0de3d7126fc7abbc69ea04279cd9f7c5712ad390
[unres.git] / source / wham / src / CMakeLists.txt
1 #
2 # CMake project file for WHAM single chain version 
3
4
5 enable_language (Fortran)
6
7 #================================
8 # Set source file lists
9 #================================
10 set(UNRES_WHAM_SRC0 
11         wham_multparm.F
12         bxread.F
13         xread.F
14         cxread.F
15         enecalc1.F 
16         energy_p_new.F
17         initialize_p.F
18         molread_zs.F
19         openunits.F
20         readrtns.F
21         arcos.f
22         cartder.f
23         cartprint.f
24         chainbuild.f
25         geomout.F
26         gnmr1.f
27         icant.f
28         intcor.f
29         int_from_cart.f
30         make_ensemble1.F
31         matmult.f
32         misc.f
33         mygetenv.F
34         parmread.F
35         pinorm.f
36         printmat.f
37         rescode.f
38         setup_var.f
39         slices.F
40         store_parm.F
41         timing.F
42         wham_calc1.F
43         readrtns_compar.F
44         readpdb.f
45         fitsq.f 
46         contact.f
47         elecont.f
48         contfunc.f
49         cont_frag.f
50         conf_compar.F
51         match_contact.f
52         angnorm.f
53         odlodc.f
54         promienie.f
55         qwolynes.f
56         read_ref_str.F
57         rmscalc.f
58         secondary.f
59         proc_cont.f
60         define_pairs.f
61         mysort.f
62 )
63
64 set(UNRES_WHAM_PP_SRC
65         bxread.F
66         chainbuild.F
67         conf_compar.F
68         cxread.F
69         enecalc1.F
70         energy_p_new.F
71         geomout.F
72         initialize_p.F
73         make_ensemble1.F
74         molread_zs.F
75         mygetenv.F
76         openunits.F
77         parmread.F
78         read_ref_str.F
79         readrtns_compar.F
80         readrtns.F
81         slices.F
82         store_parm.F
83         timing.F
84         wham_calc1.F
85         wham_multparm.F
86         xread.F
87         proc_proc.c
88
89
90
91 #================================================
92 # Set comipiler flags for different sourcefiles  
93 #================================================
94 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
95   set(FFLAGS0 "-mcmodel=medium -g -CB -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" ) 
96 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
97   set(FFLAGS0 "-g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" ) 
98 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
99
100
101 #=========================================
102 # Add MPI compiler flags
103 #=========================================
104 if(UNRES_WITH_MPI)
105   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
106 endif(UNRES_WITH_MPI)
107
108 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
109
110 #=========================================
111 # WHAM preprocesor flags
112 #=========================================
113
114 set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
115
116 #=========================================
117 # System specific flags
118 #=========================================
119 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
120   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX") 
121 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
122
123 #=========================================
124 # Compiler specific flags
125 #=========================================
126
127 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
128   # Add ifort preprocessor flags
129   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI") 
130 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
131   # Add new gfortran flags
132   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77") 
133 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
134   # Add old gfortran flags
135   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77") 
136 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
137
138 #=========================================
139 # Add MPI preprocessor flags
140 #=========================================
141 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI") 
142
143 #=========================================
144 # Add 64-bit specific preprocessor flags
145 #=========================================
146 if (architektura STREQUAL "64")
147   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
148 endif (architektura STREQUAL "64")
149
150 #=========================================
151 # Apply preprocesor flags to *.F files
152 #=========================================
153 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )  
154
155
156 #========================================
157 #  Setting binary name
158 #========================================
159 set(UNRES_WHAM_BIN "wham_${Fortran_COMPILER_NAME}.exe")
160
161 #=========================================
162 # cinfo.f stupid workaround for cmake
163 #  - shame on me ]:)
164 #=========================================
165 set_property(SOURCE compinfo.c PROPERTY CMAKE_C_FLAGS "-c" )
166 add_executable(compinfo-wham compinfo.c)
167 set_target_properties(compinfo-wham PROPERTIES OUTPUT_NAME compinfo)
168
169 set(UNRES_CINFO_DIR "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}" )
170 add_custom_command(OUTPUT ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f 
171         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/cinfo.f ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
172         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/COMMON.IOUNITS ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/COMMON.IOUNITS 
173         COMMAND ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/compinfo | true     
174         DEPENDS compinfo-wham )
175 set_property(SOURCE ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
176
177 #=========================================
178 # Set full unres CSA sources
179 #=========================================
180 set(UNRES_WHAM_SRCS ${UNRES_WHAM_SRC0} ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
181
182 #=========================================
183 # Build the binary
184 #=========================================
185 add_executable(UNRES_WHAM_BIN ${UNRES_WHAM_SRCS} )
186 set_target_properties(UNRES_WHAM_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_BIN})
187
188 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
189 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
190
191 #=========================================
192 # Link libraries
193 #=========================================
194 # link MPI library (libmpich.a)  
195 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN ${MPIF_LIBRARIES} )
196 # link libxdrf.a 
197 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN xdrf )
198
199 #=========================================
200 # TESTS 
201 #=========================================
202
203 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
204 #SET(UNRES_TEST_FILES
205 #       ala10.inp
206 #    )
207
208 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
209 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
210 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
211 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
212 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
213 #          POST_BUILD
214 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
215 #      )
216 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
217
218 #=========================================
219 # Generate data test files
220 #=========================================
221 #  test_single_ala.sh
222 #=========================================
223
224 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
225 #"#!/bin/sh
226 #export POT=GB
227 #export PREFIX=ala10
228 #-----------------------------------------------------------------------------
229 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
230 #-----------------------------------------------------------------------------
231 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
232 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
233 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
234 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
235 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
236 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
237 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
238 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
239 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
240 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
241 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
242 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
243 #-----------------------------------------------------------------------------
244 #$UNRES_BIN
245 #")
246
247 #=========================================
248 #  ala10.inp
249 #=========================================
250
251 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
252 #"ala10 unblocked
253 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
254 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
255 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
256 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
257 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
258 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
259 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
260 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
261 #12
262 #XAAAAAAAAAAX 
263 # 0
264 # 0
265 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000 
266 #   90.0000   90.0000
267 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
268 #  180.0000
269 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000 
270 #  110.0000  110.0000
271 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
272 # -120.0000 -120.0000
273 #")
274
275
276 # Add tests
277
278 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
279
280 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
281
282 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)