examples/unres/CSA/CASP3/ENERGY/protA.out_LJ000

   1 --------------------------------------------------------------------------------
   2                               FILE ASSIGNMENT
   3 --------------------------------------------------------------------------------
   4  Input file                      : protA.inp
   5  Output file                     : protA.out_LJ000
   6
   7  Sidechain potential file        : ../../../../../PARAM/scinter_LJ.parm
   8  SCp potential file              : ../../../../../PARAM/scp.parm
   9  Electrostatic potential file    : ../../../../../PARAM/electr.parm
  10  Cumulant coefficient file       : ../../../../../PARAM/fourier_GAP.parm
  11  Torsional parameter file        : ../../../../../PARAM/torsion_cryst.parm
  12  Double torsional parameter file :
  13  ../../../../../PARAM/torsion_double_631Gdp.parm
  14  SCCOR parameter file : ../../../../../PARAM/rotcorr_AM1.parm
  15  Bond & inertia constant file    : ../../../../../PARAM/bond.parm
  16  Bending parameter file          : ../../../../../PARAM/thetaml.5parm
  17  Rotamer parameter file          : ../../../../../PARAM/scgauss.parm
  18  Threading database              : ../../../../../PARAM/patterns.cart
  19 --------------------------------------------------------------------------------
  20 ********************************************************************************
  21 United-residue force field calculation - parallel job.
  22 ********************************************************************************
  23  ### LAST MODIFIED  11/03/09 1:19PM by czarek
  24  ++++ Compile info ++++
  25  Version CSA and DFA only
  26
  27 Potential is LJ , exponents are   6 12
  28
  29 Disulfide bridge parameters:
  30 S-S bridge energy:      -5.50
  31 d0cm:      3.78 akcm:     15.10
  32 akth:     11.00 akct:     12.00
  33 v1ss:     -1.08 v2ss:      7.61 v3ss:     13.70
  34  MPI: node=            0  iseed=               -3059742
  35  ran_num  0.273754117333397
  36 RMSDBC =        3.0
  37 RMSDBC1 =        0.5
  38 RMSDBC1MAX =        1.5
  39 DRMS    =        0.1
  40 RMSDBCM =        3.0
  41 Time limit (min):     960.0
  42  RESCALE_MODE           1
  43 Library  routine used to diagonalize matrices.
  44
  45 ********************************************************************************
  46                     Options in energy minimization:
  47 ********************************************************************************
