source/wham/src-M/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for WHAM multichain version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_WHAM_M_SRC0
  11         wham_multparm.F
  12         bxread.F
  13         xread.F
  14         cxread.F
  15         enecalc1.F
  16         energy_p_new.F
  17         initialize_p.F
  18         molread_zs.F
  19         openunits.F
  20         readrtns.F
  21         arcos.f
  22         cartder.f
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.F
  25         geomout.F
  26         gnmr1.f
  27         icant.f
  28         intcor.f
  29         int_from_cart.f
  30         make_ensemble1.F
  31         matmult.f
  32         misc.f
  33         mygetenv.F
  34         parmread.F
  35         permut.F
  36         pinorm.f
  37         printmat.f
  38         rescode.f
  39         setup_var.f
  40         slices.F
  41         store_parm.F
  42         timing.F
  43         wham_calc1.F
  44         readrtns_compar.F
  45         read_dist_constr.F
  46         readpdb.f
  47         fitsq.f
  48         contact.f
  49         elecont.f
  50         contfunc.f
  51         cont_frag.f
  52         conf_compar.F
  53         match_contact.f
  54         angnorm.f
  55         odlodc.f
  56         promienie.f
  57         qwolynes.f
  58         read_ref_str.F
  59         rmscalc.f
  60         secondary.f
  61         proc_cont.f
  62         define_pairs.f
  63         mysort.f
  64 )
  65
  66 set(UNRES_WHAM_M_PP_SRC
  67         bxread.F
  68         chainbuild.F
  69         conf_compar.F
  70         cxread.F
  71         enecalc1.F
  72         energy_p_new.F
  73         geomout.F
  74         initialize_p.F
  75         make_ensemble1.F
  76         molread_zs.F
  77         mygetenv.F
  78         openunits.F
  79         parmread.F
  80         permut.F
  81         read_ref_str.F
  82         read_dist_constr.F
  83         readrtns_compar.F
  84         readrtns.F
  85         slices.F
  86         store_parm.F
  87         timing.F
  88         wham_calc1.F
  89         wham_multparm.F
  90         xread.F
  91         proc_proc.c
  92 )
  93
  94
  95 #================================================
  96 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  97 #================================================
  98 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  99   set(FFLAGS0 "-g -CB -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
 100 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 101   set(FFLAGS0 "-std=legacy -g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
 102 else ()
 103   set(FFLAGS0 "-g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
 104 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 105
 106
 107 #=========================================
 108 # Add MPI compiler flags
 109 #=========================================
 110 if(UNRES_WITH_MPI)
 111   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 112 endif(UNRES_WITH_MPI)
 113
 114 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_M_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 115
 116 #=========================================
 117 #  Settings for GAB force field
 118 #=========================================
 119 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 120   # set preprocesor flags
 121   set(CPPFLAGS "PROCOR  -DSPLITELE -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC  -DSCCORPDB" )
 122
 123 #=========================================
 124 #  Settings for E0LL2Y force field
 125 #=========================================
 126 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 127   # set preprocesor flags
 128   set(CPPFLAGS "PROCOR  -DSPLITELE -DSCCORPDB" )
 129 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "4P")
 130   set(CPPFLAGS "SPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC -DSCCORPDB" )
 131 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 132
 133 #=========================================
 134 # Additional flags
 135 #=========================================
 136 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DUNRES -DISNAN")
 137
 138 #=========================================
 139 # System specific flags
 140 #=========================================
 141 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 142   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 143 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 144
 145 #=========================================
 146 # Compiler specific flags
 147 #=========================================
 148
 149 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 150   # Add ifort preprocessor flags
 151   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 152 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 153   # Add new gfortran flags
 154   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 155 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 156   # Add old gfortran flags
 157   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 158 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "pgf90")
 159   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 160   FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/source/lib/isnan_pgi.f DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
 161   list(APPEND UNRES_WHAM_M_SRC0 ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/isnan_pgi.f)
 162   set(CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS "-Bdynamic")
 163 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 164
 165 #=========================================
 166 # Add MPI preprocessor flags
 167 #=========================================
 168 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI")
 169
 170 #=========================================
 171 # Add 64-bit specific preprocessor flags
 172 #=========================================
 173 if (architektura STREQUAL "64")
 174   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 175 endif (architektura STREQUAL "64")
 176
 177 #=========================================
