correct writing of dyn_ss for cx and x
[unres.git] / examples / unres / CSA / GAB / CSA / local / 1l2y_csa.out_GB042
1 ********************************************************************************
2 United-residue force field calculation - parallel job.
3 ********************************************************************************
4  MPI: node=           42  iseed=             -131568948
5  ran_num  0.771348443150135     
6 RMSDBC =        3.0
7 RMSDBC1 =        0.5
8 RMSDBC1MAX =        1.5
9 DRMS    =        0.1
10 RMSDBCM =        3.0
11 Time limit (min):     960.0
12  RESCALE_MODE           0
13 Library  routine used to diagonalize matrices.
14
15 ********************************************************************************
16                     Options in energy minimization:
17 ********************************************************************************
18 MaxMin: 3000 MaxFun: 1000MinMin: 3000 MinFun: 3000 TolF:   1.00000E-02 RTolF:   1.00000E-04
19  NCONF_IN           0
20
21 Energy-term weights (unscaled):
22
23 WSCC=     1.352790 (SC-SC)
24 WSCP=     1.593040 (SC-p)
25 WELEC=    0.715340 (p-p electr)
26 WVDWPP=   0.113710 (p-p VDW)
27 WBOND=    1.000000 (stretching)
28 WANG=     1.138730 (bending)
29 WSCLOC=   0.162580 (SC local)
30 WTOR=     1.985990 (torsional)
31 WTORD=    1.570690 (double torsional)
32 WSTRAIN=  1.000000 (SS bridges & dist. cnstr.)
33 WEL_LOC=  0.160360 (multi-body 3-rd order)
34 WCORR4=   0.428870 (multi-body 4th order)
35 WCORR5=   0.000000 (multi-body 5th order)
36 WCORR6=   0.000000 (multi-body 6th order)
37 WSCCOR=   0.000000 (back-scloc correlation)
38 WTURN3=   1.687220 (turns, 3rd order)
39 WTURN4=   0.662300 (turns, 4th order)
40 WTURN6=   0.000000 (turns, 6th order)
41 WDFA_D=   0.000000 (DFA, distance)
42 WDFA_T=   0.000000 (DFA, torsional)
43 WDFA_N=   0.000000 (DFA, number of neighbor)
44 WDFA_B=   0.000000 (DFA, beta formation)
45
46 Hydrogen-bonding correlation between contact pairs of peptide groups
47
48 Scaling factor of 1,4 SC-p interactions:   0.400
49 General scaling factor of SC-p interactions:   1.000
50
51 Energy-term weights (scaled):
52
53 WSCC=     1.352790 (SC-SC)
54 WSCP=     1.593040 (SC-p)
55 WELEC=    0.715340 (p-p electr)
56 WVDWPP=   0.113710 (p-p VDW)
57 WBOND=    1.000000 (stretching)
58 WANG=     1.138730 (bending)
59 WSCLOC=   0.162580 (SC local)
60 WTOR=     1.985990 (torsional)
61 WTORD=    1.570690 (double torsional)
62 WSTRAIN=  1.000000 (SS bridges & dist. cnstr.)
63 WEL_LOC=  0.160360 (multi-body 3-rd order)
64 WCORR4=   0.428870 (multi-body 4th order)
65 WCORR5=   0.000000 (multi-body 5th order)
66 WCORR6=   0.000000 (multi-body 6th order)
67 WSCCOR=   0.000000 (back-scloc correlatkion)
68 WTURN3=   1.687220 (turns, 3rd order)
69 WTURN4=   0.662300 (turns, 4th order)
70 WTURN6=   0.000000 (turns, 6th order)
71 WDFA_D=   0.000000 (DFA, distance)
72 WDFA_T=   0.000000 (DFA, torsional)
73 WDFA_N=   0.000000 (DFA, number of neighbor)
74 WDFA_B=   0.000000 (DFA, beta formation)
75  Reference temperature for weights calculation:   300.000000000000     
76  Parameters of the SS-bond potential:
77  D0CM   3.78000000000000       AKCM   15.1000000000000       AKTH
78    11.0000000000000       AKCT   12.0000000000000     
79  V1SS  -1.08000000000000       V2SS   7.61000000000000       V3SS
80    13.7000000000000     
81  EBR  -5.50000000000000     
82  ITEL
83            1          21           0
84            2          14           1
85            3           5           1
86            4           8           1
87            5           4           1
88            6          13           1
89            7           7           1
90            8           5           1
91            9          19           1
92           10          16           1
93           11          10           1
94           12          10           2
95           13          20           1
96           14          12           1
97           15          12           1
98           16          10           1
99           17          18           2
100           18          20           2
101           19          20           2
102           20          20           1
103           21          12           0
104  ns=           0  iss:
