added source code
[unres.git] / examples / unres / CSA / CASP3 / ENERGY / output / protA.out_LJ000
1 --------------------------------------------------------------------------------
2                               FILE ASSIGNMENT
3 --------------------------------------------------------------------------------
4  Input file                      : protA.inp
5  Output file                     : protA.out_LJ000
6  
7  Sidechain potential file        : ../../PARAM/scinter_LJ.parm
8  SCp potential file              : ../../PARAM/scp.parm
9  Electrostatic potential file    : ../../PARAM/electr.parm
10  Cumulant coefficient file       : ../../PARAM/fourier_GAP.parm
11  Torsional parameter file        : ../../PARAM/torsion_cryst.parm
12  Double torsional parameter file : ../../PARAM/torsion_double_631Gdp.parm
13  Bending parameter file          : ../../PARAM/thetaml.5parm
14  Rotamer parameter file          : ../../PARAM/scgauss.parm
15  Threading database              : ../../PARAM/patterns.cart
16 --------------------------------------------------------------------------------
17  ### LAST MODIFIED  7/31/03 10:23PM by czarek
18  ++++ Compile info ++++
19  Version 2.0 build 1565
20  compiled Thu Aug 28 00:17:08 2003
21  compiled by czarek@scheraga2
22  OS name:    Linux 
23  OS release: 2.4.20-18.7smp 
24  OS version: #1 SMP Thu May 29 07:49:23 EDT 2003 
25  flags:
26  INSTALL_DIR = /usr/local/mpich-1.2.0
27  FC= /usr/local/opt/intel/compiler60/ia32/bin/ifc
28  OPT =  -O3 -ip -w -pc64 -tpp6
29  FFLAGS = -c ${OPT} -I$(INSTALL_DIR)/include 
30  FFLAGS1 = -c -tpp6 -w -g -d2 -CA -CB -I$(INSTAL...
31  FFLAGS2 = -c -tpp6 -w -O0 -I$(INSTALL_DIR)/incl...
32  FFLAGSE = -c -tpp6 -w -O3 -ipo -ipo_obj -pc64 -...
33  BIN = ${HOME}/UNRES/NEW/bin/unres_ifc6_cryst_to...
34  LIBS = -L$(INSTALL_DIR)/lib_pgi -lmpich -lpmpic...
35  CPPFLAGS = -DLINUX -DUNRES -DMP -DMPI -DPGI -DC...
36  ARCH = LINUX
37  PP = /lib/cpp -P
38  objectCSA = unres_CSA.o arcos.o cartprint.o cha...
39  ++++ End of compile info ++++
40
41 Potential is LJ , exponents are   6 12
42 Random seed:           -3059743.            -3059743
43  MPI: node=            0  iseed(4)=            0           0         -46
44       -45086
45  ran_num  0.273769376355290     
46 RMSDBC =        3.0
47 RMSDBC1 =        0.5
48 RMSDBC1MAX =        1.5
49 DRMS    =        0.1
50 RMSDBCM =        3.0
51 Time limit (min):      60.0
52
53 ********************************************************************************
54                     Options in energy minimization:
55 ********************************************************************************
56 MaxMin: 2000 MaxFun: 5000 TolF:   1.00000E-02 RTolF:   1.00000E-04
57  Compiled with -DMOMENT
58 Weights of energy terms:
59  Wsc:    1.000 Wscp:   1.000 Welec:    1.500 Wel_loc   0.000 Wstrain:    1.000
60
61  Wtor:    0.086 Wtor_d:    0.000 Wang:    0.104 Wscloc:    0.104 Wcorr:    1.500
62
63  Wcorr5:    0.000 Wcorr6:    0.000 Wturn3:    0.000 Wturn4:    0.000 Wturn6:    0.000
64
65
66 Hydrogen-bonding correlation between contact pairs of peptide groups
67
68 Scaling factor of 1,4 SC-p interactions:   0.400
69 General scaling factor of SC-p interactions:   1.000
70  ns=           0  iss:
