8.097   3.632   6.171
  85   8  9  ALA  -5.100   1.133   4.800       -5.457   0.459   4.842
  86   9  3  PHE  -3.074   0.840   1.534       -2.216   0.062  -1.209
  87  10 19  LYS  -1.718   4.432   1.598       -2.926   6.261   0.150
  88  11  9  ALA  -1.008   4.156   5.359       -1.530   4.006   5.894
  89  12  5  LEU   0.932   0.838   5.078       -0.091  -0.942   5.176
  90  13  5  LEU   3.201   2.333   2.390        2.359   2.035   0.462
  91  14 19  LYS   3.722   5.651   4.228        2.011   8.138   3.572
  92  15 15  GLU   4.889   3.695   7.339        3.014   2.255   8.839
  93  16 15  GLU   7.952   2.536   5.280        9.227   5.009   4.955
  94  17 19  LYS   8.107  -1.170   6.208        6.887  -3.146   8.081
  95  18  3  PHE   6.988  -3.256   3.193        4.409  -3.311   4.506
  96  19 12  SER   9.713  -4.027   0.642       10.555  -4.936   0.987
  97  20 12  SER   7.481  -5.760  -1.956        7.823  -6.965  -1.668
  98  21 13  GLN   3.881  -6.254  -3.192        3.908  -6.241  -6.014
  99  22 10  GLY   3.381  -9.715  -1.630        3.381  -9.715  -1.630
 100  23 15  GLU   4.541  -8.211   1.698        7.003  -7.296   2.662
 101  24  4  ILE   1.687  -5.642   1.826        1.369  -3.998   0.782
 102  25  6  VAL  -0.672  -8.266   0.268       -0.625  -9.096  -0.962
 103  26  9  ALA  -0.311 -10.449   3.388        0.314 -10.853   3.556
 104  27  9  ALA  -0.285  -7.406   5.737        0.146  -6.785   5.638
 105  28  5  LEU  -3.787  -6.236   4.693       -3.728  -4.706   3.209
 106  29 13  GLN  -5.111  -9.810   5.218       -4.750 -11.659   3.241
 107  30 15  GLU  -4.063  -9.457   8.886       -1.800 -10.677   9.444
 108  31 13  GLN  -5.556  -5.922   9.050       -4.273  -3.666   8.295
 109  32 10  GLY  -9.043  -7.028   7.983       -9.043  -7.028   7.983
 110  33  3  PHE  -9.236  -7.443   4.186       -8.648  -4.530   4.349
 111  34 16  ASP -10.085 -10.878   2.746      -10.576 -11.938   4.336
 112  35 14  ASN -10.366  -9.355  -0.749      -11.669  -8.620  -2.061
 113  36  4  ILE  -6.666  -8.815  -1.521       -5.735  -7.527  -0.740
 114  37 14  ASN  -4.112 -10.531  -3.790       -5.331 -10.719  -5.404
 115  38 13  GLN  -0.839  -9.851  -5.697        1.438 -11.095  -6.768
 116  39 12  SER  -2.831  -8.353  -8.619       -3.400  -8.824  -9.661
 117  40 19  LYS  -4.847  -6.064  -6.268       -7.573  -6.010  -5.771
 118  41  6  VAL  -1.629  -4.811  -4.621       -0.876  -5.364  -3.479
 119  42 12  SER   0.308  -4.380  -7.908        0.239  -5.402  -8.672
 120  43 18  ARG  -2.731  -2.580  -9.403       -6.011  -4.224 -10.572
 121  44  2  MET  -3.067  -0.279  -6.357       -4.807  -0.653  -4.435
 122  45  5  LEU   0.702   0.517  -6.486        2.219  -0.659  -5.555
 123  46 11  THR   0.427   1.623 -10.137        0.605   0.736 -11.300
 124  47 19  LYS  -3.011   3.276  -9.570       -5.552   3.837  -8.502
 125  48  3  PHE  -2.009   5.280  -6.459       -3.886   4.123  -4.435
 126  49 10  GLY   1.542   5.816  -7.773        1.542   5.816  -7.773
 127  50  9  ALA   3.792   4.575  -4.952        3.646   3.966  -4.515
 128  51  6  VAL   7.622   4.751  -5.047        7.847   6.219  -5.021
 129  52 18  ARG  10.428   2.424  -3.849       11.262  -0.883  -4.920
 130  53 11  THR  12.904   4.377  -1.669       12.091   5.585  -1.446
 131  54 18  ARG  15.633   3.865   0.946       18.657   5.665   0.476
 132  55 14  ASN  14.264   4.252   4.509       13.957   2.420   5.346
 133  56  9  ALA  16.059   5.178   7.773       15.732   5.188   8.463
 134  57 19  LYS  18.245   2.019   7.568       17.066   1.010   9.995
 135  58  2  MET  18.831   2.221   3.772       21.357   2.292   4.155
 136  59 15  GLU  16.237  -0.535   3.103       15.774  -2.269   5.202
 137  60  2  MET  14.551  -0.156  -0.310       15.668   0.539  -1.836
 138  61  6  VAL  10.872  -0.175   0.734       10.898  -0.113   2.210
 139  62  8  TYR   7.591   1.054  -0.763        6.627  -0.936  -3.346
 140  63  1  CYS   6.468   4.552   0.283        7.523   5.455   0.202
 141  64  5  LEU   4.018   7.228  -0.855        1.922   7.134  -0.884
 142  65 20  PRO   5.035  10.521  -2.593        4.654   9.728  -3.703
 143  66  9  ALA   2.971  13.760  -2.518        3.081  14.361  -2.973
 144  67 21  D     3.988  17.053  -4.256        3.988  17.053  -4.256