105  NZ_START=           2  NZ_END=          21
106  IZ_SC=           0
107
108 Geometry of the virtual chain.
109   Res           d     Theta     Gamma       Dsc     Alpha      Beta 
110 D     1     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
111 ASN   2     3.800     0.000     0.000     1.684     0.000     0.000
112 LEU   3     3.800     0.000     0.000     1.939     0.000     0.000
113 TYR   4     3.800     0.000     0.000     2.484     0.000     0.000
114 ILE   5     3.800     0.000     0.000     1.776     0.000     0.000
115 GLN   6     3.800     0.000     0.000     2.240     0.000     0.000
116 TRP   7     3.800     0.000     0.000     2.605     0.000     0.000
117 LEU   8     3.800     0.000     0.000     1.939     0.000     0.000
118 LYS   9     3.800     0.000     0.000     2.541     0.000     0.000
119 ASP  10     3.800     0.000     0.000     1.709     0.000     0.000
120 GLY  11     3.800     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
121 GLY  12     3.800     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
122 PRO  13     3.800     0.000     0.000     1.345     0.000     0.000
123 SER  14     3.800     0.000     0.000     1.150     0.000     0.000
124 SER  15     3.800     0.000     0.000     1.150     0.000     0.000
125 GLY  16     3.800     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
126 ARG  17     3.800     0.000     0.000     3.020     0.000     0.000
127 PRO  18     3.800     0.000     0.000     1.345     0.000     0.000
128 PRO  19     3.800     0.000     0.000     1.345     0.000     0.000
129 PRO  20     3.800     0.000     0.000     1.345     0.000     0.000
130 SER  21     3.800     0.000     0.000     1.150     0.000     0.000
131 D    22     3.800     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
132
133
134 ********************************************************************************
135                     Processor  42: end reading molecular data.
136 ********************************************************************************
137
138
139 CSA calculations calculation.
140
141 Conformations will be energy-minimized.
142 ********************************************************************************
143
144 Waiting for     0.4375 sec
145 Waiting for     1.2305 sec
146 Waiting for     0.0000 sec
147 Waiting for     0.0000 sec
148 Waiting for     0.0039 sec
149 Waiting for     0.0000 sec
150 Waiting for     0.0391 sec
151 Waiting for     0.0000 sec
152  Finishing minim_jlee - signal           0  from master
153 Waiting for     0.7070 sec
154 Waiting for     0.0000 sec
155 Waiting for     0.0000 sec
156 Waiting for     0.0039 sec
157 Waiting for     0.0039 sec
158 Waiting for     0.0000 sec
159 Waiting for     0.0000 sec
160 Waiting for     0.0000 sec
161 Waiting for     0.0000 sec
162 Waiting for     0.0000 sec
163 Waiting for     0.0000 sec
164 Waiting for     0.0000 sec
165 Waiting for     0.0000 sec
166 Waiting for     0.0586 sec
167 Waiting for     0.4609 sec
168 Waiting for     0.0000 sec
169 Waiting for     0.0000 sec
170 Waiting for     0.0039 sec
171 Waiting for     0.0000 sec
172 Waiting for     0.0000 sec
