added source code v.3.0
[unres.git] / source / unres / src_MD / src /
drwxr-xr-x   ..
-rw-r--r-- 1470 COMMON.BANK
-rw-r--r-- 73 COMMON.BOUNDS
-rw-r--r-- 258 COMMON.CACHE
-rw-r--r-- 920 COMMON.CALC
-rw-r--r-- 609 COMMON.CHAIN
-rw-r--r-- 4565 COMMON.CONTACTS
-rw-r--r-- 3745 COMMON.CONTACTS.moment
-rw-r--r-- 800 COMMON.CONTROL
-rw-r--r-- 475 COMMON.CSA
-rw-r--r-- 133 COMMON.DBASE
-rw-r--r-- 2072 COMMON.DERIV
-rw-r--r-- 2000 COMMON.DERIV~
-rw-r--r-- 688 COMMON.DISTFIT
-rw-r--r-- 1301 COMMON.FFIELD
-rw-r--r-- 1296 COMMON.FFIELD~
-rw-r--r-- 140 COMMON.GEO
-rw-r--r-- 228 COMMON.HAIRPIN
-rw-r--r-- 53 COMMON.HEADER
-rw-r--r-- 1021 COMMON.INFO
-rw-r--r-- 1884 COMMON.INTERACT
-rw-r--r-- 1615 COMMON.INTERACT~
-rw-r--r-- 3772 COMMON.IOUNITS
-rw-r--r-- 1111 COMMON.LANGEVIN
-rw-r--r-- 538 COMMON.LANGEVIN.lang0
-rw-r--r-- 538 COMMON.LANGEVIN.lang0_
-rw-r--r-- 3005 COMMON.LOCAL
-rw-r--r-- 657 COMMON.LOCMOVE
-rw-r--r-- 193 COMMON.MAP
-rw-r--r-- 643 COMMON.MAXGRAD
-rw-r--r-- 594 COMMON.MCE
-rw-r--r-- 4121 COMMON.MCM
-rw-r--r-- 3884 COMMON.MD
-rw-r--r-- 3896 COMMON.MD~
-rw-r--r-- 160 COMMON.MINIM
-rw-r--r-- 432 COMMON.MUCA
-rw-r--r-- 258 COMMON.NAMES
-rw-r--r-- 135 COMMON.REFSYS
-rw-r--r-- 1867 COMMON.REMD
-rw-r--r-- 1821 COMMON.REMD~
-rw-r--r-- 483 COMMON.SBRIDGE
-rw-r--r-- 209 COMMON.SCCOR
-rw-r--r-- 121 COMMON.SCROT
-rw-r--r-- 1068 COMMON.SETUP
-rw-r--r-- 71 COMMON.SPLITELE
-rw-r--r-- 327 COMMON.THREAD
-rw-r--r-- 1534 COMMON.TIME1
-rw-r--r-- 358 COMMON.TORCNSTR
-rw-r--r-- 1241 COMMON.TORSION
-rw-r--r-- 1114 COMMON.VAR
-rw-r--r-- 109 COMMON.VECTORS
-rw-r--r-- 5357 DIMENSIONS
-rw-r--r-- 3392 DIMENSIONS.2100
-rw-r--r-- 3392 DIMENSIONS.4100
-rw-r--r-- 5379 DIMENSIONS~
-rw-r--r-- 99902 MD_A-MTS.F
-rw-r--r-- 20129 MP.F
-rw-r--r-- 68181 MREMD.F
lrwxrwxrwx 24 Makefile -> Makefile_single_gfortran
-rw-r--r-- 4181 Makefile-intrepid-with-tau
-rw-r--r-- 45234 Makefile.tau-mpi-f77-pdt
-rw-r--r-- 2732 Makefile_aix_xlf
-rw-r--r-- 3420 Makefile_bigben
-rw-r--r-- 3370 Makefile_bigben-oldparm
-rw-r--r-- 3430 Makefile_bigben-tau
-rw-r--r-- 3888 Makefile_galera
-rw-r--r-- 4191 Makefile_intrepid
-rw-r--r-- 3674 Makefile_lnx_ifc10_opteron
-rw-r--r-- 3664 Makefile_lnx_ifc10_opteron_oldparm
-rw-r--r-- 2557 Makefile_single_g77
-rw-r--r-- 2798 Makefile_single_gfortran
-rw-r--r-- 2799 Makefile_single_gfortran-oldparm
-rw-r--r-- 161 README
-rw-r--r-- 184 TAU
-rwxr-xr-x 360 TAU_setup.sh
-rw-r--r-- 516 add.f
-rw-r--r-- 216 arcos.f
-rw-r--r-- 1983 banach.f
-rw-r--r-- 31039 bank.F
-rw-r--r-- 14886 blas.f
-rw-r--r-- 3500 bond_move.f
-rw-r--r-- 8530 cartder.F
-rw-r--r-- 650 cartprint.f