71 Boundaries in phi angle sampling:
72 D      1    -180.0     180.0
73 GLN    2    -180.0     180.0
74 GLN    3    -180.0     180.0
75 ASN    4    -180.0     180.0
76 ALA    5    -180.0     180.0
77 PHE    6    -180.0     180.0
78 TYR    7    -180.0     180.0
79 GLU    8    -180.0     180.0
80 ILE    9    -180.0     180.0
81 LEU   10    -180.0     180.0
82 HIS   11    -180.0     180.0
83 LEU   12    -180.0     180.0
84 PRO   13    -180.0     180.0
85 ASN   14    -180.0     180.0
86 LEU   15    -180.0     180.0
87 ASN   16    -180.0     180.0
88 GLU   17    -180.0     180.0
89 GLU   18    -180.0     180.0
90 GLN   19    -180.0     180.0
91 ARG   20    -180.0     180.0
92 ASN   21    -180.0     180.0
93 GLY   22    -180.0     180.0
94 PHE   23    -180.0     180.0
95 ILE   24    -180.0     180.0
96 GLN   25    -180.0     180.0
97 SER   26    -180.0     180.0
98 LEU   27    -180.0     180.0
99 LYS   28    -180.0     180.0
100 ASP   29    -180.0     180.0
101 ASP   30    -180.0     180.0
102 PRO   31    -180.0     180.0
103 SER   32    -180.0     180.0
104 GLN   33    -180.0     180.0
105 SER   34    -180.0     180.0
106 ALA   35    -180.0     180.0
107 ASN   36    -180.0     180.0
108 LEU   37    -180.0     180.0
109 LEU   38    -180.0     180.0
110 ALA   39    -180.0     180.0
111 GLU   40    -180.0     180.0
112 ALA   41    -180.0     180.0
113 LYS   42    -180.0     180.0
114 LYS   43    -180.0     180.0
115 LEU   44    -180.0     180.0
116 ASN   45    -180.0     180.0
117 ASP   46    -180.0     180.0
118 ALA   47    -180.0     180.0
119 D     48    -180.0     180.0
120  NZ_START=           2  NZ_END=          47
121  IZ_SC=           0
122 Initial geometry will be read in.
123
124 Geometry of the virtual chain.
125   Res       Theta       Phi       Dsc     Alpha      Omega
126 D     1     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
127 GLN   2     0.000     0.000     2.240   125.231   -56.771
128 GLN   3    92.422     0.000     2.240   164.979  -160.455
129 ASN   4    94.654   102.663     1.684   107.681   -80.278
130 ALA   5    95.394    51.388     0.743   127.497   -73.910
131 PHE   6    92.468    38.789     2.299   124.280   -26.855
132 TYR   7    91.990    45.538     2.484   151.426     6.754
133 GLU   8    90.142    45.167     2.254   115.358   -61.732
134 ILE   9    88.963    46.966     1.776   133.666  -101.682
135 LEU  10    89.861    49.456     1.939   138.585   140.128
136 HIS  11    89.504    43.668     2.113    77.934  -100.285
137 LEU  12    85.177    57.088     1.939   123.131   -73.525
138 PRO  13    90.529    63.162     1.345   104.010  -119.457
139 ASN  14    90.662   149.401     1.684    98.795   -83.729
140 LEU  15    94.694    77.978     1.939   139.791   -40.442
141 ASN  16    93.996    90.459     1.684   152.520   -41.910
142 GLU  17    98.265   -57.812     2.254   124.364   118.805
143 GLU  18    92.330  -145.431     2.254   139.187   -83.184
144 GLN  19    91.230    56.267     2.240   120.042   -64.764
145 ARG  20    91.899    46.999     3.020   176.515  -160.347
146 ASN  21    93.766    39.835     1.684   142.631  -151.412
147 GLY  22    93.274    49.797     0.000     0.000     0.000
148 PHE  23    95.600    40.322     2.299   108.184   -87.589
149 ILE  24    94.753    36.892     1.776   166.279   169.892
150 GLN  25    90.828    43.222     2.240   101.254  -148.477
151 SER  26    87.701    53.948     1.150   104.111   -73.573
152 LEU  27    86.635    53.141     1.939   112.394   -13.366
153 LYS  28    90.453    52.544     2.541   143.243  -110.289
154 ASP  29    90.879    49.231     1.709   142.251  -129.944
155 ASP  30    92.500    45.147     1.709   110.789   -86.556
156 PRO  31   100.221    39.526     1.345   100.904  -129.033
157 SER  32    92.959   170.411     1.150   113.336   -78.525
158 GLN  33    93.251    62.808     2.240    91.410   -27.146
159 SER  34    92.622    52.159     1.150   113.336   -72.440
160 ALA  35    94.520   122.246     0.743   129.021   -76.111
161 ASN  36    93.727    54.700     1.684   111.754   -82.144
162 LEU  37    94.349    44.368     1.939   152.707   -19.960
163 LEU  38    92.040    36.912     1.939   158.815  -159.616
164 ALA  39    88.121    51.756     0.743   128.136   -76.578
165 GLU  40    89.569    51.315     2.254   122.143   -39.455
166 ALA  41    89.934    41.701     0.743   130.413   -77.100
167 LYS  42    89.729    47.796     2.541   141.127  -141.273
168 LYS  43    90.353    49.131     2.541   127.689   -40.557
169 LEU  44    89.474    45.910     1.939   139.347   -92.346
170 ASN  45    89.339    45.653     1.684   121.886  -134.151
171 ASP  46    87.863    63.931     1.709   101.980   -80.736
172 ALA  47    92.081    49.298     0.743   128.593   -76.946
173 D    48    92.568    98.934     0.000     0.000     0.000
174 Energy evaluation or minimization calculation.
175
176 Conformations will be energy-minimized.
177 ********************************************************************************