  48 MaxMin: 2000 MaxFun: 5000MinMin: 2000 MinFun: 2000 TolF:   1.00000E-02 RTolF:   1.00000E-04
  49
  50 Energy-term weights (unscaled):
  51
  52 WSCC=     1.000000 (SC-SC)
  53 WSCP=     1.000000 (SC-p)
  54 WELEC=    1.500000 (p-p electr)
  55 WVDWPP=   1.500000 (p-p VDW)
  56 WBOND=    1.000000 (stretching)
  57 WANG=     0.103840 (bending)
  58 WSCLOC=   0.103840 (SC local)
  59 WTOR=     0.086170 (torsional)
  60 WTORD=    0.000000 (double torsional)
  61 WSTRAIN=  1.000000 (SS bridges & dist. cnstr.)
  62 WEL_LOC=  0.000000 (multi-body 3-rd order)
  63 WCORR4=   1.500000 (multi-body 4th order)
  64 WCORR5=   0.000000 (multi-body 5th order)
  65 WCORR6=   0.000000 (multi-body 6th order)
  66 WSCCOR=   1.000000 (back-scloc correlation)
  67 WTURN3=   0.000000 (turns, 3rd order)
  68 WTURN4=   0.000000 (turns, 4th order)
  69 WTURN6=   0.000000 (turns, 6th order)
  70 WDFA_D=   1.000000 (DFA, distance)
  71 WDFA_T=   1.000000 (DFA, torsional)
  72 WDFA_N=   1.000000 (DFA, number of neighbor)
  73 WDFA_B=   1.000000 (DFA, beta formation)
  74
  75 Hydrogen-bonding correlation between contact pairs of peptide groups
  76
  77 Scaling factor of 1,4 SC-p interactions:   0.400
  78 General scaling factor of SC-p interactions:   1.000
  79
  80 Energy-term weights (scaled):
  81
  82 WSCC=     1.000000 (SC-SC)
  83 WSCP=     1.000000 (SC-p)
  84 WELEC=    2.571429 (p-p electr)
  85 WVDWPP=   1.500000 (p-p VDW)
  86 WBOND=    1.000000 (stretching)
  87 WANG=     0.103840 (bending)
  88 WSCLOC=   0.103840 (SC local)
  89 WTOR=     0.147720 (torsional)
  90 WTORD=    0.000000 (double torsional)
  91 WSTRAIN=  1.000000 (SS bridges & dist. cnstr.)
  92 WEL_LOC=  0.000000 (multi-body 3-rd order)
  93 WCORR4=   1.616968 (multi-body 4th order)
  94 WCORR5=   0.000000 (multi-body 5th order)
  95 WCORR6=   0.000000 (multi-body 6th order)
  96 WSCCOR=   1.714286 (back-scloc correlatkion)
  97 WTURN3=   0.000000 (turns, 3rd order)
  98 WTURN4=   0.000000 (turns, 4th order)
  99 WTURN6=   0.000000 (turns, 6th order)
 100 WDFA_D=   1.000000 (DFA, distance)
 101 WDFA_T=   1.000000 (DFA, torsional)
 102 WDFA_N=   1.000000 (DFA, number of neighbor)
 103 WDFA_B=   1.000000 (DFA, beta formation)
 104  Reference temperature for weights calculation:   300.000000000000
 105  Parameters of the SS-bond potential:
 106  D0CM   3.78000000000000       AKCM   15.1000000000000       AKTH
 107    11.0000000000000       AKCT   12.0000000000000
 108  V1SS  -1.08000000000000       V2SS   7.61000000000000       V3SS
 109    13.7000000000000
 110  EBR  -5.50000000000000
 111  ITEL
 112            1          21           0
 113            2          13           1
 114            3          13           1
 115            4          14           1
 116            5           9           1
 117            6           3           1
 118            7           8           1
 119            8          15           1
 120            9           4           1
 121           10           5           1
 122           11          17           1
 123           12           5           1
 124           13          20           2
 125           14          14           1
 126           15           5           1
 127           16          14           1
 128           17          15           1
 129           18          15           1
 130           19          13           1
 131           20          18           1
 132           21          14           1
 133           22          10           1
 134           23           3           1
 135           24           4           1
 136           25          13           1
 137           26          12           1
 138           27           5           1
 139           28          19           1
 140           29          16           1
 141           30          16           1
 142           31          20           2
 143           32          12           1
 144           33          13           1
 145           34          12           1
 146           35           9           1
 147           36          14           1
 148           37           5           1
 149           38           5           1
 150           39           9           1
 151           40          15           1
 152           41           9           1
 153           42          19           1
 154           43          19           1
 155           44           5           1
 156           45          14           1
 157           46          16           1
 158           47           9           1
 159  ns=           0  iss:
 160 Boundaries in phi angle sampling:
 161 D      1    -180.0     180.0
 162 GLN    2    -180.0     180.0
 163 GLN    3    -180.0     180.0
 164 ASN    4    -180.0     180.0
 165 ALA    5    -180.0     180.0
 166 PHE    6    -180.0     180.0
 167 TYR    7    -180.0     180.0
 168 GLU    8    -180.0     180.0
 169 ILE    9    -180.0     180.0
 170 LEU   10    -180.0     180.0
 171 HIS   11    -180.0     180.0
 172 LEU   12    -180.0     180.0
 173 PRO   13    -180.0     180.0
 174 ASN   14    -180.0     180.0
 175 LEU   15    -180.0     180.0
 176 ASN   16    -180.0     180.0
 177 GLU   17    -180.0     180.0
 178 GLU   18    -180.0     180.0
 179 GLN   19    -180.0     180.0
 180 ARG   20    -180.0     180.0
 181 ASN   21    -180.0     180.0
 182 GLY   22    -180.0     180.0
 183 PHE   23    -180.0     180.0
 184 ILE   24    -180.0     180.0
 185 GLN   25    -180.0     180.0
 186 SER   26    -180.0     180.0
 187 LEU   27    -180.0     180.0
 188 LYS   28    -180.0     180.0
 189 ASP   29    -180.0     180.0
 190 ASP   30    -180.0     180.0
 191 PRO   31    -180.0     180.0
 192 SER   32    -180.0     180.0
 193 GLN   33    -180.0     180.0
 194 SER   34    -180.0     180.0
 195 ALA   35    -180.0     180.0
 196 ASN   36    -180.0     180.0
 197 LEU   37    -180.0     180.0
 198 LEU   38    -180.0     180.0
 199 ALA   39    -180.0     180.0
 200 GLU   40    -180.0     180.0
 201 ALA   41    -180.0     180.0
 202 LYS   42    -180.0     180.0
 203 LYS   43    -180.0     180.0
 204 LEU   44    -180.0     180.0
 205 ASN   45    -180.0     180.0
 206 ASP   46    -180.0     180.0
 207 ALA   47    -180.0     180.0
 208 D     48    -180.0     180.0
 209 dist_dfa.dat is opened!
 210 Error opening dist_dfa.dat file