correct writing of dyn_ss for cx and x
[unres.git] / examples / unres / CSA / GAB / CSA / global / restrained / jpred_prediction / jp_fSt_H_1.profile
1
2 Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts
3            A  R  N  D  C  Q  E  G  H  I  L  K  M  F  P  S  T  W  Y  V   A   R   N   D   C   Q   E   G   H   I   L   K   M   F   P   S   T   W   Y   V
4     1 N   -2  0  6  1 -3  0  0  0  1 -3 -3  0 -2 -3 -2  1  0 -4 -2 -3    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
5     2 L   -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3  2  4 -2  2  0 -3 -2 -1 -2 -1  1    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
6     3 Y   -2 -2 -2 -3 -2 -1 -2 -3  2 -1 -1 -2 -1  3 -3 -2 -2  2  7 -1    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
7     4 I   -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3  4  2 -3  1  0 -3 -2 -1 -3 -1  3    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
8     5 Q   -1  1  0  0 -3  5  2 -2  0 -3 -2  1  0 -3 -1  0 -1 -2 -1 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
9     6 W   -2 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1  1 -4 -3 -2 10  2 -3    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
10     7 L   -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3  2  4 -2  2  0 -3 -2 -1 -2 -1  1    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
11     8 K   -1  2  0 -1 -3  1  1 -2 -1 -3 -2  4 -1 -3 -1  0 -1 -3 -2 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
12     9 D   -2 -2  1  6 -3  0  1 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -3 -1  0 -1 -4 -3 -3    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
13    10 G    0 -2  0 -1 -2 -2 -2  6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2  0 -2 -2 -3 -3    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
14    11 G    0 -2  0 -1 -2 -2 -2  6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2  0 -2 -2 -3 -3    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
15    12 P   -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4  7 -1 -1 -4 -3 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
16    13 S    1 -1  1  0 -1  0  0  0 -1 -2 -2  0 -1 -2 -1  4  1 -3 -2 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
17    14 S    1 -1  1  0 -1  0  0  0 -1 -2 -2  0 -1 -2 -1  4  1 -3 -2 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
18    15 G    0 -2  0 -1 -2 -2 -2  6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2  0 -2 -2 -3 -3    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
19    16 R   -1  5  0 -2 -3  1  0 -2  0 -3 -2  2 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
20    17 P   -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4  7 -1 -1 -4 -3 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
21    18 P   -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4  7 -1 -1 -4 -3 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
22    19 P   -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4  7 -1 -1 -4 -3 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
23    20 S    1 -1  1  0 -1  0  0  0 -1 -2 -2  0 -1 -2 -1  4  1 -3 -2 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
24
25                       K         Lambda
26 Standard Ungapped    0.1408     0.3104
27 Standard Gapped      0.0410     0.2670
28 PSI Ungapped         0.1437     0.3166
29 PSI Gapped           0.0440     0.2670