 145 nsup= 65 nstart_sup=  2
 146  ITEL
 147            1          21           0
 148            2          13           1
 149            3          15           1
 150            4          15           1
 151            5           5           1
 152            6           6           1
 153            7          19           1
 154            8           9           1
 155            9           3           1
 156           10          19           1
 157           11           9           1
 158           12           5           1
 159           13           5           1
 160           14          19           1
 161           15          15           1
 162           16          15           1
 163           17          19           1
 164           18           3           1
 165           19          12           1
 166           20          12           1
 167           21          13           1
 168           22          10           1
 169           23          15           1
 170           24           4           1
 171           25           6           1
 172           26           9           1
 173           27           9           1
 174           28           5           1
 175           29          13           1
 176           30          15           1
 177           31          13           1
 178           32          10           1
 179           33           3           1
 180           34          16           1
 181           35          14           1
 182           36           4           1
 183           37          14           1
 184           38          13           1
 185           39          12           1
 186           40          19           1
 187           41           6           1
 188           42          12           1
 189           43          18           1
 190           44           2           1
 191           45           5           1
 192           46          11           1
 193           47          19           1
 194           48           3           1
 195           49          10           1
 196           50           9           1
 197           51           6           1
 198           52          18           1
 199           53          11           1
 200           54          18           1
 201           55          14           1
 202           56           9           1
 203           57          19           1
 204           58           2           1
 205           59          15           1
 206           60           2           1
 207           61           6           1
 208           62           8           1
 209           63           1           1
 210           64           5           2
 211           65          20           1
 212           66           9           0
 213  ns=           0  iss:
 214 nsup= 65
 215  nsup=          65  nstart_sup=           2  nstart_seq=           2
 216  NZ_START=           2  NZ_END=          66
 217  IZ_SC=           0
 218  Contact order:  0.253316749585406
 219  Shifting contacts:           2           2
 220            1  LEU            5  GLN            2
 221            2  LYS            7  GLU            4
 222            3  ALA            8  LEU            5
 223            4  ALA           11  ALA            8
 224            5  LEU           12  ALA            8
 225            6  LEU           13  PHE            9
 226            7  GLU           15  LEU           12
 227            8  PHE           18  LEU           12
 228            9  GLU           23  PHE           18
 229           10  GLU           23  SER           19
 230           11  GLU           23  SER           20
 231           12  ILE           24  PHE            9
 232           13  ILE           24  LEU           12
 233           14  ILE           24  LEU           13
 234           15  ILE           24  PHE           18
 235           16  VAL           25  GLY           22
 236           17  ALA           27  LEU           12
 237           18  ALA           27  PHE           18
 238           19  ALA           27  ILE           24
 239           20  LEU           28  LEU            5
