examples/unres/CSA/GAB/CSA/local/1l2y_csa.out_GB054

   1 ********************************************************************************
   2 United-residue force field calculation - parallel job.
   3 ********************************************************************************
   4  MPI: node=           54  iseed=             -168285864
   5  ran_num  5.637539338348874E-002
   6 RMSDBC =        3.0
   7 RMSDBC1 =        0.5
   8 RMSDBC1MAX =        1.5
   9 DRMS    =        0.1
  10 RMSDBCM =        3.0
  11 Time limit (min):     960.0
  12  RESCALE_MODE           0
  13 Library  routine used to diagonalize matrices.
  14
  15 ********************************************************************************
  16                     Options in energy minimization:
  17 ********************************************************************************
  18 MaxMin: 3000 MaxFun: 1000MinMin: 3000 MinFun: 3000 TolF:   1.00000E-02 RTolF:   1.00000E-04
  19  NCONF_IN           0
  20
  21 Energy-term weights (unscaled):
  22
  23 WSCC=     1.352790 (SC-SC)
  24 WSCP=     1.593040 (SC-p)
  25 WELEC=    0.715340 (p-p electr)
  26 WVDWPP=   0.113710 (p-p VDW)
  27 WBOND=    1.000000 (stretching)
  28 WANG=     1.138730 (bending)
  29 WSCLOC=   0.162580 (SC local)
  30 WTOR=     1.985990 (torsional)
  31 WTORD=    1.570690 (double torsional)
  32 WSTRAIN=  1.000000 (SS bridges & dist. cnstr.)
  33 WEL_LOC=  0.160360 (multi-body 3-rd order)
  34 WCORR4=   0.428870 (multi-body 4th order)
  35 WCORR5=   0.000000 (multi-body 5th order)
  36 WCORR6=   0.000000 (multi-body 6th order)
  37 WSCCOR=   0.000000 (back-scloc correlation)
  38 WTURN3=   1.687220 (turns, 3rd order)
  39 WTURN4=   0.662300 (turns, 4th order)
  40 WTURN6=   0.000000 (turns, 6th order)
  41 WDFA_D=   0.000000 (DFA, distance)
  42 WDFA_T=   0.000000 (DFA, torsional)
  43 WDFA_N=   0.000000 (DFA, number of neighbor)
  44 WDFA_B=   0.000000 (DFA, beta formation)
  45
  46 Hydrogen-bonding correlation between contact pairs of peptide groups
  47
  48 Scaling factor of 1,4 SC-p interactions:   0.400
  49 General scaling factor of SC-p interactions:   1.000
  50
  51 Energy-term weights (scaled):
  52
  53 WSCC=     1.352790 (SC-SC)
  54 WSCP=     1.593040 (SC-p)
  55 WELEC=    0.715340 (p-p electr)
  56 WVDWPP=   0.113710 (p-p VDW)
  57 WBOND=    1.000000 (stretching)
  58 WANG=     1.138730 (bending)
  59 WSCLOC=   0.162580 (SC local)
  60 WTOR=     1.985990 (torsional)
  61 WTORD=    1.570690 (double torsional)
  62 WSTRAIN=  1.000000 (SS bridges & dist. cnstr.)
  63 WEL_LOC=  0.160360 (multi-body 3-rd order)
  64 WCORR4=   0.428870 (multi-body 4th order)
  65 WCORR5=   0.000000 (multi-body 5th order)
  66 WCORR6=   0.000000 (multi-body 6th order)
  67 WSCCOR=   0.000000 (back-scloc correlatkion)
  68 WTURN3=   1.687220 (turns, 3rd order)
  69 WTURN4=   0.662300 (turns, 4th order)
  70 WTURN6=   0.000000 (turns, 6th order)
  71 WDFA_D=   0.000000 (DFA, distance)
  72 WDFA_T=   0.000000 (DFA, torsional)
  73 WDFA_N=   0.000000 (DFA, number of neighbor)
  74 WDFA_B=   0.000000 (DFA, beta formation)
  75  Reference temperature for weights calculation:   300.000000000000
  76  Parameters of the SS-bond potential:
  77  D0CM   3.78000000000000       AKCM   15.1000000000000       AKTH
  78    11.0000000000000       AKCT   12.0000000000000
  79  V1SS  -1.08000000000000       V2SS   7.61000000000000       V3SS
  80    13.7000000000000
  81  EBR  -5.50000000000000
  82  ITEL
  83            1          21           0
  84            2          14           1
  85            3           5           1
  86            4           8           1
  87            5           4           1
  88            6          13           1
  89            7           7           1
  90            8           5           1
  91            9          19           1
  92           10          16           1
  93           11          10           1
  94           12          10           2
  95           13          20           1
  96           14          12           1
  97           15          12           1
  98           16          10           1
  99           17          18           2
 100           18          20           2
 101           19          20           2
 102           20          20           1
 103           21          12           0
 104  ns=           0  iss:
