examples/unres/new/MD/DYN_SS/dyn_ss/checkgrad/small.out_GB000

   1 --------------------------------------------------------------------------------
   2                               FILE ASSIGNMENT
   3 --------------------------------------------------------------------------------
   4  Input file                      : small.inp
   5  Output file                     : small.out_GB000
   6
   7  Sidechain potential file        :
   8  /users/czarek/UNRES/GIT/unres/PARAM/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-
   9  10-8k
  10  SCp potential file              : /users/czarek/UNRES/GIT/unres/PARAM/scp.parm
  11  Electrostatic potential file    :
  12  /users/czarek/UNRES/GIT/unres/PARAM/electr_631Gdp.parm
  13  Cumulant coefficient file       :
  14  /users/czarek/UNRES/GIT/unres/PARAM/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
  15  Torsional parameter file        :
  16  /users/czarek/UNRES/GIT/unres/PARAM/torsion_631Gdp.parm
  17  Double torsional parameter file :
  18  /users/czarek/UNRES/GIT/unres/PARAM/torsion_double_631Gdp.parm
  19  SCCOR parameter file : /users/czarek/UNRES/GIT/unres/PARAM/sccor_pdb_shelly.dat
  20  Bond & inertia constant file    : /users/czarek/UNRES/GIT/unres/PARAM/bond.parm
  21  Bending parameter file          :
  22  /users/czarek/UNRES/GIT/unres/PARAM/thetaml.5parm
  23  Rotamer parameter file          :
  24  /users/czarek/UNRES/GIT/unres/PARAM/scgauss.parm
  25  Threading database              :
  26  /users/czarek/UNRES/GIT/unres/PARAM/patterns.cart
  27 --------------------------------------------------------------------------------
  28 ********************************************************************************
  29 United-residue force field calculation - parallel job.
  30 ********************************************************************************
  31  ### LAST MODIFIED  03/28/12 23:29 by czarek
  32  ++++ Compile info ++++
  33  Version 3.1 build 43
  34  compiled Fri Feb 15 05:04:12 2013
  35  compiled by czarek@piasek3
  36  OS name:    Linux
  37  OS release: 2.6.32-42-generic
  38  OS version: #96-Ubuntu SMP Wed Aug 15 19:37:37 UTC 2012
  39  flags:
  40  INSTALL_DIR = /users/software/mpich-1.2.7p1_int...
  41  FC= ifort
  42  OPT =  -O3 -ip -w
  43  FFLAGS = -c ${OPT} -I$(INSTALL_DIR)/include
  44  FFLAGS1 = -c -w -g -d2 -CA -CB -I$(INSTALL_DIR)...
  45  FFLAGS2 = -c -w -g -O0 -I$(INSTALL_DIR)/include
  46  FFLAGSE = -c -w -O3 -ipo -ipo_obj  -opt_report ...
  47  LIBS = -L$(INSTALL_DIR)/lib -lmpich xdrf/libxdr...
  48  ARCH = LINUX
  49  PP = /lib/cpp -P
  50  object = unres.o arcos.o cartprint.o chainbuild...