178
179
180 Virtual-chain energies:
181
182 EVDW=     -1.157927E+02 WEIGHT=    1.000000D+00 (SC-SC)
183 EVDW2=     1.766157E+02 WEIGHT=    1.000000D+00 (SC-p)
184 EES=      -9.045967E+01 WEIGHT=    1.500000D+00 (p-p)
185 EBE=      -1.027936E+02 WEIGHT=    1.038400D-01 (bending)
186 ESC=       7.971537E+01 WEIGHT=    1.038400D-01 (SC local)
187 ETORS=     4.774222E+01 WEIGHT=    8.617000D-02 (torsional)
188 ETORSD=    8.346316-270 WEIGHT=    0.000000D+00 (double torsional)
189 EHBP=      0.000000E+00 WEIGHT=    1.000000D+00 (SS bridges & dist. cnstr.)
190 ECORR4=   -4.781431E+01 WEIGHT=    1.500000D+00 (multi-body)
191 ECORR5=    0.000000E+00 WEIGHT=    0.000000D+00 (multi-body)
192 ECORR6=    0.000000E+00 WEIGHT=    0.000000D+00 (multi-body)
193 EELLO=     0.000000E+00 WEIGHT=    0.000000D+00 (electrostatic-local)
194 ETURN3=    0.000000E+00 WEIGHT=    0.000000D+00 (turns, 3rd order)
195 ETURN4=    0.000000E+00 WEIGHT=    0.000000D+00 (turns, 4th order)
196 ETURN6=    0.000000E+00 WEIGHT=    0.000000D+00 (turns, 6th order)
197 EDIHC=     0.000000E+00 (dihedral angle constraints)
198 ESS=       0.000000E+00 (disulfide-bridge intrinsic energy)
199 ETOT=     -1.448705E+02 (total)
200 PP contact map:
201   1  GLN   2  ASN   4
202   2  GLN   2  ALA   5
203   3  GLN   2  PHE   6
204   4  GLN   3  ALA   5
205   5  GLN   3  PHE   6
206   6  GLN   3  TYR   7
207   7  ASN   4  PHE   6
208   8  ASN   4  TYR   7
209   9  ASN   4  GLU   8
210  10  ALA   5  TYR   7
211  11  ALA   5  GLU   8
212  12  ALA   5  ILE   9
213  13  PHE   6  GLU   8
214  14  PHE   6  ILE   9
215  15  PHE   6  LEU  10
216  16  TYR   7  ILE   9
217  17  TYR   7  LEU  10
218  18  TYR   7  HIS  11
219  19  GLU   8  LEU  10
220  20  GLU   8  HIS  11
221  21  ILE   9  HIS  11
222  22  ILE   9  LEU  12
223  23  LEU  10  LEU  12
224  24  HIS  11  PRO  13
225  25  LEU  12  ASN  14
226  26  PRO  13  LEU  15
227  27  PRO  13  ASN  16
228  28  ASN  14  ASN  16
229  29  LEU  15  GLU  17
230  30  ASN  16  GLU  18
231  31  ASN  16  GLN  19
232  32  ASN  16  ARG  20
233  33  GLU  17  GLN  19
234  34  GLU  17  ARG  20
235  35  GLU  17  ASN  21
236  36  GLU  18  ARG  20
237  37  GLU  18  ASN  21
238  38  GLU  18  GLY  22
239  39  GLN  19  ASN  21
240  40  GLN  19  GLY  22
241  41  GLN  19  PHE  23
242  42  ARG  20  GLY  22
243  43  ARG  20  PHE  23
244  44  ARG  20  ILE  24
245  45  ASN  21  PHE  23
246  46  ASN  21  ILE  24
247  47  ASN  21  GLN  25
248  48  GLY  22  ILE  24
249  49  GLY  22  GLN  25
250  50  PHE  23  GLN  25
251  51  PHE  23  SER  26
252  52  ILE  24  SER  26
253  53  ILE  24  LEU  27
254  54  GLN  25  LEU  27
255  55  GLN  25  LYS  28
256  56  GLN  25  ASP  29
257  57  SER  26  LYS  28
258  58  SER  26  ASP  29
259  59  SER  26  ASP  30
260  60  LEU  27  ASP  29
261  61  LEU  27  ASP  30
262  62  LYS  28  ASP  30
263  63  ASP  29  PRO  31
264  64  ASP  30  SER  32
265  65  ASP  30  GLN  33
266  66  PRO  31  GLN  33
267  67  SER  32  SER  34
268  68  GLN  33  ALA  35
269  69  GLN  33  ASN  36
270  70  GLN  33  LEU  37
271  71  SER  34  ASN  36
272  72  SER  34  LEU  37
273  73  SER  34  LEU  38
274  74  ALA  35  LEU  37
275  75  ALA  35  LEU  38
276  76  ALA  35  ALA  39
277  77  ASN  36  LEU  38
278  78  ASN  36  ALA  39
279  79  ASN  36  GLU  40
280  80  LEU  37  ALA  39
281  81  LEU  37  GLU  40
282  82  LEU  37  ALA  41
283  83  LEU  38  GLU  40
284  84  LEU  38  ALA  41
285  85  LEU  38  LYS  42
286  86  ALA  39  ALA  41
287  87  ALA  39  LYS  42
288  88  ALA  39  LYS  43
289  89  GLU  40  LYS  42
290  90  GLU  40  LYS  43
291  91  GLU  40  LEU  44
292  92  ALA  41  LYS  43
293  93  ALA  41  LEU  44
294  94  ALA  41  ASN  45
295  95  LYS  42  LEU  44
296  96  LYS  42  ASN  45