 105  NZ_START=           2  NZ_END=          21
 106  IZ_SC=           0
 107
 108 Geometry of the virtual chain.
 109   Res           d     Theta     Gamma       Dsc     Alpha      Beta
 110 D     1     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
 111 ASN   2     3.800     0.000     0.000     1.684     0.000     0.000
 112 LEU   3     3.800     0.000     0.000     1.939     0.000     0.000
 113 TYR   4     3.800     0.000     0.000     2.484     0.000     0.000
 114 ILE   5     3.800     0.000     0.000     1.776     0.000     0.000
 115 GLN   6     3.800     0.000     0.000     2.240     0.000     0.000
 116 TRP   7     3.800     0.000     0.000     2.605     0.000     0.000
 117 LEU   8     3.800     0.000     0.000     1.939     0.000     0.000
 118 LYS   9     3.800     0.000     0.000     2.541     0.000     0.000
 119 ASP  10     3.800     0.000     0.000     1.709     0.000     0.000
 120 GLY  11     3.800     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
 121 GLY  12     3.800     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
 122 PRO  13     3.800     0.000     0.000     1.345     0.000     0.000
 123 SER  14     3.800     0.000     0.000     1.150     0.000     0.000
 124 SER  15     3.800     0.000     0.000     1.150     0.000     0.000
 125 GLY  16     3.800     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
 126 ARG  17     3.800     0.000     0.000     3.020     0.000     0.000
 127 PRO  18     3.800     0.000     0.000     1.345     0.000     0.000
 128 PRO  19     3.800     0.000     0.000     1.345     0.000     0.000
 129 PRO  20     3.800     0.000     0.000     1.345     0.000     0.000
 130 SER  21     3.800     0.000     0.000     1.150     0.000     0.000
 131 D    22     3.800     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
 132
 133
 134 ********************************************************************************
 135                     Processor  54: end reading molecular data.
 136 ********************************************************************************
 137
 138
 139 CSA calculations calculation.
 140
 141 Conformations will be energy-minimized.
 142 ********************************************************************************
 143
 144 Waiting for     0.4414 sec
 145 Waiting for     1.2656 sec
 146 Waiting for     0.0000 sec
 147 Waiting for     0.0000 sec
 148 Waiting for     0.0000 sec
 149  Finishing minim_jlee - signal           0  from master
 150 Waiting for     0.0000 sec
 151 Waiting for     0.0000 sec
 152 Waiting for     0.0000 sec
 153 Waiting for     0.0000 sec
 154 Waiting for     0.5312 sec
 155 Waiting for     0.0000 sec
 156 Waiting for     0.0000 sec
 157 Waiting for     0.0000 sec
 158 Waiting for     0.1328 sec
 159 Waiting for     0.0000 sec
 160 Waiting for     0.0000 sec
 161 Waiting for     0.0000 sec
 162 Waiting for     0.4766 sec
 163 Waiting for     0.0000 sec
 164 Waiting for     0.0000 sec
 165 Waiting for     0.0000 sec
 166 Waiting for     0.0000 sec
 167 Waiting for     0.3320 sec
 168 Waiting for     0.0000 sec
 169 Waiting for     0.0000 sec
 170 Waiting for     0.0859 sec
 171 Waiting for     0.0000 sec
 172 Waiting for     0.0000 sec
 173 Waiting for     0.0000 sec
 174 Waiting for     0.0039 sec
 175 Waiting for     0.0000 sec
 176 Waiting for     1.0938 sec
 177 Waiting for     0.0000 sec
 178 Waiting for     0.0508 sec
 179 Waiting for     0.4414 sec
 180 Waiting for     0.0039 sec
 181 Waiting for     0.3047 sec
 182 Waiting for     0.0078 sec
 183 Waiting for     0.0000 sec
 184 Waiting for     0.0039 sec
 185 Waiting for     0.0039 sec
 186 Waiting for     0.6484 sec