  51  GAB: CPPFLAGS = -DPROCOR -DLINUX -DPGI -DUNRES ...
  52  GAB: BIN = ../../../bin/unres/MD/unres_ifort_MP...
  53  E0LL2Y: CPPFLAGS = -DPROCOR -DLINUX -DPGI -DUNR...
  54  E0LL2Y: BIN = ../../../bin/unres/MD/unres_ifort...
  55  ++++ End of compile info ++++
  56
  57 Potential is GB , exponents are   6 12
  58
  59 Disulfide bridge parameters:
  60 S-S bridge energy:      -5.50
  61 d0cm:      3.78 akcm:     15.10
  62 akth:     11.00 akct:     12.00
  63 v1ss:     -1.08 v2ss:      7.61 v3ss:     13.70
  64  MPI: node=            0  iseed(4)=            0           0         -16
  65       -62756
  66  ran_num  6.422640197456531E-013
  67 RMSDBC =        3.0
  68 RMSDBC1 =        0.5
  69 RMSDBC1MAX =        1.5
  70 DRMS    =        0.1
  71 RMSDBCM =        3.0
  72 Time limit (min):     960.0
  73  RESCALE_MODE           2
  74 Library  routine used to diagonalize matrices.
  75
  76 Energy-term weights (unscaled):
  77
  78 WSCC=     1.000000 (SC-SC)
  79 WSCP=     2.794050 (SC-p)
  80 WELEC=    0.145810 (p-p electr)
  81 WVDWPP=   0.145810 (p-p VDW)
  82 WBOND=    1.000000 (stretching)
  83 WANG=     1.956840 (bending)
  84 WSCLOC=   0.170100 (SC local)
  85 WTOR=     2.046980 (torsional)
  86 WTORD=    1.696240 (double torsional)
  87 WSTRAIN=  1.000000 (SS bridges & dist. cnstr.)
  88 WEL_LOC=  1.218370 (multi-body 3-rd order)
  89 WCORR4=   1.846150 (multi-body 4th order)
  90 WCORR5=   0.027300 (multi-body 5th order)
  91 WCORR6=   0.007410 (multi-body 6th order)
  92 WSCCOR=   1.000000 (back-scloc correlation)
  93 WTURN3=   2.913860 (turns, 3rd order)
  94 WTURN4=   0.731780 (turns, 4th order)
  95 WTURN6=   0.023910 (turns, 6th order)
  96
  97 Hydrogen-bonding correlation between contact pairs of peptide groups
  98
  99 Scaling factor of 1,4 SC-p interactions:   0.400
 100 General scaling factor of SC-p interactions:   1.000
 101
 102 Energy-term weights (scaled):
 103
 104 WSCC=     1.000000 (SC-SC)
 105 WSCP=     2.794050 (SC-p)
 106 WELEC=    0.145810 (p-p electr)
 107 WVDWPP=   0.145810 (p-p VDW)
 108 WBOND=    1.000000 (stretching)
 109 WANG=     1.956840 (bending)
 110 WSCLOC=   0.170100 (SC local)
 111 WTOR=     2.046980 (torsional)
 112 WTORD=    1.696240 (double torsional)
 113 WSTRAIN=  1.000000 (SS bridges & dist. cnstr.)
 114 WEL_LOC=  1.218370 (multi-body 3-rd order)
 115 WCORR4=   1.846150 (multi-body 4th order)
 116 WCORR5=   0.027300 (multi-body 5th order)
 117 WCORR6=   0.007410 (multi-body 6th order)
 118 WSCCOR=   1.000000 (back-scloc correlatkion)
 119 WTURN3=   2.913860 (turns, 3rd order)
 120 WTURN4=   0.731780 (turns, 4th order)
 121 WTURN6=   0.023910 (turns, 6th order)
 122  Reference temperature for weights calculation:   300.000000000000
 123  Parameters of the SS-bond potential:
 124  D0CM   3.78000000000000       AKCM   15.1000000000000       AKTH
 125    11.0000000000000       AKCT   12.0000000000000
 126  V1SS  -1.08000000000000       V2SS   7.61000000000000       V3SS
 127    13.7000000000000
 128  EBR  -5.50000000000000       SS_DEPTH  -6.90133843152500
 129   HT   3.59866156847500
 130  ITEL
 131            1          10           1
 132            2           9           1
 133            3           9           1
 134            4           9           1
 135            5           1           1
 136            6           9           1
 137            7           9           1
 138            8           9           1
 139            9           9           1
 140           10           9           1
 141           11           9           1
 142           12           9           1
 143           13           9           1
 144           14           1           1
 145           15           9           1
 146           16           9           1
 147           17           9           1
 148  ns=           2  iss:           5          14
 149  nss=           0  ihpb,jhpb:
