introduction of different ftors for each site
[unres.git] / source / unres / src_MD-M /
drwxr-xr-x   ..
-rw-r--r-- 9098 CMakeLists.txt
-rw-r--r-- 1470 COMMON.BANK
-rw-r--r-- 73 COMMON.BOUNDS
-rw-r--r-- 258 COMMON.CACHE
-rw-r--r-- 920 COMMON.CALC
-rw-r--r-- 804 COMMON.CHAIN
-rw-r--r-- 4565 COMMON.CONTACTS
-rw-r--r-- 3745 COMMON.CONTACTS.moment
-rw-r--r-- 4542 COMMON.CONTACTS_safe1
-rw-r--r-- 814 COMMON.CONTROL
-rw-r--r-- 475 COMMON.CSA
-rw-r--r-- 133 COMMON.DBASE
-rw-r--r-- 2006 COMMON.DERIV
-rw-r--r-- 2000 COMMON.DERIV_safe
-rw-r--r-- 688 COMMON.DISTFIT
-rw-r--r-- 1296 COMMON.FFIELD
-rw-r--r-- 140 COMMON.GEO
-rw-r--r-- 228 COMMON.HAIRPIN
-rw-r--r-- 53 COMMON.HEADER
-rw-r--r-- 1021 COMMON.INFO
-rw-r--r-- 1661 COMMON.INTERACT
-rw-r--r-- 3892 COMMON.IOUNITS
-rw-r--r-- 1111 COMMON.LANGEVIN
-rw-r--r-- 538 COMMON.LANGEVIN.lang0
-rw-r--r-- 538 COMMON.LANGEVIN.lang0_
-rw-r--r-- 3493 COMMON.LOCAL
-rw-r--r-- 657 COMMON.LOCMOVE
-rw-r--r-- 193 COMMON.MAP
-rw-r--r-- 643 COMMON.MAXGRAD
-rw-r--r-- 594 COMMON.MCE
-rw-r--r-- 4121 COMMON.MCM
-rw-r--r-- 3394 COMMON.MD
-rw-r--r-- 241 COMMON.MINIM
-rw-r--r-- 432 COMMON.MUCA
-rw-r--r-- 292 COMMON.NAMES
-rw-r--r-- 1736 COMMON.REMD
-rw-r--r-- 844 COMMON.SBRIDGE
-rw-r--r-- 918 COMMON.SCCOR
-rw-r--r-- 123 COMMON.SCROT
-rw-r--r-- 1068 COMMON.SETUP
-rw-r--r-- 71 COMMON.SPLITELE
-rw-r--r-- 327 COMMON.THREAD
-rw-r--r-- 1534 COMMON.TIME1
-rw-r--r-- 381 COMMON.TORCNSTR
-rw-r--r-- 1677 COMMON.TORSION
-rw-r--r-- 1202 COMMON.VAR
-rw-r--r-- 109 COMMON.VECTORS
-rw-r--r-- 5360 DIMENSIONS
-rw-r--r-- 3392 DIMENSIONS.2100
-rw-r--r-- 3392 DIMENSIONS.4100
-rw-r--r-- 5189 DIMENSIONS_safe1
-rw-r--r-- 77992 MD.F
-rw-r--r-- 74901 MD_A-MTS.F
-rw-r--r-- 71355 MD_A-MTS.F_safe
-rw-r--r-- 72271 MD_A-MTS.F_safe1
-rw-r--r-- 20166 MP.F
-rw-r--r-- 61548 MREMD.F
-rw-r--r-- 38902 MREMD.F.drabinka
-rw-r--r-- 57911 MREMD.F.safe
-rw-r--r-- 29437 MREMD_nosy1traj.F
-rw-r--r-- 4055 Makefile
-rw-r--r-- 3300 Makefile-biosim
-rw-r--r-- 4181 Makefile-intrepid-with-tau
-rw-r--r-- 3341 Makefile-matrix-intel
-rw-r--r-- 3706 Makefile-matrix3
-rw-r--r-- 3426 Makefile-matrix3-oldparm
-rw-r--r-- 3556 Makefile-oldparm
-rw-r--r-- 690 Makefile-rstconv
-rw-r--r-- 3865 Makefile-tau-temp
-rw-r--r-- 3777 Makefile.old
-rw-r--r-- 45234 Makefile.tau-mpi-f77-pdt
-rwxr-xr-x 44092 Makefile.tau-mpi-pdt-pgi.org
-rw-r--r-- 2669 Makefile_aix_xlf
-rw-r--r-- 3327 Makefile_bigben
-rw-r--r-- 3289 Makefile_bigben-oldparm
-rw-r--r-- 3430 Makefile_bigben-tau
-rw-r--r-- 4191 Makefile_intrepid
-rw-r--r-- 3506 Makefile_jubl
-rw-r--r-- 3611 Makefile_jubl-debug
-rw-r--r-- 2970 Makefile_jubl-opt
-rw-r--r-- 2945 Makefile_jubl-opt-oldparm
-rw-r--r-- 2664 Makefile_lnx_ifc
-rw-r--r-- 3472 Makefile_lnx_ifc10_em64
-rw-r--r-- 3399 Makefile_lnx_ifc10_em64_galera
-rw-r--r-- 3410 Makefile_lnx_ifc10_em64_galera-oldparm
-rw-r--r-- 3832 Makefile_lnx_ifc10_em64_mpi2
-rw-r--r-- 3453 Makefile_lnx_ifc8
-rw-r--r-- 3016 Makefile_lnx_pgf90
-rw-r--r-- 2297 Makefile_osf_f90
-rw-r--r-- 2169 Makefile_win_ifl
-rw-r--r-- 1312 Makefile_win_pgf90
-rw-r--r-- 161 README
-rw-r--r-- 184 TAU
-rwxr-xr-x 360 TAU_setup.sh