173 Waiting for     0.0000 sec
174 Waiting for     0.0000 sec
175 Waiting for     0.0000 sec
176 Waiting for     0.0000 sec
177 Waiting for     0.5312 sec
178 Waiting for     0.0000 sec
179 Waiting for     0.0000 sec
180 Waiting for     0.0000 sec
181 Waiting for     0.0000 sec
182 Waiting for     0.0000 sec
183 Waiting for     0.0000 sec
184 Waiting for     0.2656 sec
185 Waiting for     0.0000 sec
186 Waiting for     0.0000 sec
187 Waiting for     0.0000 sec
188 Waiting for     0.0000 sec
189 Waiting for     0.0000 sec
190 Waiting for     0.0000 sec
191 Waiting for     0.5195 sec
192 Waiting for     0.0000 sec
193 Waiting for     0.0000 sec
194 Waiting for     0.0000 sec
195 Waiting for     0.0000 sec
196 Waiting for     0.0000 sec
197 Waiting for     0.0000 sec
198 Waiting for     0.2695 sec
199 Waiting for     0.0820 sec
200 Waiting for     0.0000 sec
201 Waiting for     0.0000 sec
202 Waiting for     0.0000 sec
203 Waiting for     0.0000 sec
204 Waiting for     0.0000 sec
205 Waiting for     1.1172 sec
206 Waiting for     0.0000 sec
207 Waiting for     0.0000 sec
208 Waiting for     0.0039 sec
209 Waiting for     0.0586 sec
210 Waiting for     0.0000 sec
211 Waiting for     0.4492 sec
212 Waiting for     0.0000 sec
213 Waiting for     0.0000 sec
214 Waiting for     0.0000 sec
215 Waiting for     0.0039 sec
216 Waiting for     0.0000 sec
217 Waiting for     0.0000 sec
218 Waiting for     0.0000 sec
219 Waiting for     0.3477 sec
220 Waiting for     0.0000 sec
221 Waiting for     0.0000 sec
222 Waiting for     0.0000 sec
223 Waiting for     0.0000 sec
224 Waiting for     0.0039 sec
225 Waiting for     0.0000 sec
226 Waiting for     0.0000 sec
227 Waiting for     0.7617 sec
228 Waiting for     0.0000 sec
229 Waiting for     0.0000 sec
230 Waiting for     0.0000 sec
231 Waiting for     0.0000 sec
232 Waiting for     0.0000 sec
233 Waiting for     1.3594 sec
234 Waiting for     0.0000 sec
235 Waiting for     0.0000 sec
236 Waiting for     0.0039 sec
237 Waiting for     0.0000 sec
238 Waiting for     0.0039 sec
239 Waiting for     0.0000 sec
240 Waiting for     0.0000 sec
241 Waiting for     0.0000 sec
242 Waiting for     0.0000 sec
243 Waiting for     0.0000 sec
244 Waiting for     0.3711 sec
245 Waiting for     0.0039 sec
246 Waiting for     0.0000 sec
247 Waiting for     0.0000 sec
248 Waiting for     0.0039 sec
249 Waiting for     0.0000 sec
250 Waiting for     0.3242 sec
251 Waiting for     0.0000 sec
252 Waiting for     0.0000 sec
253 Waiting for     0.0000 sec
254 Waiting for     0.0000 sec
255 Waiting for     0.0000 sec
256 Waiting for     0.0000 sec
257 Waiting for     0.0000 sec
258 Waiting for     0.0000 sec
259 Waiting for     0.5195 sec
260 Waiting for     0.0000 sec
261 Waiting for     0.0000 sec
262 Waiting for     0.0000 sec
263 Waiting for     0.0000 sec
264 Waiting for     0.0000 sec
265 Waiting for     0.0000 sec
266 Waiting for     0.0000 sec
267 Waiting for     0.2891 sec
268 Waiting for     0.0000 sec
269 Waiting for     0.0000 sec
270 Waiting for     0.0000 sec
271 Waiting for     0.0000 sec
272 Waiting for     0.0000 sec
273 Waiting for     0.0000 sec
274 Waiting for     0.2578 sec
