examples/unres/new/MREMD/ff_1l2y/1L2Y_MREMD.inp

   1 1L2Y MREMD simulation with Berendsen thermostat and A-MTS algorithm in ff_1l2y
   2 SEED=-3059743 PDBREF RE EXTCONF RESCALE_MODE=2 RESPA
   3 nstep=1000000 ntwe=10000 ntwx=10000 dt=0.20 damax=10.0 lang=0 tbf              &
   4 tau_bath=1.0 t_bath=300 reset_vel=10000 respa ntime_split=1 maxtime_split=64
   5 nrep=16 nstex=100000 tlist mlist traj1file rest1file sync nsyn=100000
   6   250  260  270  280  290  300  310  320  330  340  350  360  370  380  390  400
   7     2    2    2    2    2    2    2    2    2    2    2    2    2    2    2    2
   8 WLONG=1.00000 WSCP=1.23315 WELEC=0.84476 WBOND=1.00000 WANG=0.62954            &
   9 WSCLOC=0.10554 WTOR=1.84316 WTORD=1.26571 WCORRH=0.19212 WCORR5=0.00000        &
  10 WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.37357 WTURN3=1.40323 WTURN4=0.64673 WTURN6=0.00000    &
  11 WVDWPP=0.23173 WHPB=1.00000 WSCCOR=0.0                                         &
  12 CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
  13 ../../1L2Y.pdb
  14 22
  15  D   ASN LEU TYR ILE GLN TRP LEU LYS ASP GLY GLY PRO SER SER GLY ARG PRO PRO PRO
  16  SER D
  17  0
  18  0