source/wham/src-M/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for WHAM multichain version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_WHAM_M_SRC0
  11         wham_multparm.F
  12         bxread.F
  13         xread.F
  14         cxread.F
  15         enecalc1.F
  16         energy_p_new.F
  17         initialize_p.F
  18         molread_zs.F
  19         openunits.F
  20         readrtns.F
  21         arcos.f
  22         cartder.f
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.F
  25         geomout.F
  26         gnmr1.f
  27         icant.f
  28         intcor.f
  29         int_from_cart.f
  30         make_ensemble1.F
  31         matmult.f
  32         misc.f
  33         mygetenv.F
  34         parmread.F
  35         permut.F
  36         pinorm.f
  37         printmat.f
  38         rescode.f
  39         setup_var.f
  40         slices.F
  41         store_parm.F
  42         timing.F
  43         wham_calc1.F
  44         readrtns_compar.F
  45         read_dist_constr.F
  46         readpdb.f
  47         fitsq.f
  48         contact.f
  49         elecont.f
  50         contfunc.f
  51         cont_frag.f
  52         conf_compar.F
  53         match_contact.f
  54         angnorm.f
  55         odlodc.f
  56         promienie.f
  57         qwolynes.f
  58         read_ref_str.F
  59         rmscalc.f
  60         secondary.f
  61         proc_cont.f
  62         define_pairs.f
  63         mysort.f
  64 )
  65
  66 set(UNRES_WHAM_M_PP_SRC
  67         bxread.F
  68         chainbuild.F
  69         conf_compar.F
  70         cxread.F
  71         enecalc1.F
  72         energy_p_new.F
  73         geomout.F
  74         initialize_p.F
  75         make_ensemble1.F
  76         molread_zs.F
  77         mygetenv.F
  78         openunits.F
  79         parmread.F
  80         permut.F
  81         read_ref_str.F
  82         read_dist_constr.F
  83         readrtns_compar.F
  84         readrtns.F
  85         slices.F
  86         store_parm.F
  87         timing.F
  88         wham_calc1.F
  89         wham_multparm.F
  90         xread.F
  91         proc_proc.c
  92 )
  93
  94
  95 #================================================
  96 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  97 #================================================
  98 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  99   set(FFLAGS0 "-g -CB -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
 100 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 101   set(FFLAGS0 "-std=legacy -g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
 102 else ()
 103   set(FFLAGS0 "-g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
 104 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 105
 106
 107 #=========================================
 108 # Add MPI compiler flags
 109 #=========================================
 110 if(UNRES_WITH_MPI)
 111   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 112 endif(UNRES_WITH_MPI)
 113
 114 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_M_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 115
 116 #=========================================
 117 #  Settings for GAB force field
 118 #=========================================
 119 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 120   # set preprocesor flags
 121   set(CPPFLAGS "PROCOR  -DSPLITELE -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC  -DSCCORPDB" )
 122
 123
 124 #=========================================
 125 #  Settings for E0LL2Y force field
 126 #=========================================
 127 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 128   # set preprocesor flags
 129   set(CPPFLAGS "PROCOR  -DSPLITELE -DSCCORPDB" )
 130 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 131
 132 #=========================================
 133 # Additional flags
 134 #=========================================
 135 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DUNRES -DISNAN")
 136
 137 #=========================================
 138 # System specific flags
 139 #=========================================
 140 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 141   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 142 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 143
 144 #=========================================
 145 # Compiler specific flags
 146 #=========================================
 147
 148 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 149   # Add ifort preprocessor flags
 150   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 151 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 152   # Add new gfortran flags
 153   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 154 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 155   # Add old gfortran flags
 156   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 157 else (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 158   # Default preprocessor flags
 159   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 160 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 161
 162 #=========================================
 163 # Add MPI preprocessor flags
 164 #=========================================
 165 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI")
 166
 167 #=========================================
 168 # Add 64-bit specific preprocessor flags
 169 #=========================================
 170 if (architektura STREQUAL "64")
 171   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 172 endif (architektura STREQUAL "64")
 173
 174 #=========================================
 175 # Apply preprocesor flags to *.F files
 176 #=========================================
 177 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_M_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 178
 179
 180 #========================================
 181 #  Setting binary name
 182 #========================================
 183 set(UNRES_WHAM_M_BIN "wham_M_${Fortran_COMPILER_NAME}_${UNRES_MD_FF}.exe")
 184
 185 #=========================================
 186 # cinfo.f workaround for CMake
 187 #=========================================
 188 # get the current date
 189 TODAY(DATE)
 190 # generate cinfo.f
 191
 192 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
 193 FILE(WRITE ${CINFO}
 194 "C CMake generated file
 195        subroutine cinfo
 196        include 'COMMON.IOUNITS'
 197        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 198        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 199 ")
 200
 201 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
 202 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
 203 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
 204 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
 205 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
 206 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
 207 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
 208
 209 FILE(APPEND ${CINFO}
 210 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 211        return
 212        end ")
 213
 214 # set include paths
 215 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}"  )
 216
 217 #=========================================
 218 # Set full unres CSA sources
 219 #=========================================
 220 set(UNRES_WHAM_M_SRCS ${UNRES_WHAM_M_SRC0} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
 221
 222 #=========================================
 223 # Build the binary
 224 #=========================================
 225 add_executable(UNRES_WHAM_M_BIN ${UNRES_WHAM_M_SRCS} )
 226 set_target_properties(UNRES_WHAM_M_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_M_BIN})
 227 set_property(TARGET UNRES_WHAM_M_BIN PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin )
 228 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 229
 230 #=========================================
 231 # Link libraries
 232 #=========================================
 233 # link MPI library (libmpich.a)
 234 target_link_libraries( UNRES_WHAM_M_BIN ${MPI_Fortran_LIBRARIES} )
 235 # link libxdrf.a
 236 target_link_libraries( UNRES_WHAM_M_BIN xdrf )
 237
 238
 239 #=========================================
 240 # Install Path
 241 #=========================================
 242 install(TARGETS UNRES_WHAM_M_BIN DESTINATION ${CMAKE_INSTALL_PREFIX})
 243
 244
 245 #=========================================
 246 # TESTS
 247 #=========================================
 248
 249 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 250 #SET(UNRES_TEST_FILES
 251 #       ala10.inp
 252 #    )
 253
 254 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 255 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 256 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 257 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 258 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 259 #          POST_BUILD
 260 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 261 #      )
 262 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 263
 264 #=========================================
 265 # Generate data test files
 266 #=========================================
 267 #  test_single_ala.sh
 268 #=========================================
 269
 270 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 271 #"#!/bin/sh
 272 #export POT=GB
 273 #export PREFIX=ala10
 274 #-----------------------------------------------------------------------------
 275 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 276 #-----------------------------------------------------------------------------
 277 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 278 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 279 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 280 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 281 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 282 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 283 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 284 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 285 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 286 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 287 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 288 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 289 #-----------------------------------------------------------------------------
 290 #$UNRES_BIN
 291 #")
 292
 293 #=========================================
 294 #  ala10.inp
 295 #=========================================
 296
 297 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 298 #"ala10 unblocked
 299 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 300 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 301 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 302 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 303 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 304 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 305 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 306 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 307 #12
 308 #XAAAAAAAAAAX
 309 # 0
 310 # 0
 311 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 312 #   90.0000   90.0000
 313 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 314 #  180.0000
 315 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 316 #  110.0000  110.0000
 317 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 318 # -120.0000 -120.0000
 319 #")
 320
 321
 322 # Add tests
 323
 324 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 325
 326 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 327
 328 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)