275 Waiting for     0.0000 sec
276 Waiting for     0.0000 sec
277 Waiting for     0.0000 sec
278 Waiting for     0.0000 sec
279 Waiting for     0.0000 sec
280 Waiting for     0.0000 sec
281 Waiting for     0.2930 sec
282 Waiting for     0.0000 sec
283 Waiting for     0.0039 sec
284 Waiting for     0.0000 sec
285 Waiting for     0.0000 sec
286 Waiting for     0.0000 sec
287 Waiting for     0.2656 sec
288 Waiting for     0.0000 sec
289 Waiting for     0.0000 sec
290 Waiting for     0.0000 sec
291 Waiting for     0.0000 sec
292 Waiting for     0.0000 sec
293 Waiting for     0.0000 sec
294 Waiting for     0.0000 sec
295 Waiting for     0.0000 sec
296 Waiting for     0.0000 sec
297 Waiting for     0.3242 sec
298 Waiting for     0.0000 sec
299 Waiting for     0.0000 sec
300 Waiting for     0.0000 sec
301 Waiting for     0.0000 sec
302 Waiting for     0.0000 sec
303 Waiting for     0.0000 sec
304 Waiting for     0.0039 sec
305 Waiting for     0.0000 sec
306 Waiting for     0.3438 sec
307 Waiting for     0.0000 sec
308 Waiting for     0.0000 sec
309 Waiting for     0.0000 sec
310 Waiting for     0.0000 sec
311 Waiting for     0.0000 sec
312 Waiting for     0.5938 sec
313 Waiting for     0.0000 sec
314 Waiting for     0.0000 sec
315 Waiting for     0.0039 sec
316 Waiting for     0.0000 sec
317 Waiting for     0.0000 sec
318 Waiting for     0.0000 sec
319 Waiting for     0.0000 sec
320 Waiting for     0.0000 sec
321 Waiting for     0.0000 sec
322 Waiting for     0.3438 sec
323 Waiting for     0.0000 sec
324 Waiting for     0.0000 sec
325 Waiting for     0.0000 sec
326 Waiting for     0.0000 sec
327 Waiting for     0.3398 sec
328 Waiting for     0.0000 sec
329 Waiting for     0.0000 sec
330 Waiting for     0.0000 sec
331 Waiting for     0.0000 sec
332 Waiting for     0.0000 sec
333 Waiting for     0.0000 sec
334 Waiting for     0.0039 sec
335 Waiting for     0.4023 sec
336 Waiting for     0.0000 sec
337 Waiting for     0.0039 sec
338 Waiting for     0.0000 sec
339 Waiting for     0.0000 sec
340 Waiting for     0.0000 sec
341 Waiting for     0.0000 sec
342 Waiting for     0.0000 sec
343 Waiting for     0.4531 sec
344 Waiting for     0.0000 sec
345 Waiting for     0.0000 sec
346 Waiting for     0.0000 sec
347 Waiting for     0.0000 sec
348 Waiting for     0.0000 sec
349 Waiting for     0.0000 sec
350 Waiting for     0.0000 sec
351 Waiting for     1.1016 sec
352 Waiting for     0.0000 sec
353 Waiting for     0.0000 sec
354 Waiting for     0.0000 sec
355 Waiting for     0.0000 sec
356 Waiting for     0.0000 sec
357 Waiting for     0.0000 sec
358 Waiting for     0.0000 sec
359 Waiting for     0.3008 sec
360 Waiting for     0.0000 sec
361 Waiting for     0.0000 sec
362 Waiting for     0.0000 sec
363 Waiting for     0.0000 sec
364 Waiting for     0.0000 sec
365 Waiting for     0.0039 sec
366 Waiting for     0.0000 sec
367 Waiting for     0.0000 sec
368 Waiting for     0.0000 sec
369 Waiting for     0.0000 sec
370 Waiting for     0.0000 sec
371 Waiting for     0.4023 sec
372 Waiting for     0.0000 sec
373 Waiting for     0.0000 sec
374 Waiting for     0.0000 sec
375 Waiting for     0.0000 sec
376 Waiting for     0.0000 sec