-rw-r--r-- 655 WVRND
-rw-r--r-- 516 add.f
-rw-r--r-- 233 arcos.f
-rw-r--r-- 1983 banach.f
-rw-r--r-- 31021 bank.F
-rw-r--r-- 435 big-sizes
-rw-r--r-- 14886 blas.f
-rw-r--r-- 3506 bond_move.f
-rw-r--r-- 10689 brown_step.F
-rw-r--r-- 8530 cartder.F
-rw-r--r-- 650 cartprint.f
-rw-r--r-- 7063 chainbuild.F
-rw-r--r-- 688 check_bond.f
-rw-r--r-- 1307 check_sc_distr.f
-rw-r--r-- 1747 check_sc_map.f
-rw-r--r-- 21803 checkder_p.F
-rw-r--r-- 1664 cinfo.f
-rw-r--r-- 6357 common.size
-rw-r--r-- 6004 common.size.orig
-rw-r--r-- 6267 compare_s1.F
-rw-r--r-- 2113 compinfo.c
-rw-r--r-- 6189 contact.f
-rw-r--r-- 5684 convert.f
-rw-r--r-- 103473 cored.f
-rw-r--r-- 10359 csa.f
-rw-r--r-- 691 diff12.f
-rw-r--r-- 6137 dihed_cons.F
-rw-r--r-- 11101 distfit.f
-rw-r--r-- 7649 djacob.f
-rw-r--r-- 3073 econstr_local.F
-rw-r--r-- 18963 ecorr_num.f
-rw-r--r-- 8674 eelec.F
-rw-r--r-- 74411 eigen.f
-rw-r--r-- 15778 elecont.f
-rw-r--r-- 83580 energy_p_new-sep.F
-rw-r--r-- 78435 energy_p_new-sep_barrier.F
-rw-r--r-- 299788 energy_p_new.F
-rw-r--r-- 330655 energy_p_new_barrier.F
-rw-r--r-- 321263 energy_p_new_barrier.F.orig
-rw-r--r-- 319117 energy_p_new_barrier.F.safe
-rw-r--r-- 13995 energy_split-sep.F
-rw-r--r-- 13266 energy_split.F
-rw-r--r-- 24506 entmcm.F
-rw-r--r-- 6054 env.log
-rw-r--r-- 24019 fitsq.f
-rw-r--r-- 1544 gauss.f
-rw-r--r-- 27098 gen_rand_conf.F
-rw-r--r-- 16100 geomout.F
-rw-r--r-- 2347 gnmr1.f
-rw-r--r-- 11227 gradient_p.F
-rw-r--r-- 1986 indexx.f
-rw-r--r-- 48378 initialize_p.F
-rw-r--r-- 10636 int_to_cart.f
-rw-r--r-- 29096 intcartderiv.F
-rw-r--r-- 2660 intcor.f
-rw-r--r-- 18707 intlocal.f
-rw-r--r-- 3168 kinetic_lesyng.f
-rw-r--r-- 20070 lagrangian_lesyng.F
-rw-r--r-- 26757 local_move.f
-rw-r--r-- 85671 make-tau.log
-rw-r--r-- 2727 map.f
-rw-r--r-- 411 matmult.f
-rw-r--r-- 29952 mc.F
-rw-r--r-- 51646 mcm.F
-rw-r--r-- 15945 minim_jlee.F
-rw-r--r-- 4901 minim_mcmf.F
-rw-r--r-- 23971 minimize_p.F
-rw-r--r-- 5904 misc.f
-rw-r--r-- 522 module.log
-rw-r--r-- 10113 moments.f
-rw-r--r-- 9237 muca_md.f
-rw-r--r-- 70006 newconf.f
-rw-r--r-- 45146 parmread.F
-rw-r--r-- 1325 permut.F
-rw-r--r-- 928 pinorm.f
-rw-r--r-- 414 printmat.f
-rw-r--r-- 58200 prng_32.F
-rw-r--r-- 2196 proc_proc.c
-rw-r--r-- 17443 q_measure.F
-rw-r--r-- 15581 q_measure1.F
-rw-r--r-- 17557 q_measure3.F
-rw-r--r-- 3712 ran.f
-rw-r--r-- 2387 randgens.f
drwxr-xr-x - random_multi_chain
-rw-r--r-- 19783 rattle.F
-rw-r--r-- 16332 readpdb.F
-rw-r--r-- 43512 readpdb.f
-rw-r--r-- 90955 readrtns_CSA.F
-rw-r--r-- 1864 refsys.f
-rw-r--r-- 2590 regularize.F
-rw-r--r-- 634 rescode.f
-rw-r--r-- 13885 restbin2asc.F
-rw-r--r-- 4585 rmdd.f
-rw-r--r-- 5454 rmsd.F
-rw-r--r-- 24559 sc_move.F
-rw-r--r-- 871 select.tau
-rw-r--r-- 3195 shift.F
-rw-r--r-- 3392 sizes.i
-rw-r--r-- 15786 sort.f
-rw-r--r-- 66294 ssMD.F
-rw-r--r-- 16818 stochfric.F
-rw-r--r-- 57498 sumsld.f
-rw-r--r-- 14217 surfatom.f
-rw-r--r-- 3072 tau.options
-rw-r--r-- 84307 test.F
-rw-r--r-- 17584 thread.F
-rw-r--r-- 10608 timing.F
-rw-r--r-- 39038 together.F
-rw-r--r-- 23961 unres.F
lrwxrwxrwx 14 xdrf -> ../../lib/xdrf