 150 Boundaries in phi angle sampling:
 151 GLY    1    -180.0     180.0
 152 ALA    2    -180.0     180.0
 153 ALA    3    -180.0     180.0
 154 ALA    4    -180.0     180.0
 155 CYS    5    -180.0     180.0
 156 ALA    6    -180.0     180.0
 157 ALA    7    -180.0     180.0
 158 ALA    8    -180.0     180.0
 159 ALA    9    -180.0     180.0
 160 ALA   10    -180.0     180.0
 161 ALA   11    -180.0     180.0
 162 ALA   12    -180.0     180.0
 163 ALA   13    -180.0     180.0
 164 CYS   14    -180.0     180.0
 165 ALA   15    -180.0     180.0
 166 ALA   16    -180.0     180.0
 167 ALA   17    -180.0     180.0
 168 GLY   18    -180.0     180.0
 169  NZ_START=           1  NZ_END=          18
 170  IZ_SC=           0
 171 Initial geometry will be read in.
 172
 173 Geometry of the virtual chain.
 174   Res           d     Theta     Gamma       Dsc     Alpha      Beta
 175 GLY   1     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
 176 ALA   2     3.800     0.000     0.000     0.743   110.000  -120.000
 177 ALA   3     3.800    90.000     0.000     0.743   110.000  -120.000
 178 ALA   4     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 179 CYS   5     3.800    90.000   180.000     1.237   100.000  -120.000
 180 ALA   6     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 181 ALA   7     3.800    90.000   180.000     0.743   100.000  -120.000
 182 ALA   8     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 183 ALA   9     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 184 ALA  10     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 185 ALA  11     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 186 ALA  12     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 187 ALA  13     3.800    90.000   180.000     0.743   100.000  -120.000
 188 CYS  14     3.800    90.000   180.000     1.237   110.000  -120.000
 189 ALA  15     3.800    90.000   180.000     0.743   100.000  -120.000
 190 ALA  16     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 191 ALA  17     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 192 GLY  18     3.800    90.000   180.000     0.000     0.000     0.000
 193
 194 The chain contains  2 disulfide-bridging cysteines.
 195    5  14
 196  Running with dynamic disulfide-bond formation
 197  Processor           0  CG group           0  absolute rank           0  nhpb
 198            0  link_start=           1  link_end           0
 199
 200
 201 ********************************************************************************
 202                     Processor   0: end reading molecular data.
 203 ********************************************************************************
 204
 205
 206 Checking energy gradient calculation.
 207
 208 ********************************************************************************
 209
 210  nset           0  nfrag           0  npair           0  nfrag_back           0