297  97  LYS  43  ASN  45
298  98  LYS  43  ASP  46
299  99  LEU  44  ASP  46
300  Hairpins:
301 Constants of electrostatic interaction energy expression.
302  1 1     0.2149E+08    -0.5117E+04    -0.1306E+04     0.3727E+01
303  1 2     0.2794E+08    -0.6386E+04    -0.1129E+04     0.0000E+00
304  2 1     0.2794E+08    -0.6386E+04    -0.1129E+04     0.0000E+00
305  2 2     0.3800E+08    -0.9344E+04    -0.3348E+03     0.5127E+01
306  Total average electrostatic energy:   -64.9618055120381     
307  VDW energy between peptide-group centers:   -24.8371766312840     
308  
309  Electrostatic contacts before pruning: 
310   1  GLN   2  ASN   4  -0.75434
311   2  GLN   2  ALA   5  -0.41619
312   3  GLN   3  ALA   5  -1.05001
313   4  GLN   3  PHE   6  -0.62191
314   5  ASN   4  PHE   6  -1.07721
315   6  ASN   4  TYR   7  -0.59006
316   7  ALA   5  TYR   7  -1.20272
317   8  ALA   5  GLU   8  -0.66528
318   9  PHE   6  GLU   8  -1.32722
319  10  PHE   6  ILE   9  -0.62797
320  11  TYR   7  ILE   9  -1.27300
321  12  TYR   7  LEU  10  -0.69963
322  13  GLU   8  LEU  10  -1.40591
323  14  GLU   8  HIS  11  -0.57877
324  15  ILE   9  HIS  11  -1.27642
325  16  LEU  10  LEU  12  -1.04739
326  17  ASN  14  ASN  16  -0.60288
327  18  ASN  16  GLU  18  -0.88976
328  19  ASN  16  GLN  19  -0.37270
329  20  GLU  17  GLN  19  -1.10865
330  21  GLU  17  ARG  20  -0.63496
331  22  GLU  18  ARG  20  -1.13752
332  23  GLU  18  ASN  21  -0.50166
333  24  GLN  19  ASN  21  -0.88384
334  25  GLN  19  GLY  22  -0.45484
335  26  ARG  20  GLY  22  -0.97813
336  27  ARG  20  PHE  23  -0.61459
337  28  ASN  21  PHE  23  -0.97162
338  29  ASN  21  ILE  24  -0.62063
339  30  GLY  22  ILE  24  -1.07083
340  31  GLY  22  GLN  25  -0.49733
341  32  PHE  23  GLN  25  -1.16334
342  33  PHE  23  SER  26  -0.47582
343  34  ILE  24  SER  26  -1.42993
344  35  ILE  24  LEU  27  -0.52661
345  36  GLN  25  LEU  27  -1.28012
346  37  GLN  25  LYS  28  -0.49618
347  38  SER  26  LYS  28  -1.14474
348  39  SER  26  ASP  29  -0.55034
349  40  LEU  27  ASP  29  -1.13839
350  41  LEU  27  ASP  30  -0.54742
351  42  LYS  28  ASP  30  -0.83477
352  43  ASP  30  SER  32  -0.68660
353  44  PRO  31  GLN  33  -0.73398
354  45  GLN  33  ALA  35  -0.75816
355  46  GLN  33  ASN  36  -0.32831
356  47  SER  34  ASN  36  -0.94114
357  48  SER  34  LEU  37  -0.62853
358  49  ALA  35  LEU  37  -1.15856
359  50  ALA  35  LEU  38  -0.62005
360  51  ASN  36  LEU  38  -1.13809
361  52  ASN  36  ALA  39  -0.48835
362  53  LEU  37  ALA  39  -1.28397
363  54  LEU  37  GLU  40  -0.72137
364  55  LEU  38  GLU  40  -1.45364
365  56  LEU  38  ALA  41  -0.78048
366  57  ALA  39  ALA  41  -1.27167
367  58  ALA  39  LYS  42  -0.58135
368  59  GLU  40  LYS  42  -1.21240
369  60  GLU  40  LYS  43  -0.61754
370  61  ALA  41  LYS  43  -1.31396
371  62  ALA  41  LEU  44  -0.73876
372  63  LYS  42  LEU  44  -1.38340
373  64  LYS  42  ASN  45  -0.38838
374  65  LYS  43  ASN  45  -0.96647
375  66  LYS  43  ASP  46  -0.32962
376  67  LEU  44  ASP  46  -1.21303
377  
378  Electrostatic contacts after pruning: 
379   1  GLN   2  ASN   4  -0.75434
380   2  GLN   2  ALA   5  -0.41619
381   3  GLN   3  ALA   5  -1.05001
382   4  GLN   3  PHE   6  -0.62191
383   5  ASN   4  PHE   6  -1.07721
384   6  ASN   4  TYR   7  -0.59006
385   7  ALA   5  TYR   7  -1.20272
386   8  ALA   5  GLU   8  -0.66528
387   9  PHE   6  GLU   8  -1.32722
388  10  PHE   6  ILE   9  -0.62797
389  11  TYR   7  ILE   9  -1.27300
390  12  TYR   7  LEU  10  -0.69963
391  13  GLU   8  LEU  10  -1.40591
392  14  GLU   8  HIS  11  -0.57877
393  15  ILE   9  HIS  11  -1.27642
394  16  LEU  10  LEU  12  -1.04739
395  17  ASN  14  ASN  16  -0.60288