 240           21  LEU           28  ALA            8
 241           22  LEU           28  LEU           12
 242           23  LEU           28  ILE           24
 243           24  GLN           29  ALA           26
 244           25  GLN           31  LEU           12
 245           26  GLN           31  LEU           28
 246           27  PHE           33  LEU            5
 247           28  PHE           33  ALA            8
 248           29  PHE           33  LEU           28
 249           30  ILE           36  LEU            5
 250           31  ILE           36  VAL           25
 251           32  ILE           36  LEU           28
 252           33  ILE           36  GLN           29
 253           34  GLN           38  GLN           21
 254           35  LYS           40  ILE           36
 255           36  LYS           40  ASN           37
 256           37  VAL           41  PHE            9
 257           38  VAL           41  GLN           21
 258           39  VAL           41  ILE           24
 259           40  VAL           41  VAL           25
 260           41  VAL           41  ILE           36
 261           42  SER           42  GLN           21
 262           43  SER           42  SER           39
 263           44  MET           44  LEU            5
 264           45  MET           44  PHE            9
 265           46  LEU           45  PHE            9
 266           47  LEU           45  LEU           13
 267           48  LEU           45  GLN           21
 268           49  LEU           45  VAL           41
 269           50  LEU           45  SER           42
 270           51  PHE           48  VAL            6
 271           52  PHE           48  PHE            9
 272           53  PHE           48  LYS           10
 273           54  PHE           48  MET           44
 274           55  ALA           50  LEU           13
 275           56  ALA           50  LEU           45
 276           57  ASN           55  GLU           16
 277           58  GLU           59  ASN           55
 278           59  MET           60  ARG           52
 279           60  VAL           61  SER           19
 280           61  VAL           61  ASN           55
 281           62  TYR           62  LEU           45
 282           63  TYR           62  ARG           52
 283           64  CYS           63  LEU           13
 284           65  CYS           63  GLU           16
 285           66  CYS           63  VAL           51
 286           67  CYS           63  THR           53
 287           68  LEU           64  LYS           10
 288           69  LEU           64  LEU           13
 289           70  LEU           64  LYS           14
 290           71  LEU           64  ALA           50
 291           72  PRO           65  VAL           51
 292 intinname
 293 1aoy_csa_GB000.int
 294
 295 Geometry of the virtual chain.
 296   Res           d     Theta     Gamma       Dsc     Alpha      Beta
 297 D     1     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
 298 GLN   2     3.800     0.000     0.000     2.240   134.341  -124.887
 299 GLU   3     3.800    85.088     0.000     2.254   145.984  -119.712
 300 GLU   4     3.800    85.088  -180.000     2.254   165.761  -119.383
 301 LEU   5     3.800   100.862    61.029     1.939   150.012   -43.998
 302 VAL   6     3.800    85.042    60.101     1.410   143.527   -76.712
 303 LYS   7     3.800    98.415    51.719     2.541   102.244   -53.662
 304 ALA   8     3.800    89.333    43.772     0.743   124.673   -73.856
 305 PHE   9     3.800    93.002    47.600     2.299   145.839   -17.616
 306 LYS  10     3.800    95.761    50.088     2.541   145.353  -103.968
 307 ALA  11     3.800    90.825    42.865     0.743   126.329   -72.874
 308 LEU  12     3.800    94.796    50.779     1.939   145.616  -102.635
 309 LEU  13     3.800    90.765    52.347     1.939   135.062  -104.680
 310 LYS  14     3.800    94.712    44.257     2.541   153.069  -110.877
 311 GLU  15     3.800    89.364    54.034     2.254   143.083  -101.827
 312 GLU  16     3.800    87.833    65.911     2.254   143.650  -140.617
 313 LYS  17     3.800   101.146  -136.156     2.541   132.944   -50.123