377 Waiting for     0.0000 sec
378 Waiting for     0.3320 sec
379 Waiting for     0.0000 sec
380 Waiting for     0.0000 sec
381 Waiting for     0.0000 sec
382 Waiting for     0.0000 sec
383 Waiting for     0.0000 sec
384 Waiting for     0.3945 sec
385 Waiting for     0.0000 sec
386 Waiting for     0.0000 sec
387 Waiting for     0.0000 sec
388 Waiting for     0.0000 sec
389 Waiting for     0.0000 sec
390 Waiting for     0.0000 sec
391 Waiting for     0.3047 sec
392 Waiting for     0.0039 sec
393 Waiting for     0.0000 sec
394 Waiting for     0.0000 sec
395 Waiting for     0.0000 sec
396 Waiting for     0.0000 sec
397 Waiting for     0.0000 sec
398 Waiting for     0.0000 sec
399 Waiting for     0.5156 sec
400 Waiting for     0.0000 sec
401 Waiting for     0.0000 sec
402 Waiting for     0.0000 sec
403 Waiting for     0.0000 sec
404 Waiting for     0.0000 sec
405 Waiting for     0.4336 sec
406 Waiting for     0.0000 sec
407 Waiting for     0.0000 sec
408 Waiting for     0.0000 sec
409 Waiting for     0.0000 sec
410 Waiting for     0.0039 sec
411 Waiting for     0.0000 sec
412 Waiting for     0.0000 sec
413 Waiting for     0.0000 sec
414 Waiting for     0.0000 sec
415 Waiting for     0.3789 sec
416 Waiting for     0.0000 sec
417 Waiting for     0.0000 sec
418 Waiting for     0.0000 sec
419 Waiting for     0.0000 sec
420 Waiting for     0.0000 sec
421 Waiting for     0.0000 sec
422 Waiting for     0.0000 sec
423 Waiting for     0.3711 sec
424 Waiting for     0.0000 sec
425 Waiting for     0.0000 sec
426 Waiting for     0.0000 sec
427 Waiting for     0.0000 sec
428 Waiting for     0.0039 sec
429 Waiting for     0.0000 sec
430 Waiting for     0.3750 sec
431 Waiting for     0.0000 sec
432 Waiting for     0.0039 sec
433 Waiting for     0.0000 sec
434 Waiting for     0.0000 sec
435 Waiting for     0.0000 sec
436 Waiting for     0.0000 sec
437 Waiting for     0.0000 sec
438 Waiting for     0.3086 sec
439 Waiting for     0.0000 sec
440 Waiting for     0.0000 sec
441 Waiting for     0.0000 sec
442 Waiting for     0.0000 sec
443 Waiting for     0.0039 sec
444 Waiting for     0.0000 sec
445 Waiting for     0.0000 sec
446 Waiting for     0.0000 sec
447 Waiting for     0.0000 sec
448 Waiting for     0.3555 sec
449 Waiting for     0.0000 sec
450 Waiting for     0.0000 sec
451 Waiting for     0.0000 sec
452 Waiting for     0.0000 sec
453 Waiting for     0.0039 sec
454 Waiting for     0.0000 sec
455 Waiting for     0.0000 sec
456 Waiting for     0.2695 sec
457 Waiting for     0.0000 sec
458 Waiting for     0.0000 sec
459 Waiting for     0.0000 sec
460 Waiting for     0.0000 sec
461 Waiting for     0.0039 sec
462 Waiting for     0.0000 sec
463 Waiting for     0.3047 sec
464 Waiting for     0.0000 sec
465 Waiting for     0.0000 sec
466 Waiting for     0.0000 sec
467 Waiting for     0.0000 sec
468 Waiting for     0.0000 sec
469 Waiting for     0.3398 sec
470 Waiting for     0.0000 sec
471 Waiting for     0.0000 sec
472 Waiting for     0.0000 sec
473 Waiting for     0.0000 sec
474 Waiting for     0.0000 sec
475 Waiting for     0.0000 sec
476 Waiting for     0.0000 sec
477 Waiting for     0.3164 sec
