examples/UNRES-Dock/output/log

   1  All files read
   2  Option           0 selected                                       (0 for protein, 1 for peptide)
   3  Molecule 1 read
   4  Molecule 2 read
   5  Molecule 1 calculated
   6  How many dummy atoms:           4
   7
   8  Molecule 2 calculated
   9  Number of atoms:        1818         654
  10  Min and max coordinates in the systems
  11    47.33  100.31   -4.32   44.63  -23.56   25.64
  12    79.41  105.90  -11.12   21.96  -22.74   12.22
  13  Distances in axes x, y, z
  14    52.98   48.95   49.20
  15    26.48   33.08   34.95
  16  Maximum distances:
  17    55.895991197938336        36.664730109466234
  18  Boxsize (suggested)
  19    131.07286998252462
  20  Center of masses:
  21     0.00    0.00   -0.00
  22    -0.00    0.00    0.00
  23  Center of masses atoms:
  24 ATOM   1034  N   LEU   146      -0.199   0.658   0.096
  25 ATOM   2245  C   MET    56       0.020  -0.761   1.198
  26  Number of amino-acid residues in two proteins:
  27          227          83
  28  Original number of the first residue in                           the first protein:
  29           18
  30  Correction of the first residue in the first protein:
  31           18
  32  Rotation space (+/-):   48.322865054733114        46.309365054733121        46.434365054733121
  33  Conformation will be saved to file:model01.pdb
  34  Initial minimum distance between centers of mass:   35.093571428571430
  35  Rotation vector: -0.47447285056114197       0.59865057468414307      -0.56966233253479004      -0.30327856540679932
  36  Conformation           1 Is accepted after           3          38           1           1         134 attempts. Dist between CoM of previous=   35.093571428571430
  37  Extr   35.676279974667352        20.021331361687377        14.686587910430235
  38  Conformation will be saved to file:model02.pdb
  39  Rotation vector:  0.32097816467285156       0.88429701328277588       8.10135528445243835E-003  0.33900773525238037
  40  Conformation           2 Is accepted after           3          27           1          22         127 attempts. Dist between CoM of previous=   35.034669145289797
  41  Extr   13.272340412197817        9.7466088135663238        31.235309102314613
  42  Conformation will be saved to file:model03.pdb
  43  Rotation vector:  0.69724404811859131      -0.25069552659988403       0.44936251640319824      -0.49907493591308594
  44  Conformation           3 Is accepted after           3           4           1           6          19 attempts. Dist between CoM of previous=   35.079538099333902
  45  Extr   15.477795575127661        33.581506070788421        14.001415149171772
  46  Conformation will be saved to file:model04.pdb
  47  Rotation vector: -0.74532145261764526       0.61607712507247925       5.79295009374618530E-002 -0.24817144870758057
  48  Conformation           4 Is accepted after           3          19           1          44          98 attempts. Dist between CoM of previous=   34.973068025991772
  49  Extr   6.7726833506000155        19.230242779130741        36.949886846658458
  50  Conformation will be saved to file:model05.pdb
  51  Rotation vector: -0.81096941232681274      -0.25304839015007019      -0.18417000770568848       0.49434453248977661
  52  Conformation           5 Is accepted after           3          29           1         183         327 attempts. Dist between CoM of previous=   34.586357222486903
  53  Extr   26.679984256670142        24.258055122052031        2.6683764792471418
  54  Conformation will be saved to file:model06.pdb
  55  Rotation vector:  0.94843769073486328      -9.95820611715316772E-002  2.38786898553371429E-002  0.29996538162231445
  56  Conformation           6 Is accepted after           3           1           1           7           9 attempts. Dist between CoM of previous=   35.076732106961309
  57  Extr   28.637989903388149        22.125991344717558        7.7036047112002191
  58  Conformation will be saved to file:model07.pdb
  59  Rotation vector:  0.27619513869285583      -0.82017630338668823      -0.45946681499481201      -0.19979345798492432
  60  Conformation           7 Is accepted after           3           1           1         165         209 attempts. Dist between CoM of previous=   34.636192860033027
  61  Extr   26.118516488578582        8.3476683004573520        18.523223249017516
  62  Conformation will be saved to file:model08.pdb
  63  Rotation vector:  0.62126344442367554      -0.48670083284378052      -0.61379468441009521       2.02509164810180664E-002
  64  Conformation           8 Is accepted after           3           2           1         381         449 attempts. Dist between CoM of previous=   34.042875119940177
  65  Extr   13.498752456736188        44.085395885058048        6.7888453814657748
  66  Conformation will be saved to file:model09.pdb
  67  Rotation vector:  0.40048557519912720      -0.62082046270370483      -0.50050693750381470      -0.45131587982177734
  68  Conformation           9 Is accepted after           3           3           1         488         578 attempts. Dist between CoM of previous=   33.752738387404506
  69  Extr   1.1886056284824957        27.659835396162730        25.571590683632760
  70  Conformation will be saved to file:model10.pdb
  71  Rotation vector:  0.62588703632354736       3.66273038089275360E-002  0.30391284823417664       0.71732896566390991
  72  Conformation          10 Is accepted after           3           7           1        1735        2092 attempts. Dist between CoM of previous=   30.548351961908818
  73  Extr   8.1756269434928903        21.162861697354238        28.282611943561250
  74  Conformation will be saved to file:model11.pdb
  75  Rotation vector: -0.25546601414680481      -0.47567224502563477      -0.20293374359607697      -0.81687879562377930
