ctest corrections to mpi script and remd test
authorCezary Czaplewski <czarek@chem.univ.gda.pl>
Wed, 9 Mar 2016 08:04:01 +0000 (09:04 +0100)
committerCezary Czaplewski <czarek@chem.univ.gda.pl>
Wed, 9 Mar 2016 08:04:01 +0000 (09:04 +0100)
ctest/prota_unres_energy_check.sh
source/unres/src_MD/CMakeLists.txt

index 868163f..4d19aaa 100755 (executable)
@@ -95,7 +95,8 @@ elif [ "$1" == "1L2Y_B" ]; then
 
 
 elif [ "$1" == "1L2Y_remd" ]; then
- tail -q -n +5 1L2Y_remd*.stat >remd_all.stat
+ rm -rf remd_all.stat
+ tail -q -n +1000 1L2Y_remd*.stat >remd_all.stat
  ./matplotlib_hist.py
 
  echo  "<DartMeasurementFile name=\"Histograms $1\" type=\"image/png\">`pwd`/1L2Y_remd_ene_hist.png</DartMeasurementFile>"
index 1c07c18..163e776 100644 (file)
@@ -554,9 +554,9 @@ else(NOT UNRES_WITH_MPI)
     add_test(NAME UNRES_MIN_INT COMMAND mpiexec ${boot_lam} -np 1 ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_prota_E0LL2Y.sh 1l2y_MIN_INT 1 )
     add_test(NAME UNRES_REGULAR COMMAND mpiexec ${boot_lam} -np 1 ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_prota_E0LL2Y.sh 1l2y_MIN_REGULAR_INT 1 )
     add_test(NAME UNRES_MD_microcanonical COMMAND mpiexec ${boot_lam} -np 2 ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_prota_E0LL2Y.sh 1l2y_micro 2 )
-    add_test(NAME UNRES_Langevin COMMAND mpiexec ${boot_lam} -np 2 ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_prota_E0LL2Y.sh 1L2Y_L 2 )
-    add_test(NAME UNRES_NoseHoover COMMAND mpiexec ${boot_lam} -np 2 ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_prota_E0LL2Y.sh 1L2Y_NH 2 )
-    add_test(NAME UNRES_Berendsen COMMAND mpiexec ${boot_lam} -np 2 ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_prota_E0LL2Y.sh 1L2Y_B 2 )
+    add_test(NAME UNRES_Langevin COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_mpi_E0LL2Y.sh 1L2Y_L 2 2 )
+    add_test(NAME UNRES_NoseHoover COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_mpi_E0LL2Y.sh 1L2Y_NH 2 2 )
+    add_test(NAME UNRES_Berendsen COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_mpi_E0LL2Y.sh 1L2Y_B 2 2 )
     add_test(NAME UNRES_remd COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_mpi_E0LL2Y.sh 1L2Y_remd 1 8 )
   endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")