478 Waiting for     0.0000 sec
479 Waiting for     0.0000 sec
480 Waiting for     0.0000 sec
481 Waiting for     0.0039 sec
482 Waiting for     0.0000 sec
483 Waiting for     0.0000 sec
484 Waiting for     0.3008 sec
485 Waiting for     0.0000 sec
486 Waiting for     0.0000 sec
487 Waiting for     0.0000 sec
488 Waiting for     0.0000 sec
489 Waiting for     0.0000 sec
490 Waiting for     0.3984 sec
491 Waiting for     0.0000 sec
492 Waiting for     0.0000 sec
493 Waiting for     0.0000 sec
494 Waiting for     0.0000 sec
495 Waiting for     0.0000 sec
496 Waiting for     0.9844 sec
497 Waiting for     0.0000 sec
498 Waiting for     0.0000 sec
499 Waiting for     0.0000 sec
500 Waiting for     0.0000 sec
501 Waiting for     0.0000 sec
502 Waiting for     0.3828 sec
503 Waiting for     0.0000 sec
504 Waiting for     0.0000 sec
505 Waiting for     0.0000 sec
506 Waiting for     0.0000 sec
507 Waiting for     0.0000 sec
508 Waiting for     0.4805 sec
509 Waiting for     0.0000 sec
510 Waiting for     0.0000 sec
511 Waiting for     0.0000 sec
512 Waiting for     0.0000 sec
513 Waiting for     0.0000 sec
514 Waiting for     0.0000 sec
515 Waiting for     0.0000 sec
516 Waiting for     0.0000 sec
517 Waiting for     0.0000 sec
518 Waiting for     0.0000 sec
519 Waiting for     0.3516 sec
520 Waiting for     0.0000 sec
521 Waiting for     0.0000 sec
522 Waiting for     0.0000 sec
523 Waiting for     0.0000 sec
524 Waiting for     0.0000 sec
525 Waiting for     0.4258 sec
526 Waiting for     0.0000 sec
527 Waiting for     0.0000 sec
528 Waiting for     0.0000 sec
529 Waiting for     0.0000 sec
530 Waiting for     0.0000 sec
531 Waiting for     0.3828 sec
532 Waiting for     0.0000 sec
533 Waiting for     0.0000 sec
534 Waiting for     0.0000 sec
535 Waiting for     0.0000 sec
536 Waiting for     0.0000 sec
537 Waiting for     0.9766 sec
538 Waiting for     0.0000 sec
539 Waiting for     0.0000 sec
540 Waiting for     0.0000 sec
541 Waiting for     0.0000 sec
542 Waiting for     0.0000 sec
543 Waiting for     0.0000 sec
544 Waiting for     0.3906 sec
545 Waiting for     0.0000 sec
546 Waiting for     0.0000 sec
547 Waiting for     0.0000 sec
548 Waiting for     0.0000 sec
549 Waiting for     0.0000 sec
550 Waiting for     0.0039 sec
551 Waiting for     0.0000 sec
552 Waiting for     0.3672 sec
553 Waiting for     0.0000 sec
554 Waiting for     0.0000 sec
555 Waiting for     0.0039 sec
556 Waiting for     0.0000 sec
557 Waiting for     0.0000 sec
558 Waiting for     0.0000 sec
559 Waiting for     0.3242 sec
560 Waiting for     0.0000 sec
561 Waiting for     0.0000 sec
562 Waiting for     0.0000 sec
563 Waiting for     0.0000 sec
564 Waiting for     0.0000 sec
565 Waiting for     0.3828 sec
566 Waiting for     0.0000 sec
567 Waiting for     0.0000 sec
568 Waiting for     0.0000 sec
569 Waiting for     0.0000 sec
570 Waiting for     0.0000 sec
571 Waiting for     0.0039 sec
572 Waiting for     0.3984 sec
573  Finishing minim_jlee - signal           0  from master
574  End of minim, proc          42 time    67.8164062500000     
575 CG processor  42 is finishing work.
576  Total wall clock time   74.6992187500000       sec