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[unres.git] / CMakeLists.txt
diff --git a/CMakeLists.txt b/CMakeLists.txt
index 87cffd9..d23f507 100644 (file)
--- a/CMakeLists.txt
+++ b/CMakeLists.txt
@@ -6,8 +6,8 @@ cmake_minimum_required(VERSION 2.8)
 project(UNRESPACK Fortran C)
 
 set(UNRES_MAJOR 3)
-set(UNRES_MINOR 2)
-set(UNRES_PATCH 1)
+set(UNRES_MINOR 5)
+set(UNRES_PATCH 2)
 set(UNRES_VERSION ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR}.${UNRES_PATCH})
 
 #======================================
@@ -20,18 +20,18 @@ MACRO (TODAY RESULT)
         EXECUTE_PROCESS(COMMAND "date" "/T" OUTPUT_VARIABLE ${RESULT})
         string(REGEX REPLACE "(..)/(..)/..(..).*" "\\3\\2\\1" ${RESULT} ${${RESULT}})
     ELSEIF(UNIX)
-        EXECUTE_PROCESS(COMMAND "date" OUTPUT_VARIABLE ${RESULT})
-        string(REGEX REPLACE "(...) (...) (.+) (..:..:..) (.+) (....).*" "\\1 \\2 \\3 \\4 \\5 \\6" ${RESULT} ${${RESULT}})
+        EXECUTE_PROCESS(COMMAND "date" "--rfc-2822" OUTPUT_VARIABLE ${RESULT})
+        string(REGEX REPLACE "\n" " " ${RESULT} ${${RESULT}})
     ELSE (WIN32)
         MESSAGE(SEND_ERROR "date not implemented")
         SET(${RESULT} 000000)
     ENDIF (WIN32)
 ENDMACRO (TODAY)
 
-# foramt variables used in cinfo.f 
+# format variables used in cinfo.f 
 MACRO (CINFO_FORMAT FN VN VD)
 # 50 znakowi
-# 73 w całej linii
+# 73 w ca?ej linii
 #        write(iout,*)'INSTALL_DIR = /users/software/mpich-1.2.7p1_int...'
     string(LENGTH "${VN}" VNLEN)
     string(LENGTH "${VD}" VDLEN)
@@ -63,6 +63,13 @@ MACRO (CINFO_FORMAT FN VN VD)
        file(APPEND ${FN} "       write(iout,*)'${STR}'\n")
     endif(SUMA GREATER 50)
 ENDMACRO (CINFO_FORMAT)
+
+# Some MPI wrappers pass double include paths
+# This macro fixes broken by semicolon occurence in path
+MACRO (FIX_DBL_INCLUDE RESULT)
+  string(REPLACE ";" " -I" ${RESULT} "${${RESULT}}")
+ENDMACRO (FIX_DBL_INCLUDE)
+
 #======================================
 # CTest stuff
 #======================================A
@@ -70,8 +77,6 @@ ENDMACRO (CINFO_FORMAT)
 include(CTest)
 enable_testing()
  
-# Set makefile verbose on
-set( CMAKE_VERBOSE_MAKEFILE 1 )
 
 #======================================
 # Fortran compilers stuff
@@ -88,23 +93,36 @@ SET(CMAKE_Fortran_COMPILE_OBJECT "<CMAKE_Fortran_COMPILER>  ${CMAKE_START_TEMP_F
    
 # make sure that the default is a RELEASE
 if (NOT CMAKE_BUILD_TYPE)
-  set (CMAKE_BUILD_TYPE "Release" CACHE STRING "Choose the type of build, options are: None Debug Release." FORCE)
-  set_property(CACHE CMAKE_BUILD_TYPE PROPERTY STRINGS "None" "Debug" "Release" )
+  set (CMAKE_BUILD_TYPE "Release" CACHE STRING "Choose the type of build, options are: None Debug Release RelWithDebInfo." FORCE)
+  set_property(CACHE CMAKE_BUILD_TYPE PROPERTY STRINGS "None" "Debug" "Release" "RelWithDebInfo")
 endif (NOT CMAKE_BUILD_TYPE)
-   
+
+
+if (CMAKE_BUILD_TYPE STREQUAL "Release")
+  # Set makefile verbosity off for Release builds
+  set( CMAKE_VERBOSE_MAKEFILE 0 )
+else()
+  # Set makefile verbosity on for other builds
+  set( CMAKE_VERBOSE_MAKEFILE 1 )
+endif (CMAKE_BUILD_TYPE STREQUAL "Release")
+
+# Default Install Path
+
+set(CMAKE_INSTALL_PREFIX "${CMAKE_SOURCE_DIR}/bin" CACHE PATH "Binary install directory " FORCE)
+
 #=======================================  
 # Set the varous build variables 
 #=======================================
 
 # Set force field
 if (NOT UNRES_FF)
-  set(UNRES_MD_FF "GAB" CACHE STRING "Choose the force field, options are: GAB E0LL2Y" )
-  set_property(CACHE UNRES_MD_FF PROPERTY STRINGS "GAB" "E0LL2Y")
+  set(UNRES_MD_FF "NEWCORR" CACHE STRING "Choose the force field, options are: GAB E0LL2Y NEWCORR" )
+  set_property(CACHE UNRES_MD_FF PROPERTY STRINGS "GAB" "E0LL2Y" "NEWCORR")
 endif (NOT UNRES_FF)
 