 211
 212
 213               alpha-carbon coordinates            centroid coordinates
 214              X           Y           Z          X           Y           Z
 215 GLY(  1)     0.00000     0.00000     0.00000     0.00000     0.00000     0.00000
 216 ALA(  2)     3.80000     0.00000     0.00000     3.73284     0.42654     0.60465
 217 ALA(  3)     3.80000    -3.80000     0.00000     3.37346    -3.73284    -0.60465
 218 ALA(  4)     7.60000    -3.80000     0.00000     7.53284    -3.37346     0.60465
 219 CYS(  5)     7.60000    -7.60000     0.00000     7.01741    -7.32119    -1.05500
 220 ALA(  6)    11.40000    -7.60000     0.00000    11.33284    -7.17346     0.60465
 221 ALA(  7)    11.40000   -11.40000     0.00000    11.05007   -11.23253    -0.63368
 222 ALA(  8)    15.20000   -11.40000     0.00000    15.13284   -10.97346     0.60465
 223 ALA(  9)    15.20000   -15.20000     0.00000    14.77346   -15.13284    -0.60465
 224 ALA( 10)    19.00000   -15.20000     0.00000    18.93284   -14.77346     0.60465
 225 ALA( 11)    19.00000   -19.00000     0.00000    18.57346   -18.93284    -0.60465
 226 ALA( 12)    22.80000   -19.00000     0.00000    22.73284   -18.57346     0.60465
 227 ALA( 13)    22.80000   -22.80000     0.00000    22.45007   -22.63253    -0.63368
 228 CYS( 14)    26.60000   -22.80000     0.00000    26.48819   -22.08987     1.00667
 229 ALA( 15)    26.60000   -26.60000     0.00000    26.25007   -26.43253    -0.63368
 230 ALA( 16)    30.40000   -26.60000     0.00000    30.33284   -26.17346     0.60465
 231 ALA( 17)    30.40000   -30.40000     0.00000    29.97346   -30.33284    -0.60465
 232 GLY( 18)    34.20000   -30.40000     0.00000    34.20000   -30.40000     0.00000
 233
 234 Geometry of the virtual chain.
 235   Res           d     Theta     Gamma       Dsc     Alpha      Beta
 236 GLY   1     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
 237 ALA   2     3.800     0.000     0.000     0.743   110.000  -120.000
 238 ALA   3     3.800    90.000     0.000     0.743   110.000  -120.000
 239 ALA   4     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 240 CYS   5     3.800    90.000   180.000     1.237   100.000  -120.000
 241 ALA   6     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 242 ALA   7     3.800    90.000   180.000     0.743   100.000  -120.000
 243 ALA   8     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 244 ALA   9     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 245 ALA  10     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 246 ALA  11     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 247 ALA  12     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 248 ALA  13     3.800    90.000   180.000     0.743   100.000  -120.000
 249 CYS  14     3.800    90.000   180.000     1.237   110.000  -120.000
 250 ALA  15     3.800    90.000   180.000     0.743   100.000  -120.000
 251 ALA  16     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 252 ALA  17     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 253 GLY  18     3.800    90.000   180.000     0.000   180.000   180.000