396  18  ASN  16  GLU  18  -0.88976
397  19  ASN  16  GLN  19  -0.37270
398  20  GLU  17  GLN  19  -1.10865
399  21  GLU  17  ARG  20  -0.63496
400  22  GLU  18  ARG  20  -1.13752
401  23  GLU  18  ASN  21  -0.50166
402  24  GLN  19  ASN  21  -0.88384
403  25  GLN  19  GLY  22  -0.45484
404  26  ARG  20  GLY  22  -0.97813
405  27  ARG  20  PHE  23  -0.61459
406  28  ASN  21  PHE  23  -0.97162
407  29  ASN  21  ILE  24  -0.62063
408  30  GLY  22  ILE  24  -1.07083
409  31  GLY  22  GLN  25  -0.49733
410  32  PHE  23  GLN  25  -1.16334
411  33  PHE  23  SER  26  -0.47582
412  34  ILE  24  SER  26  -1.42993
413  35  ILE  24  LEU  27  -0.52661
414  36  GLN  25  LEU  27  -1.28012
415  37  GLN  25  LYS  28  -0.49618
416  38  SER  26  LYS  28  -1.14474
417  39  SER  26  ASP  29  -0.55034
418  40  LEU  27  ASP  29  -1.13839
419  41  LEU  27  ASP  30  -0.54742
420  42  LYS  28  ASP  30  -0.83477
421  43  ASP  30  SER  32  -0.68660
422  44  PRO  31  GLN  33  -0.73398
423  45  GLN  33  ALA  35  -0.75816
424  46  GLN  33  ASN  36  -0.32831
425  47  SER  34  ASN  36  -0.94114
426  48  SER  34  LEU  37  -0.62853
427  49  ALA  35  LEU  37  -1.15856
428  50  ALA  35  LEU  38  -0.62005
429  51  ASN  36  LEU  38  -1.13809
430  52  ASN  36  ALA  39  -0.48835
431  53  LEU  37  ALA  39  -1.28397
432  54  LEU  37  GLU  40  -0.72137
433  55  LEU  38  GLU  40  -1.45364
434  56  LEU  38  ALA  41  -0.78048
435  57  ALA  39  ALA  41  -1.27167
436  58  ALA  39  LYS  42  -0.58135
437  59  GLU  40  LYS  42  -1.21240
438  60  GLU  40  LYS  43  -0.61754
439  61  ALA  41  LYS  43  -1.31396
440  62  ALA  41  LEU  44  -0.73876
441  63  LYS  42  LEU  44  -1.38340
442  64  LYS  42  ASN  45  -0.38838
443  65  LYS  43  ASN  45  -0.96647
444  66  LYS  43  ASP  46  -0.32962
445  67  LEU  44  ASP  46  -1.21303
446 Helix  1   1  12
447 Helix  2  16  30
448 Helix  3  33  46
449  UNRES seq:
450  helix            2          13
451  helix           17          31
452  helix           34          47
453  #OVERLAPing residues            0
454
455  #OVERLAPing all corrected after            1  random generation
456 PP contact map:
457   1  GLN   2  ASN   4
458   2  GLN   2  ALA   5
459   3  GLN   2  PHE   6
460   4  GLN   3  ALA   5
461   5  GLN   3  PHE   6
462   6  GLN   3  TYR   7
463   7  ASN   4  PHE   6
464   8  ASN   4  TYR   7
465   9  ASN   4  GLU   8
466  10  ALA   5  TYR   7
467  11  ALA   5  GLU   8
468  12  ALA   5  ILE   9
469  13  PHE   6  GLU   8
470  14  PHE   6  ILE   9
471  15  PHE   6  LEU  10
472  16  TYR   7  ILE   9
473  17  TYR   7  LEU  10
474  18  TYR   7  HIS  11
475  19  GLU   8  LEU  10
476  20  GLU   8  HIS  11
477  21  ILE   9  HIS  11
478  22  ILE   9  LEU  12
479  23  LEU  10  LEU  12
480  24  HIS  11  PRO  13
481  25  LEU  12  ASN  14
482  26  PRO  13  LEU  15
483  27  PRO  13  ASN  16
484  28  ASN  14  ASN  16
485  29  LEU  15  GLU  17
486  30  LEU  15  GLN  19
487  31  ASN  16  GLU  18
488  32  ASN  16  GLN  19
489  33  ASN  16  ARG  20
490  34  GLU  17  GLN  19
491  35  GLU  17  ARG  20
492  36  GLU  17  ASN  21
493  37  GLU  18  ARG  20
494  38  GLU  18  ASN  21
495  39  GLU  18  GLY  22
496  40  GLN  19  ASN  21
497  41  GLN  19  GLY  22
498  42  GLN  19  PHE  23
499  43  ARG  20  GLY  22
500  44  ARG  20  PHE  23
501  45  ARG  20  ILE  24
502  46  ASN  21  PHE  23
503  47  ASN  21  ILE  24
504  48  ASN  21  GLN  25
505  49  GLY  22  ILE  24
506  50  GLY  22  GLN  25
507  51  PHE  23  GLN  25
508  52  PHE  23  SER  26
509  53  ILE  24  SER  26
510  54  ILE  24  LEU  27
511  55  GLN  25  LEU  27
512  56  GLN  25  LYS  28
513  57  GLN  25  ASP  29
514  58  SER  26  LYS  28
515  59  SER  26  ASP  29
516  60  SER  26  ASP  30
517  61  LEU  27  ASP  29
