ctest/dfa_newcorr/remd_dfa.inp

   1 T0580 small REMD simulation
   2 SEED=-3059743 RE rescale_mode=2 one_letter PDBSTART timlim=2800.0              &
   3 CONSTR_HOMOL=8 PDBREF REFSTR tormode=2
   4 nstep=10000     dt=0.10 ntwe=100 ntwx=100  lang=0 tbf tau_bath=1 t_bath=300    &
   5 damax=20.0 EDRIFTMAX=20.0 reset_moment=100 reset_vel=100  PRINT_COMPON         &
   6 preminim cart read_minim_par
   7 maxfun=100
   8 nrep=8 nstex=100 tlist mlist traj1file rest1file sync nsyn=100
   9  240 260 280 300 320 340 360 390
  10    1   1   1   1   1   1   1   1
  11 WSC=0.81230 WSCP=1.20420 WELEC=0.87690 WBOND=1.00000 WANG=1.97730              &
  12 WSCLOC=0.063657 WTOR=1.41540 WTORD=0.00000 WCORRH=0.00000 WCORR5=0.00000       &
  13 WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.036638 WTURN3=1.45110 WTURN4=0.00000 WTURN6=0.00000   &
  14 WSCCOR=0.00000 WVDWPP=0.33393 WHPB=1.00000 WSCP14=0.00000                      &
  15 WDFAD=1.5 WDFAT=0.75 WDFAN=1.4 WDFAB=1.0                                       &
  16 CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
  17 ./model01.pdb
  18 0
  19 0
  20 HOMOL_DIST=0.50 HOMOL_ANGLE=1.0 HOMOL_THETA=1.0 HOMOL_SCD=1.0 DIST_CUT=15.0    &
  21 READ2SIGMA START_FROM_MODELS
  22 model01.pdb
  23 model02.pdb
  24 model03.pdb
  25 model04.pdb
  26 model05.pdb
  27 model06.pdb
  28 model07.pdb
  29 model08.pdb