  76  Conformation          11 Is accepted after           3           3           1        1104        1250 attempts. Dist between CoM of previous=   32.129868801066898
  77  Extr   20.051314266375936        1.2213126957164753        34.623022878952774
  78  Conformation will be saved to file:model12.pdb
  79  Rotation vector:  0.28662410378456116       0.40606340765953064       0.80200725793838501       0.33127552270889282
  80  Conformation          12 Is accepted after           3          12           1        2786        3272 attempts. Dist between CoM of previous=   28.085080202463462
  81  Extr   30.786024059296849        19.717813913892808        7.5849477124093294
  82  Conformation will be saved to file:model13.pdb
  83  Rotation vector: -0.73789364099502563      -0.35934650897979736       0.50327926874160767      -0.27035725116729736
  84  Conformation          13 Is accepted after           3          21           1        3774        4463 attempts. Dist between CoM of previous=   25.950886234892700
  85  Extr   18.700883705185010        13.348982212141598        34.207867303784042
  86  Conformation will be saved to file:model14.pdb
  87  Rotation vector: -0.25208485126495361       0.21378462016582489      -0.21115475893020630      -0.91987121105194092
  88  Conformation          14 Is accepted after           3          24           1        3757        4356 attempts. Dist between CoM of previous=   25.986200195778672
  89  Extr   12.255905636228125        31.707846162067394        14.254095438442464
  90  Conformation will be saved to file:model15.pdb
  91  Rotation vector: -5.75632415711879730E-002 -0.75787240266799927      -0.31681057810783386       0.56740367412567139
  92  Conformation          15 Is accepted after           3           6           1        2649        2928 attempts. Dist between CoM of previous=   28.394557013731195
  93  Extr   45.370084241435436       0.49589605857570751       0.81164575567786734
  94  Conformation will be saved to file:model16.pdb
  95  Rotation vector:  0.48737671971321106      -0.37335842847824097       0.73547238111495972      -0.28661417961120605
  96  Conformation          16 Is accepted after           3          40           1        4332        5055 attempts. Dist between CoM of previous=   24.818016759883662
  97  Extr   42.339397960746673        4.1324082693947419        10.465596004944084
  98  Conformation will be saved to file:model17.pdb
  99  Rotation vector: -0.69653552770614624       0.27639216184616089       9.88664999604225159E-002 -0.65472972393035889
 100  Conformation          17 Is accepted after           3          33           1        3897        4441 attempts. Dist between CoM of previous=   25.696805044817619
 101  Extr   9.3555226439440666        4.3833042491577148        38.456558389245458
 102  Conformation will be saved to file:model18.pdb
 103  Rotation vector: -0.19951096177101135       5.26577839627861977E-003  0.63188093900680542      -0.74892866611480713
 104  Conformation          18 Is accepted after           3          54           1        5057        6002 attempts. Dist between CoM of previous=   23.419645303253350
 105  Extr   34.932917571975182        5.0245000390166465        21.720718276521037
 106  Conformation will be saved to file:model19.pdb
 107  Rotation vector:  0.48514991998672485      -0.87134373188018799       3.25093567371368408E-002 -6.58243894577026367E-002
 108  Conformation          19 Is accepted after           3          47           1        4747        5500 attempts. Dist between CoM of previous=   24.007659592764732
 109  Extr   25.030697170172534        7.4349960825746377        17.270006952774853
 110  Conformation will be saved to file:model20.pdb
 111  Rotation vector:  0.52858650684356689      -0.51273655891418457      -0.64514464139938354      -0.20368075370788574
 112  Conformation          20 Is accepted after           3         127           1        6141        7503 attempts. Dist between CoM of previous=   21.474435889115657
 113  Extr   5.6789422028181598        38.105781974127297        15.028056138710346
 114  Conformation will be saved to file:model21.pdb
 115  Rotation vector: -5.21010532975196838E-002  0.53795766830444336      -0.34546294808387756      -0.76716518402099609
 116  Conformation          21 Is accepted after           3          70           1        5609        6659 attempts. Dist between CoM of previous=   22.408027827572514
 117  Extr   6.5117311417258215        37.909539008790780        21.111911999462944
 118  Conformation will be saved to file:model22.pdb
 119  Rotation vector:  0.25637090206146240      -0.52398252487182617      -0.52135384082794189       0.62282133102416992
 120  Conformation          22 Is accepted after           3         181           1        7203        9124 attempts. Dist between CoM of previous=   19.725476496610721
 121  Extr   18.487006583527620        4.4942001838848240        43.292002687612012
 122  Conformation will be saved to file:model23.pdb
 123  Rotation vector:  0.34616225957870483       0.73187118768692017      -2.93888598680496216E-002  0.58623594045639038
 124  Conformation          23 Is accepted after           3         196           1        7474        9512 attempts. Dist between CoM of previous=   19.302469092670634
 125  Extr  0.34724501436942345        36.090002145871495        4.9041940616144881
 126  Conformation will be saved to file:model24.pdb
 127  Rotation vector: -0.52204686403274536       0.10627520084381104       0.48067766427993774      -0.69650673866271973
 128  Conformation          24 Is accepted after           3         180           1        7453        9448 attempts. Dist between CoM of previous=   19.334921504246616
 129  Extr   12.005506726397147        19.097971443205733        36.830676307100674