source/xdrfpdb/src-M/CMakeLists.txt

   1 # Set of programs to convert UNRES xdrf format (compressed Cartesian coordinates) to PDF
   2 # or raw-Cartesian format (*.x) or to extract backbone angular coordinates (*.ang)
   3 # The pdb files can be constructed from canonical or MREMD trajectories.
   4 #
   5 # The xdrf library is required
   6 #
   7 # Programs
   8 #
   9 # xdrf2pdb   : converts a single cx trajectory file to PDB format
  10 # xdrf2x     : converts a single cx trajectory file to raw-coordinate (x) format
  11 # xdrf2ang   : extracts backbone angles from a cx trajectory file
  12 # xdrf2pdb-m : converts a selected trajectory of a MREMD run dumpend into a cx file to PDB format
  13 #
  14 # xdrf2pdb1  : converts conformation(s) selected from a wham post-processing run into PDB format
  15 # xdrf2x1    : converts conformation(s) selected from a wham post-processing run into raw (x) format.
  16 #
  17 # 9/23/2010 A. Liwo
  18 #
  19 # CMake file by D. Jagie?a
  20 #
  21
  22 set(UNRES_XDRF_XDRF2PDB_SRC-M
  23         xdrf2pdb.F
  24         geomout.F
  25         misc.f
  26         rescode.f
  27         nazwy.f
  28 )
  29
  30 set(UNRES_XDRF_XDRF2PDB-M_SRC-M
  31         xdrf2pdb-m.F
  32         geomout.F
  33         misc.f
  34         rescode.f
  35         nazwy.f
  36 )
  37
  38
  39 set(UNRES_XDRF_PP_SRC-M
  40         geomout.F
  41         xdrf2pdb.F
  42         xdrf2pdb-m.F
  43         xdrf2x.F
  44 )
  45
  46 set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DMP -DMPI -DSPLITELE -DNEWUNRES" )
  47
  48 #=========================================
  49 # System specific flags
  50 #=========================================
  51 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
  52   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
  53 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
  54
  55 # Apply preprocesor flags to *.F files
  56 set_property(SOURCE ${UNRES_XDRF_PP_SRC-M} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
  57
  58
  59 #=========================================
  60 # Build the binaries
  61 #=========================================
  62 add_executable(UNRES_XDRF2PDB_BIN-M   ${UNRES_XDRF_XDRF2PDB_SRC-M} )
  63 target_link_libraries(UNRES_XDRF2PDB_BIN-M xdrf )
  64 set_target_properties(UNRES_XDRF2PDB_BIN-M PROPERTIES OUTPUT_NAME xdrf2pdb )
  65 set_property(TARGET UNRES_XDRF2PDB_BIN-M PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin )
  66
  67 add_executable(UNRES_XDRF2PDBM_BIN-M ${UNRES_XDRF_XDRF2PDB-M_SRC-M} )
  68 target_link_libraries( UNRES_XDRF2PDBM_BIN-M xdrf )
  69 set_target_properties(UNRES_XDRF2PDBM_BIN-M PROPERTIES OUTPUT_NAME xdrf2pdb-m )
  70 set_property(TARGET UNRES_XDRF2PDBM_BIN-M PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin )
  71
  72
  73 #=========================================
  74 # Install Path
  75 #=========================================
  76 install(TARGETS UNRES_XDRF2PDB_BIN-M DESTINATION ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/xdrfpdb)
  77 install(TARGETS UNRES_XDRF2PDBM_BIN-M DESTINATION ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/xdrfpdb)
  78
  79
  80 #=========================================
  81 # TESTS
  82 #=========================================
  83
  84
  85 # Create files needed for tests
  86
  87 file(   COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/ala10one.seq
  88         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
  89
  90 file(   COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/ala10three.seq
  91         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
  92
  93 file(   COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1L2Yone.seq
  94         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
  95
  96 file(   COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1L2Ythree.seq
  97         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
  98
  99 file(   COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/ala10MD.cx
 100         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
 101
 102 file(   COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1L2Y_MREMD_MD000.cx
 103         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
 104
 105
 106 # Test xdrf2pdb
 107 add_test(NAME XDRF2PDB-one   COMMAND ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/xdrf2pdb one ala10one.seq ala10MD.cx )
 108 add_test(NAME XDRF2PDB-three COMMAND ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/xdrf2pdb three ala10three.seq ala10MD.cx )
 109
 110 # Test xdrf2pdb-m
 111 add_test(NAME XDRF2PDB-M-one   COMMAND ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/xdrf2pdb-m one 1L2Yone.seq 1L2Y_MREMD_MD000.cx 32 30 )
 112 add_test(NAME XDRF2PDB-M-three COMMAND ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/xdrf2pdb-m three 1L2Ythree.seq 1L2Y_MREMD_MD000.cx 32 30 )
 113
 114 # Test xdrf2ang
 115 #add_test(NAME XDRF2ANG-one   COMMAND ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/xdrf2ang one ala10one.seq ala10MD.cx )
 116 #add_test(NAME XDRF2ANG-three COMMAND ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/xdrf2ang three ala10three.seq ala10MD.cx )
 117
 118
 119