 314 PHE  18     3.800   108.949   108.066     2.299   142.643   176.338
 315 SER  19     3.800   115.328    84.879     1.150   120.744   -81.597
 316 SER  20     3.800    97.388  -174.849     1.150   122.149   -92.963
 317 GLN  21     3.800   145.229    19.035     2.240   122.899   -94.618
 318 GLY  22     3.800    96.167  -102.179     0.000     0.000     0.000
 319 GLU  23     3.800    87.708    52.129     2.254   144.881   -71.230
 320 ILE  24     3.800    93.813    60.495     1.776   129.903   -67.944
 321 VAL  25     3.800    89.196    36.496     1.410   137.929   -68.865
 322 ALA  26     3.800    90.061    64.876     0.743   127.392   -75.856
 323 ALA  27     3.800    92.711    37.778     0.743   125.959   -73.533
 324 LEU  28     3.800    93.953    60.852     1.939   144.428  -118.273
 325 GLN  29     3.800    89.639    49.049     2.240   146.235  -107.818
 326 GLU  30     3.800    87.187    61.120     2.254   145.032  -115.829
 327 GLN  31     3.800    91.109    44.322     2.240   149.438   -92.025
 328 GLY  32     3.800    94.394    56.746     0.000     0.000     0.000
 329 PHE  33     3.800   110.834   -80.743     2.299   139.568   176.940
 330 ASP  34     3.800   118.883   119.108     1.709   145.744  -151.055
 331 ASN  35     3.800    90.156   171.891     1.684   165.457   -24.707
 332 ILE  36     3.800    99.786    74.292     1.776   171.076    -2.676
 333 ASN  37     3.800   134.742   106.179     1.684   111.842   -90.686
 334 GLN  38     3.800   141.528   154.314     2.240   141.482   -55.701
 335 SER  39     3.800    90.276   -83.188     1.150   149.270   -72.325
 336 LYS  40     3.800    92.229    49.958     2.541   169.764  -115.140
 337 VAL  41     3.800    90.983    50.412     1.410   143.767   -77.293
 338 SER  42     3.800    95.311    43.548     1.150   110.306   -77.022
 339 ARG  43     3.800    89.235    46.977     3.020   137.190   -80.014
 340 MET  44     3.800    92.375    48.901     2.142   153.603  -103.522
 341 LEU  45     3.800    90.668    48.245     1.939   148.604   -94.635
 342 THR  46     3.800    91.224    54.604     1.393   139.687   -84.515
 343 LYS  47     3.800    92.734    37.794     2.541   125.280   -22.637
 344 PHE  48     3.800    96.336    49.291     2.299   139.267  -136.897
 345 GLY  49     3.800    92.128    34.111     0.000     0.000     0.000
 346 ALA  50     3.800   104.355  -126.423     0.743   149.390   -68.581
 347 VAL  51     3.800   123.753  -177.197     1.410   150.382  -108.385
 348 ARG  52     3.800   134.004  -142.309     3.020   169.545   -60.351
 349 THR  53     3.800   109.931  -128.122     1.393   146.483  -104.053
 350 ARG  54     3.800   141.590   160.792     3.020   137.298   -86.171
 351 ASN  55     3.800   111.584   -96.038     1.684   109.666   -76.240
 352 ALA  56     3.800   130.331  -155.911     0.743   128.684   -76.112
 353 LYS  57     3.800    91.279   -62.702     2.541   133.320  -146.864
 354 MET  58     3.800    95.511    40.432     2.142   121.009  -125.157
 355 GLU  59     3.800    91.794  -102.279     2.254   170.731  -151.508
 356 MET  60     3.800   112.439   150.822     2.142   160.522   122.577
 357 VAL  61     3.800   100.366  -126.173     1.410   150.183   -98.626
 358 TYR  62     3.800   136.018   157.820     2.484   163.623   129.853
 359 CYS  63     3.800   116.166   -93.286     1.237   121.668   -77.637
 360 LEU  64     3.800   138.758   163.693     1.939   167.831    30.516
 361 PRO  65     3.800   124.430  -106.601     1.345    99.123  -107.923
 362 ALA  66     3.800   124.679  -154.465     0.743    64.215    12.653
 363 D    67     3.800   124.679  -180.000     0.000     0.000     0.000
 364
 365
 366 ********************************************************************************
 367                     Processor   2: end reading molecular data.
 368 ********************************************************************************
 369
 370
 371 Energy minimization of multiple conformations calculation.
 372
 373 Conformations will be energy-minimized.
 374 ********************************************************************************
 375
 376 CG processor   2 is finishing work.
 377  Total wall clock time   17.0234375000000       sec