 # Set CSA version force field
 if (NOT UNRES_CSA_FF)
-  set(UNRES_CSA_FF "4P" CACHE STRING "Choose the CSA version force field, options are: CASP3 ALPHA BETA ALPHABETA CASP5 3P 4P" )
+  set(UNRES_CSA_FF "E0LL2Y" CACHE STRING "Choose the CSA version force field, options are: CASP3 ALPHA BETA ALPHABETA CASP5 3P 4P" )
   set_property(CACHE UNRES_CSA_FF PROPERTY STRINGS "CASP3" "ALPHA" "BETA" "ALPHABETA" "CASP5" "3P" "4P" ) 
 endif (NOT UNRES_CSA_FF)
 
@@ -113,8 +131,12 @@ option(UNRES_WITH_MPI "Choose whether or not to use MPI library" ON )
 
 
 # Piasek cluster devel stuff
-option(UNRES_NA_MMCE "Kompilujemy na mmmce?" OFF )
+#option(UNRES_NA_MMCE "Kompilujemy na mmmce?" OFF )
 
+option(UNRES_DFA "Choose whether or not to use DFA" OFF )
+option(UNRES_5D "Choose whether or not to use HCD-5D" ON )
+option(UNRES_NO5D "Choose the old code" OFF )
+option(UNRES_SUMSLD "Choose SUMSLD (ON) or LBFGS (OFF, default)" OFF )
 
 #=================================
 # MPI stuff
@@ -125,6 +147,7 @@ find_package(MPI QUIET)
 
 if (MPI_Fortran_FOUND)
   message("MPI found")
+  FIX_DBL_INCLUDE(MPI_Fortran_INCLUDE_PATH)
 else()
   message("MPI not found - disabling MPI compile flags ")
   set ( UNRES_WITH_MPI "OFF")
@@ -149,59 +172,43 @@ message("Detected ${architektura}-bit architecture")
 # used by unres/src_MIN
 find_package (Threads)
 
-
-
-#=======================================
-#  Create diractories for build targets
-#=======================================
-#execute_process(COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E make_directory ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
-
 #=======================================
 # Add source files
 #=======================================     
 
-
 add_subdirectory(source/lib/xdrf)
 
+#add_subdirectory(source/unres/src_MD)
+
+if(UNRES_WITH_MPI)
+ if(UNRES_NO5D)
+#    add_subdirectory(source/unres/src_MD-M)
+#    add_subdirectory(source/unres/src_MD_DFA)
+#    add_subdirectory(source/unres/src_CSA)
+    add_subdirectory(source/unres/src_MD-M-SAXS-homology)
+#    add_subdirectory(source/unres/src_CSA_DiL)
+#    add_subdirectory(source/wham/src)
+#    add_subdirectory(source/wham/src-M)
+    add_subdirectory(source/wham/src-M-SAXS-homology)
+#    add_subdirectory(source/cluster/wham/src)
+#    add_subdirectory(source/cluster/wham/src-M)
+    add_subdirectory(source/cluster/wham/src-M-SAXS-homology)
+#
+ else(UNRES_NO5D)
+# src-HCD-5D
+  add_subdirectory(source/cluster/wham/src-HCD-5D)
+  add_subdirectory(source/wham/src-HCD-5D)
+  add_subdirectory(source/unres/src-HCD-5D)
+ endif(UNRES_NO5D)
+# if(NOT UNRES_DFA)
+   add_subdirectory(source/unres-dock)
+# endif(NOT UNRES_DFA)
+endif(UNRES_WITH_MPI)
+
+#add_subdirectory(source/unres/src_MIN)
+add_subdirectory(source/cluster/unres/src)
+#add_subdirectory(source/xdrfpdb/src)
+add_subdirectory(source/xdrfpdb/src-M)
+#add_subdirectory(source/maxlik/src_CSA)
 
-if(UNRES_NA_MMCE)
-
-  if(UNRES_WITH_MPI)
-    # Brak MPI dla gfortrana, wiec tylko na ifort sie skompiluje
-    if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
-      add_subdirectory(source/unres/src_MD)
-      add_subdirectory(source/unres/src_MD-M)
-      add_subdirectory(source/unres/src_CSA)
-      add_subdirectory(source/unres/src_CSA_DiL)
-      add_subdirectory(source/cluster/wham/src)
-      add_subdirectory(source/cluster/wham/src-M)
-    endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
-  else()
-    add_subdirectory(source/unres/src_MD)
-    # src_MD-M doesn't work yet witout MPI
-    # add_subdirectory(source/unres/src_MD-M)
-  endif()
-  add_subdirectory(source/unres/src_MIN)
-  add_subdirectory(source/cluster/unres/src)
-  add_subdirectory(source/xdrfpdb/src)
-  add_subdirectory(source/xdrfpdb/src-M)
-  add_subdirectory(source/maxlik/src_CSA)
-else()
-
-  add_subdirectory(source/unres/src_MD)
-  if(UNRES_WITH_MPI)
-    add_subdirectory(source/unres/src_MD-M)
-    add_subdirectory(source/unres/src_CSA)
-    add_subdirectory(source/unres/src_CSA_DiL)
-    add_subdirectory(source/wham/src)
-    add_subdirectory(source/wham/src-M)
-    add_subdirectory(source/cluster/wham/src)
-    add_subdirectory(source/cluster/wham/src-M)
-  endif(UNRES_WITH_MPI)
-  add_subdirectory(source/unres/src_MIN)
-  add_subdirectory(source/cluster/unres/src)
-  add_subdirectory(source/xdrfpdb/src)
-  add_subdirectory(source/xdrfpdb/src-M)
-  add_subdirectory(source/maxlik/src_CSA)
-endif(UNRES_NA_MMCE)
 
UNRESPACK 3.x