518  62  LEU  27  ASP  30
519  63  LYS  28  ASP  30
520  64  ASP  29  PRO  31
521  65  ASP  30  SER  32
522  66  ASP  30  GLN  33
523  67  PRO  31  GLN  33
524  68  SER  32  SER  34
525  69  GLN  33  ALA  35
526  70  GLN  33  ASN  36
527  71  GLN  33  LEU  37
528  72  SER  34  ASN  36
529  73  SER  34  LEU  37
530  74  SER  34  LEU  38
531  75  ALA  35  LEU  37
532  76  ALA  35  LEU  38
533  77  ALA  35  ALA  39
534  78  ASN  36  LEU  38
535  79  ASN  36  ALA  39
536  80  ASN  36  GLU  40
537  81  LEU  37  ALA  39
538  82  LEU  37  GLU  40
539  83  LEU  37  ALA  41
540  84  LEU  38  GLU  40
541  85  LEU  38  ALA  41
542  86  LEU  38  LYS  42
543  87  ALA  39  ALA  41
544  88  ALA  39  LYS  42
545  89  ALA  39  LYS  43
546  90  GLU  40  LYS  42
547  91  GLU  40  LYS  43
548  92  GLU  40  LEU  44
549  93  ALA  41  LYS  43
550  94  ALA  41  LEU  44
551  95  ALA  41  ASN  45
552  96  LYS  42  LEU  44
553  97  LYS  42  ASN  45
554  98  LYS  43  ASN  45
555  99  LYS  43  ASP  46
556 100  LEU  44  ASP  46
557  Hairpins:
558 Constants of electrostatic interaction energy expression.
559  1 1     0.2149E+08    -0.5117E+04    -0.1306E+04     0.3727E+01
560  1 2     0.2794E+08    -0.6386E+04    -0.1129E+04     0.0000E+00
561  2 1     0.2794E+08    -0.6386E+04    -0.1129E+04     0.0000E+00
562  2 2     0.3800E+08    -0.9344E+04    -0.3348E+03     0.5127E+01
563  Total average electrostatic energy:   -64.8656851290132     
564  VDW energy between peptide-group centers:   -24.8625713820566     
565  
566  Electrostatic contacts before pruning: 
567   1  GLN   2  ASN   4  -0.75197
568   2  GLN   2  ALA   5  -0.41743
569   3  GLN   3  ALA   5  -1.04923
570   4  GLN   3  PHE   6  -0.62025
571   5  ASN   4  PHE   6  -1.07342
572   6  ASN   4  TYR   7  -0.58701
573   7  ALA   5  TYR   7  -1.19974
574   8  ALA   5  GLU   8  -0.66642
575   9  PHE   6  GLU   8  -1.32504
576  10  PHE   6  ILE   9  -0.63349
577  11  TYR   7  ILE   9  -1.27323
578  12  TYR   7  LEU  10  -0.70076
579  13  GLU   8  LEU  10  -1.40330
580  14  GLU   8  HIS  11  -0.57926
581  15  ILE   9  HIS  11  -1.27809
582  16  LEU  10  LEU  12  -1.03834
583  17  ASN  14  ASN  16  -0.60943
584  18  ASN  16  GLU  18  -0.89197
585  19  ASN  16  GLN  19  -0.37608
586  20  GLU  17  GLN  19  -1.10408
587  21  GLU  17  ARG  20  -0.63117
588  22  GLU  18  ARG  20  -1.13210
589  23  GLU  18  ASN  21  -0.50550
590  24  GLN  19  ASN  21  -0.88338
591  25  GLN  19  GLY  22  -0.45289
592  26  ARG  20  GLY  22  -0.96113
593  27  ARG  20  PHE  23  -0.60484
594  28  ASN  21  PHE  23  -0.96816
595  29  ASN  21  ILE  24  -0.62155
596  30  GLY  22  ILE  24  -1.07266
597  31  GLY  22  GLN  25  -0.49941
598  32  PHE  23  GLN  25  -1.16459
599  33  PHE  23  SER  26  -0.47545
600  34  ILE  24  SER  26  -1.42670
601  35  ILE  24  LEU  27  -0.52559
602  36  GLN  25  LEU  27  -1.27872
603  37  GLN  25  LYS  28  -0.49450
604  38  SER  26  LYS  28  -1.14240
605  39  SER  26  ASP  29  -0.54775
606  40  LEU  27  ASP  29  -1.13685
607  41  LEU  27  ASP  30  -0.54667
608  42  LYS  28  ASP  30  -0.83112
609  43  ASP  30  SER  32  -0.68148
610  44  PRO  31  GLN  33  -0.73493
611  45  GLN  33  ALA  35  -0.75133
612  46  GLN  33  ASN  36  -0.32503
613  47  SER  34  ASN  36  -0.94378
614  48  SER  34  LEU  37  -0.62901
615  49  ALA  35  LEU  37  -1.15720
616  50  ALA  35  LEU  38  -0.61756
617  51  ASN  36  LEU  38  -1.13496
618  52  ASN  36  ALA  39  -0.48777
619  53  LEU  37  ALA  39  -1.28374
620  54  LEU  37  GLU  40  -0.72289
621  55  LEU  38  GLU  40  -1.45459
622  56  LEU  38  ALA  41  -0.78055
623  57  ALA  39  ALA  41  -1.26937
624  58  ALA  39  LYS  42  -0.57896
625  59  GLU  40  LYS  42  -1.21073
