examples/unres/CSA/BETA/CSA/unresbetanova.csh

   1 #!/bin/csh -f
   2 # Script to run the program unresCSA on linux with MPICH/PBS (parallel version).
   3 #
   4 # This example script pertains to the BETA force field (see section 4 of the
   5 # description).
   6
   7 # The GB potentials is used with the BETA force field; DO NOT change the line below.
   8 setenv POT GB
   9
  10 # The line below defines the system-specific input file; the example is for 1IGD.
  11 setenv PREFIX betanova_beta
  12
  13 # Define the location of UNRES parameter file and binaries directory.
  14 set DD = /users/adam/UNRES/PARAM
  15 set BIN = /users/czarek/UNRES/NEW/bin
  16 #---------------------------------
  17 setenv THETPAR $DD/thetaml.5parm
  18 setenv ROTPAR $DD/scgauss.parm
  19 setenv TORPAR $DD/torsion_ecepp.parm
  20 setenv TORDPAR $DD/torsion_double_631Gdp.parm
  21 setenv ELEPAR $DD/electr.parm
  22 setenv SIDEPAR $DD/scinter_GB.parm
  23 setenv FOURIER $DD/fourier_GAP.parm
  24 setenv SCPPAR $DD/scp.parm
  25
  26 # Pattern database
  27 setenv PATTERN $DD/patterns.cart
  28 #--------------------------------------------
  29
  30 endif
  31
  32 set DEBUG = 0
  33
  34 $BIN/unres_ifc6_moment.exe $*
  35
  36 if ("$3" != "-p4amslave") then
  37 # Remove links
  38 /bin/rm fort.*
  39 # Clear empty files
  40 find . -size 0 -exec rm {} \;
  41 endif
  42