 187 Waiting for     0.0000 sec
 188 Waiting for     0.0000 sec
 189 Waiting for     0.0000 sec
 190 Waiting for     1.3672 sec
 191 Waiting for     0.0000 sec
 192 Waiting for     0.0000 sec
 193 Waiting for     0.0000 sec
 194 Waiting for     0.0000 sec
 195 Waiting for     0.4609 sec
 196 Waiting for     0.0000 sec
 197 Waiting for     0.0000 sec
 198 Waiting for     0.0000 sec
 199 Waiting for     0.0000 sec
 200 Waiting for     0.3047 sec
 201 Waiting for     0.0000 sec
 202 Waiting for     0.0000 sec
 203 Waiting for     0.0000 sec
 204 Waiting for     0.0000 sec
 205 Waiting for     0.0000 sec
 206 Waiting for     0.5117 sec
 207 Waiting for     0.0000 sec
 208 Waiting for     0.0000 sec
 209 Waiting for     0.0000 sec
 210 Waiting for     0.0039 sec
 211 Waiting for     0.2617 sec
 212 Waiting for     0.0000 sec
 213 Waiting for     0.0000 sec
 214 Waiting for     0.0000 sec
 215 Waiting for     0.0000 sec
 216 Waiting for     0.2344 sec
 217 Waiting for     0.0000 sec
 218 Waiting for     0.0000 sec
 219 Waiting for     0.0000 sec
 220 Waiting for     0.2109 sec
 221 Waiting for     0.0000 sec
 222 Waiting for     0.0000 sec
 223 Waiting for     0.0000 sec
 224 Waiting for     0.0000 sec
 225 Waiting for     0.0000 sec
 226 Waiting for     0.1953 sec
 227 Waiting for     0.0000 sec
 228 Waiting for     0.0000 sec
 229 Waiting for     0.0000 sec
 230 Waiting for     0.0000 sec
 231 Waiting for     0.0039 sec
 232 Waiting for     0.0000 sec
 233 Waiting for     0.2695 sec
 234 Waiting for     0.0000 sec
 235 Waiting for     0.0000 sec
 236 Waiting for     0.0000 sec
 237 Waiting for     0.0000 sec
 238 Waiting for     0.0000 sec
 239 Waiting for     0.0039 sec
 240 Waiting for     0.1055 sec
 241 Waiting for     0.0000 sec
 242 Waiting for     0.0000 sec
 243 Waiting for     0.0000 sec
 244 Waiting for     0.0000 sec
 245 Waiting for     0.5352 sec
 246 Waiting for     0.0000 sec
 247 Waiting for     0.0000 sec
 248 Waiting for     0.0000 sec
 249 Waiting for     0.0000 sec
 250 Waiting for     0.3086 sec
 251 Waiting for     0.0000 sec
 252 Waiting for     0.0000 sec
 253 Waiting for     0.0000 sec
 254 Waiting for     0.0000 sec
 255 Waiting for     0.2656 sec
 256 Waiting for     0.0000 sec
 257 Waiting for     0.0000 sec
 258 Waiting for     0.0000 sec
 259 Waiting for     0.0000 sec
 260 Waiting for     0.0000 sec
 261 Waiting for     0.3516 sec
 262 Waiting for     0.0039 sec
 263 Waiting for     0.0000 sec
 264 Waiting for     0.4922 sec
 265 Waiting for     0.0000 sec
 266 Waiting for     0.0000 sec
 267 Waiting for     1.0898 sec
 268 Waiting for     0.0000 sec
 269 Waiting for     0.0000 sec
 270 Waiting for     0.1367 sec
 271 Waiting for     0.0000 sec
 272 Waiting for     0.0000 sec
 273 Waiting for     0.0000 sec
 274 Waiting for     0.0039 sec
 275 Waiting for     0.0000 sec
 276 Waiting for     0.0039 sec
 277 Waiting for     0.4023 sec
 278 Waiting for     0.0000 sec
 279 Waiting for     0.0000 sec
 280 Waiting for     0.0000 sec
 281 Waiting for     0.3164 sec
 282 Waiting for     0.0000 sec
 283 Waiting for     0.0039 sec
 284 Waiting for     0.0039 sec
 285 Waiting for     0.3164 sec
 286 Waiting for     0.0000 sec
 287 Waiting for     0.0195 sec
 288 Waiting for     0.0000 sec
 289 Waiting for     0.0000 sec
 290 Waiting for     0.0000 sec
 291 Waiting for     0.0000 sec
 292 Waiting for     0.3203 sec
 293 Waiting for     0.0000 sec
 294 Waiting for     0.0000 sec
 295 Waiting for     0.0000 sec
 296 Waiting for     0.0000 sec
 297 Waiting for     0.5078 sec
 298 Waiting for     0.0000 sec
 299 Waiting for     0.0000 sec
 300 Waiting for     0.0000 sec