 254  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 255
 256 Virtual-chain energies:
 257
 258 EVDW=     -1.784028E+01 WEIGHT=    1.000000E+00 (SC-SC)
 259 EVDW2=     2.118779E+01 WEIGHT=    2.794050E+00 (SC-p)
 260 EES=      -8.122745E+00 WEIGHT=    1.458100E-01 (p-p)
 261 EVDWPP=   -2.540621E+01 WEIGHT=    1.458100E-01 (p-p VDW)
 262 ESTR=      4.237046E-27 WEIGHT=    1.000000E+00 (stretching)
 263 EBE=      -1.185178E+00 WEIGHT=    1.956840E+00 (bending)
 264 ESC=       1.520408E+02 WEIGHT=    1.701000E-01 (SC local)
 265 ETORS=     0.000000E+00 WEIGHT=    2.046980E+00 (torsional)
 266 ETORSD=   -2.194244E+00 WEIGHT=    1.696240E+00 (double torsional)
 267 EHPB=      0.000000E+00 WEIGHT=    1.000000E+00 (SS bridges & dist. cnstr.)
 268 ECORR4=   -5.324225E+00 WEIGHT=    1.846150E+00 (multi-body)
 269 ECORR5=    2.317900E+01 WEIGHT=    2.730000E-02 (multi-body)
 270 ECORR6=    1.215220E+01 WEIGHT=    7.410000E-03 (multi-body)
 271 EELLO=     3.759544E+01 WEIGHT=    1.218370E+00 (electrostatic-local)
 272 ETURN3=   -3.193381E+00 WEIGHT=    2.913860E+00 (turns, 3rd order)
 273 ETURN4=    1.424793E+01 WEIGHT=    7.317800E-01 (turns, 4th order)
 274 ETURN6=    0.000000E+00 WEIGHT=    2.391000E-02 (turns, 6th order)
 275 ESCCOR=    7.779132E+00 WEIGHT=    1.000000E+00 (backbone-rotamer corr)
 276 EDIHC=     0.000000E+00 (dihedral angle constraints)
 277 ESS=       0.000000E+00 (disulfide-bridge intrinsic energy)
 278 UCONST=     0.000000E+00 (Constraint energy)
 279 ETOT=      1.018907E+02 (total)
 280  Uconst  0.000000000000000E+000  Uconst_back  0.000000000000000E+000
 281
 282 Geometry of the virtual chain.
 283   Res           d     Theta     Gamma       Dsc     Alpha      Beta
 284 GLY   1     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
 285 ALA   2     3.800     0.000     0.000     0.743   110.000  -120.000
 286 ALA   3     3.800    90.000     0.000     0.743   110.000  -120.000
 287 ALA   4     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 288 CYS   5     3.800    90.000   180.000     1.237   100.000  -120.000
 289 ALA   6     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 290 ALA   7     3.800    90.000   180.000     0.743   100.000  -120.000
 291 ALA   8     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 292 ALA   9     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 293 ALA  10     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 294 ALA  11     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 295 ALA  12     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 296 ALA  13     3.800    90.000   180.000     0.743   100.000  -120.000
 297 CYS  14     3.800    90.000   180.000     1.237   110.000  -120.000
 298 ALA  15     3.800    90.000   180.000     0.743   100.000  -120.000
 299 ALA  16     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 300 ALA  17     3.800    90.000   180.000     0.743   110.000  -120.000
 301 GLY  18     3.800    90.000   180.000     0.000   180.000   180.000
 302  Calling CHECK_ECARTINT.
 303  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 304
 305 Virtual-chain energies:
 306
 307 EVDW=     -1.784028E+01 WEIGHT=    1.000000E+00 (SC-SC)
 308 EVDW2=     2.118779E+01 WEIGHT=    2.794050E+00 (SC-p)
 309 EES=      -8.122745E+00 WEIGHT=    1.458100E-01 (p-p)
 310 EVDWPP=   -2.540621E+01 WEIGHT=    1.458100E-01 (p-p VDW)
 311 ESTR=      4.237046E-27 WEIGHT=    1.000000E+00 (stretching)
 312 EBE=      -1.185178E+00 WEIGHT=    1.956840E+00 (bending)
 313 ESC=       1.520408E+02 WEIGHT=    1.701000E-01 (SC local)
 314 ETORS=     0.000000E+00 WEIGHT=    2.046980E+00 (torsional)
 315 ETORSD=   -2.194244E+00 WEIGHT=    1.696240E+00 (double torsional)
 316 EHPB=      0.000000E+00 WEIGHT=    1.000000E+00 (SS bridges & dist. cnstr.)
 317 ECORR4=   -5.324225E+00 WEIGHT=    1.846150E+00 (multi-body)
 318 ECORR5=    2.317900E+01 WEIGHT=    2.730000E-02 (multi-body)
 319 ECORR6=    1.215220E+01 WEIGHT=    7.410000E-03 (multi-body)
 320 EELLO=     3.759544E+01 WEIGHT=    1.218370E+00 (electrostatic-local)
 321 ETURN3=   -3.193381E+00 WEIGHT=    2.913860E+00 (turns, 3rd order)
 322 ETURN4=    1.424793E+01 WEIGHT=    7.317800E-01 (turns, 4th order)
 323 ETURN6=    0.000000E+00 WEIGHT=    2.391000E-02 (turns, 6th order)
 324 ESCCOR=    7.779132E+00 WEIGHT=    1.000000E+00 (backbone-rotamer corr)
 325 EDIHC=     0.000000E+00 (dihedral angle constraints)
 326 ESS=       0.000000E+00 (disulfide-bridge intrinsic energy)
 327 UCONST=     0.000000E+00 (Constraint energy)
 328 ETOT=      1.018907E+02 (total)
 329  enter cartgrad
 330  exit cartgrad
 331     1   0.00000   0.00000   0.00000
 332     2   0.00000   0.00000   0.00000
 333     3   0.00000   0.00000   0.00000
 334     4   0.00000   0.00000   0.00000
 335     5   0.00000   0.00000   0.00000
 336     6   0.00000   0.00000   0.00000
 337     7   0.00000   0.00000   0.00000
 338     8   0.00000   0.00000   0.00000
 339     9   0.00000   0.00000   0.00000
 340    10   0.00000   0.00000   0.00000
 341    11   0.00000   0.00000   0.00000
 342    12   0.00000   0.00000   0.00000
 343    13   0.00000   0.00000   0.00000
 344    14   0.00000   0.00000   0.00000
 345    15   0.00000   0.00000   0.00000
 346    16   0.00000   0.00000   0.00000
 347    17   0.00000   0.00000   0.00000
 348    18   0.00000   0.00000   0.00000
 349
 350 Gradient in virtual-bond and SC vectors
 351