-rw-r--r-- 7063 chainbuild.F
-rw-r--r-- 218 change.awk
-rw-r--r-- 688 check_bond.f
-rw-r--r-- 1307 check_sc_distr.f
-rw-r--r-- 21150 checkder_p.F
-rw-r--r-- 1209 cinfo.f
-rw-r--r-- 6357 common.size
-rw-r--r-- 6004 common.size.orig
-rw-r--r-- 6261 compare_s1.F
-rwxr-xr-x 10291 compinfo
-rw-r--r-- 2053 compinfo.c
-rw-r--r-- 6177 contact.f
-rw-r--r-- 5684 convert.f
-rw-r--r-- 103473 cored.f
-rw-r--r-- 10341 csa.f
-rw-r--r-- 691 diff12.f
-rw-r--r-- 6104 dihed_cons.F
-rw-r--r-- 11101 distfit.f
-rw-r--r-- 7649 djacob.f
-rw-r--r-- 3073 econstr_local.F
-rw-r--r-- 74411 eigen.f
-rw-r--r-- 15650 elecont.f
-rw-r--r-- 79894 energy_p_new-sep_barrier.F
-rw-r--r-- 76966 energy_p_new-sep_barrier.F.org
-rw-r--r-- 321592 energy_p_new_barrier.F
-rw-r--r-- 315506 energy_p_new_barrier.F.org
-rw-r--r-- 14123 energy_split-sep.F
-rw-r--r-- 13995 energy_split-sep.F.org
-rw-r--r-- 24428 entmcm.F
-rw-r--r-- 24015 fitsq.f
-rw-r--r-- 1544 gauss.f
-rw-r--r-- 26990 gen_rand_conf.F
-rw-r--r-- 14613 geomout.F
-rw-r--r-- 1373 gnmr1.f
-rw-r--r-- 11117 gradient_p.F
-rw-r--r-- 1986 indexx.f
-rw-r--r-- 46838 initialize_p.F
-rw-r--r-- 4429 int_to_cart.f
-rw-r--r-- 17191 intcartderiv.F
-rw-r--r-- 2571 intcor.f
-rw-r--r-- 18707 intlocal.f
-rw-r--r-- 3156 kinetic_lesyng.f
-rw-r--r-- 20487 lagrangian_lesyng.F
-rw-r--r-- 26696 local_move.f
-rw-r--r-- 2727 map.f
-rw-r--r-- 411 matmult.f
-rw-r--r-- 29948 mc.F
-rw-r--r-- 51663 mcm.F
drwxr-xr-x - md-diff
-rw-r--r-- 15962 minim_jlee.F
-rw-r--r-- 4919 minim_mcmf.F
-rw-r--r-- 24248 minimize_p.F
-rw-r--r-- 5904 misc.f
-rw-r--r-- 9911 moments.f
-rw-r--r-- 9237 muca_md.f
-rw-r--r-- 70024 newconf.F
-rw-r--r-- 1243 newconf.f
-rw-r--r-- 8360 objects.sizes
drwxr-xr-x - old_F
-rw-r--r-- 30535 parmread.F
-rw-r--r-- 928 pinorm.f
-rw-r--r-- 414 printmat.f
-rw-r--r-- 28969 prng.f
-rw-r--r-- 58200 prng_32.F
-rw-r--r-- 2177 proc_proc.c
-rw-r--r-- 17156 q_measure.F
-rw-r--r-- 15581 q_measure1.F
-rw-r--r-- 17557 q_measure3.F
-rw-r--r-- 3712 ran.f
-rw-r--r-- 2387 randgens.f
-rw-r--r-- 19415 rattle.F
-rw-r--r-- 11984 readpdb.F
-rw-r--r-- 92654 readrtns_CSA.F
-rw-r--r-- 2037 refsys.f
-rw-r--r-- 2590 regularize.F
-rw-r--r-- 624 rescode.f
-rw-r--r-- 4585 rmdd.f
-rw-r--r-- 4545 rmsd.F
-rw-r--r-- 24550 sc_move.F
-rw-r--r-- 3195 shift.F
-rw-r--r-- 3392 sizes.i
-rw-r--r-- 15786 sort.f
-rw-r--r-- 16680 stochfric.F
-rw-r--r-- 57498 sumsld.f
-rw-r--r-- 14217 surfatom.f
-rw-r--r-- 85615 test.F
-rw-r--r-- 17578 thread.F
-rw-r--r-- 10755 timing.F
-rw-r--r-- 5 tmptmp
-rw-r--r-- 39027 together.F
-rw-r--r-- 36040 unres
-rw-r--r-- 24054 unres.F
drwxr-xr-x - xdrf
drwxr-xr-x - xdrf_em64