projects / unres.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
Merge branch 'prerelease-3.2.1' into czarek
[unres.git] / examples / unres / CSA / GAB / CSA / global / restrained / jpred_prediction / jp_fSt_H_1.profile
diff --git a/examples/unres/CSA/GAB/CSA/global/restrained/jpred_prediction/jp_fSt_H_1.profile b/examples/unres/CSA/GAB/CSA/global/restrained/jpred_prediction/jp_fSt_H_1.profile
deleted file mode 100644 (file)
index c4b747c..0000000
--- a/examples/unres/CSA/GAB/CSA/global/restrained/jpred_prediction/jp_fSt_H_1.profile
+++ /dev/null
@@ -1,29 +0,0 @@
-
-Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts
-           A  R  N  D  C  Q  E  G  H  I  L  K  M  F  P  S  T  W  Y  V   A   R   N   D   C   Q   E   G   H   I   L   K   M   F   P   S   T   W   Y   V
-    1 N   -2  0  6  1 -3  0  0  0  1 -3 -3  0 -2 -3 -2  1  0 -4 -2 -3    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-    2 L   -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3  2  4 -2  2  0 -3 -2 -1 -2 -1  1    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-    3 Y   -2 -2 -2 -3 -2 -1 -2 -3  2 -1 -1 -2 -1  3 -3 -2 -2  2  7 -1    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-    4 I   -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3  4  2 -3  1  0 -3 -2 -1 -3 -1  3    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-    5 Q   -1  1  0  0 -3  5  2 -2  0 -3 -2  1  0 -3 -1  0 -1 -2 -1 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-    6 W   -2 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1  1 -4 -3 -2 10  2 -3    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-    7 L   -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3  2  4 -2  2  0 -3 -2 -1 -2 -1  1    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-    8 K   -1  2  0 -1 -3  1  1 -2 -1 -3 -2  4 -1 -3 -1  0 -1 -3 -2 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-    9 D   -2 -2  1  6 -3  0  1 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -3 -1  0 -1 -4 -3 -3    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-   10 G    0 -2  0 -1 -2 -2 -2  6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2  0 -2 -2 -3 -3    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-   11 G    0 -2  0 -1 -2 -2 -2  6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2  0 -2 -2 -3 -3    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-   12 P   -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4  7 -1 -1 -4 -3 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-   13 S    1 -1  1  0 -1  0  0  0 -1 -2 -2  0 -1 -2 -1  4  1 -3 -2 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-   14 S    1 -1  1  0 -1  0  0  0 -1 -2 -2  0 -1 -2 -1  4  1 -3 -2 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-   15 G    0 -2  0 -1 -2 -2 -2  6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2  0 -2 -2 -3 -3    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-   16 R   -1  5  0 -2 -3  1  0 -2  0 -3 -2  2 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-   17 P   -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4  7 -1 -1 -4 -3 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-   18 P   -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4  7 -1 -1 -4 -3 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-   19 P   -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4  7 -1 -1 -4 -3 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-   20 S    1 -1  1  0 -1  0  0  0 -1 -2 -2  0 -1 -2 -1  4  1 -3 -2 -2    0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0.00    0.00
-
-                      K         Lambda
-Standard Ungapped    0.1408     0.3104
-Standard Gapped      0.0410     0.2670
-PSI Ungapped         0.1437     0.3166
-PSI Gapped           0.0440     0.2670
UNRESPACK 3.x