 352  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 353  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 354  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 355  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 356  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 357  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 358  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 359  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 360  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 361  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 362  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 363  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 364   0 1.42109E-09 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00
 365     0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00
 366     Infinity    NaN         NaN         NaN         NaN         NaN
 367
 368  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 369  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 370  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 371  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 372  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 373  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 374  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 375  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 376  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 377  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 378  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 379  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 380   1-1.74349E+00 5.18417E+00-2.08101E+00 5.07964E-01 3.52529E-01 1.84397E-01
 381    -1.74349E+00 5.18417E+00-2.08101E+00 5.07964E-01 3.52529E-01 1.84397E-01
 382     1.00000E+00 1.00000E+00 9.99997E-01 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00
 383
 384  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 385  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 386  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 387  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 388  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 389  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 390  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 391  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 392  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 393  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 394  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 395  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 396   2-1.16404E+01 7.19505E+00 2.70513E+00-2.56188E+00-6.28518E-01 3.50568E-01
 397    -1.16404E+01 7.19505E+00 2.70514E+00-2.56188E+00-6.28518E-01 3.50568E-01
 398     1.00000E+00 1.00000E+00 9.99998E-01 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00
 399
 400  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 401  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 402  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 403  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 404  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 405  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 406  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 407  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 408  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 409  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 410  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 411  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 412   3-7.27366E+00 1.22950E+01-9.21906E-01 5.08876E-01 1.95471E+00-2.42307E-01
 413    -7.27366E+00 1.22950E+01-9.21903E-01 5.08888E-01 1.95471E+00-2.42307E-01
 414     1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00 9.99978E-01 1.00000E+00 1.00000E+00
 415
 416  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 417  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 418  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 419  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 420  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 421  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 422  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 423  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 424  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 425  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 426  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 427  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 428   4-1.08763E+01 1.04145E+01 7.05762E-01-2.67909E+00-1.31645E+00-2.07874E+00
 429    -1.08763E+01 1.04145E+01 7.05759E-01-2.67909E+00-1.31645E+00-2.07874E+00
 430     1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00
 431
 432  dyn_ssbond_ene  -1.212203002155275E-004
 433  dyn_ssbond_ene  -1.212208163365449E-004
 434  dyn_ssbond_ene  -1.212207368175458E-004
 435  dyn_ssbond_ene  -1.212203797341455E-004
 436  dyn_ssbond_ene  -1.212205450305021E-004
 437  dyn_ssbond_ene  -1.212205715208689E-004
 438  dyn_ssbond_ene  -1.212203436549044E-004
 439  dyn_ssbond_ene  -1.212207728931174E-004
 440  dyn_ssbond_ene  -1.212205026409908E-004
 441  dyn_ssbond_ene  -1.212206139067858E-004
 442  dyn_ssbond_ene  -1.212208650285028E-004
 443  dyn_ssbond_ene  -1.212202515289574E-004
 444   5-1.71104E+01 9.34099E+00 1.37349E-01-4.41128E+00 9.43293E-01 6.64912E+00
 445    -1.71104E+01 9.34100E+00 1.37355E-01-4.41130E+00 9.43287E-01 6.64915E+00
 446     9.99998E-01 9.99998E-01 9.99958E-01 9.99995E-01 1.00001E+00 9.99995E-01
 447
 448  dyn_ssbond_ene  -1.212203002155275E-004
 449  dyn_ssbond_ene  -1.212208163365449E-004
 450  dyn_ssbond_ene  -1.212207368175458E-004
 451  dyn_ssbond_ene  -1.212203797341455E-004
 452  dyn_ssbond_ene  -1.212205450305021E-004
 453  dyn_ssbond_ene  -1.212205715208689E-004
 454  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 455  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 456  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 457  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 458  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 459  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 460   6-1.24113E+01 8.10754E+00 1.14610E+00-1.22273E+01-3.30263E+00 9.06444E-01