 178 # Apply preprocesor flags to *.F files
 179 #=========================================
 180 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_M_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 181
 182
 183 #========================================
 184 #  Setting binary name
 185 #========================================
 186 set(UNRES_WHAM_M_BIN "wham-mult_${Fortran_COMPILER_NAME}_MPI_${UNRES_MD_FF}.exe")
 187
 188 #=========================================
 189 # cinfo.f workaround for CMake
 190 #=========================================
 191 # get the current date
 192 TODAY(DATE)
 193 # generate cinfo.f
 194
 195 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
 196 FILE(WRITE ${CINFO}
 197 "C CMake generated file
 198        subroutine cinfo
 199        include 'COMMON.IOUNITS'
 200        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 201        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 202 ")
 203
 204 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
 205 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
 206 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
 207 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
 208 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
 209 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
 210 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
 211
 212 FILE(APPEND ${CINFO}
 213 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 214        return
 215        end ")
 216
 217 # set include paths
 218 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}"  )
 219
 220 #=========================================
 221 # Set full unres CSA sources
 222 #=========================================
 223 set(UNRES_WHAM_M_SRCS ${UNRES_WHAM_M_SRC0} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
 224
 225 #=========================================
 226 # Build the binary
 227 #=========================================
 228 add_executable(UNRES_WHAM_M_BIN ${UNRES_WHAM_M_SRCS} )
 229 set_target_properties(UNRES_WHAM_M_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_M_BIN})
 230 set_property(TARGET UNRES_WHAM_M_BIN PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin )
 231 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 232
 233 #=========================================
 234 # Link libraries
 235 #=========================================
 236 # link MPI library (libmpich.a)
 237 target_link_libraries( UNRES_WHAM_M_BIN ${MPI_Fortran_LIBRARIES} )
 238 # link libxdrf.a
 239 target_link_libraries( UNRES_WHAM_M_BIN xdrf )
 240
 241
 242 #=========================================
 243 # Install Path
 244 #=========================================
 245 install(TARGETS UNRES_WHAM_M_BIN DESTINATION ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/wham)
 246
 247
 248 #=========================================
 249 # TESTS
 250 #=========================================
 251
 252 #  MESSAGE (STATUS "${MPI_Fortran_LIBRARIES}")
 253   if ("${MPI_Fortran_LIBRARIES}"  MATCHES "lam")
 254      MESSAGE (STATUS "LAM MPI library detected")
 255      set (boot_lam "-boot")
 256   else()
 257      set (boot_lam "")
 258   endif()
 259
 260   if (UNRES_SRUN)
 261    set (np "-n")
 262    set (mpiexec "srun")
 263   elseif(UNRES_MPIRUN)
 264    set (np "-np")
 265    set (mpiexec "mpirun")
 266   else()
 267    set (np "-np")
 268    set (mpiexec "mpiexec")
 269   endif()
 270
 271 FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/scripts/wham_mpi_E0LL2Y.sh
 272 "#!/bin/sh
 273 export POT=GB
 274 export PREFIX=$1
 275 #-----------------------------------------------------------------------------
 276 WHAM_BIN=${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/${UNRES_WHAM_M_BIN}
 277 #-----------------------------------------------------------------------------
 278 DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 279 export BONDPAR=$DD/bond_AM1.parm
 280 export THETPAR=$DD/theta_abinitio.parm
 281 export ROTPAR=$DD/rotamers_AM1_aura.10022007.parm
 282 export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 283 export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 284 export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 285 export SIDEPAR=$DD/scinter_$POT.parm
 286 export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 287 export SCPPAR=$DD/scp.parm
 288 export SCCORPAR=$DD/sccor_am1_pawel.dat
 289 export THETPARPDB=$DD/thetaml.5parm
 290 export ROTPARPDB=$DD/scgauss.parm
 291 export PATTERN=$DD/patterns.cart
 292 export CONTFUNC=GB
 293 export SIDEP=$DD/contact.3.parm
 294 export SCRATCHDIR=.
 295 #-----------------------------------------------------------------------------
 296 echo CTEST_FULL_OUTPUT
 297 ${mpiexec} ${boot_lam} ${np} $2 $WHAM_BIN
 298 ./wham_check.sh $1
 299 ")
 300
 301 #
 302 # File permissions workaround
 303 #
 304 FILE(   COPY ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/scripts/wham_mpi_E0LL2Y.sh
 305         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}
 306         FILE_PERMISSIONS OWNER_READ OWNER_WRITE OWNER_EXECUTE GROUP_READ GROUP_EXECUTE WORLD_READ WORLD_EXECUTE
 307 )
 308
 309 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/wham_check.sh
 310         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}
 311         FILE_PERMISSIONS OWNER_READ OWNER_WRITE OWNER_EXECUTE GROUP_READ GROUP_EXECUTE WORLD_READ WORLD_EXECUTE
 312 )
 313
 314 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1L2Y_wham.inp
 315         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
 316
 317 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1L2Y_remd_MD000.cx
 318         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
 319
 320 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1L2Y.pdb
 321         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
 322
 323
 324 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 325     add_test(NAME WHAM_M_remd COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/wham_mpi_E0LL2Y.sh 1L2Y_wham 2 )
 326 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")