examples/UNRES-Dock/unres_example.inp

   1 Multi MREMD
   2 SEED=-3059743 RE rescale_mode=2            PDBSTART timlim=4100.0              &
   3 CONSTR_HOMOL=24 pdbref refstr BOXX=boxxx BOXY=boxxx BOXZ=boxxx
   4 dt=0.2 ntwe=2500  ntwx=2500  lang=0 tbf tau_bath=1 t_bath=300 damax=20.0       &
   5 EDRIFTMAX=20.0 reset_moment=5000  reset_vel=5000 preminim cart nstep=NNN
   6 maxfun=100
   7 nrep=12 nstex=2500 tlist mlist traj1file rest1file sync nsyn=2500
   8 280 288 296 304 312 320 328 336 342 350 360 370
   9   2   2   2   2   2   2   2   2   2   2   2   2
  10 WSC=0.82686 WSCP=0.96947 WELEC=0.79373 WBOND=1.00000 WANG=0.46542              &
  11 WSCLOC=0.07969 WTOR=0.81684 WTORD=0.67806 WCORRH=0.00000 WCORR5=0.00000        &
  12 WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.71100 WTURN3=2.30298 WTURN4=0.86517 WTURN6=0.00000    &
  13 WSCCOR=0.14577 WVDWPP=0.17781 WHPB=1.00000 WSCP14=0.00000                      &
  14 CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
  15 ./reference.pdb
  16 0
  17 0
  18 HOMOL_DIST=0.10   HOMOL_ANGLE=1.0 HOMOL_THETA=1.0 HOMOL_SCD=1.0 DIST_CUT=15.0  &
  19 READ2SIGMA START_FROM_MODELS
  20 ./model01.pdb
  21 ./model02.pdb
  22 ./model03.pdb
  23 ./model04.pdb
  24 ./model05.pdb
  25 ./model06.pdb
  26 ./model07.pdb
  27 ./model08.pdb
  28 ./model09.pdb
  29 ./model10.pdb
  30 ./model11.pdb
  31 ./model12.pdb
  32 ./model13.pdb
  33 ./model14.pdb
  34 ./model15.pdb
  35 ./model16.pdb
  36 ./model17.pdb
  37 ./model18.pdb
  38 ./model19.pdb
  39 ./model20.pdb
  40 ./model21.pdb
  41 ./model22.pdb
  42 ./model23.pdb
  43 ./model24.pdb