 461    -1.24113E+01 8.10756E+00 1.14609E+00-1.22273E+01-3.30263E+00 9.06444E-01
 462     9.99998E-01 9.99998E-01 1.00001E+00 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00
 463
 464  dyn_ssbond_ene  -1.212203002155275E-004
 465  dyn_ssbond_ene  -1.212208163365451E-004
 466  dyn_ssbond_ene  -1.212207368175458E-004
 467  dyn_ssbond_ene  -1.212203797341455E-004
 468  dyn_ssbond_ene  -1.212205450305021E-004
 469  dyn_ssbond_ene  -1.212205715208689E-004
 470  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 471  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 472  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 473  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 474  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 475  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 476   7-7.45920E+00 1.26658E+01-5.84631E-01 1.78806E+00 2.78456E+00-2.95300E-01
 477    -7.45923E+00 1.26658E+01-5.84650E-01 1.78806E+00 2.78482E+00-2.95293E-01
 478     9.99997E-01 9.99999E-01 9.99967E-01 1.00000E+00 9.99907E-01 1.00002E+00
 479
 480  dyn_ssbond_ene  -1.212203002155275E-004
 481  dyn_ssbond_ene  -1.212208163365449E-004
 482  dyn_ssbond_ene  -1.212207368175459E-004
 483  dyn_ssbond_ene  -1.212203797341455E-004
 484  dyn_ssbond_ene  -1.212205450305021E-004
 485  dyn_ssbond_ene  -1.212205715208689E-004
 486  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 487  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 488  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 489  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 490  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 491  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 492   8-1.26335E+01 7.55790E+00 4.32051E-01-1.54499E+00-1.07541E+00 6.68456E-01
 493    -1.26336E+01 7.55792E+00 4.32050E-01-1.54499E+00-1.07541E+00 6.68456E-01
 494     9.99998E-01 9.99998E-01 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00
 495
 496  dyn_ssbond_ene  -1.212203002155275E-004
 497  dyn_ssbond_ene  -1.212208163365449E-004
 498  dyn_ssbond_ene  -1.212207368175458E-004
 499  dyn_ssbond_ene  -1.212203797341455E-004
 500  dyn_ssbond_ene  -1.212205450305021E-004
 501  dyn_ssbond_ene  -1.212205715208689E-004
 502  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 503  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 504  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 505  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 506  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 507  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 508   9-7.55860E+00 1.26320E+01-4.29428E-01 7.61680E-01 1.69973E+00-4.28855E-01
 509    -7.55862E+00 1.26320E+01-4.29429E-01 7.61681E-01 1.69973E+00-4.28855E-01
 510     9.99997E-01 9.99999E-01 9.99997E-01 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00
 511
 512  dyn_ssbond_ene  -1.212203002155275E-004
 513  dyn_ssbond_ene  -1.212208163365449E-004
 514  dyn_ssbond_ene  -1.212207368175458E-004
 515  dyn_ssbond_ene  -1.212203797341455E-004
 516  dyn_ssbond_ene  -1.212205450305021E-004
 517  dyn_ssbond_ene  -1.212205715208689E-004
 518  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 519  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 520  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 521  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 522  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 523  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 524  10-1.26280E+01 7.55615E+00 4.29762E-01-1.69205E+00-7.56982E-01 4.26542E-01
 525    -1.26280E+01 7.55617E+00 4.29761E-01-1.69205E+00-7.56982E-01 4.26542E-01
 526     9.99998E-01 9.99998E-01 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00
 527
 528  dyn_ssbond_ene  -1.212203002155275E-004
 529  dyn_ssbond_ene  -1.212208163365449E-004
 530  dyn_ssbond_ene  -1.212207368175458E-004
 531  dyn_ssbond_ene  -1.212203797341455E-004
 532  dyn_ssbond_ene  -1.212205450305021E-004
 533  dyn_ssbond_ene  -1.212205715208689E-004
 534  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 535  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 536  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 537  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 538  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 539  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 540  11-7.52400E+00 1.26239E+01-4.62928E-01 7.57607E-01 1.70207E+00-4.43111E-01
 541    -7.52403E+00 1.26240E+01-4.62929E-01 7.57607E-01 1.70207E+00-4.43111E-01
 542     9.99997E-01 9.99999E-01 9.99997E-01 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00
 543
 544  dyn_ssbond_ene  -1.212203002155275E-004
 545  dyn_ssbond_ene  -1.212208163365449E-004
 546  dyn_ssbond_ene  -1.212207368175458E-004
 547  dyn_ssbond_ene  -1.212203797341455E-004
 548  dyn_ssbond_ene  -1.212205450305021E-004
 549  dyn_ssbond_ene  -1.212205715208689E-004
 550  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 551  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 552  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 553  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 554  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 555  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 556  12-1.22023E+01 8.04684E+00 4.74392E-01-2.46935E+00-6.58314E-01-3.27295E-01
 557    -1.22023E+01 8.04686E+00 4.74387E-01-2.46935E+00-6.58314E-01-3.27295E-01
 558     9.99998E-01 9.99998E-01 1.00001E+00 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00
 559
 560  dyn_ssbond_ene  -1.212203002155275E-004
