examples/unres/REMD/Nose-Hoover/ff_gab/1L2Y_REMD.inp

   1 1L2Y with Nose-Hoover thermostat in ff_gab Replica Exchange MD simulation
   2 SEED=-3059743 PDBREF RE EXTCONF RESCALE_MODE=2
   3 nstep=1000000 ntwe=10000 ntwx=10000 dt=0.10 damax=10.0 lang=0 XIRESP           &
   4 t_bath=300 reset_vel=10000 respa ntime_split=1 maxtime_split=64 NOSEHOOVER96   &
   5 Q_NP=1.0
   6 nrep=16 nstex=100000 tlist mlist traj1file rest1file sync nsyn=100000
   7   250  260  270  280  290  300  310  320  330  340  350  360  370  380  390  400
   8     1    1    1    1    1    1    1    1    1    1    1    1    1    1    1    1
   9 WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
  10 WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
  11 WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
  12 WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
  13 CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000 WSCCOR=0.0
  14 ../../../1L2Y.pdb
  15 22
  16  D   ASN LEU TYR ILE GLN TRP LEU LYS ASP GLY GLY PRO SER SER GLY ARG PRO PRO PRO
  17  SER D
  18  0
  19  0