dynamic SS bond tests
[unres.git] / examples / unres / new / MD / DYN_SS / dyn_ss / small.inp
1 small
2 SEED=-1111333 MD ONE_LETTER
3 nstep=20000  dt=0.1 ntwe=1000  ntwx=300   lang=0 tbf tau_bath=1.0 t_bath=400   &
4 reset_moment=1000 reset_vel=0 damax=5.0 eq_time=1000 MDPDB 
5 WSC=1.00000 WSCP=2.79405 WELEC=0.14581 WANG=1.95684 WSCLOC=0.17010             &
6 WTOR=2.04698 WTORD=1.69624 WCORRH=1.84615 WCORR5=0.02730 WCORR6=0.00741        &
7 WEL_LOC=1.21837 WTURN3=2.91386 WTURN4=0.73178 WTURN6=0.02391 WBOND=1.0         &
8 CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000 DYN_SS HT=5.0
9 18
10 GAAACAAAAAAAACAAAG
11 2 5 14
12 0 5 14
13  0
14    90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
15    90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
16   180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
17   180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
18   110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
19   110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
20  -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
21  -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000