examples/unres/new/MD/DYN_SS/dyn_ss_from_pdb/small.inp

   1 small
   2 SEED=-1111333 MD ONE_LETTER pdbstart
   3 nstep=20000  dt=0.1 ntwe=1000  ntwx=300   lang=0 tbf tau_bath=1.0 t_bath=400   &
   4 reset_moment=1000 reset_vel=0 damax=5.0 eq_time=1000 MDPDB
   5 WSC=1.00000 WSCP=2.79405 WELEC=0.14581 WANG=1.95684 WSCLOC=0.17010             &
   6 WTOR=2.04698 WTORD=1.69624 WCORRH=1.84615 WCORR5=0.02730 WCORR6=0.00741        &
   7 WEL_LOC=1.21837 WTURN3=2.91386 WTURN4=0.73178 WTURN6=0.02391 WBOND=1.0         &
   8 CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000 DYN_SS
   9 ss.pdb
  10 2 5 14
  11 0 5 14
  12  0