 561  dyn_ssbond_ene  -1.212208163365449E-004
 562  dyn_ssbond_ene  -1.212207368175458E-004
 563  dyn_ssbond_ene  -1.212203797341455E-004
 564  dyn_ssbond_ene  -1.212205450305021E-004
 565  dyn_ssbond_ene  -1.212205715208689E-004
 566  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 567  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 568  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 569  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 570  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 571  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 572  13-8.05648E+00 1.07398E+01-2.82845E-01 1.81165E+00 3.56088E+00 4.79524E-01
 573    -8.05651E+00 1.07398E+01-2.82843E-01 1.81165E+00 3.56088E+00 4.79524E-01
 574     9.99997E-01 9.99998E-01 1.00001E+00 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00
 575
 576  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 577  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 578  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 579  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 580  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 581  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 582  dyn_ssbond_ene  -1.212199125315703E-004
 583  dyn_ssbond_ene  -1.212212040271847E-004
 584  dyn_ssbond_ene  -1.212207424173909E-004
 585  dyn_ssbond_ene  -1.212203741323063E-004
 586  dyn_ssbond_ene  -1.212204980202443E-004
 587  dyn_ssbond_ene  -1.212206185317819E-004
 588  14 2.27508E+00 6.66126E+01-7.26727E+00 2.10526E+01 3.72340E+01-5.51040E+01
 589     2.27508E+00 6.66126E+01-7.26727E+00 2.10526E+01 3.72340E+01-5.51041E+01
 590     1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00
 591
 592  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 593  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 594  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 595  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 596  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 597  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 598  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 599  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 600  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 601  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 602  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 603  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 604  15-7.08428E+00 1.22839E+01-6.31136E-01 2.28991E+01 7.84185E+01-9.15701E+00
 605    -7.08428E+00 1.22839E+01-6.31137E-01 2.28991E+01 7.84185E+01-9.15701E+00
 606     1.00000E+00 1.00000E+00 9.99998E-01 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00
 607
 608  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 609  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 610  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 611  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 612  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 613  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 614  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 615  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 616  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 617  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 618  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 619  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 620  16-1.12777E+01 6.99092E+00-1.34157E+00-1.34165E+00-1.25815E+00 7.41408E-01
 621    -1.12777E+01 6.99092E+00-1.34158E+00-1.34165E+00-1.25815E+00 7.41408E-01
 622     1.00000E+00 1.00000E+00 9.99996E-01 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00
 623
 624  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 625  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 626  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 627  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 628  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 629  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 630  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 631  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 632  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 633  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 634  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 635  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 636  17-4.50061E+00 5.63307E+00 1.69471E+00 1.02393E+00 3.88236E+00-1.51025E-01
 637    -4.50061E+00 5.63307E+00 1.69471E+00 1.02393E+00 3.88236E+00-1.51025E-01
 638     1.00000E+00 1.00000E+00 9.99997E-01 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00
 639
 640  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 641  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 642  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 643  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 644  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 645  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 646  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 647  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 648  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 649  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 650  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 651  dyn_ssbond_ene  -1.212205582757399E-004
 652  18 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 3.07274E-01-1.55217E-01-2.42152E-02
 653     0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 3.07274E-01-1.55217E-01-2.42152E-02
 654     NaN         NaN         NaN         1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00
 655
 656 CG processor   0 is finishing work.
 657  Total wall clock time  0.101562500000000       sec