626  60  GLU  40  LYS  43  -0.61672
627  61  ALA  41  LYS  43  -1.31347
628  62  ALA  41  LEU  44  -0.73709
629  63  LYS  42  LEU  44  -1.38097
630  64  LYS  42  ASN  45  -0.38538
631  65  LYS  43  ASN  45  -0.96403
632  66  LYS  43  ASP  46  -0.32907
633  67  LEU  44  ASP  46  -1.21945
634  
635  Electrostatic contacts after pruning: 
636   1  GLN   2  ASN   4  -0.75197
637   2  GLN   2  ALA   5  -0.41743
638   3  GLN   3  ALA   5  -1.04923
639   4  GLN   3  PHE   6  -0.62025
640   5  ASN   4  PHE   6  -1.07342
641   6  ASN   4  TYR   7  -0.58701
642   7  ALA   5  TYR   7  -1.19974
643   8  ALA   5  GLU   8  -0.66642
644   9  PHE   6  GLU   8  -1.32504
645  10  PHE   6  ILE   9  -0.63349
646  11  TYR   7  ILE   9  -1.27323
647  12  TYR   7  LEU  10  -0.70076
648  13  GLU   8  LEU  10  -1.40330
649  14  GLU   8  HIS  11  -0.57926
650  15  ILE   9  HIS  11  -1.27809
651  16  LEU  10  LEU  12  -1.03834
652  17  ASN  14  ASN  16  -0.60943
653  18  ASN  16  GLU  18  -0.89197
654  19  ASN  16  GLN  19  -0.37608
655  20  GLU  17  GLN  19  -1.10408
656  21  GLU  17  ARG  20  -0.63117
657  22  GLU  18  ARG  20  -1.13210
658  23  GLU  18  ASN  21  -0.50550
659  24  GLN  19  ASN  21  -0.88338
660  25  GLN  19  GLY  22  -0.45289
661  26  ARG  20  GLY  22  -0.96113
662  27  ARG  20  PHE  23  -0.60484
663  28  ASN  21  PHE  23  -0.96816
664  29  ASN  21  ILE  24  -0.62155
665  30  GLY  22  ILE  24  -1.07266
666  31  GLY  22  GLN  25  -0.49941
667  32  PHE  23  GLN  25  -1.16459
668  33  PHE  23  SER  26  -0.47545
669  34  ILE  24  SER  26  -1.42670
670  35  ILE  24  LEU  27  -0.52559
671  36  GLN  25  LEU  27  -1.27872
672  37  GLN  25  LYS  28  -0.49450
673  38  SER  26  LYS  28  -1.14240
674  39  SER  26  ASP  29  -0.54775
675  40  LEU  27  ASP  29  -1.13685
676  41  LEU  27  ASP  30  -0.54667
677  42  LYS  28  ASP  30  -0.83112
678  43  ASP  30  SER  32  -0.68148
679  44  PRO  31  GLN  33  -0.73493
680  45  GLN  33  ALA  35  -0.75133
681  46  GLN  33  ASN  36  -0.32503
682  47  SER  34  ASN  36  -0.94378
683  48  SER  34  LEU  37  -0.62901
684  49  ALA  35  LEU  37  -1.15720
685  50  ALA  35  LEU  38  -0.61756
686  51  ASN  36  LEU  38  -1.13496
687  52  ASN  36  ALA  39  -0.48777
688  53  LEU  37  ALA  39  -1.28374
689  54  LEU  37  GLU  40  -0.72289
690  55  LEU  38  GLU  40  -1.45459
691  56  LEU  38  ALA  41  -0.78055
692  57  ALA  39  ALA  41  -1.26937
693  58  ALA  39  LYS  42  -0.57896
694  59  GLU  40  LYS  42  -1.21073
695  60  GLU  40  LYS  43  -0.61672
696  61  ALA  41  LYS  43  -1.31347
697  62  ALA  41  LEU  44  -0.73709
698  63  LYS  42  LEU  44  -1.38097
699  64  LYS  42  ASN  45  -0.38538
700  65  LYS  43  ASN  45  -0.96403
701  66  LYS  43  ASP  46  -0.32907
702  67  LEU  44  ASP  46  -1.21945
703 Helix  1   1  12
704 Helix  2  16  30
705 Helix  3  33  46
706  UNRES seq:
707  helix            2          13
708  helix           17          31
709  helix           34          47
710
711 Virtual-chain energies:
712
713 EVDW=     -1.158417E+02 WEIGHT=    1.000000D+00 (SC-SC)
714 EVDW2=     1.763858E+02 WEIGHT=    1.000000D+00 (SC-p)
715 EES=      -9.038752E+01 WEIGHT=    1.500000D+00 (p-p)
716 EBE=      -1.027600E+02 WEIGHT=    1.038400D-01 (bending)
717 ESC=       8.027690E+01 WEIGHT=    1.038400D-01 (SC local)
718 ETORS=     4.779044E+01 WEIGHT=    8.617000D-02 (torsional)
719 ETORSD=    0.000000E+00 WEIGHT=    0.000000D+00 (double torsional)
720 EHBP=      0.000000E+00 WEIGHT=    1.000000D+00 (SS bridges & dist. cnstr.)
721 ECORR4=   -4.775090E+01 WEIGHT=    1.500000D+00 (multi-body)
722 ECORR5=    0.000000E+00 WEIGHT=    0.000000D+00 (multi-body)
723 ECORR6=    0.000000E+00 WEIGHT=    0.000000D+00 (multi-body)
