source/wham/src-HCD-5D/DIMENSIONS

   1 ********************************************************************************
   2 * Settings for the program of united-residue peptide simulation in real space  *
   3 *                                                                              *
   4 *                -------  As of 6/23/01 -----------                            *
   5 *                                                                              *
   6 ********************************************************************************
   7 c      implicit real*8 (a-h,o-z)
   8 C Max. number of processors.
   9 c      parameter (maxprocs=128)
  10 C Max. number of fine-grain processors
  11 c      parameter (max_fg_procs=maxprocs)
  12 C Max. number of coarse-grain processors
  13 c      parameter (max_cg_procs=maxprocs)
  14 C Max. number of AA residues
  15       integer maxres
  16 c      parameter (maxres=250)
  17       parameter (maxres=5000)
  18 c      parameter (maxres=3300)
  19 C Appr. max. number of interaction sites
  20       integer maxres2
  21       parameter (maxres2=2*maxres)
  22 c Max. number of chains
  23       integer maxchain
  24       parameter (maxchain=6)
  25 C Max number of symetries
  26        integer maxsym,maxperm
  27        parameter (maxsym=maxchain,maxperm=720)
  28 C Max. number of variables
  29       integer maxvar
  30       parameter (maxvar=4*maxres)
  31 C Max. number of groups of interactions that a given SC is involved in
  32       integer maxint_gr
  33       parameter (maxint_gr=2)
  34 C Max. number of derivatives of virtual-bond and side-chain vectors in theta
  35 C or phi.
  36       integer maxdim
  37       parameter (maxdim=(maxres-1)*(maxres-2)/2)
  38 c      parameter (maxdim=10000)
  39 C Max. number of SC contacts
  40       integer maxcont
  41       parameter (maxcont=12*maxres)
  42 C Max. number of contacts per residue
  43       integer maxconts
  44       parameter (maxconts=maxres)
  45 C Number of AA types (at present only natural AA's will be handled
  46       integer ntyp,ntyp1
  47       parameter (ntyp=24,ntyp1=ntyp+1)
  48       integer nntyp
  49       parameter (nntyp=ntyp*(ntyp+1)/2)
  50 C Max. number of types of dihedral angles & multiplicity of torsional barriers
  51 C and the number of terms in double torsionals
  52       integer maxtor,maxterm,maxlor,maxtermd_1,maxtermd_2,maxtor_kcc,
  53      & maxval_kcc
  54       parameter (maxtor=4,maxterm=10,maxlor=3,maxtermd_1=8,maxtermd_2=8)
  55       parameter (maxtor_kcc=6,maxval_kcc=6)
  56 c Max number of new valence-angle (only) terms
  57       integer maxang_kcc
  58       parameter (maxang_kcc=36)
  59 c Max number of torsional terms in SCCOR
  60       integer maxterm_sccor
  61       parameter (maxterm_sccor=6)
  62 C Max. number of residue types and parameters in expressions for
  63 C virtual-bond angle bending potentials
  64       integer maxthetyp,maxthetyp1,maxtheterm,maxtheterm2,maxtheterm3,
  65      &  maxsingle,maxdouble,mmaxtheterm
  66       parameter (maxthetyp=3,maxthetyp1=maxthetyp+1,maxtheterm=20,
  67      & maxtheterm2=6,maxtheterm3=4,maxsingle=6,maxdouble=4,
  68      & mmaxtheterm=maxtheterm)
  69 C Max. number of lobes in SC distribution
  70       integer maxlob
  71       parameter (maxlob=4)
  72 C Max. number of S-S bridges
  73       integer maxss
  74       parameter (maxss=20)
  75 C Max. number of dihedral angle constraints
  76       integer maxdih_constr
  77       parameter (maxdih_constr=maxres)
  78 C Max. number of patterns in the pattern database
  79       integer maxseq
  80       parameter (maxseq=1000)
  81 C Max. number of residues in a peptide in the database
  82       integer maxres_base
  83       parameter (maxres_base=1000)
  84 C Max. number of threading attempts
  85       integer maxthread
  86       parameter (maxthread=2000)
  87 C Max. number of move types in MCM
  88       integer maxmovetype
  89       parameter (maxmovetype=4)
  90 C Max. number of stored confs. in MC/MCM simulation
  91       integer maxsave
  92       parameter (maxsave=2000)
  93 C Max. number of conformations in Master's cache array
  94       integer max_cache
  95       parameter (max_cache=1000)
  96 C Max. number of conformations in the pool
  97       integer max_pool
  98       parameter (max_pool=1000)
  99 C Number of threads in deformation
 100       integer max_thread,max_thread2
 101       parameter (max_thread=40,max_thread2=2*max_thread)
 102 C Number of steps in DSM
 103       integer max_step
 104       parameter (max_step=1)
 105 C Number of structures to compare at t=0
 106       integer max_threadss,max_threadss2
 107       parameter (max_threadss=80,max_threadss2=2*max_threadss)
 108 C Maxmimum number of angles per residue
 109       integer mxang
 110       parameter (mxang=4)
 111 C Maximum number of groups of angles
 112       integer mxgr
 113       parameter (mxgr=2*maxres)
 114 C Maximum number of chains
 115       integer mxch
 116       parameter (mxch=1)
 117 C Maximum number of generated conformations
 118       integer mxio
 119       parameter (mxio=1000)
 120 C Maximum number of seed
 121       integer max_seed
 122       parameter (max_seed=100)
 123 C Maximum number of structures for ZSCORE for each protein
 124       integer maxzs
 125       parameter (maxzs=2)
 126 C Maximum number of structures stored for comparison for ZSCORE for each protein
 127       integer maxzs1
 128       parameter (maxzs1=6)
 129 C Maximum number of proteins for ZSCORE
 130       integer maxprotzs
 131       parameter (maxprotzs=1)
 132 C Maximum number of conf in rmsdbank
 133       integer maxrmsdb
 134       parameter (maxrmsdb=110)
 135 C Maximum number of bankt conformations
 136       integer mxiot
 137       parameter (mxiot=mxio)
 138 c Maximum number of conformations in MCMF
 139       integer maxstr_mcmf
 140       parameter (maxstr_mcmf=800)
 141 c Maximum number of families in MCMF
 142       integer maxfam_p
 143       parameter (maxfam_p=20)
 144 c Maximum number of structures in family in MCMF
 145       integer maxstr_fam
 146       parameter (maxstr_fam=40)
 147 C Maximum number of threads in MCMF
 148       integer maxthread_mcmf
 149       parameter (maxthread_mcmf=10)
 150 C Maximum number of SC local term fitting function coefficiants
 151       integer maxsccoef
 152       parameter (maxsccoef=65)
 153 C Maximum number of terms in SC bond-stretching potential
 154       integer maxbondterm
 155       parameter (maxbondterm=3)
 156 C Maximum number of bins in SAXS restraints
 157       integer MaxSAXS
 158       parameter (MaxSAXS=1000)
 159 C Maximum number of templates in homology-modeling restraints
 160       integer max_template
 161       parameter(max_template=50)
 162 c Maximum number of clusters of templates containing same fragments
 163       integer maxclust
 164       parameter(maxclust=1000)