 301 Waiting for     0.0000 sec
 302 Waiting for     0.4414 sec
 303 Waiting for     0.0039 sec
 304 Waiting for     0.0000 sec
 305 Waiting for     0.0000 sec
 306 Waiting for     0.3945 sec
 307 Waiting for     0.0000 sec
 308 Waiting for     0.0000 sec
 309 Waiting for     0.0000 sec
 310 Waiting for     0.0000 sec
 311 Waiting for     0.2695 sec
 312 Waiting for     0.0039 sec
 313 Waiting for     0.0000 sec
 314 Waiting for     0.0000 sec
 315 Waiting for     0.0000 sec
 316 Waiting for     0.1602 sec
 317 Waiting for     0.0000 sec
 318 Waiting for     0.0000 sec
 319 Waiting for     0.0000 sec
 320 Waiting for     0.0000 sec
 321 Waiting for     0.3359 sec
 322 Waiting for     0.0000 sec
 323 Waiting for     0.0000 sec
 324 Waiting for     0.0000 sec
 325 Waiting for     0.0000 sec
 326 Waiting for     0.0000 sec
 327 Waiting for     0.3398 sec
 328 Waiting for     0.0000 sec
 329 Waiting for     0.0000 sec
 330 Waiting for     0.0000 sec
 331 Waiting for     0.2070 sec
 332 Waiting for     0.0000 sec
 333 Waiting for     0.0000 sec
 334 Waiting for     0.0000 sec
 335 Waiting for     0.0039 sec
 336 Waiting for     0.0000 sec
 337 Waiting for     0.2969 sec
 338 Waiting for     0.0000 sec
 339 Waiting for     0.0000 sec
 340 Waiting for     0.0000 sec
 341 Waiting for     0.0000 sec
 342 Waiting for     0.2969 sec
 343 Waiting for     0.0000 sec
 344 Waiting for     0.0000 sec
 345 Waiting for     0.0000 sec
 346 Waiting for     0.0000 sec
 347 Waiting for     0.0000 sec
 348 Waiting for     0.3086 sec
 349 Waiting for     0.0000 sec
 350 Waiting for     0.0000 sec
 351 Waiting for     0.0000 sec
 352 Waiting for     0.0000 sec
 353 Waiting for     0.0000 sec
 354 Waiting for     0.0000 sec
 355 Waiting for     0.3203 sec
 356 Waiting for     0.0000 sec
 357 Waiting for     0.0000 sec
 358 Waiting for     0.0000 sec
 359 Waiting for     0.0000 sec
 360 Waiting for     0.3672 sec
 361 Waiting for     0.0000 sec
 362 Waiting for     0.0000 sec
 363 Waiting for     0.0039 sec
 364 Waiting for     0.0000 sec
 365 Waiting for     0.0000 sec
 366 Waiting for     0.9570 sec
 367 Waiting for     0.0000 sec
 368 Waiting for     0.3984 sec
 369 Waiting for     0.0000 sec
 370 Waiting for     0.0000 sec
 371 Waiting for     0.0000 sec
 372 Waiting for     0.3438 sec
 373 Waiting for     0.0000 sec
 374 Waiting for     0.0039 sec
 375 Waiting for     0.0000 sec
 376 Waiting for     0.0000 sec
 377 Waiting for     0.2969 sec
 378 Waiting for     0.0000 sec
 379 Waiting for     0.0000 sec
 380 Waiting for     0.0000 sec
 381 Waiting for     0.0000 sec
 382 Waiting for     0.4492 sec
 383 Waiting for     0.0000 sec
 384 Waiting for     0.0039 sec
 385 Waiting for     0.0000 sec
 386 Waiting for     0.0000 sec
 387 Waiting for     0.3633 sec
 388 Waiting for     0.0000 sec
 389 Waiting for     0.0000 sec
 390 Waiting for     0.0000 sec
 391 Waiting for     0.9648 sec
 392 Waiting for     0.0000 sec
 393 Waiting for     0.0000 sec
 394 Waiting for     0.3711 sec
 395 Waiting for     0.0000 sec
 396 Waiting for     0.0000 sec
 397 Waiting for     0.3789 sec
 398 Waiting for     0.0000 sec
 399 Waiting for     0.0000 sec
 400 Waiting for     0.0000 sec
 401 Waiting for     0.3125 sec
 402 Waiting for     0.0000 sec
 403 Waiting for     0.0000 sec
 404 Waiting for     0.0000 sec
 405 Waiting for     0.3633 sec
 406 Waiting for     0.0000 sec
 407 Waiting for     0.0000 sec
 408 Waiting for     0.4180 sec
 409  Finishing minim_jlee - signal           0  from master
 410  End of minim, proc          54 time    64.8164062500000
 411 CG processor  54 is finishing work.
 412  Total wall clock time   74.6953125000000       sec