724 EELLO=     0.000000E+00 WEIGHT=    0.000000D+00 (electrostatic-local)
725 ETURN3=    0.000000E+00 WEIGHT=    0.000000D+00 (turns, 3rd order)
726 ETURN4=    0.000000E+00 WEIGHT=    0.000000D+00 (turns, 4th order)
727 ETURN6=    0.000000E+00 WEIGHT=    0.000000D+00 (turns, 6th order)
728 EDIHC=     0.000000E+00 (dihedral angle constraints)
729 ESS=       0.000000E+00 (disulfide-bridge intrinsic energy)
730 ETOT=     -1.448800E+02 (total)
731
732 Geometry of the virtual chain.
733   Res       Theta       Phi       Dsc     Alpha      Omega
734 D     1     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
735 GLN   2     0.000     0.000     2.240   125.446   -56.746
736 GLN   3    92.431     0.000     2.240   164.910  -164.540
737 ASN   4    94.823   102.783     1.684   107.602   -80.366
738 ALA   5    95.398    51.193     0.743   127.526   -73.856
739 PHE   6    92.510    38.718     2.299   124.552   -25.883
740 TYR   7    92.012    45.574     2.484   151.332     6.751
741 GLU   8    90.171    45.178     2.254   115.190   -62.041
742 ILE   9    89.065    46.770     1.776   133.717  -101.411
743 LEU  10    89.868    49.231     1.939   137.553   137.823
744 HIS  11    89.484    43.788     2.113    77.748  -100.252
745 LEU  12    85.258    56.931     1.939   123.146   -73.226
746 PRO  13    90.506    63.410     1.345   103.784  -118.766
747 ASN  14    90.727   149.520     1.684    98.815   -83.734
748 LEU  15    94.820    77.860     1.939   139.882   -40.385
749 ASN  16    94.018    91.134     1.684   152.384   -41.951
750 GLU  17    98.198   -57.388     2.254   124.350   118.797
751 GLU  18    92.363  -144.680     2.254   139.177   -83.169
752 GLN  19    91.321    55.929     2.240   120.354   -64.868
753 ARG  20    91.954    46.888     3.020   176.471   166.977
754 ASN  21    93.780    39.930     1.684   142.639  -151.086
755 GLY  22    93.559    49.204     0.000     0.000     0.000
756 PHE  23    95.676    40.426     2.299   108.421   -87.476
757 ILE  24    94.777    36.841     1.776   166.155   168.594
758 GLN  25    90.809    43.121     2.240   101.198  -148.726
759 SER  26    87.694    53.952     1.150   104.009   -73.516
760 LEU  27    86.691    53.143     1.939   112.493   -13.347
761 LYS  28    90.433    52.526     2.541   143.363  -110.018
762 ASP  29    90.905    49.314     1.709   142.396  -130.004
763 ASP  30    92.499    45.158     1.709   110.520   -86.595
764 PRO  31   100.366    39.404     1.345   100.942  -129.016
765 SER  32    92.986   170.339     1.150   113.463   -78.519
766 GLN  33    93.306    62.988     2.240    91.571   -27.744
767 SER  34    92.632    51.967     1.150   113.354   -72.543
768 ALA  35    94.624   122.303     0.743   129.111   -76.152
769 ASN  36    93.711    54.954     1.684   111.654   -82.071
770 LEU  37    94.291    44.391     1.939   152.832   -20.415
771 LEU  38    92.111    36.951     1.939   158.746  -159.670
772 ALA  39    88.117    51.746     0.743   128.147   -76.601
773 GLU  40    89.583    51.305     2.254   122.000   -39.687
774 ALA  41    89.936    41.633     0.743   130.407   -77.114
775 LYS  42    89.751    47.829     2.541   141.074  -141.488
776 LYS  43    90.340    49.175     2.541   127.706   -40.581
777 LEU  44    89.509    45.881     1.939   139.262   -92.831
778 ASN  45    89.320    45.701     1.684   122.054  -134.484
779 ASP  46    87.844    64.094     1.709   101.896   -80.552
780 ALA  47    91.998    49.266     0.743   128.516   -76.974
781 D    48    92.618    99.003     0.000     0.000     0.000
782 SUMSL return code:  4
783 # of energy evaluations:                 654
784 # of energy evaluations/sec:         185.279
785 Processor   0 is finishing work.
786  Total time   3.55270400000000       sec